药物基因组学的研究及应用进展课件.ppt
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- 药物 基因组 研究 应用 进展 课件
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1、2008-4-20中药物基因组学药物基因组学12008-4-20中概述概述药物相关基因的分类药物相关基因的分类药物基因组学的研究方法药物基因组学的研究方法药物基因组学的应用药物基因组学的应用基因芯片技术在药物基因组学基因芯片技术在药物基因组学研究中的应用研究中的应用22008-4-20中概述 1.1.药物基因组学的定义药物基因组学的定义 Pharmacogenomics Pharmacogenomics 是研究基因是研究基因序列多态性序列多态性与与药物效应多药物效应多样性样性之间关系,即基因本身及其突变体与之间关系,即基因本身及其突变体与药物效应相互关系的一门科学。药物效应相互关系的一门科学。
2、32008-4-20中药效个体差异药效个体差异:个体对药物的反应在分子水:个体对药物的反应在分子水平存在的差异。平存在的差异。个体差异个体差异早就为人所知早就为人所知基因组学的开展与深入基因组学的开展与深入药物基因组学是基因功能学与分子药理学的有药物基因组学是基因功能学与分子药理学的有机结合机结合42008-4-20中 药物基因组学与一般意义上基因组学的药物基因组学与一般意义上基因组学的区别区别它不以发现人体基因组基因它不以发现人体基因组基因 为主要目的为主要目的相对简单地运用已知的基因理论改善病人相对简单地运用已知的基因理论改善病人的治疗,的治疗,药物基因组学是以药物基因组学是以药物效应药物
3、效应及及安全性安全性为为目标,研究各种目标,研究各种基因变异基因变异与与药效药效及及安全安全性性的关系。的关系。52008-4-20中基因变异基因变异安全性安全性药效药效62008-4-20中 2.2.药物基因组学的诞生药物基因组学的诞生早在早在2020世纪世纪5050年代,人们就发现不同的遗传年代,人们就发现不同的遗传背景会导致药物反应的差异,而这些差异是背景会导致药物反应的差异,而这些差异是由由基因多态性基因多态性造成的造成的基因组中每基因组中每500-1000bp500-1000bp就有就有1 1个呈现变异,个呈现变异,但是直到但是直到2020世纪世纪8080年代这些差异才引入药物年代这
4、些差异才引入药物遗传学。遗传学。人们发现了许多具有人们发现了许多具有基因多态性的酶基因多态性的酶,在此,在此基础上建立了药物基因组学。基础上建立了药物基因组学。72008-4-20中研究影响药物研究影响药物吸收吸收、转运转运、代谢代谢、清除清除、效应效应等个体差异的基因特性,即决定药物行为和敏等个体差异的基因特性,即决定药物行为和敏感性的全部基因的新学科。感性的全部基因的新学科。基因多态性与药物效应及不良反应之间的关系,基因多态性与药物效应及不良反应之间的关系,并在此基础上研制新的药物或新的用药方法并在此基础上研制新的药物或新的用药方法药物代谢药物代谢药物转运药物转运药物靶分子药物靶分子 82
5、008-4-20中3.3.国外药物基因组学的研究动态国外药物基因组学的研究动态 1997 1997年年6 6月月2828日日,金赛特(巴黎)可伯特金赛特(巴黎)可伯特实验室宣布成立世界上第一个独特的实验室宣布成立世界上第一个独特的基因与基因与制药制药公司研究药物基因组学,随后已有几十公司研究药物基因组学,随后已有几十家公司已涉及此领域。目前,药物基因组学家公司已涉及此领域。目前,药物基因组学已涉及的研究领域包括:已涉及的研究领域包括:92008-4-20中实验室和(或)公司实验室和(或)公司 研究领域研究领域 1.Aeiveos Sciences Group 年龄相关的基因及基因作用年龄相关的
