生物化学:蛋白质的化学课件.ppt
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- 生物化学 蛋白质 化学课件
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1、 蛋白质蛋白质(protein)(protein)是由氨基酸为是由氨基酸为单位组成的一类重要的生物大分单位组成的一类重要的生物大分子,是生命的物质基础子,是生命的物质基础。第一节第一节 蛋白质的分子组成蛋白质的分子组成第二节第二节 蛋白质的分子结构蛋白质的分子结构 第第三三节节 蛋白质的理化性质蛋白质的理化性质 及分离纯化及分离纯化第一节第一节 蛋白质的分子组成蛋白质的分子组成 蛋白质分子中主要的元素组成是:蛋白质分子中主要的元素组成是:C C、H H、O O、N N、S S等。其中等。其中N N元素的含量相对稳定,约元素的含量相对稳定,约为为16%16%,故每克氮相当于,故每克氮相当于6.2
2、56.25克克蛋白质。蛋白质。一、氨基酸一、氨基酸(amino acid)(amino acid)组成蛋白质的基本单位是氨基酸。如将组成蛋白质的基本单位是氨基酸。如将天然的蛋白质完全水解,最后都可得到天然的蛋白质完全水解,最后都可得到约二十种不同的氨基酸。除约二十种不同的氨基酸。除脯氨酸脯氨酸和和甘甘氨酸氨酸外,其余均属于外,其余均属于L-L-氨基酸氨基酸。L-L-氨基酸的结构通式氨基酸的结构通式 COOH H2N C H R CCOOHHRH2NCCOOHNH2RHL-AAD-AA为了表达蛋白质或多肽结构的需要,为了表达蛋白质或多肽结构的需要,氨基酸的名称常常使用三字母的简写符氨基酸的名称常
3、常使用三字母的简写符号来表示,有时也用单字母的简写符号号来表示,有时也用单字母的简写符号来表示,单字母主要用于表示长链多肽来表示,单字母主要用于表示长链多肽的氨基酸顺序。的氨基酸顺序。(一)氨基酸的分类:(一)氨基酸的分类:从结构通式中可以看出,各种氨基酸从结构通式中可以看出,各种氨基酸的区别就在于侧链的区别就在于侧链R基的不同。组成蛋白基的不同。组成蛋白质的氨基酸按其质的氨基酸按其-碳原子上侧链碳原子上侧链R的结构的结构分为分为20种,种,20种氨基酸可按种氨基酸可按R的结构和极的结构和极性的不同进行分类。性的不同进行分类。1.根据根据R基的化学结构,基的化学结构,20种常见氨基酸可种常见氨
4、基酸可以分为脂肪族、芳香族和杂环族三类以分为脂肪族、芳香族和杂环族三类。(1)脂肪族氨基酸)脂肪族氨基酸含一氨基一羧基的中性氨基酸:含一氨基一羧基的中性氨基酸:GlyGly、AlaAla、ValVal、LeuLeu、IleIle含羟基的氨基酸:含羟基的氨基酸:SerSer、ThrThr含硫的氨基酸:含硫的氨基酸:CysCys、MetMet含酰胺基的氨基酸:含酰胺基的氨基酸:AsnAsn、GlnGln含一氨基二羧基的酸性氨基酸:含一氨基二羧基的酸性氨基酸:AspAsp、GluGlu含二氨基一羧基的碱性氨基酸:含二氨基一羧基的碱性氨基酸:LysLys、ArgArg(2)(2)芳香族氨基酸芳香族氨基
5、酸 PhePhe、TyrTyr、(Try)(Try)(3)(3)杂环族氨基酸杂环族氨基酸HisHis、ProPro、(Try)(Try)2.根据根据R基极性来分,基极性来分,20种氨基酸可以分种氨基酸可以分为四类。为四类。(1)非极性非极性R基氨基酸基氨基酸Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Met、Pro(2)不带电荷的极性不带电荷的极性R基氨基酸基氨基酸R基中含有不解离的极性基团,能与水形成氢键。基中含有不解离的极性基团,能与水形成氢键。Ser、Thr、Tyr(OH)Cys(SH)Asn、Gln(酰胺基酰胺基)Gly的侧链介于极性与非极性之间,有时也把它归的侧链介于极性与非极性
