《生物化学课件》4:酶.ppt
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1、 第第 四四 章章 酶酶化学(化学(EnzymeEnzyme)学习目的与要求:学习目的与要求:1.酶的酶的概念概念及发展及发展分类及命名分类及命名 5.酶作用的机制酶作用的机制2.酶催化作用的特点酶催化作用的特点 6.酶促反应的速度及其影响因素酶促反应的速度及其影响因素3.3.酶的化学本质及组成酶的化学本质及组成 7.酶的分离纯化与酶活力测定酶的分离纯化与酶活力测定4.4.酶结构与其生物活性的关系酶结构与其生物活性的关系 重点:重点:1.1.酶的化学本质及组成酶的化学本质及组成 4.酶促反应的速度及其影响因素酶促反应的速度及其影响因素2.2.酶结构与其生物活性的关系酶结构与其生物活性的关系 5
2、.酶的分离纯化与酶活力测定酶的分离纯化与酶活力测定3.酶作用的机制酶作用的机制难点:难点:1.酶作用的机制酶作用的机制 3.3.抑制剂对酶反应的影响抑制剂对酶反应的影响2.2.底物浓度对酶促反应速度影响底物浓度对酶促反应速度影响 4.4.酶活力测定酶活力测定第一节、酶的概念,分类及命名第一节、酶的概念,分类及命名一一.酶的概念及发展酶的概念及发展 酶酶是一类由活性细胞产生的具有催化作用和高度专一是一类由活性细胞产生的具有催化作用和高度专一性的特殊性的特殊蛋白质蛋白质。简单说,酶是一类由活性细胞产生的。简单说,酶是一类由活性细胞产生的生生物催化剂物催化剂。酶的概念酶的概念发展史发展史(1)(1)
3、酶是蛋白质酶是蛋白质:1926 1926年年,James Summer,James Summer由刀豆制出脲酶结晶确立酶是蛋白质的由刀豆制出脲酶结晶确立酶是蛋白质的观念,其具有蛋白质的一切性质。观念,其具有蛋白质的一切性质。(2)(2)核酶的发现:核酶的发现:1981 198119821982年,年,Thomas R.CechThomas R.Cech实验发现有催化活性的天然实验发现有催化活性的天然RNARibozymeRNARibozyme。L19 RNA L19 RNA和核糖核酸酶和核糖核酸酶P P的的RNARNA组分具有酶活性是两个最著名的组分具有酶活性是两个最著名的例子。例子。1995
4、 1995年,发现年,发现DNADNA的催化活性。的催化活性。(3)(3)抗体酶(抗体酶(abzymeabzyme):):1986 1986年,年,Richard LerrurRichard Lerrur和和Peter SchaltzPeter Schaltz运用单克隆抗体技运用单克隆抗体技术制备了具有酶活性的抗体(术制备了具有酶活性的抗体(catalytic antibodycatalytic antibody)。)。CH3CHCOOHOHNAD+H+CH3CCOOHONADH二二.酶的分类酶的分类n氧化氧化-还原酶催化氧化还原酶催化氧化-还原反应。还原反应。n主要包括脱氢酶主要包括脱氢酶(
5、Dehydrogenase)(Dehydrogenase)和氧化酶和氧化酶(Oxidase)(Oxidase)。n如,乳酸如,乳酸(Lactate)(Lactate)脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。1.1.氧化氧化-还原酶还原酶 Oxidoreductase OxidoreductaseCH3CHCOOHNH2HOOCCH2CH2CCOOHOHOOCCH2CH2CHCOOHNH2CH3CCOOHO转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子的基团或原子转转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。移到另一个底物的分子上。例如,例如,谷丙转氨酶催
