新版生化实验技术专题培训课件.ppt
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- 新版 生化 实验 技术 专题 培训 课件
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1、生化实验技术专题生化实验技术专题 主要内容:介绍生物大分子分离纯化的一主要内容:介绍生物大分子分离纯化的一般步骤和原则;介绍层析技术、电泳技术、离般步骤和原则;介绍层析技术、电泳技术、离心技术、超过滤技术的原理及其应用;总结蛋心技术、超过滤技术的原理及其应用;总结蛋白质、核酸、酶、氨基酸测定的主要方法白质、核酸、酶、氨基酸测定的主要方法。精选1第一节第一节 生物大分子物质的制备生物大分子物质的制备第二节第二节 几类主要的生化实验技术几类主要的生化实验技术第三节第三节 蛋白质、核酸的检测蛋白质、核酸的检测精选2第一节第一节 生物大分子物质的制备生物大分子物质的制备一一一般过程和原则一般过程和原则
2、二二注意事项注意事项三纯化方案的设计和评价三纯化方案的设计和评价例:例:宇佐美曲霉宇佐美曲霉537酸性蛋白酶的纯化酸性蛋白酶的纯化确立有效成分的测定方法确立有效成分的测定方法材料的选择和预处理材料的选择和预处理细胞的破碎和细胞组分分离细胞的破碎和细胞组分分离有效成分的抽提有效成分的抽提有效成分的纯化和浓缩有效成分的纯化和浓缩精选3层析法层析法 电泳法电泳法 超离心法超离心法 透析和超滤透析和超滤盐析(盐析(硫酸铵盐析硫酸铵盐析)等点电沉淀等点电沉淀有机溶剂沉淀有机溶剂沉淀离心离心前处理前处理 粗分级粗分级 细分级细分级 材料选择与处理材料选择与处理细胞破碎(机械破细胞破碎(机械破碎、溶账和自溶
3、、碎、溶账和自溶、酶解、化学处理)酶解、化学处理)生物组织生物组织 提取液提取液 粗产品粗产品结晶结晶分子大小分子大小溶解度溶解度电荷性质电荷性质吸附性质吸附性质生物亲和力生物亲和力依据原理依据原理精选4精选5注意事项注意事项基本原则:防止生物分子变性、降解基本原则:防止生物分子变性、降解 1控制适当的控制适当的pH 2控制低温控制低温 3注意提取过程中的溶液环境注意提取过程中的溶液环境 4防止提纯过程中丟失一些辅助因子或亚基防止提纯过程中丟失一些辅助因子或亚基精选6宇佐美曲霉宇佐美曲霉537酸性蛋白酶的纯化酸性蛋白酶的纯化 纯化步骤纯化步骤 总蛋白总蛋白 总活力总活力 比活力比活力 纯化倍数
4、纯化倍数 回收率回收率 (mg)(U)(U/mg蛋白)蛋白)(%)1、粗酶液、粗酶液 80 4320 54 1 1002、乙醇沉淀、乙醇沉淀 29 3585 123 2.27 833、醋酸钙沉淀、醋酸钙沉淀 21 2980 141 2.64 694、盐析、盐析 4 1771 464 8.52 415、丙酮沉淀、丙酮沉淀 1 1166 1104 20.29 276、结晶、结晶 0.12 130 1072 19.70 3精选7一、一、层析技术层析技术二二、电泳技术电泳技术三三 、离心技术离心技术四四 、透析透析和和超过滤超过滤精选81层析技术一般原理层析技术一般原理2层析技术分类层析技术分类3常用
5、层析技术及应用常用层析技术及应用精选9 层析技术是一种物理的分离方法。无论何种层析层析技术是一种物理的分离方法。无论何种层析,都是由互不都是由互不相溶的两个相组成相溶的两个相组成:一是固定相一是固定相(固体或吸附在固体上的液体),固体或吸附在固体上的液体),一是流动相(液体或气体)。层析时,利用混合物中各组分理化一是流动相(液体或气体)。层析时,利用混合物中各组分理化性质(如吸附力、分子形状和大小、分子极性、分子亲和力、溶性质(如吸附力、分子形状和大小、分子极性、分子亲和力、溶解度等)的差异,使各组分不同程度地分布在两相中,随着流动解度等)的差异,使各组分不同程度地分布在两相中,随着流动相从固