6、之间,有时也把它归为非极性类。为非极性类。(3)带正电荷的带正电荷的R基氨基酸(碱性氨基酸)基氨基酸(碱性氨基酸)Lys、Arg、His(4)带负电荷的带负电荷的R基氨基酸(酸性氨基酸)基氨基酸(酸性氨基酸)Asp、Glu(一)氨基酸的分类:(一)氨基酸的分类:根据根据R R侧链基团解离性质的不同,可将氨侧链基团解离性质的不同,可将氨基酸进行分类:基酸进行分类:1.1.酸性氨基酸酸性氨基酸GluGlu,AspAsp;侧链基团;侧链基团在中性溶液中解离后带负电荷的氨基酸。在中性溶液中解离后带负电荷的氨基酸。2.2.碱性氨基酸碱性氨基酸HisHis,ArgArg,LysLys;侧链基团在中性溶液中
7、解离后带正电荷侧链基团在中性溶液中解离后带正电荷的氨基酸。的氨基酸。3.3.中性氨基酸中性氨基酸 侧链基团在中性溶液中侧链基团在中性溶液中不发生解离,因而不带电荷的氨基酸。可分不发生解离,因而不带电荷的氨基酸。可分为:为:a)a)极性氨基酸:极性氨基酸:TyrTyr,CysCys,SerSer,ThrThr,AsnAsn,GlnGln,TrpTrp;a)a)非极性氨基酸:非极性氨基酸:GlyGly,AlaAla,ValVal,LeuLeu,IleIle,ProPro,Phe,Met Phe,Met。(二)氨基酸的理化性质:(二)氨基酸的理化性质:1.1.物理性质物理性质无色结晶,每种氨基酸都有
8、自己特有的结晶形无色结晶,每种氨基酸都有自己特有的结晶形状,可用于鉴定。状,可用于鉴定。熔点极高(熔点极高(200200以上)。以上)。有不同的味道。有不同的味道。除胱氨酸、半胱氨酸、酪氨酸外,氨基酸一般除胱氨酸、半胱氨酸、酪氨酸外,氨基酸一般都溶于水,但在水中的溶解度差别较大。在稀酸、都溶于水,但在水中的溶解度差别较大。在稀酸、稀碱中溶解最好。稀碱中溶解最好。除脯氨酸溶于乙醇、乙醚之外,绝大多数氨基除脯氨酸溶于乙醇、乙醚之外,绝大多数氨基酸都不溶于有机溶剂。所以可用有机溶剂沉淀法生酸都不溶于有机溶剂。所以可用有机溶剂沉淀法生产氨基酸。产氨基酸。2 2两性解离及等电点两性解离及等电点:氨基酸分
9、子是一种两性电解质。氨基酸分子是一种两性电解质。通过改变通过改变溶液的溶液的pHpH可使氨基酸分子的解离状态发生改可使氨基酸分子的解离状态发生改变。变。氨基酸分子带有相等正、负电荷时,溶液氨基酸分子带有相等正、负电荷时,溶液的的pHpH值称为该氨基酸的值称为该氨基酸的等电点等电点(pIpI)。)。氨基酸的解离情况氨基酸的解离情况COO-C HH3N+R-pK1+H+H+COOHCHH3N+RH+H+pK2-COO-CHH2NR净电荷净电荷 +0 -+0 -正离子正离子 两性离子两性离子 负离子负离子 等电点等电点pIpI3 3紫外吸收性质:紫外吸收性质:组成天然蛋白质分子的组成天然蛋白质分子的
10、2020种氨基酸中,种氨基酸中,只有色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸对紫外只有色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸对紫外光有光吸收。其吸收峰在光有光吸收。其吸收峰在280nm280nm左右,以左右,以色氨酸色氨酸吸收最强。吸收最强。可利用此性质采用紫外分分光度法测定可利用此性质采用紫外分分光度法测定蛋白质的含量。蛋白质的含量。4 4茚三酮反应:茚三酮反应:l氨基酸可与茚三酮缩合产生氨基酸可与茚三酮缩合产生蓝紫色蓝紫色化化合物,其最大吸收峰在合物,其最大吸收峰在570nm570nm。可利用此。可利用此性质测定氨基酸的含量。性质测定氨基酸的含量。二、肽二、肽(peptide)(peptide)(一)肽键与肽链:(一)
