生物化学课件基因重组和基因工程.ppt
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- 生物化学课件 基因重组和基因工程 生物化学 课件 基因 重组 基因工程
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1、 Genetic Recombination and Genetic Engineering第十四章第十四章 基因重组和基因工程基因重组和基因工程1第一节第一节 自然界自然界DNADNA重组和基因转移重组和基因转移2接合作用接合作用(conjugation)转化作用转化作用(transformation)转导作用转导作用(transduction)一、细菌的基因转移与重组一、细菌的基因转移与重组3(一)接合作用(一)接合作用当细胞与细胞、或细菌通过菌毛相互接当细胞与细胞、或细菌通过菌毛相互接触时,质粒触时,质粒DNADNA从一个细胞(细菌)转移至从一个细胞(细菌)转移至另一细胞(细菌)的另一细
2、胞(细菌)的DNADNA转移称为转移称为接合作用接合作用(conjugation)。45质粒质粒 细菌染色体外的小型环状双链细菌染色体外的小型环状双链DNA分子分子6可接合质粒如可接合质粒如 F F 因子因子(F factor)7(二)转化作用(二)转化作用通过自动获取或人为地供给外源通过自动获取或人为地供给外源DNADNA,使细胞或培养的受体细胞获得新的遗传表使细胞或培养的受体细胞获得新的遗传表型,称为型,称为转化作用转化作用 (transformation)。8例:溶菌时,裂解的例:溶菌时,裂解的DNADNA片段被另一细菌摄取。片段被另一细菌摄取。910(三)转导作用(三)转导作用当病毒从
3、被感染的(供体)细胞释放出当病毒从被感染的(供体)细胞释放出来、再次感染另一(供体)细胞时,发生在来、再次感染另一(供体)细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间的供体细胞与受体细胞之间的DNADNA转移及基因转移及基因重组即为重组即为转导作用转导作用(transduction)。11噬菌体的生活史噬菌体的生活史溶菌生长途径溶菌生长途径(lysis pathway)溶源菌生长途径溶源菌生长途径(lysogenic pathway)例例1213(四)(四)、转座、转座由插入序列和转座子介导的基因移位或由插入序列和转座子介导的基因移位或重排称为重排称为转座转座(transposition)。14插入序
4、列插入序列(insertion sequences,IS)组成:组成:二个分离的反向重复二个分离的反向重复(inverted repeats,IR)序列序列特有的正向重复序列特有的正向重复序列 一个转座酶(一个转座酶(transposase)编码基因编码基因 IRTransposase GeneIR发生形式:发生形式:保守性转座保守性转座(conservative transposition)复制性转座复制性转座(duplicative transposition)(一)插入序列转座(一)插入序列转座15插入序列的复制性转座插入序列的复制性转座16转座子转座子(transposons)可从一个
5、染色体位可从一个染色体位点转移到另一位点的分散重复序列。点转移到另一位点的分散重复序列。转座子组成:转座子组成:反向重复序列反向重复序列转座酶编码基因转座酶编码基因抗生素抗性等有用的基因抗生素抗性等有用的基因IRIRTransposase Gene有用基有用基因因(二)转座子转座(二)转座子转座17由转座子介导的转座由转座子介导的转座18在接合、转化、转导或转座过程中,不同在接合、转化、转导或转座过程中,不同DNADNA分子间发生的共价连接称基因重组分子间发生的共价连接称基因重组 。二、基因重组二、基因重组同源重组同源重组(homologous recombination)位点特异的重组位点特
6、异的重组(site-specific recombination)19一、同源重组一、同源重组 (homologous recombination)发生在同源序列间的重组称为同源重组,发生在同源序列间的重组称为同源重组,又称基本重组。是最基本的又称基本重组。是最基本的DNA重组方式,重组方式,通过链的断裂和再连接,在两个通过链的断裂和再连接,在两个DNA分子同分子同源序列间进行单链或双链片段的交换。源序列间进行单链或双链片段的交换。2021以以E.coli的同源重组为例,了解同源重组的同源重组为例,了解同源重组机制的机制的Holliday模型。模型。22Holliday模型中,同源重组主要模型
7、中,同源重组主要4 4个关键步骤个关键步骤 两个同源染色体两个同源染色体DNADNA排列整齐排列整齐一个一个DNA的一条链断裂、并与另一个的一条链断裂、并与另一个DNA对应的链连接,形成对应的链连接,形成Holliday中间体中间体通过分支移动产生异源双链通过分支移动产生异源双链DNADNAHolliday中间体切开并修复,形成两个双链中间体切开并修复,形成两个双链重组体重组体DNA,分别为:,分别为:片段重组体片段重组体(patch recombinant)拼接重组体拼接重组体(splice recombinant)23片段重组体片段重组体 (见模型图左边产物):(见模型图左边产物):切开的