6、基因及基因作用 (Seattle,WA)2.Avitech Diagostics 酶基因突变检测方法酶基因突变检测方法 (Malvern,PA)。3.Eurona Medical,AB 药物效应与遗传学关系药物效应与遗传学关系 (Upsala 瑞典瑞典)4.Gemini Research,Ltd 根据表型发现新的基因,孪生根据表型发现新的基因,孪生 (Cambridge,英国英国)子研究子研究 5.Genaissance 遗传多态性、发现相关同源遗传多态性、发现相关同源 Pharaceeuticals,Inc 基因、乳腺癌基因、血管损基因、乳腺癌基因、血管损 伤基因等伤基因等102008-4-
7、20中实验室和(或)公司实验室和(或)公司 研究领域研究领域 6.6.Genome Therapeutics Genome Therapeutics 人类高分辨率基因多态性数据库人类高分辨率基因多态性数据库 Crop,Crop,(Waltham,MA)Waltham,MA)7.7.金赛特金赛特 高密度的等位基因图,高密度的等位基因图,6 6万个标识物万个标识物8.8.Variagenics,Inc Variagenics,Inc 根据杂合型缺失型设计的抗癌治疗,根据杂合型缺失型设计的抗癌治疗,(Gambrige,MA)(Gambrige,MA)抗癌药物基因组学抗癌药物基因组学 9.9.Lion
8、 Bioscience,AG Lion Bioscience,AG 以药物为目标的个人基因序列鉴定、以药物为目标的个人基因序列鉴定、(Aeidelberg,Aeidelberg,德国德国 )分析软件、不同情况下的表达数据分析软件、不同情况下的表达数据 10.10.策内卡策内卡 人类基因多态性分析人类基因多态性分析11.11.SmithKine Beecham SmithKine Beecham 诊断与药物基因组学试剂盒、人类基因图谱诊断与药物基因组学试剂盒、人类基因图谱 112008-4-20中实验室和(或)公司实验室和(或)公司 研究领域研究领域12.GuraGen 整合基因与药物基因组学的
9、平台多样性分析 13.Epidauros Biotechnologie 目的基因多态性分析 14.Hexagen 单链核苷酸多态性分析15.Janssen Pharmaceutica 线粒体基因多样性分析 16.Millenium 预防医药公司 用于药物基因组学的单链核苷酸17.Nova Mollecular 中枢神经系统疾病图18.MitoKor 线粒体的基因分析 19.Rosetta Inpharmatics 基于核苷酸研究的试剂盒 20.Sequanna Therapeutics 高通量基因型 122008-4-20中药物相关基因的分类药物相关基因的分类复杂过程复杂过程药物进入人体内药物
10、进入人体内到发挥作用到发挥作用被清除。被清除。在这个过程中的任何一个环节出现问题都可能在这个过程中的任何一个环节出现问题都可能引起药物效应的各种异常。引起药物效应的各种异常。药物作用的差异是药物作用的差异是药物动力学药物动力学/药效学药效学差异。差异。132008-4-20中 药代动力学差异药代动力学差异:将药物转运至介导药:将药物转运至介导药物的效果和(或)毒性的关键分子部位或自物的效果和(或)毒性的关键分子部位或自该部位除去的差异。该部位除去的差异。涉及这些过程的分子涉及这些过程的分子药物代谢酶药物代谢酶:细胞色素:细胞色素P450P450酶超家族成员酶超家族成员药物转运分子:药物转运分子
