基因工程药物指南课件.ppt
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- 基因工程 药物 指南 课件
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1、 八、目的基因在受体细胞中的表达v基因表达:结构基因在生物体内的转录、翻译以及所有加工过程。v基因工程中基因的高效表达:外源基因在生物体内的转录、翻译以及所有加工过程真核基因在原核细胞中表达的困难1.细菌细菌RNA聚合酶不能识别真核基因的启动子聚合酶不能识别真核基因的启动子2.mRNA的的SD序列不能与核糖体结合序列不能与核糖体结合3.真核蛋白易被细菌蛋白酶破坏真核蛋白易被细菌蛋白酶破坏几种常见的表达系统v原核表达系统原核表达系统v真核表达系统真核表达系统大肠杆菌大肠杆菌枯草杆菌枯草杆菌酵母酵母哺乳动物细胞哺乳动物细胞昆虫细胞昆虫细胞植物细胞植物细胞(一)原核细胞表达体系v大肠杆菌:最常用的表
2、达形式。v大肠杆菌表达外源基因的优势大肠杆菌表达外源基因的优势全基因组测序,共有全基因组测序,共有4405个开放型阅读框架个开放型阅读框架基因克隆表达系统成熟完善基因克隆表达系统成熟完善繁殖迅速、培养简单、操作方便、遗传稳定繁殖迅速、培养简单、操作方便、遗传稳定被美国被美国FDA批准为安全的基因工程受体生物批准为安全的基因工程受体生物v大肠杆菌表达外源基因的劣势大肠杆菌表达外源基因的劣势大肠杆菌不存在信号肽,产物为胞内产物,提取时需裂解细胞,大肠杆菌不存在信号肽,产物为胞内产物,提取时需裂解细胞,导致产物含大量杂质;导致产物含大量杂质;蛋白产物常为包涵体,需经过复性才能恢复蛋白活性;蛋白产物常
3、为包涵体,需经过复性才能恢复蛋白活性;缺乏对真核生物蛋白质的修饰加工系统,不适用于需糖基化修饰缺乏对真核生物蛋白质的修饰加工系统,不适用于需糖基化修饰的蛋白质;的蛋白质;内源性蛋白酶降解空间构象不正确的异源蛋白;内源性蛋白酶降解空间构象不正确的异源蛋白;翻译常从翻译常从AUG开始,目的蛋白的开始,目的蛋白的N端常多一个甲硫氨酸残基,会端常多一个甲硫氨酸残基,会引起免疫反应;引起免疫反应;细胞周质内含有种类繁多的内毒素。细胞周质内含有种类繁多的内毒素。1、影响目的基因在大肠杆菌中表达的因素A.外源基因的剂量B.外源基因的表达效率启动子的强弱:容易被RNA聚合酶识别并能够稳定结合;核糖体结合位点的
4、有效性;消除相关二级结构。SD序列和起始密码的间距;密码子组成;选择大肠杆菌偏爱的密码子。C.表达产物的稳定性组建融合基因;利用内源或外源信号肽将产物运送到胞间浆周质;改变真核蛋白质二级结构;采用蛋白酶缺陷型大肠杆菌。Ion-营养缺陷型大肠杆菌不能合成黄嘌呤核苷,从而不能合成蛋白酶。D 细胞的代谢负荷外源基因的表达产物可能本身对宿主菌有毒性,或因消耗其氨基酸等营养物质对宿主菌产生间接毒害。解决方案:v将细胞的生长和外源基因的表达分为两个阶段;v将细胞的生长与质粒的表达分开;v蛋白质以包涵体形式存在。E 工程菌的培养条件pCP3拥有一个温度可诱导型的复制子,在28时,每个细胞的质粒拷贝数为60在
5、42时,拷贝数迅速增至300 600。2 真核基因在大肠杆菌中的表达形式 以融合蛋白的形式表达药物基因蛋白质在菌体内比较稳定;融合蛋白本身不能做注射用药;可以通过特殊设计,将两类蛋白分开。v凝血因子Xa专一识别 Ile-Glu-Gly-Arg;vCNBr专一性切割甲硫氨酸。NHCOOH原核序列真核序列v 以非融合蛋白的形式表达药物基因外源基因的表达产物不含细菌多肽序列。v易被细菌蛋白酶降解;v常含有甲硫氨酸,用药时易引起免疫反应。外源基因的结构细菌启动子细菌启动子 SD序列序列AUG结结 构构 基基 因因终止密码终止密码v以分泌型表达蛋白药物的基因外源基因的表达产物在胞质内合成,后被运输至细胞
6、周质,信号肽被信号肽酶识别、切割。v避免被细菌蛋白酶降解;v产物不含有甲硫氨酸;v产量不高;v信号肽不切割或切割位置不正确。外源基因的结构细菌启动子细菌启动子 SD序列序列AUG结结 构构 基基 因因终止密码终止密码信号肽信号肽3 枯草芽孢杆菌枯草芽孢杆菌v优势:分泌能力强,将蛋白质产物分泌到细胞液中,故不产生包涵体;v局限性:具有极强的胞外蛋白酶,对产物进行不同程度的降解;能进行产物的糖基化。4 链霉菌链霉菌v优势:非致病,使用安全;分泌能力强,不形成包涵体;具有糖基化能力;已构建了一系列的表达载体;下游培养工艺成熟。新的外源基因表达体系(二)真核细胞表达体系v酵母:最有效的单细胞真核微生物