11、肽键与肽链:蛋白质是由若干氨蛋白质是由若干氨基酸的氨基与羧基经脱水缩合而连接起基酸的氨基与羧基经脱水缩合而连接起来形成的长链化合物。一个氨基酸分子来形成的长链化合物。一个氨基酸分子的的-羧基与另一个氨基酸分子的羧基与另一个氨基酸分子的-氨氨基在适当的条件下经脱水缩合即生成基在适当的条件下经脱水缩合即生成肽肽。两氨基酸单位之间的酰胺键,称为两氨基酸单位之间的酰胺键,称为肽键肽键。多肽链中的氨基酸单位称为多肽链中的氨基酸单位称为氨基酸残基氨基酸残基。多多肽链具有方向性,头端为肽链具有方向性,头端为氨基端氨基端(N N端),尾端),尾端为端为羧基端羧基端(C C端)。端)。凡氨基酸残基数目在凡氨基酸
12、残基数目在5050个以上,且具有特定个以上,且具有特定空间结构的肽称空间结构的肽称蛋白质蛋白质;凡氨基酸残基数目;凡氨基酸残基数目在在5050个以下,且无特定空间结构者称个以下,且无特定空间结构者称多肽多肽。(二)生物活性肽:(二)生物活性肽:生物体内具有一定生物学活性的肽类物生物体内具有一定生物学活性的肽类物质称质称生物活性肽生物活性肽。重要的有谷胱甘肽、。重要的有谷胱甘肽、神经肽、肽类激素等。神经肽、肽类激素等。1.1.谷胱甘肽(谷胱甘肽(GSHGSH):):l全称为全称为-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸。其巯基可氧谷氨酰半胱氨酰甘氨酸。其巯基可氧化、还原,故有还原型(化、还原,故有还原型(GSHG
13、SH)与氧化型()与氧化型(GSSGGSSG)两种存在形式。两种存在形式。Glu-Cys-Gly Glu-Cys-Gly SH S S Glu-Cys-Gly 谷胱甘肽的生理功用:谷胱甘肽的生理功用:解毒作用解毒作用:与毒物或药物结合,消除其:与毒物或药物结合,消除其毒性作用;毒性作用;参与氧化还原反应参与氧化还原反应:作为重要的还原剂,:作为重要的还原剂,参与体内多种氧化还原反应;参与体内多种氧化还原反应;保护巯基酶的活性保护巯基酶的活性:使巯基酶的活性基:使巯基酶的活性基团团-SH-SH维持还原状态;维持还原状态;维持红细胞膜结构的稳定维持红细胞膜结构的稳定:消除氧化剂:消除氧化剂对红细胞
14、膜结构的破坏作用。对红细胞膜结构的破坏作用。2.2.多肽类激素:多肽类激素:种类较多,生理功能各异。主要见于下种类较多,生理功能各异。主要见于下丘脑及垂体分泌的激素。丘脑及垂体分泌的激素。第二节第二节 蛋白质的分子结构蛋白质的分子结构蛋白质是由许多氨基酸单位通过肽键连接起来蛋白质是由许多氨基酸单位通过肽键连接起来的,具有特定分子结构的高分子化合物。的,具有特定分子结构的高分子化合物。蛋白质的分子结构可人为划分为一、二、三、蛋白质的分子结构可人为划分为一、二、三、四级结构。除一级结构外,蛋白质的二、三、四级结构。除一级结构外,蛋白质的二、三、四级结构均属于空间结构,即四级结构均属于空间结构,即构
15、象构象。构象是由于有机分子中单键的旋转所形成的。构象是由于有机分子中单键的旋转所形成的。蛋白质的构象通常由蛋白质的构象通常由非共价键(次级键)非共价键(次级键)来维来维系。系。一、蛋白质分子中的非共价键一、蛋白质分子中的非共价键(次级键次级键)1.1.氢键:氢键:氢键氢键(hydrogen bond)(hydrogen bond)的形成常见的形成常见于连接在一电负性很强的原子上的氢原子,于连接在一电负性很强的原子上的氢原子,与另一电负性很强的原子之间。与另一电负性很强的原子之间。氢键在维氢键在维系蛋白质的空间结构稳定上起着重要的作用。系蛋白质的空间结构稳定上起着重要的作用。氢键的键能较低氢键的