11、:介导药物摄入和排出介导药物摄入和排出142008-4-20中 药效学差异药效学差异:等量药物转运到分:等量药物转运到分子作用部位但出现不同的药物疗效。子作用部位但出现不同的药物疗效。反映了药物取得疗效的反映了药物取得疗效的靶分子靶分子功能功能的差异,或是各种药物与分子靶位间的的差异,或是各种药物与分子靶位间的相互作用相互作用存在的广泛病理生理上的差异。存在的广泛病理生理上的差异。152008-4-20中 基于目前的认识,药物相关的基因大基于目前的认识,药物相关的基因大致可分为四类编码基因:致可分为四类编码基因:1 1)药物)药物代谢代谢相关的相关的酶酶 2 2)药物)药物结合结合相关的相关的
12、受体受体 3 3)药物)药物转运转运相关的相关的膜通道膜通道 4 4)信号传导信号传导相关的相关的蛋白质蛋白质162008-4-20中1.1.药物代谢酶相关基因药物代谢酶相关基因细胞色素细胞色素P450P450酶(酶(CYPCYP)-血红蛋白超级家族,血红蛋白超级家族,大大的酶系统,包含大量与药物代谢有关的酶,是药物的酶系统,包含大量与药物代谢有关的酶,是药物代谢的主要酶系代谢的主要酶系与一氧化碳结合和还原时,分光光度法测得的吸收与一氧化碳结合和还原时,分光光度法测得的吸收峰在峰在450nm附近附近普遍存在于细菌、真菌及动植物中普遍存在于细菌、真菌及动植物中 催化内源性和外源性化合物的代谢。催
13、化内源性和外源性化合物的代谢。参与外源性物质(如参与外源性物质(如药物药物、酒精、抗氧化剂、有机、酒精、抗氧化剂、有机溶剂、麻醉药、染料、环境污染物质、化学制品)溶剂、麻醉药、染料、环境污染物质、化学制品)的代谢,产生的代谢产物可能有毒性或致癌性的代谢,产生的代谢产物可能有毒性或致癌性 172008-4-20中Nehert在常见氨基酸序列的基础上提出了在常见氨基酸序列的基础上提出了通用的系统命名法,将同工酶及基因分通用的系统命名法,将同工酶及基因分为家族和亚家族,为家族和亚家族,CYP命名所有物种的细命名所有物种的细胞色素胞色素P450同工酶同工酶17家族:所有来源的细胞色素家族:所有来源的细
14、胞色素P450蛋白蛋白的氨基酸若有的氨基酸若有40%以上的同源性,则归于以上的同源性,则归于同一家族,并以同一家族,并以阿拉伯数字阿拉伯数字来标示,来标示,CYP2 亚家族:氨基酸序列有亚家族:氨基酸序列有55以上同源性,以上同源性,以以大写字母大写字母标示,字母后面阿拉伯数字标示,字母后面阿拉伯数字表示不同的酶,表示不同的酶,CYP2C、CYP2D、CYP2E 182008-4-20中肝脏代谢肝脏代谢:细胞色素:细胞色素P450系统和肝脏代系统和肝脏代谢有关。谢有关。CYP1,2,3家族占总肝家族占总肝P450含含量的量的70%,负责大多数药物的代谢。,负责大多数药物的代谢。CYP3A占总肝
15、占总肝P450的的30%,CYP2约占约占20%,CYP1A2占占13%,CYP2E1占占7%,CYP2A6占占4%,CYP2D6占占2%。小肠、胰、脑、肺、肾上腺、肾、骨髓、小肠、胰、脑、肺、肾上腺、肾、骨髓、肥大细胞、皮肤、卵巢及睾丸均发现细肥大细胞、皮肤、卵巢及睾丸均发现细胞色素胞色素P450 192008-4-20中CYP2家族家族 亚家族:亚家族:2A、2B、2C、2D、2ECYP2C亚家族:使安定、三环类抗抑郁药亚家族:使安定、三环类抗抑郁药(阿米替林、丙米嗪)去甲基,氧化奥美拉(阿米替林、丙米嗪)去甲基,氧化奥美拉唑。唑。2C9的底物是苯妥英、甲苯磺丁脲的底物是苯妥英、甲苯磺丁脲
