医院生物样本资源库与临床研究课件.pptx

1、医院生物样本资源库与临床研究医院生物样本资源库与临床研究汇汇 报报 提提 纲纲一、生物样本库科学发展趋势一、生物样本库科学发展趋势二、国内外代表性生物样本库二、国内外代表性生物样本库 三、三、302医院生物样本库建设医院生物样本库建设 四、四、302医院临床与转化研究医院临床与转化研究据据经济合作与发展组织经济合作与发展组织（OECD）的定的定义义，生物样本库（Biobank）是一 种集中保存各种人类生物材料（Human biological material），用于疾病 的临床治疗和生命科学研究的生物应用系统。标准化收集、处理、储标准化收集、处理、储存存和应用和应用健康和疾病生物体的生物大分

2、子、细胞、组织和器官等样本，包括人体 器官组织、全血、血浆、血清、体液或经处理过的生物样本，如 DNA、RNA、蛋白等；与这些生物样本相关的临床、病理、治疗、随访、知情同意等资料及 其质量控制、信息管理与应用系统。生物样本库定义生物样本库定义单个研究人员或单个科室因其研究需要将其搜集单个研究人员或单个科室因其研究需要将其搜集的的 生物样本单独保存而建立的生物样本库生物样本单独保存而建立的生物样本库1医院或研究机构建立的生物样本库，进行内部生医院或研究机构建立的生物样本库，进行内部生物物 样本资源统一保存和分配使用样本资源统一保存和分配使用2多个医院或研究机构联合组成的生物样本库，实多个医院或研

3、究机构联合组成的生物样本库，实现现 各单位生物样本集中保存和共享使用各单位生物样本集中保存和共享使用3第三方机构从社群中搜集大型的队列生物样本库，第三方机构从社群中搜集大型的队列生物样本库，集中保存集中保存4生物样本库主要形式生物样本库主要形式Biobank相关的杂志和论文逐年递增相关的杂志和论文逐年递增杂志数量杂志数量论文数量论文数量研究题目中含研究题目中含“生物样本相关类型生物样本相关类型和和关键关键词词”逐逐年年递增递增9种生物样本类型种生物样本类型7个代表性关键词个代表性关键词生物生物样样本学本学科科近年近年来来获得获得飞飞速发速发展展，作，作为为一一 种特种特殊殊的资的资源源，得，得

4、到到了各了各国国政府政府、各级各级卫生卫生 组织组织的的高度高度重重视。视。国际生物和环境样本库国际生物和环境样本库协协会会（ISBER）通过建立规范和标准通过建立规范和标准，利用培训等方式影响发展中国家的，利用培训等方式影响发展中国家的 样本库建设，使其达到一定的质量和标准样本库建设，使其达到一定的质量和标准 下辖下辖6个不同类型的生物样本库个不同类型的生物样本库，分别是动物样本库、环，分别是动物样本库、环境境 样本库、人体样本库、微生物样本库、博物馆样本库、样本库、人体样本库、微生物样本库、博物馆样本库、植植 物物/种子样本库种子样本库 设置了若干个专门性的工作组设置了若干个专门性的工作组

5、，逐步推进，逐步推进ISBER在生物样在生物样本本 库建设过程中各个领域内的专业性和权威性库建设过程中各个领域内的专业性和权威性美国国家癌症中心生物样本库和生美国国家癌症中心生物样本库和生物物样本样本研研究办究办公公室室(OBBR)确立生物样本库研究新领域确立生物样本库研究新领域，确定高效保存生物样品使，确定高效保存生物样品使其其 适用于基因组和蛋白质组研究的各种搜集和处理协议；适用于基因组和蛋白质组研究的各种搜集和处理协议；推广普及最佳操作规范推广普及最佳操作规范，以协调各机构政策和程序。，以协调各机构政策和程序。促进发展生物样本的质量标准，建立专业第三方标准监促进发展生物样本的质量标准，建

6、立专业第三方标准监督督 机构机构；发展生物样本库业务的新技术发展生物样本库业务的新技术；与国际社会协调，以协；与国际社会协调，以协调调 政策和程序，促进多国研究。政策和程序，促进多国研究。国内标准化标本库国内标准化标本库首席首席单位单位特色特色宁光上海交大瑞金医院内分泌陈香美301医院肾病王秋菊301医院聋病李宁北京佑安医院慢性肝炎和HIV贾伟平上海交大第六人民医院代谢性疾病杜详复旦大学肿瘤医院肿瘤刘玉兰北大人民医院肠病王伟业上海交大新华医院肿瘤周伟平东方肝胆病医院肝癌聂勇战四军大消化道疾病5年前建立，标准化建设、通过了国际、国内认证年前建立，标准化建设、通过了国际、国内认证.如何建立一个高效