7、。常用啤酒酵母。v动物(哺乳动物和昆虫)v植物细胞v酵母表达外源基因的特点:酵母表达外源基因的特点:全基因组测序,基因表达调控机理比较清楚,遗传操作简全基因组测序,基因表达调控机理比较清楚,遗传操作简便;便;大规模发酵历史悠久、技术成熟、工艺简单、成本低廉;大规模发酵历史悠久、技术成熟、工艺简单、成本低廉;成功建立了几种有分泌能力的表达系统;成功建立了几种有分泌能力的表达系统;表达产物可以进行糖基化;具有原核细菌无法比拟的真核表达产物可以进行糖基化;具有原核细菌无法比拟的真核蛋白翻译后加工系统;蛋白翻译后加工系统;不含有特异性的病毒、不产内毒素;不含有特异性的病毒、不产内毒素;酵母菌是最简单的
8、真核模式生物。酵母菌是最简单的真核模式生物。酵母菌的结构酵母菌的结构1 载体的分类:根据载体的复制序列分为四类:v(1)YEp类:复制序列为酵母天然的2m-m-双链环双链环状状质粒质粒成分。拷贝数可高达100-200。v(2)YRp类:非2m-m-来源的自主复制序列(ARS)。拷贝数5-10。v(3)YCp类:非2m-m-来源的自主复制序列(ARS)。含酵母染色体中心粒成分,拷贝数1。(4)YIp类:含有可与酵母染色体重组的序列,整合到酵母染色体中,随酵母染色体一起复制,稳定性好。拷贝数1。v质粒转化酵母通常有两种方式:质粒转化酵母通常有两种方式:碱金属离子(碱金属离子(Li)介导的酵母菌完整
9、细胞的转化介导的酵母菌完整细胞的转化酵母菌电击转化法酵母菌电击转化法v鉴于从大肠杆菌转化和制备质粒比酵母容易的多,鉴于从大肠杆菌转化和制备质粒比酵母容易的多,可向酵母载体中引入大肠杆菌的起始和抗生素筛选可向酵母载体中引入大肠杆菌的起始和抗生素筛选标记,此类克隆载体即可以在细菌中,又可以在酵标记,此类克隆载体即可以在细菌中,又可以在酵母中进行质粒复制和表型选择。母中进行质粒复制和表型选择。2 克隆载体克隆载体3 表达载体v啤酒酵母表达系统啤酒酵母表达系统v乳酸克鲁维酵母表达系统乳酸克鲁维酵母表达系统v巴斯德毕赤酵母表达系统巴斯德毕赤酵母表达系统影响目的基因在酵母菌中表达的因素影响目的基因在酵母菌
10、中表达的因素v1 外源基因的剂量:高拷贝数质粒常会引起细胞生长量降低。v2 外源基因的表达效率:(1)启动子:v组成型启动子:在各个生长时期表达v诱导型启动子:受诱导物或诱导条件的影响酿酒酵母PHO5启动子在培养基中游离磷酸盐耗尽时才能打开;PHO4基因编码产物是PHO5启动子的正调控因子,PHO4温度敏感型突变基因pho4TS的编码产物在35时失活,因此,装在pho4TS-PHO5启动子下游的外源基因在35时关闭,23诱导表达.(2)分泌信号分泌信号的效率:(3)终止序列终止序列的影响的影响:v终止序列保证了转录产物(mRNA)在适当部位终止,并加上polyA尾巴。v常用的终止子有:ADH1
11、,CYC1,MF1,PGK。信号肽信号肽+前导肽前导肽表达产物的运输表达产物的修饰3 外源蛋白的糖基化外源蛋白的糖基化v外源蛋白在酵母细胞中存在两种糖基化形式:N-糖苷键(天冬酰胺连接)和O-糖苷键(丝氨酸或苏氨酸连接),与天然状态下相同。v酵母细胞能够识别这两种糖基化信号,使外源蛋白正确折叠,产生与天然状态相同的蛋白,分泌到胞外。第三节第三节 基因工程菌的不稳定性基因工程菌的不稳定性v一、质粒的不稳定性1 质粒的不稳定分为分裂分裂不稳定和结构结构不稳定2 质粒的不稳定性产生的原因v(1)工程菌的质粒由于分裂的原因而不稳定;工程菌分裂时会产生不含质粒的子代菌,造成质粒的丢失;两种菌的比生长速率