6、化的氨基转移反应。谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。2.2.转移酶转移酶 Transferase TransferaseH2OCOOCH2CH3RRCOOHCH3CH2OHn水解酶催化底物的加水分解反应。水解酶催化底物的加水分解反应。n主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。n例如,脂肪酶例如,脂肪酶(Lipase)(Lipase)催化的脂的水解反应催化的脂的水解反应3.3.水解酶水解酶 Hydrolase HydrolaseHOOCCH=CHCOOHH2OHOOCCH2CHCOOHOHn裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或裂合酶催化从底物分子中移去一个基团
7、或 原子形成双键的反原子形成双键的反应及其逆反应。应及其逆反应。n 主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。n 例如,例如,延胡索酸水合酶催化的反应。延胡索酸水合酶催化的反应。4.裂解酶裂解酶 Lyase LyaseOCH2OHOHOHOHOHOCH2OHCH2OHOHOHOH异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即底物分子内基团或原异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即底物分子内基团或原子的重排过程。子的重排过程。例如,例如,6-6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。5.异构酶异构酶 Isomerase Isomerasen合成酶,又称为连接酶
8、,能够催化合成酶,又称为连接酶,能够催化C-CC-C、C-OC-O、C-N C-N 以及以及C-S C-S 键的键的形成反应。这类反应必须与形成反应。这类反应必须与ATPATP分解反应相互偶联。分解反应相互偶联。A+B+ATP+H-O-H=A A+B+ATP+H-O-H=A B+ADP+Pi B+ADP+Pi 例如,丙酮酸羧化酶催化的反应例如,丙酮酸羧化酶催化的反应 丙酮酸丙酮酸 +CO +CO2 2 草酰乙酸草酰乙酸6.6.合成酶合成酶 Ligase or Synthetase Ligase or Synthetase三三.酶的命名酶的命名(1 1)根据其催化底物来命名;)根据其催化底物来命
9、名;(2 2)根据所催化反应的性质来命名;)根据所催化反应的性质来命名;(3 3)结合上述两个原则来命名;)结合上述两个原则来命名;(4 4)有时在这些命名基础上加上酶的来源或其它特点。)有时在这些命名基础上加上酶的来源或其它特点。1.1.习惯命名法习惯命名法2.2.国际系统命名法国际系统命名法n系统名称包括底物名称、构型、反应性质系统名称包括底物名称、构型、反应性质,2,2个底物,底物个底物,底物之间之间“:”,水解酶水解,水解酶水解2 2字可省略,最后加一个酶字。字可省略,最后加一个酶字。例如:例如:(习惯名称习惯名称:谷丙转氨酶谷丙转氨酶)系统名称系统名称:L-:L-丙氨酸丙氨酸 :-酮