6、定相上流过,不同组分以不同速度移动而最终被分离。相从固定相上流过,不同组分以不同速度移动而最终被分离。混合物在层析系统中的分离决定于该混合物的组分在两相中的混合物在层析系统中的分离决定于该混合物的组分在两相中的分配情况,一般用分配系数分配情况,一般用分配系数(distribution coefficient,Kdistribution coefficient,Kd d)来)来描述。混合物各组分的分配系数差异越大,越容易分离开。描述。混合物各组分的分配系数差异越大,越容易分离开。物质在层析系统中的行为并不直接决定于其物质在层析系统中的行为并不直接决定于其K Kd d,而取决于它的,而取决于它的有
7、效分配系数有效分配系数K Keffeff :K Keff eff=某一物质在某一物质在A A相中的总量相中的总量某一物质在某一物质在B B相中的总量相中的总量精选10 纸层析纸层析 薄膜层析薄膜层析 柱层析柱层析洗脱液洗脱液样品样品填充物填充物分部收集分部收集玻璃柱玻璃柱精选11AspThrThrLysGlyGluSerProAlaCysValMetIleLeuTyrPheHisNH3Arg0.20.41.00.60.8光光吸吸收收流出液流出液(mL)150cm柱柱,pH3.25,0.067mol/L柠檬酸钠柠檬酸钠150cm柱柱,pH4.25,0.067mol/L柠檬酸钠柠檬酸钠15cm柱柱
8、,pH5.25,0.12mol/L柠檬酸钠柠檬酸钠缓冲液泵缓冲液泵显色反显色反应管应管茚三酮泵茚三酮泵已分开的已分开的氨基酸氨基酸离子交换柱离子交换柱样品注入口样品注入口记录仪记录仪光电倍光电倍增管增管光源光源精选12层析柱层析柱恒温装置恒温装置载气(流动相)载气(流动相)样品)样品)进样室进样室检测器检测器记录仪记录仪出口出口精选13层层析析柱柱恒恒温温装装置置溶剂储瓶溶剂储瓶溶剂过滤器溶剂过滤器进样室进样室检测器检测器记录仪记录仪精选14各类层析的原理和载体各类层析的原理和载体类别类别 分离原理分离原理 基质或载体基质或载体吸附层析吸附层析 化学、物理吸附化学、物理吸附 硅胶、氧化铝硅胶、
9、氧化铝、羟基磷酸、羟基磷酸分配层析分配层析 两溶剂相中的溶解效应两溶剂相中的溶解效应 纤维素、硅藻土纤维素、硅藻土、硅胶、硅胶凝胶层析凝胶层析 分子筛效应的排阻效应分子筛效应的排阻效应 sepharose 、sephadex离子交换层析离子交换层析 离子基团的交换反应离子基团的交换反应 离子交换树脂离子交换树脂 、纤维素、纤维素、葡聚糖葡聚糖亲和层析亲和层析 分离物与配体之间有分离物与配体之间有 带配基的带配基的sepharose 特殊亲和力特殊亲和力 或或sephadex聚焦层析聚焦层析 等电点和离子交换作用等电点和离子交换作用 多缓冲交换剂(与带有多种电多缓冲交换剂(与带有多种电 荷基团的
10、配体相偶联的荷基团的配体相偶联的 sepharose 6B)精选15精选16吸附层析吸附层析分配层析分配层析凝胶过滤凝胶过滤(分子筛层析(分子筛层析)离子交换层析离子交换层析亲和层析亲和层析 聚焦层析聚焦层析精选17原理:原理:载体载体:硅胶硅胶 氧化铝氧化铝 羟基磷石灰羟基磷石灰应用:分离纯化蛋白质、酶、氨基酸、核苷酸应用:分离纯化蛋白质、酶、氨基酸、核苷酸 等生化物质等生化物质以吸附剂作为固定相,选择适当的溶剂作流动相。以吸附剂作为固定相,选择适当的溶剂作流动相。由于各种物质的极性不同,被吸附剂吸附的程度和由于各种物质的极性不同,被吸附剂吸附的程度和在流动相中的溶解度不同。层析时,当流动相