16、(tolbutamine)和双氯芬酸)和双氯芬酸(diclofenec)。2C10酶参与甲苯磺丁脲和环已巴比妥的羟化。酶参与甲苯磺丁脲和环已巴比妥的羟化。苯磺唑酮苯磺唑酮(sulfinpyrazone)和硫苯拉唑和硫苯拉唑(sulfaphenaxole)可抑制这两种酶。可抑制这两种酶。2C19参与环已巴比妥、安定和参与环已巴比妥、安定和S-美芬妥英美芬妥英(S-mephenytoin)的代谢。的代谢。202008-4-20中CYP2D6CYP2D6:异喹胍异喹胍(debrisoquine)羟化酶,研羟化酶,研究很多,参与大量药物的代谢,如异喹胍究很多,参与大量药物的代谢,如异喹胍(抗高血压抗高
17、血压)、三环类)、三环类抗抑郁药抗抑郁药、镇痛药镇痛药(可待因、右美沙芬可待因、右美沙芬)、抗心律失常药抗心律失常药。奎。奎尼丁和选择性尼丁和选择性5羟色胺羟色胺 为抑制剂抑制剂CYP2E1(二甲基亚硝胺、(二甲基亚硝胺、N去甲基酶):去甲基酶):负责许多负责许多挥发性麻醉药挥发性麻醉药(如七氟醚、安氟(如七氟醚、安氟醚、甲氧氟烷、异氟醚、乙醚、三氯乙烯醚、甲氧氟烷、异氟醚、乙醚、三氯乙烯和氯仿、乙醇及芳香类化合物,如苯、扑和氯仿、乙醇及芳香类化合物,如苯、扑热息痛及亚硝基二甲胺)的代谢热息痛及亚硝基二甲胺)的代谢 CYP3A4酶:参与酶:参与多种麻醉药物多种麻醉药物的代谢的代谢 212008
18、-4-20中CYP2D6 CYP2D6、CYP2C9CYP2C9和和CYP2C19CYP2C19对许对许多药物的效应非常重要。多药物的效应非常重要。对作用于神经系统或需要通过血脑对作用于神经系统或需要通过血脑屏障的亲脂性药物而言,肾脏排出屏障的亲脂性药物而言,肾脏排出的方式只有分泌,而且分泌量很小。的方式只有分泌,而且分泌量很小。细胞色素细胞色素P450P450的代谢作用就显得尤的代谢作用就显得尤其重要其重要222008-4-20中CYP2D6CYP2D6非功能性等位基因纯合子携带者不非功能性等位基因纯合子携带者不能代谢和分泌许多药物,如异喹呱、美能代谢和分泌许多药物,如异喹呱、美托洛尔、去甲
19、替林、普罗帕酮等。托洛尔、去甲替林、普罗帕酮等。病人对这些药物不能进行正常的代谢,故对这病人对这些药物不能进行正常的代谢,故对这类药物非常敏感。类药物非常敏感。这种基因型的这种基因型的发生率发生率在不同的种族中有很大的在不同的种族中有很大的差异,如日本人的发生率约为差异,如日本人的发生率约为1%1%,而尼日利,而尼日利亚人的发生率为亚人的发生率为5%5%。这就要求临床用药中要。这就要求临床用药中要特别注意药物的用量。特别注意药物的用量。232008-4-20中 CYP2C19CYP2C19基因缺陷的病人对于一些基因缺陷的病人对于一些药物如苯妥英、环已烯巴比妥等高度敏药物如苯妥英、环已烯巴比妥等
20、高度敏感。感。其第外显子上单个碱基的突变其第外显子上单个碱基的突变(AGAG)就可以导致功能的丧失。就可以导致功能的丧失。目前已被制成相应的生物芯片,目前已被制成相应的生物芯片,即将投入临床应用。即将投入临床应用。242008-4-20中 CYP2C9CYP2C9:介导介导S-S-华法林消除华法林消除 临床用华法林(临床用华法林(5 5mg/mg/日)治疗日)治疗深静脉血栓深静脉血栓患者患者 一例:治疗一周后,发生颅内出血。一例:治疗一周后,发生颅内出血。患者使用的华法林为消旋体,它的活性对患者使用的华法林为消旋体,它的活性对映体映体S-S-华法林的消除依赖于华法林的消除依赖于CYP2C9CY