10、戊二酸氨基转移酶酮戊二酸氨基转移酶 酶催化的反应酶催化的反应:谷氨酸谷氨酸+丙酮酸丙酮酸 -酮戊二酸酮戊二酸+丙氨酸丙氨酸四四.酶的编号酶的编号例如:例如:RNaseT1-EC3148 EC -EC -酶酶 3 -3 -水解酶水解酶 1 -1 -脂脂键键 4 -4 -磷酸二酯键磷酸二酯键 8 -8 -编号(第编号(第8 8个)个)第二节、酶催化作用的特点一.酶和一般催化剂的共性及酶催化作用特性酶和一般催化剂的共性及酶催化作用特性1.1.酶和一般催化剂的酶和一般催化剂的共性共性:n加快反应速度;加快反应速度;n不改变平衡常数;不改变平衡常数;n自身不参与反应。自身不参与反应。2.2.酶催化作用酶
11、催化作用特性特性:n条件温和条件温和:常温、常压、:常温、常压、pH=7pH=7;n高效率高效率:反应速度与不加催化剂相比可提高:反应速度与不加催化剂相比可提高10108 8 10102020,与加普通催化剂相比可提高,与加普通催化剂相比可提高10107 710101313;n专一性专一性:即酶只能对特定的一种或一类底物起作用。:即酶只能对特定的一种或一类底物起作用。n易变敏感性易变敏感性:易受各种因素的影响。:易受各种因素的影响。n酶的活性调节控制酶的活性调节控制:受在活细胞内受到精密严格的调节控制。:受在活细胞内受到精密严格的调节控制。n酶分子代谢更新:酶分子代谢更新:二二.专一性专一性1
12、.1.绝对专一性绝对专一性有些酶只作用于一种底物,催化一个反应,有些酶只作用于一种底物,催化一个反应,而不作用于任何其它物质。而不作用于任何其它物质。2.2.相对专一性相对专一性这类酶对结构相近的一类底物都有作用。这类酶对结构相近的一类底物都有作用。3.3.立体异构专一性立体异构专一性簇(基团)专一性簇(基团)专一性键专一性键专一性旋光异构专一性。旋光异构专一性。几何异构专一性几何异构专一性第三节、酶的化学本质及组成第三节、酶的化学本质及组成一一.酶的化学本质酶的化学本质1.1.由由基本组成单位氨基酸基本组成单位氨基酸2.2.具有具有蛋白质的性质蛋白质的性质-两性离解性质等两性离解性质等3.3
13、.具具有有双缩脲反应双缩脲反应二二.酶的组成酶的组成全酶全酶(holoenzyme(holoenzyme)=酶蛋白酶蛋白+辅因子辅因子单成份酶单成份酶:脲酶、蛋白酶、淀粉酶、核糖核酸酶等。:脲酶、蛋白酶、淀粉酶、核糖核酸酶等。(简单蛋白质简单蛋白质)双成份酶双成份酶(结合蛋白质)(结合蛋白质)酶酶 酶蛋白酶蛋白(apoenzymeapoenzyme)辅因子辅因子(cofacter)cofacter)辅酶辅酶(coenzyme)coenzyme)辅基辅基(prosthetic group)(prosthetic group)三三.酶的辅因子酶的辅因子酶的辅因子是酶的对热稳定的非蛋白小分子物质部分
14、,酶的辅因子是酶的对热稳定的非蛋白小分子物质部分,其主要作用是作为电子、原子或某些基团的载体参与反其主要作用是作为电子、原子或某些基团的载体参与反应并促进整个催化过程。应并促进整个催化过程。(1)(1)传递电子体:传递电子体:如如 卟啉铁、卟啉铁、铁硫簇;铁硫簇;(2)(2)传递氢(递氢体):传递氢(递氢体):如如 FMN/FADFMN/FAD、NAD/NADPNAD/NADP、C C0 0Q Q、硫辛酸;、硫辛酸;(3)(3)传递酰基体:传递酰基体:如如 C C0 0A A、TPPTPP、硫辛酸;、硫辛酸;(4)(4)传递一碳基团:传递一碳基团:如如 四氢叶酸;四氢叶酸;(5)(5)传递磷酸
15、基:传递磷酸基:如如 ATPATP,GTPGTP;(6)(6)其它作用:其它作用:转氨基,如转氨基,如 V VB6 B6;传递传递COCO2 2,如,如 生物素。生物素。第四节第四节 酶分子结构与其生物活性的关系酶分子结构与其生物活性的关系一.酶分子结构酶分子结构根据结构不同酶可分为根据结构不同酶可分为单体酶单体酶:只有单一的三级结构蛋白质构成。:只有单一的三级结构蛋白质构成。寡聚酶寡聚酶:由多个(两个以上)具有三级结构的亚基聚合而成。:由多个(两个以上)具有三级结构的亚基聚合而成。多酶复合体多酶复合体:由几个功能相关的酶嵌合而成的复合体。:由几个功能相关的酶嵌合而成的复合体。二二.活性中心活