11、从固在流动相中的溶解度不同。层析时,当流动相从固定相上流过时,各组分也就不同程度地被溶解(解定相上流过时,各组分也就不同程度地被溶解(解吸),然后又再被吸附、再溶解再吸附,从而以不吸),然后又再被吸附、再溶解再吸附,从而以不同速度随流动相向前移动。同速度随流动相向前移动。精选18原理:原理:载体载体:纤维素纤维素 硅藻土硅藻土 硅胶硅胶应用:应用:各种生化物质的分离鉴定各种生化物质的分离鉴定 分配层析实际上是一种连续抽提方式。如纸层析中分配层析实际上是一种连续抽提方式。如纸层析中滤纸的结合水为固定相,以水饱和的有机溶剂为流滤纸的结合水为固定相,以水饱和的有机溶剂为流动相(展开剂)。当流动相沿滤
12、纸经过样品点时,动相(展开剂)。当流动相沿滤纸经过样品点时,样品点中的溶质在水和有机相中溶解度不同而不均样品点中的溶质在水和有机相中溶解度不同而不均匀地分配在两相中,各种组分按其各自的匀地分配在两相中,各种组分按其各自的分配系数分配系数进行不断分配,从而使物质得到分离和纯化。进行不断分配,从而使物质得到分离和纯化。精选19物质物质Y(Kd=1)的分配情况的分配情况溶剂溶剂 A物质物质Z(Kd=3)的分配情况的分配情况溶剂溶剂 B总量总量总量总量总量总量总量总量总量总量总量总量平衡后平衡后转移转移 1转移转移 2转移转移 3分溶管号分溶管号转移转移 4上相转移上相转移下相转移下相转移上相转移上相
13、转移管管中中蛋蛋白白质质总总量量物质物质Y物质物质Z分溶曲线分溶曲线管号管号有效分配系数(有效分配系数(Keff)某一物质在某一物质在A相中的总量相中的总量某一物质在某一物质在B相中的总量相中的总量精选20基质基质 葡聚糖凝胶(葡聚糖凝胶(sephadex)琼脂糖凝胶(琼脂糖凝胶(sepharose)应用应用 测定分子量测定分子量 脱盐和浓缩脱盐和浓缩 分离提纯生物大分子分离提纯生物大分子 除去热原物质除去热原物质 原理原理:凝胶层析也称为排阻凝胶层析、凝胶过滤和分子筛层析。它是:凝胶层析也称为排阻凝胶层析、凝胶过滤和分子筛层析。它是60 年代发展起来的,利用凝胶把物质按分子大小不同进行分离的
14、一种方年代发展起来的,利用凝胶把物质按分子大小不同进行分离的一种方法。由于被分离物质的分子大小(直径)和形状不同,洗脱时,大分子法。由于被分离物质的分子大小(直径)和形状不同,洗脱时,大分子物质由于直径大于凝胶网孔不能进入凝胶内部,只能沿着凝胶颗粒间的物质由于直径大于凝胶网孔不能进入凝胶内部,只能沿着凝胶颗粒间的孔隙,随溶剂向下移动,因此流程短,首先流出层析柱,而小分子物质孔隙,随溶剂向下移动,因此流程短,首先流出层析柱,而小分子物质,由于直径小于凝胶网孔,能自由进出胶粒网孔,使之洗脱时流程增长,由于直径小于凝胶网孔,能自由进出胶粒网孔,使之洗脱时流程增长,移动速度慢而后流出层析柱。,移动速度
15、慢而后流出层析柱。精选21精选22凝胶颗粒凝胶颗粒收收集集蛋蛋白白质质管管蛋白质混合物蛋白质混合物大分子大分子从柱上面加缓冲溶液从柱上面加缓冲溶液小分子小分子洗脱体积(洗脱体积(Ve)凝胶柱凝胶柱大分子大分子小分子小分子Ve1Ve2V0精选23蛋白质蛋白质Mr=49,000洗出洗出液中液中的蛋的蛋白质白质浓度浓度洗脱体积(洗脱体积(mL)未知未知logMrAndrews的经验公式:的经验公式:logMr=K1-K2(Ve/Vo)G-200G-100logMrKav精选24原理原理基质基质 疏水型离子交换剂;亲水型离子交换剂疏水型离子交换剂;亲水型离子交换剂应用应用 制备纯化生物物质制备纯化生物