21、P2C9,几乎只限几乎只限于于CYP2C9CYP2C9的氧化作用。的氧化作用。CYP2C9 CYP2C9的变异的变异削弱其催化能力,仅极少数削弱其催化能力,仅极少数变异体的纯合子个体表现为变异体的纯合子个体表现为S-S-华法林血浓度的华法林血浓度的明显升高,因此,在标准剂量下明显升高,因此,在标准剂量下 CYP2C9CYP2C9变异变异的个体,通常表现为的个体,通常表现为华法林抗凝作用华法林抗凝作用的显著增的显著增强。强。252008-4-20中“高风险药物动力学高风险药物动力学”:有效浓度有效浓度和和中中毒浓度毒浓度相近的药物经相近的药物经单一单一途径消除时,途径消除时,这条途径的遗传变异将
22、导致药物清除、这条途径的遗传变异将导致药物清除、血药浓度和效应的较大(有时大几个数血药浓度和效应的较大(有时大几个数量级)改变。量级)改变。高风险药物动力学也成为高风险药物动力学也成为药物相互药物相互作用作用致药效大幅度变化的基础,如奎尼致药效大幅度变化的基础,如奎尼丁加地高辛或特非那丁加酮康唑。丁加地高辛或特非那丁加酮康唑。262008-4-20中奎尼丁和地高辛:奎尼丁和地高辛:经常合用,成功治愈了多经常合用,成功治愈了多种心脏疾患。地高辛的半衰期无明显变动种心脏疾患。地高辛的半衰期无明显变动特非那丁:特非那丁:季节性、常年性过敏性鼻炎、急季节性、常年性过敏性鼻炎、急慢性荨麻疹、过敏性花粉症
23、慢性荨麻疹、过敏性花粉症 酮康唑酮康唑:治疗浅表和深部真菌病,如皮肤和治疗浅表和深部真菌病,如皮肤和指甲癣、阴道白色念珠菌病、胃肠真菌感指甲癣、阴道白色念珠菌病、胃肠真菌感染染 特非那丁加酮康唑:特非那丁加酮康唑:头晕加重,头晕加重,头痛,继头痛,继而意识丧失,摔倒撞伤头部,四肢抽搐,而意识丧失,摔倒撞伤头部,四肢抽搐,小便失禁小便失禁 272008-4-20中 CYP2C19CYP2C19基因多态性影响临床疗效的另一基因多态性影响临床疗效的另一实例是实例是质子泵抑制剂质子泵抑制剂。奥美拉唑、兰索拉唑和潘托拉唑等质子泵奥美拉唑、兰索拉唑和潘托拉唑等质子泵抑制剂(抑制剂(抗酸及抗溃疡药抗酸及抗溃
24、疡药)由)由P450P450酶代谢,酶代谢,主要由主要由S-S-美芬妥英羟化酶美芬妥英羟化酶(S-mephenytoin S-mephenytoin 4 4-hydroxylase,CYP2C19-hydroxylase,CYP2C19),部分由部分由CYP3A4CYP3A4代谢。代谢。CYP2C19 CYP2C19的基因多态性会影响质子泵抑制的基因多态性会影响质子泵抑制剂的药动学,从而影响后者治疗相关疾病的剂的药动学,从而影响后者治疗相关疾病的临床效果。临床效果。282008-4-20中 CYP2C19CYP2C19分分弱代谢型弱代谢型(poor metabolisher,poor meta
25、bolisher,PMPM)和和强代谢型强代谢型(extensive metabolisher,extensive metabolisher,EMEM)。白种人、美国黑人白种人、美国黑人PMPM基因型约占基因型约占3%3%5%5%,亚,亚洲人为洲人为12%12%100%100%,其中中国人为,其中中国人为15%15%,日本人,日本人19%19%23%23%,朝鲜人,朝鲜人13%13%,均远高于白种人。,均远高于白种人。最基本的最基本的PMPM基因型是在基因型是在CYP2C19CYP2C19外显子外显子5 5的的1 1个单碱基突变个单碱基突变(CYP2C19m1CYP2C19m1),),另一种在
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