16、性中心活性中心:酶分子中直接和底物结合活性中心:酶分子中直接和底物结合并起催化反应的空间局限(部位)。并起催化反应的空间局限(部位)。催化部位催化部位(Catalytic site):):酶分子中促使酶分子中促使底物发生化学变化的底物发生化学变化的部位称为催化部位。部位称为催化部位。l通常将酶的结合部通常将酶的结合部位和催化部位总称为位和催化部位总称为酶的活性部位或活性酶的活性部位或活性中心。中心。l结合部位决定酶的结合部位决定酶的专一性,专一性,l催化部位决定酶所催化部位决定酶所催化反应的性质。催化反应的性质。调控部位调控部位(Regulatory siteRegulatory site):
17、):酶分子中存在着一酶分子中存在着一些可以与其他分子发生某种程度的结合的部位,些可以与其他分子发生某种程度的结合的部位,从而引起酶分子空间构象的变化,对酶起激活或从而引起酶分子空间构象的变化,对酶起激活或抑制作用抑制作用三三.必须基团必须基团酶表现催化活性不可缺少的基团。酶表现催化活性不可缺少的基团。亲核性基团:丝氨酸的羟基,半胱氨酸的巯基和组氨酸的咪亲核性基团:丝氨酸的羟基,半胱氨酸的巯基和组氨酸的咪唑基。唑基。酸碱性基团:门冬氨酸和谷氨酸的羧基,赖氨酸的氨基,酪酸碱性基团:门冬氨酸和谷氨酸的羧基,赖氨酸的氨基,酪氨酸的酚羟基,组氨酸的咪唑基和半胱氨酸的巯基等。氨酸的酚羟基,组氨酸的咪唑基和
18、半胱氨酸的巯基等。H2NCHCCH2OHOOHOHH2NCHCCH2OHOSHSHH2NCHCCH2OHONNHNNHH2NCHCCH2OHOCH2COHOH2NCHCCH2OHOCOHOCOOHH2NCHCCH2OHOCH2CH2CH2NH2NH2H2NCHCCH2OHOOHOH第五节、酶作用的机制第五节、酶作用的机制一一.酶催化作用与反应活化能酶催化作用与反应活化能自自由由能能反应进程反应进程产物产物反应物反应物IIIIIII:酶催化反应活化能酶催化反应活化能II:化学催化剂反应活化能化学催化剂反应活化能III:无催化反应活化能:无催化反应活化能二二.酶催化作用的中间产(络合)物学说酶催化
19、作用的中间产(络合)物学说n在酶催化的反应中,第一步是酶与底物形成酶在酶催化的反应中,第一步是酶与底物形成酶底物中间复合物。当底物分子在酶作用下发底物中间复合物。当底物分子在酶作用下发生化学变化生化学变化,中间复合物再分解成产物和酶。中间复合物再分解成产物和酶。E +S =E-S E +S =E-S P +E P +En许多实验事实证明了许多实验事实证明了E ES S复合物的存在。复合物的存在。E ES S复合物形成的速率与酶和底物的性质有关。复合物形成的速率与酶和底物的性质有关。三三.使酶具有高效性的机制使酶具有高效性的机制1.1.临近定向效应临近定向效应l在酶促反应中,底物分子结合到酶的活
20、性中心,一方面底物在酶促反应中,底物分子结合到酶的活性中心,一方面底物在酶活性中心的有效浓度大大增加,有利于提高反应速度;在酶活性中心的有效浓度大大增加,有利于提高反应速度;l另一方面,由于活性中心的立体结构和相关基团的诱导和定另一方面,由于活性中心的立体结构和相关基团的诱导和定向作用,使底物分子中参与反应的基团相互接近,并被严格定向作用,使底物分子中参与反应的基团相互接近,并被严格定向定位,使酶促反应具有高效率和专一性特点向定位,使酶促反应具有高效率和专一性特点.2.“2.“张力张力”和和“形变形变”底物与酶结合诱导酶的分子构象变化,变化的酶分子又使底物分底物与酶结合诱导酶的分子构象变化,变