16、键能较低(12kJ/mol)12kJ/mol),因而易被破,因而易被破坏。坏。蛋白质分子中氢键的形成蛋白质分子中氢键的形成2.2.疏水键:疏水键:非极性物质在含水的极性环境中存在时,会产生非极性物质在含水的极性环境中存在时,会产生一种相互聚集的力,这种力称为疏水键或疏水作一种相互聚集的力,这种力称为疏水键或疏水作用力。用力。蛋白质分子中的许多氨基酸残基侧链也是非极性蛋白质分子中的许多氨基酸残基侧链也是非极性的,这些非极性的基团在水中也可相互聚集,形的,这些非极性的基团在水中也可相互聚集,形成疏水键,如成疏水键,如Leu,Ile,Val,Phe,Ala等的侧链等的侧链基团。基团。3.3.离子键(
17、盐键):离子键(盐键):离子键离子键(salt bond)是由带正电荷基团与带负是由带正电荷基团与带负电荷基团之间相互吸引而形成的化学键。电荷基团之间相互吸引而形成的化学键。在近中性环境中,蛋白质分子中的酸性氨基在近中性环境中,蛋白质分子中的酸性氨基酸残基侧链电离后带负电荷,而碱性氨基酸残基酸残基侧链电离后带负电荷,而碱性氨基酸残基侧链电离后带正电荷,二者之间可形成离子键。侧链电离后带正电荷,二者之间可形成离子键。蛋白质分子中离子键的形成蛋白质分子中离子键的形成4 4范德华氏(范德华氏(van der Waals)van der Waals)引力:引力:原子之间存在的相互作用力。原子之间存在的
18、相互作用力。二、蛋白质的一级结构二、蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构蛋白质的一级结构是指蛋白质多肽链中通过是指蛋白质多肽链中通过肽键连接起来的氨基酸的排列顺序,即多肽肽键连接起来的氨基酸的排列顺序,即多肽链的线状结构。链的线状结构。维系蛋白质一级结构的主要维系蛋白质一级结构的主要化学键为化学键为肽键肽键。胰岛素(胰岛素(InsulinInsulin)由)由5151个氨基酸残基组成,分为个氨基酸残基组成,分为A A、B B两条链。两条链。A A链链2121个氨基酸残基,个氨基酸残基,B B链链3030个氨基酸残个氨基酸残基。基。A A、B B两条链之间通过两条链之间通过两个二硫键两个二硫键联结
19、在一起,联结在一起,A A链另有链另有一个链内二硫键一个链内二硫键。蛋白质一级结构的测定蛋白质一级结构的测定 研究蛋白质的一级结构从确定组成蛋白质的研究蛋白质的一级结构从确定组成蛋白质的单元结构单元结构氨基酸算起,已有氨基酸算起,已有150年的悠久历史,年的悠久历史,直到直到1953年,年,Sanger首次阐明胰岛素的氨基酸首次阐明胰岛素的氨基酸排列顺序,为研究蛋白质的一级结构开辟了道排列顺序,为研究蛋白质的一级结构开辟了道路。这在分子生物学的发展进程中是一个重要路。这在分子生物学的发展进程中是一个重要突破。目前关于核酸的一级结构研究,由于突破。目前关于核酸的一级结构研究,由于Sanger等发
20、明了加减法,可以得到了突飞猛进等发明了加减法,可以得到了突飞猛进的发展。的发展。蛋白质分子一级结构的研究包括氨基酸的组蛋白质分子一级结构的研究包括氨基酸的组成、氨基酸的排列顺序、二硫键位置、肽链数目成、氨基酸的排列顺序、二硫键位置、肽链数目和末端氨基酸种类等等。和末端氨基酸种类等等。样品必需纯(样品必需纯(97%97%以上);以上);知道蛋白质的分子量;知道蛋白质的分子量;知道蛋白质由几个亚基组成;知道蛋白质由几个亚基组成;测定蛋白质的氨基酸组成;并根据分子量测定蛋白质的氨基酸组成;并根据分子量计算每种氨基酸的个数。计算每种氨基酸的个数。测定水解液中的氨量,计算酰胺的含量。测定水解液中的氨量,