16、物质 定量、定性测定混合物中各组分定量、定性测定混合物中各组分1.平衡阶段平衡阶段:离子交换剂离子交换剂与反离子结合与反离子结合2.吸附阶段:样品与反离吸附阶段:样品与反离子进行交换子进行交换3、4.解吸附阶段:用解吸附阶段:用梯度缓冲溶液洗脱,先梯度缓冲溶液洗脱,先洗下弱吸附物质,后洗洗下弱吸附物质,后洗下强吸附物质下强吸附物质5.再生阶段:用原始平再生阶段:用原始平衡液进行充分洗涤,既衡液进行充分洗涤,既可重复使用可重复使用12345原始缓冲溶原始缓冲溶液的反离子液的反离子样品溶液样品溶液梯度浓度梯度浓度精选25蛋蛋白白质质浓浓度度洗脱体积洗脱体积带正电荷带正电荷的蛋白质的蛋白质带负电荷的
17、蛋白质带负电荷的蛋白质收集样品的管收集样品的管收集样品的管收集样品的管带负电荷带负电荷的蛋白质的蛋白质蛋白质混合物蛋白质混合物玻璃柱玻璃柱带正电荷带正电荷的蛋白质的蛋白质带负电荷带负电荷的蛋白质的蛋白质带正电荷带正电荷的蛋白质的蛋白质收集样品的管收集样品的管NaClNaCl梯度梯度精选26凝胶颗粒凝胶颗粒蛋白质混合物蛋白质混合物大分子大分子小分子小分子储液瓶储液瓶混合瓶混合瓶层层析析柱柱磁力搅拌器磁力搅拌器洗脱剂体积(洗脱剂体积(mL)洗洗脱脱剂剂浓浓度度简单型梯度混合器简单型梯度混合器梯度洗脱曲线梯度洗脱曲线洗脱剂体积(洗脱剂体积(mL)洗洗脱脱剂剂浓浓度度储液瓶储液瓶混混合合瓶瓶复合型梯度
18、混合器复合型梯度混合器梯度洗脱曲线梯度洗脱曲线凸形凸形线形线形凹形凹形精选27离子交换剂离子交换剂 可电离基团可电离基团 可电离基团结构可电离基团结构CM-纤维素(弱酸型)纤维素(弱酸型)羧甲基羧甲基P-纤维素(中强弱酸型)纤维素(中强弱酸型)磷酸基磷酸基SE-纤维素(强弱酸型)纤维素(强弱酸型)磺乙基磺乙基SP-纤维素(强弱酸型)纤维素(强弱酸型)磺丙基磺丙基精选28AE-纤维素(弱减型)纤维素(弱减型)氨基乙基氨基乙基离子交换剂离子交换剂 可电离基团可电离基团 可电离基团结构可电离基团结构PAB-纤维素(弱减型)纤维素(弱减型)对氨基苯甲酸对氨基苯甲酸DEAE-纤维素纤维素 二乙基氨基乙基
19、二乙基氨基乙基DEAE-Sephadex 二乙基氨基乙基二乙基氨基乙基DEAE-纤维素(强减型)纤维素(强减型)二乙基氨基乙基二乙基氨基乙基QAE-纤维素(强减型)纤维素(强减型)二乙基(二乙基(2-羟丙羟丙基)基)-氨基乙基氨基乙基(中弱减型)(中弱减型)(中弱减型)(中弱减型)精选29应用应用 分离纯化酶、分离纯化酶、抗原、抗体抗原、抗体 分离纯化核酸分离纯化核酸 研究酶的结构与功能研究酶的结构与功能+待纯化分子待纯化分子配体配体a.理论依据理论依据:待纯化分子和配体间具有亲和性:待纯化分子和配体间具有亲和性+基质基质b.活性基质与配体结合产生亲和吸附剂活性基质与配体结合产生亲和吸附剂+杂
20、质杂质c.待纯化分子与亲和吸附剂结合,与杂质分离待纯化分子与亲和吸附剂结合,与杂质分离+d.偶联复合物经解离后,得到纯的待纯化分子偶联复合物经解离后,得到纯的待纯化分子原理原理:基质基质 纤维素、聚丙烯酰胺凝胶、纤维素、聚丙烯酰胺凝胶、sepharose、sephadex精选30蛋白质混合物蛋白质混合物配体配体与配体结合的与配体结合的蛋白质蛋白质加入的可溶性加入的可溶性配基配基专一性结专一性结合蛋白质合蛋白质没有结合的没有结合的蛋白质蛋白质非专一性结非专一性结合蛋白质合蛋白质蛋蛋白白质质浓浓度度洗脱体积洗脱体积与配体专一性与配体专一性结合蛋白质结合蛋白质加入配基加入配基基质基质精选31 该法是