8、链与原来断裂的是同一条链,重组体含切开的链与原来断裂的是同一条链,重组体含有一段异源双链区,其两侧来自同一亲本有一段异源双链区,其两侧来自同一亲本DNADNA。拼接重组体拼接重组体(见模型图右边产物):(见模型图右边产物):切开的链并非原来断裂的链,重组体异源双切开的链并非原来断裂的链,重组体异源双链区的两侧来自不同亲本链区的两侧来自不同亲本DNADNA。24 内切酶内切酶(recBCD)DNA侵扰侵扰(recA)分支迁移分支迁移 (recA)内切酶内切酶(recBCD)DNA 连接酶连接酶5 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 3
9、5 3 3 3 5 3 5 3 3 5 5 3 5 3 5 3 Holiday中间体中间体5 3 5 3 5 3 5 3 25Holiday中间体中间体5 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 5 5 3 3 3 5 5 5 5 3 3 3 3 5 5 5 5 3 3 3 3 5 5 5 5 3 3 3 3 5 5 5 5 3 3 3 3 内切酶内切酶(ruvC)内切酶内切酶(ruvC)DNA连接酶连接酶 DNA连接酶连接酶片段重组体片段重组体拼接重组体拼接重组体26二、位点特异重组二、位点特异重组位点特异重组位点特异重组(site-specific recombination)是由整合酶催
10、化,在两个是由整合酶催化,在两个DNADNA序列的特异位点序列的特异位点间发生的整合。间发生的整合。27能否让能否让禾本科的植物禾本科的植物也能够固定空气中的氮?也能够固定空气中的氮?能否让能否让细菌细菌“吐出吐出”蚕丝蚕丝?定向基因改造设想定向基因改造设想 28基因工程的基因工程的原理原理操作环境操作环境操作对象操作对象操作水平操作水平基本过程基本过程结果结果生物体外生物体外基因基因(或或DNA片段)片段)DNA水平水平剪切剪切拼接拼接 导入导入 表达表达人类需要的新的生物类型人类需要的新的生物类型基因产物基因产物基因重组基因重组DNADNA重组技术重组技术是基因工程的核心技术是基因工程的核
11、心技术29重组重组DNA技术的发展史技术的发展史18651865年年 G.J.Mendel的豌豆杂交试验的豌豆杂交试验19441944年年 O.T.Avery的肺炎球菌转化实验的肺炎球菌转化实验19731973年年 美国斯坦福大学的科学家构建美国斯坦福大学的科学家构建第一个第一个重组重组DNADNA分子分子19771977年年 美国南旧金山由博耶和斯旺森建立世界上美国南旧金山由博耶和斯旺森建立世界上第一家第一家遗传遗传工程公司,专门应用重组工程公司,专门应用重组DNADNA技术制造医学上重要的药物。技术制造医学上重要的药物。19801980年年 开始建造开始建造第一家第一家应用重组应用重组DN
12、ADNA技术生产胰岛素的工厂技术生产胰岛素的工厂19971997年年 英国罗林研究所成功的克隆了英国罗林研究所成功的克隆了多莉多莉30第第 二二 节节 重组重组DNA技术技术DNA Recombination Technique 31一、重组一、重组DNA技术相关概念技术相关概念 克隆克隆(clone)(clone)来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。克隆化克隆化(cloning)获取同一拷贝的过程,即获取同一拷贝的过程,即无性繁殖无性繁殖。(一)(一)DNA克隆克隆32(1)分子克隆分子克隆(molecular clone),即即DNA 克隆克隆(2)细胞
13、克隆;细胞克隆;(3)个体克隆(动物或植物)。个体克隆(动物或植物)。重组水平重组水平:33DNA克隆克隆应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质(同源的或异源的、原核的或真核的、天然物质(同源的或异源的、原核的或真核的、天然的或人工的的或人工的DNADNA)与载体)与载体DNADNA接合成一具有自我复接合成一具有自我复制能力的制能力的DNADNA分子分子复制子复制子(replicon),继而通,继而通过转化或转染宿主细胞,筛选出含有目的基因的过转化或转染宿主细胞,筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增提取获得大量同一转化子细胞,再进行扩增提取获得大