21、计算酰胺的含量。测定蛋白质的一级结构的要求测定蛋白质的一级结构的要求测定蛋白质的一级结构的主要意义:测定蛋白质的一级结构的主要意义:一级结构是研究高级结构的基础。一级结构是研究高级结构的基础。可以从分子水平阐明蛋白质的结构与功能可以从分子水平阐明蛋白质的结构与功能的关系。的关系。可以为生物进化理论提供依据可以为生物进化理论提供依据 可以为人工合成蛋白质提供参考顺序。可以为人工合成蛋白质提供参考顺序。在镰刀状红细胞贫血患者中,由于基因突变在镰刀状红细胞贫血患者中,由于基因突变导致血红蛋白导致血红蛋白-链第六位氨基酸残基由谷氨链第六位氨基酸残基由谷氨酸改变为缬氨酸,血红蛋白的亲水性明显下酸改变为缬
22、氨酸,血红蛋白的亲水性明显下降,从而发生聚集,使红细胞变为镰刀状。降,从而发生聚集,使红细胞变为镰刀状。细胞色素细胞色素c c的一级结构与生物进化的关系的一级结构与生物进化的关系三、蛋白质的二级结构三、蛋白质的二级结构 蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构是指蛋白质多肽链主链原是指蛋白质多肽链主链原子局部的空间结构,但不包括与其他肽段的子局部的空间结构,但不包括与其他肽段的相互关系及侧链构象的内容。维系蛋白质二相互关系及侧链构象的内容。维系蛋白质二级结构的主要化学键是级结构的主要化学键是氢键氢键。(一)蛋白质立体结构原则:(一)蛋白质立体结构原则:1.1.由于由于C=OC=O双键中的双键中的电子云
23、与电子云与N N原子上的未共原子上的未共用电子对发生用电子对发生“电子共振电子共振”,使,使肽键具有部分双键肽键具有部分双键的性质的性质,不能自由旋转。,不能自由旋转。2.2.与肽键相连的六个原子构成刚性平面结构,与肽键相连的六个原子构成刚性平面结构,称为称为肽单元或肽键平面肽单元或肽键平面。但由于。但由于-碳原子与其他碳原子与其他原子之间均形成单键,因此两相邻的肽键平面可原子之间均形成单键,因此两相邻的肽键平面可以作相对旋转。以作相对旋转。肽键平面肽键平面由于肽键具有部分双键由于肽键具有部分双键的性质,使参与肽键构成的六个原子的性质,使参与肽键构成的六个原子被束缚在同一平面上,这一平面称为被
24、束缚在同一平面上,这一平面称为肽键平面或肽单元肽键平面或肽单元。(二)蛋白质二级结构的类型:(二)蛋白质二级结构的类型:蛋白质的二级结构主要包括蛋白质的二级结构主要包括-螺旋,螺旋,-折迭,折迭,-转角及无规卷曲转角及无规卷曲等几种类型。等几种类型。1.-螺旋螺旋:-螺旋是多肽链的主链原子沿一中心轴盘绕螺旋是多肽链的主链原子沿一中心轴盘绕所形成的有规律的螺旋构象,其结构特征为:所形成的有规律的螺旋构象,其结构特征为:为一右手螺旋;为一右手螺旋;螺旋每圈包含螺旋每圈包含3.6个氨基酸残基,个氨基酸残基,螺距螺距为为5.44埃;埃;螺旋以氢键维系。螺旋以氢键维系。影响影响-螺旋稳定的因素有:螺旋稳
25、定的因素有:极大的侧链基团(存在空间位阻);极大的侧链基团(存在空间位阻);连续存在的侧链带有相同电荷的氨基酸连续存在的侧链带有相同电荷的氨基酸残基(同种电荷的互斥效应);残基(同种电荷的互斥效应);有有Pro等亚氨基酸存在(不能形成氢键)。等亚氨基酸存在(不能形成氢键)。2.-2.-折迭:折迭:-折迭是由若干肽段或肽链排列起来所形成折迭是由若干肽段或肽链排列起来所形成的扇面状片层构象,其结构特征为:的扇面状片层构象,其结构特征为:由若干条肽段或肽链平行或反平行排列由若干条肽段或肽链平行或反平行排列组成片状结构;组成片状结构;主链骨架伸展呈锯齿状;主链骨架伸展呈锯齿状;借相邻主链之间的氢键维系
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