12、有差异。v(2)工程菌质粒结构的不稳定是由于DNA从质粒上丢失、重排、缺失导致工程均性能的改变。二、提高质粒稳定性的方法二、提高质粒稳定性的方法v1 选择合适的宿主菌;v2 选择合适的载体;v3 添加选择压力;对结构不稳定质粒和大规模生产无效。药物和食品生产时禁止使用抗生素药物和食品生产时禁止使用抗生素v4 分阶段控制培养;为提高培养过程中质粒的稳定性,一般采用两阶段法,第一阶段先使菌体生长至一定密度,第二阶段诱导外源基因的表达。在培养基中加入选择性压力如抗生素等,以抑制质粒丢失菌的生长,也是提高质粒稳定性的方法。v5 控制培养条件;采用适当的操作方式可使工程菌生长速率具有优势,并使工程菌和质
13、粒丢失菌生长竞争趋于极端化。可调控的环境参数为温度、pH、培养基组分和溶解氧浓度。通过间隙供氧和改变稀释速率都可以提高质粒的稳定性。v6 固定化:固定化载体有海藻酸胶、卡拉胶、明胶、甲壳素等。固定化培养大肠杆菌W3110(pTG201)240代没有测到质粒丢失。二、提高质粒稳定性的方法二、提高质粒稳定性的方法培养基组成:限制培养基比丰富培养基更有利于稳定培养基组成:限制培养基比丰富培养基更有利于稳定培养温度:培养温度:较低的培养温度有利于重组质粒的稳定较低的培养温度有利于重组质粒的稳定固定化方法固定化方法酶的固定化方法有下述4种:吸附法,包埋法,共价键结合法,交联法EEEEEEEEEEEEEE
14、EEEEE吸附法共价结合法交联法包埋法固定化菌体概念:把菌体细胞中特定的酶不经过分固定化菌体概念:把菌体细胞中特定的酶不经过分离提纯离提纯直接用适当的方法将菌体加以固定来催化各种特定直接用适当的方法将菌体加以固定来催化各种特定的生物化学反应。的生物化学反应。优点优点:不需提制酶,可保持酶的活性。反复使用,成:不需提制酶,可保持酶的活性。反复使用,成 本低本低与固定化酶比较与固定化酶比较制备方法制备方法:与固定化酶相同,有与固定化酶相同,有包埋法、载包埋法、载体结合法、交联法、热处理法、射线处理法体结合法、交联法、热处理法、射线处理法。其中其中包埋法是最理想的方法包埋法是最理想的方法。一 包埋法
15、1 1 原理原理 在菌体细胞本身不发生化学反应的情况下,将其在菌体细胞本身不发生化学反应的情况下,将其 包进包进半透性的多聚物膜半透性的多聚物膜内内。小分子的底物和产物均可小分子的底物和产物均可 自由出入自由出入,而,而菌体细胞却不会漏出菌体细胞却不会漏出。2 2 方法方法常用的包埋材料常用的包埋材料是是:聚丙烯酰胺凝胶、明胶、琼脂聚丙烯酰胺凝胶、明胶、琼脂以制备含天门冬氨酸的大肠杆菌细胞为例以制备含天门冬氨酸的大肠杆菌细胞为例将菌体细胞预先用生理盐水悬浮,向悬浮液中加入聚将菌体细胞预先用生理盐水悬浮,向悬浮液中加入聚丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺,然后加入催化剂过硫酸丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺,然后
16、加入催化剂过硫酸胺和加速剂四甲基乙二胺,混匀后放置一定时间聚合胺和加速剂四甲基乙二胺,混匀后放置一定时间聚合。将得到的凝胶破碎即得到固定化细胞。收率达。将得到的凝胶破碎即得到固定化细胞。收率达72.572.5包埋法制备固定化菌体应用举例包埋材料包埋材料菌种菌种酶系酶系用途用途 琼脂琼脂大肠杆菌大肠杆菌大肠杆菌大肠杆菌谷氨酸脱羧酶谷氨酸脱羧酶青霉素酰胺酶青霉素酰胺酶制造制造-酪蛋白酪蛋白 生产生产6-6-氨基青霉烷酸氨基青霉烷酸(6-(6-APA)APA)明胶戊二醛明胶戊二醛短乳杆菌短乳杆菌链霉菌链霉菌葡萄糖异构酶葡萄糖异构酶从葡萄糖生产高果糖浆从葡萄糖生产高果糖浆聚丙烯酰胺聚丙烯酰胺大肠杆菌大
17、肠杆菌天门冬氨酸酶天门冬氨酸酶醋酸纤维素醋酸纤维素大肠杆菌大肠杆菌青霉素酰胺酶青霉素酰胺酶(裂解)(裂解)青霉素酰胺酶青霉素酰胺酶(合成)(合成)生产生产6 6APAAPA生产半合成青霉素生产半合成青霉素二 载体结合法(吸附法)1 1 原理原理 微生物细胞表面带有电荷,在适当的条件下可以微生物细胞表面带有电荷,在适当的条件下可以 与载体的离子交换基团形成络合物或吸附在载体上。与载体的离子交换基团形成络合物或吸附在载体上。2 2 常用载体常用载体离子交换纤维素。阴离子树脂、离子交换纤维素。阴离子树脂、DEAEDEAE纤维素。纤维素。3 3 优缺点优缺点 优点:方法简单、载体易于再生。优点:方法简
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