21、在等电点聚焦方法基础上发展起来的,其分离纯化蛋白质的依据该法是在等电点聚焦方法基础上发展起来的,其分离纯化蛋白质的依据是等电点的差异和离子交换行为。蛋白质按其等电点在是等电点的差异和离子交换行为。蛋白质按其等电点在pH梯度环境中进行排梯度环境中进行排列的过程叫做聚焦效应。列的过程叫做聚焦效应。pH梯度的形成梯度的形成(由多缓冲剂和多缓冲交换剂形成由多缓冲剂和多缓冲交换剂形成)是是聚焦效应的先决条件,如果一种蛋白质加到已形成聚焦效应的先决条件,如果一种蛋白质加到已形成pH梯度的层析柱上时梯度的层析柱上时,由于由于洗脱液的连续流动,蛋白质将迅速地洗脱液的连续流动,蛋白质将迅速地 迁移到与它等电点相
22、同的迁移到与它等电点相同的pH处。从此位处。从此位置开始,该蛋白质将以缓慢的速度进行吸附、解吸附,直到在等电点置开始,该蛋白质将以缓慢的速度进行吸附、解吸附,直到在等电点pH时被时被洗出。在聚焦层析过程中洗出。在聚焦层析过程中,一种样品分次加入时,只要先加入者尚未洗出一种样品分次加入时,只要先加入者尚未洗出,并且并且有一定的时间进行聚焦有一定的时间进行聚焦,剩余样品还可以加到柱上剩余样品还可以加到柱上,其聚焦过程都能顺利完成。其聚焦过程都能顺利完成。pH梯度溶液的形成示意图梯度溶液的形成示意图蛋白质蛋白质1(pI=7)蛋白质蛋白质2(pI=8)流速流速移动速率移动速率层析时的聚焦效应示意图层析
23、时的聚焦效应示意图精选32精选33 1电泳的一般原理电泳的一般原理 2.电泳技术的类别电泳技术的类别 3、常用电泳技术常用电泳技术4、电泳技术的拓展电泳技术的拓展精选34电泳的一般原理电泳的一般原理 电泳是带电颗粒在电场作用下向着与其电荷相反的电极电泳是带电颗粒在电场作用下向着与其电荷相反的电极移动的现象移动的现象 。许多生物分子都带有电荷,其电荷的多少取。许多生物分子都带有电荷,其电荷的多少取决于分子组成、性质及其所在介质的决于分子组成、性质及其所在介质的pHpH。如果混合物中各组。如果混合物中各组分的结构组成不同,在某一分的结构组成不同,在某一pHpH溶液中,各组分所带电荷性质溶液中,各组
24、分所带电荷性质、电荷数量不同,加之其分子量不同,在同一电场的作用下、电荷数量不同,加之其分子量不同,在同一电场的作用下,各组分泳动的方向和速度也各异,而达到分离鉴定各组分,各组分泳动的方向和速度也各异,而达到分离鉴定各组分的目的。的目的。精选35垂直板电泳垂直板电泳毛细管电泳毛细管电泳水平板电泳水平板电泳电电泳泳支支持持物物滤纸滤纸凝胶凝胶薄膜薄膜圆盘电泳圆盘电泳精选361、醋酸纤维薄膜电泳、醋酸纤维薄膜电泳2、聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳3、琼脂糖电泳琼脂糖电泳 4、毛细管电泳毛细管电泳精选37 聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamide gel electr
25、ophoresis,PAGE)1、一般、一般PAGE2、SDS-PAGE3、PAGE等电点聚焦等电点聚焦精选38polyacrylamidegelpolyacrylamidegel electrophoresis electrophoresis,PAGEPAGE是在区带电泳原理的基础上,以孔径大小不同的聚丙烯是在区带电泳原理的基础上,以孔径大小不同的聚丙烯酰胺凝胶酰胺凝胶(PAG)(PAG)作为支持物,采用电泳基质的作为支持物,采用电泳基质的不连续体系不连续体系(即凝即凝胶层的不连续性、缓冲液离子成分的不连续性、胶层的不连续性、缓冲液离子成分的不连续性、pHpH的不连续性的不连续性及电位梯度的
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