7、、有序的管理系统？如何建立一个高效、有序的管理系统？如何建立合理的科学技术标准及质量监控体系？如何建立合理的科学技术标准及质量监控体系？国际合作设计到的标准兼容问题？国际合作设计到的标准兼容问题？合理的医学伦理和法律框架的规定？合理的医学伦理和法律框架的规定？资金投入、资金投入、使用、维持？使用、维持？问题和挑战问题和挑战汇汇 报报 提提 纲纲一、生物样本库科学发展趋势一、生物样本库科学发展趋势二、国内外代表性生物样本库二、国内外代表性生物样本库 三、三、302医院生物样本库建设医院生物样本库建设 四、四、302医院临床与转化研究医院临床与转化研究总体定位总体定位 基于医院传染病特色，重点建立

8、基于医院传染病特色，重点建立“前瞻性队列牵引的生物前瞻性队列牵引的生物样样 本库本库”。建成建成标准化、规范化、网络化标准化、规范化、网络化的传染病大样本生物样品库的传染病大样本生物样品库以以 及生物信息提取、生产、储存和应用平台。及生物信息提取、生产、储存和应用平台。搭建转化医学研究的基地，促进我院转化医学研究的深入搭建转化医学研究的基地，促进我院转化医学研究的深入开开 展，整体提升我院的竞争实力。展，整体提升我院的竞争实力。管理与组织结构管理与组织结构医学伦理委员会生物样本库专家 委员会生物样品库PI-1PI-2PI-3采集 运输加工 保存信息 录入质控解放军第302医院医院管理医院管理临

9、床队列设计临床队列设计样品保存质控样品保存质控医院标准化生物样本库医院标准化生物样本库建建设三设三部部曲曲规划规划建设建设转化转化专职人员专职人员组织管理框架组织管理框架顶层设计顶层设计硬件（环境硬件（环境/设施）设施）网络、信息网络、信息伦理、法律伦理、法律信息整合信息整合出入库管理出入库管理合作、转化合作、转化门户网站门户网站标准认证标准认证备案备案人员培训人员培训规章制度（规章制度（SOP）保存方法、程序保存方法、程序试剂、耗材试剂、耗材质量控制质量控制生生物样本库物样本库建建立的基立的基本本原则原则安安 全全样本生物样本生物样本信息样本信息设备运行设备运行工作人员工作人员准准 确确样本

10、信息样本信息样本存放取出样本存放取出 位置位置快快 捷捷工作流程工作流程软件系统操作软件系统操作信息交流信息交流耗材供应及技耗材供应及技 术支持术支持建设样本库的基本原则建设样本库的基本原则1.硬件建设硬件建设样本库面积样本库面积800平平米米，可，可容容纳超纳超低低温冰温冰箱箱120台台，液，液氮氮存储系存储系 统统40台台 基本设备：基本设备：-80冰冰箱箱43台；台；气气相液相液氮氮系统系统3套套 监控设监控设备备：低低温冷链温冷链监监测测系系统、环统、环境境监监测测系统、系统、视视频频监监测系统、测系统、液液氮容器液位监控、远程氮容器液位监控、远程报报警等。警等。2.生物样品库规范管理

11、生物样品库规范管理 SOP文件：文件：编写制定样本库的样本采集管理、储存、使用及储存设备 管理和人员管理等SOP文件并汇编成册（6册）。管理规定管理规定：初步制定302医院的样本管理规定：样本库的质量管理规定、信息管理规定和出入库管理规定等有关样本库运行的方案。3.软件建设：三位软件建设：三位一体一体生物样本库管理系统生物样本 信息患者病历 信息患者随访 信息采用病案、随访、样本三层树形数据存储结构采用病案、随访、样本三层树形数据存储结构可实现不同科室、不同课题数据同时显示可实现不同科室、不同课题数据同时显示 对对E M R电子病历文本进行结构化处理电子病历文本进行结构化处理安全完整保存生物样