21、化的酶分子又使底物分子的敏感键产生子的敏感键产生“张力张力”甚至甚至“形变形变”,从而促使酶,从而促使酶底物中间底物中间产物进入过渡态。产物进入过渡态。3.3.酸碱催化酸碱催化l酸酸-碱催化可分为狭义的酸碱催化可分为狭义的酸-碱催化和广义的酸碱催化和广义的酸-碱催化。酶参碱催化。酶参与的酸与的酸-碱催化反应一般都是广义的酸碱催化方式。碱催化反应一般都是广义的酸碱催化方式。l广义酸碱催化是指通过质子酸提供部分质子广义酸碱催化是指通过质子酸提供部分质子,或是通过质子或是通过质子碱接受部分质子的作用,达到降低反应活化能的过程。碱接受部分质子的作用,达到降低反应活化能的过程。l酶活性部位上的某些基团可
22、以作为良好的质子供体或受体对酶活性部位上的某些基团可以作为良好的质子供体或受体对底物进行酸碱催化。底物进行酸碱催化。His His 残基的咪唑基是酶的酸碱催化作用中最活泼的一个催化功能团。残基的咪唑基是酶的酸碱催化作用中最活泼的一个催化功能团。-COOH,-NH3,-SH,+OHNHNH+-COO,-NH2,-S,-.-O-NHN:4.4.共价催化共价催化l催化剂通过与底物形成反应催化剂通过与底物形成反应活性很高的共价过渡产物,使活性很高的共价过渡产物,使反应活化能降低,从而提高反反应活化能降低,从而提高反应速度的过程,称为共价催化。应速度的过程,称为共价催化。l酶中参与共价催化的基团主酶中参
23、与共价催化的基团主要包括要包括 His His 的咪唑基,的咪唑基,Cys Cys 的巯基,的巯基,Asp Asp 的羧基,的羧基,Ser Ser 的羟基等。的羟基等。l某些辅酶,如焦磷酸硫胺素某些辅酶,如焦磷酸硫胺素和磷酸吡哆醛等也可以参与共和磷酸吡哆醛等也可以参与共价催化作用。价催化作用。四四.酶专一性的机制酶专一性的机制认为整个酶分子的天然构象是具有刚性结构的,酶表面具有特认为整个酶分子的天然构象是具有刚性结构的,酶表面具有特定的形状。酶与底物的结合如同一把钥匙对一把锁一样定的形状。酶与底物的结合如同一把钥匙对一把锁一样1.1.锁钥假说锁钥假说(lock and key hypothes
24、is)(lock and key hypothesis)该学说认为酶表面并没有一种与底物互补的固定形该学说认为酶表面并没有一种与底物互补的固定形状,而只是由于底物的诱导才形成了互补形状状,而只是由于底物的诱导才形成了互补形状.2.2.诱导契合假说(诱导契合假说(inducedfit hypothesis)inducedfit hypothesis)第六节、酶促反应动力学第六节、酶促反应动力学一一.底物浓度对酶促反应速度影响底物浓度对酶促反应速度影响底物浓度底物浓度对酶促反应速度影响对酶促反应速度影响 在酶浓度,在酶浓度,pHpH,温度等条件不,温度等条件不变的情况下研究底物浓度和反应变的情况下
25、研究底物浓度和反应速度的关系。如右图所示:速度的关系。如右图所示:n在低底物浓度时在低底物浓度时,反应速度与底反应速度与底物浓度成正比,表现为物浓度成正比,表现为一级反应一级反应特征特征。n当底物浓度达到一定值时,底物当底物浓度达到一定值时,底物浓度增加,反应速度增加,表现浓度增加,反应速度增加,表现为为混合级反应特征混合级反应特征n当底物浓度,几乎所有的酶都与当底物浓度,几乎所有的酶都与底物结合后,反应速度达到最大底物结合后,反应速度达到最大值(值(V Vmaxmax),此时再增加底物浓),此时再增加底物浓度,反应速度不再增加,表现为度,反应速度不再增加,表现为零级反应零级反应。V=Vmax
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