14、量同一DNADNA分子,也称分子,也称基因克隆或重组基因克隆或重组DNA(recombinant DNA)。341.1.目的基因的获取目的基因的获取2.2.克隆载体的选择与构建克隆载体的选择与构建3.3.外源基因与载体的连接外源基因与载体的连接4.4.重组重组DNADNA导入受体菌导入受体菌5.5.重组体的筛选重组体的筛选6.6.克隆基因的表达克隆基因的表达二、重组二、重组DNADNA技术基本过程技术基本过程35基因工程的工具酶基因工程的工具酶n 限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶n DNADNA聚合酶聚合酶n 逆转录酶逆转录酶n T4DNAT4DNA连接酶连接酶n 碱性磷酸酶碱性磷酸酶n 末端
15、转移酶末端转移酶n TaqTaq DNA DNA聚合酶聚合酶36限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶-限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶(restriction endonuclease,RE)是是识别识别DNA的特异序列的特异序列,并在识别位点或其周并在识别位点或其周围切割双链围切割双链DNA的一类内切酶。的一类内切酶。Arber、Smith和和Nathans因为在发现限制性内切酶因为在发现限制性内切酶方面开创性工作而共同获得了方面开创性工作而共同获得了1978年的诺贝尔奖。年的诺贝尔奖。37作用作用与甲基化酶共同构成细菌的限制修与甲基化酶共同构成细菌的限制修饰系统,限制外源饰系统,限制外源DNA
16、,保护自身保护自身DNA。38细菌的限制性核酸内切酶细菌的限制性核酸内切酶DNADNA粘性末端粘性末端细菌自身细菌自身DNA甲基保护甲基保护CH3CH3不工作不工作这种这种限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶有何用呢?有何用呢?打击入侵的敌人打击入侵的敌人39噬菌体噬菌体DNA专一序列点无甲基专一序列点无甲基保护,将被降解。保护,将被降解。40第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第四个字母代表株第四个字母代表株;用罗马数字表示发现的先后次序用罗马数字表示发现的先后次序。命名
17、命名EcoR 属属 种种 株株 序序Escherichia coli RY13株株大肠杆菌大肠杆菌 RY13株的第一种酶株的第一种酶41第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第四个字母代表株;第四个字母代表株;用罗马数字表示发现的先后次序。用罗马数字表示发现的先后次序。Hin d 属属 系系 株株 序序Haemophilus influenzae d株株流感嗜血杆菌流感嗜血杆菌d株的第三种酶株的第三种酶42分类分类、(基因工程技术中常用(基因工程技术中常用型)型)已经发
18、现和鉴定了已经发现和鉴定了200200多种多种43类酶识别序列特点类酶识别序列特点 回文结构回文结构(palindrome)(palindrome)切口切口 :平端切口平端切口、粘端切口粘端切口44Bam HGTCCAGGCCTAGGATCC GGGATCCCCTAGGHindGTCGACCAGCTGGACCTG平端切口平端切口粘端切口粘端切口45 被限制酶切开的被限制酶切开的DNADNA两条两条单链的切口单链的切口,带有几个,带有几个伸出的核伸出的核苷酸苷酸,他们之间正好,他们之间正好互补配对互补配对,这样的切口叫,这样的切口叫黏性末端黏性末端。黏性末端黏性末端46Enzymes invol
19、ved in DNA cloningRestriction endonucleases(II)EcolRPstSmal47同功异源酶同功异源酶来源不同的限制酶,但能识别和切割同一位来源不同的限制酶,但能识别和切割同一位点,这些酶称点,这些酶称同功异源酶同功异源酶。GGATCCCCTAGGGCCTAGGATCC GBam HGGATCCCCTAGGGCCTAGGATCC GBst48同尾酶同尾酶有些限制性内切酶虽然识别序列不完全相同,有些限制性内切酶虽然识别序列不完全相同,但切割但切割DNA后,产生相同的粘性末端,称为后,产生相同的粘性末端,称为同尾酶同尾酶。这两个相同的粘性末端称为这两个相同的
20、粘性末端称为配伍未端配伍未端(compatible end)。Bam HBg l GGATCC CCTAGG AGATCT TCTAGAGCCTAG GATCC GATCTAG GATCT A49重组重组DNA技术中常用的工具酶技术中常用的工具酶工工 具具 酶酶功功 能能限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶识别特异序列,切割识别特异序列,切割DNADNA连接酶连接酶催化催化DNA中相邻的中相邻的5 磷酸基和磷酸基和3 羟基末端之间形成磷酸羟基末端之间形成磷酸二酯键,使二酯键,使DNA切口封合或使两个切口封合或使两个DNA分子或片段连接分子或片段连接DNA聚合酶聚合酶合成双链合成双链cDNA分子或片
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