12、本及相关信息安全完整保存生物样本及相关信息 快捷准确查询快捷准确查询和导出数据和导出数据按科研需要进行数据统计分析和挖掘按科研需要进行数据统计分析和挖掘生物样本库管理系统的生物样本库管理系统的主主要特要特点点和功能和功能患者随访信息系统的功能患者随访信息系统的功能随访信息的查询统计分析随访信息的采集录入随访计划的制定随访内容的制定到期随访的提醒4.立足于我院的行业优立足于我院的行业优势势，建，建立立特色库特色库1.军队医院规范化管理：军队医院规范化管理：利利于建于建设设高质高质量量随访随访队队列；列；2.网络化的对口支援传染网络化的对口支援传染病病医院：医院：利于建立全国多中心利于建立全国多中

13、心、更全更全面面、更、更具具有代有代表表性的性的队队列和列和样样品品库库3.较为雄厚的肝病较为雄厚的肝病/AIDS病转病转化化医学医学研研究：究：有利于后期的成果转有利于后期的成果转化化4.特色诊疗技术：特色诊疗技术：生物治疗、中医诊疗生物治疗、中医诊疗、儿童儿童肝肝病、病、其其它新它新发发/突突发发传染传染病病等等HBV感染感染耐受耐受肝炎肝炎肝硬化肝硬化/衰竭衰竭HCC死亡死亡妇产科妇产科 新新生儿科生儿科青少年青少年 科科门诊、各门诊、各 科科各科室各科室肝纤科肝纤科肝衰竭肝衰竭外科外科 肝肝移植移植逐渐形成覆盖逐渐形成覆盖HBV感染全病程的特感染全病程的特色色临床临床队队列和列和标标本

14、库本库母婴传播、病毒库建立母婴传播、病毒库建立 免疫耐受发免疫耐受发生生免疫耐受形成、维持、打免疫耐受形成、维持、打破破慢性乙肝抗病毒疗效、慢性乙肝抗病毒疗效、sAg清除清除肝纤维化转归、终末期肝病预警肝纤维化转归、终末期肝病预警外科术后预警、转归外科术后预警、转归成立成立“临床队列及其样临床队列及其样本本库研库研究究计划计划”项目组项目组专家咨询委员会和伦理专家咨询委员会和伦理委委员会员会审审查查子队列建立及权益分享子队列建立及权益分享样本出入库管理、信息样本出入库管理、信息管管理、理、质质量管理量管理5.前瞻性队列牵引的样前瞻性队列牵引的样本本库库提出临床问题提出临床问题建立临床队列建立临

15、床队列建成样本库建成样本库已构架出已构架出“以队列为牵以队列为牵引引”特特色色生物生物样样本库本库运行运行1年，年，已已建立研究建立研究队队列列12项，项，共共纳入纳入肝病肝病/艾滋艾滋病病患者患者4500余余 例，血清例，血清、血、血浆、浆、P B M C、组组织等；各织等；各类样类样本共本共4.6万万份份牵牵头头人人队队列列王王福福生生艾滋病患者长期随访队列及生物样本库建设赵赵平平慢性乙肝抗病毒队列及生物样本库建设HBV慢性感染免疫耐受长期随访队列及生物样本库邹邹正升正升酒精性肝病队列及生物样本库建设自身免疫性肝病队列及生物样本库建设药物性肝病队列及生物样本库建设张张政政慢性乙型肝炎患者急

16、性发作的临床观察和免疫学发病机制研究张张敏敏青少年疑难肝病长期随访队列及生物样本库建设慢性乙肝病毒感染青少年患者抗病毒治疗队列及生物样本库何何宏宏宇宇肝炎干眼症患者队列及生物样本库建设刘刘振振文文肝移植患者队列及组织生物样本库建设陆陆荫荫英英肝脏肿瘤不同治疗方式长期随访队列及生物样本库建设6、多种类样本标准化、多种类样本标准化处处理、理、保保存存免疫组学蛋白质组学基因组学 病理学病原学 基因组学 免疫组学其他传染病特色样本库其他传染病特色样本库前期血清库前期血清库 目前保有目前保有20多万多万份的传染病份的传染病血血清标本清标本细胞库细胞库保存常用细胞株保存常用细胞株 51 种，种，10多多种

17、肝细胞种肝细胞病毒库病毒库目前保存目前保存225株常见病毒株，株常见病毒株，110种种抗抗病毒病毒血血清清HBV基因数据库基因数据库 收录了收录了2.7万万例乙肝患者例乙肝患者HBV序序列列/克隆克隆、4800多例多例 耐药患者随访样本和诊耐药患者随访样本和诊疗疗信息信息网址：网址：www.HBV汇汇 报报 提提 纲纲一、生物样本库科学发展趋势一、生物样本库科学发展趋势二、国内外代表性生物样本库二、国内外代表性生物样本库 三、三、302医院生物样本库建设医院生物样本库建设 四、四、302医院临床与转化研究医院临床与转化研究临床 信息生物学 信息生生物样物样 本库本库1.临床临床病例转病例转化化

18、为科为科研研队列队列2.临床临床数据转数据转化化为科为科研研数据数据1.风风险因险因素素评估评估分分析；析；2.预警预预警预后后指标指标、模型模型3.疾病疾病进进展展机机制、治制、治疗疗靶靶标标；4.新治疗新治疗方方法目法目标标人群人群确确定定临床向科研科研向临床生物样本库是转化医学生物样本库是转化医学研研究的究的关关键源头键源头基于临基于临 床队列床队列 的生物的生物 样本库样本库研研 究究 思思 路路预警预警 靶标靶标临床问题临床问题 预测？预测？治疗？治疗？建立预警模型锁定目标人群治疗治疗 靶标靶标机制 研究动物模型（人源化小鼠）临床试验前瞻性队列 验证产品转化 推广应用实例 1中中国慢

19、性国慢性乙乙肝患者肝患者肝肝纤维化纤维化无无创诊断创诊断模模型的建型的建立立（Chronic Hepatitis B Score,CHBScore）入组大样本人群所有患者：所有患者：1.40种临床指标完整；种临床指标完整；2.具有肝穿组织；具有肝穿组织；3.病理诊断明确；病理诊断明确；4.METAVIR system；UnpublishedCHBScore诊诊断特异断特异性性和敏和敏感感性高性高UnpublishedCHB patientLSM-FS,PLT,Age,HAStep 1:S1 cut-off-1 cut-off-1F0/F1Step 2:S2 cut-off-2 cut-off-

20、2F2-F4F2F3-F4 cut-off-3 cut-off-3F3Step 3:S3F4基基于于CHBScore的慢的慢性性乙肝肝纤乙肝肝纤维维化化诊诊断流断流程程Unpublished实例 2我我国首个国首个多多功能共功能共享享H B V 基基因因数据库数据库建立了我国首个多功能建立了我国首个多功能共共享享HBV基因数基因数据据库库HBV前前C变异是变异是ACLF患者死亡的独立风险因素患者死亡的独立风险因素发现发现BCP/前前C区多个位点变异率区多个位点变异率 随病情加重递增随病情加重递增发现发现HBV基因型和基因型和BCP/前前C区多个位点区多个位点 特征性变异特征性变异中科院微生物所

21、高福、孟颂东课题组：中科院微生物所高福、孟颂东课题组：鉴定了新的鉴定了新的HBV CTL表位表位HBV基因数据库共基因数据库共享享成果成果北京基因组研究所曾长清课题组：北京基因组研究所曾长清课题组：揭示了我国患者揭示了我国患者HBV多种变异和基多种变异和基因因 型与疾病进展的相关性型与疾病进展的相关性实例 3传染病组织样本库的建立及其应用建立了微量人体组织保存技术建立了微量人体组织保存技术Sci Rep,2016福尔马林固定福尔马林固定病理学分布病理学分布Sci Rep,2016淋巴细胞提取技术淋巴细胞提取技术免疫学特性研究免疫学特性研究基因组保存基因组保存-人组织人组织mRNA表达谱分析表达

22、谱分析/信信号号通路通路分分析析448 genes up-regulated;631 genes down-regulatedHC:healthy control;CHB:chronic hepatitis B.Hepatology,2011,2014BMLPSpleenPBMC114116115NDNDCD117BM,bone marrow;LP,liver perfusion;SI,small intestine;LI,large intestineUnpublishedCD127Gated on CD45+Lin-cells SILI免疫细胞组织分布差异分析免疫细胞组织分布差异分析-区域

23、区域免免疫特性疫特性生物样本库建设是临床医学研究的生物样本库建设是临床医学研究的重重要基础要基础转化医转化医 学的战学的战略资源略资源健康健康研研究和究和 产业产业化化的必的必要因素要因素精准医精准医疗的奠疗的奠 基石基石生物样本库是集成基础研究与临床生物样本库是集成基础研究与临床应应用的用的重重要技要技术术载体载体生物样本库生物样本库提高临床诊疗水平加速基础科学研究搭建转化医学平台提供合作研究平台“存不是目的，用才是存不是目的，用才是王王道道”1比质量、比特色、比转化，不比比质量、比特色、比转化，不比规规模模2尽早转化、越早越好！尽早转化、越早越好！3围绕生物样品库，建立转化医学围绕生物样品库，建立转化医学人人才团才团队队，实现早期转化实现早期转化谢谢谢谢