基因工程大实验课件.ppt
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- 基因工程 实验 课件
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1、实验实验 一、一、大肠杆菌感受态细胞的制备大肠杆菌感受态细胞的制备实验实验 二、二、大肠杆菌感受态细胞的转化大肠杆菌感受态细胞的转化实验实验 一、一、碱变性法抽提质粒碱变性法抽提质粒DNA实验实验 四、四、DNA的纯度、浓度及分子量的测定的纯度、浓度及分子量的测定实验实验 五、五、DNA的酶切、连接与转化的酶切、连接与转化实验实验 六、六、动物基因动物基因组组DNA的提取和检测的提取和检测实验实验 七、七、植物基因组植物基因组DNA的提取和检测的提取和检测实验实验 八、八、聚合酶链式反应实验聚合酶链式反应实验-随机扩增随机扩增 多态性多态性DNA分析分析实验目的实验目的相关知识及原理相关知识及
2、原理仪器、材料和试剂仪器、材料和试剂操作步骤操作步骤实验结果实验结果仪器、材料和试剂仪器、材料和试剂v仪器仪器 琼脂糖凝胶电琼脂糖凝胶电 泳系统泳系统 凝胶成像系统凝胶成像系统 紫外紫外-可见分光光可见分光光 度计度计v材料材料 pUC18pUC18v试剂试剂 DNA MarkerDNA Marker TAE/TBE TAE/TBE缓冲液缓冲液 点样缓冲液点样缓冲液 溴化乙锭(溴化乙锭(EBEB)琼脂糖琼脂糖实验结果实验结果v l ll l操作步骤操作步骤vDNADNA分子量测定分子量测定 (1 1)琼脂糖凝胶的制备)琼脂糖凝胶的制备 取取0.70.7g g 琼脂糖,放入锥形瓶中,加琼脂糖,放
3、入锥形瓶中,加100100ml ml 0.5 0.5倍倍TBE/TAETBE/TAE缓冲液,置微波炉加热至完全溶缓冲液,置微波炉加热至完全溶 化,取出摇匀,则为化,取出摇匀,则为0.7%0.7%琼脂糖凝胶。待凝胶琼脂糖凝胶。待凝胶 冷却至冷却至60 60,加入,加入EBEB,使终浓度为使终浓度为0.50.5g/mlg/ml。(2 2)胶板的制备)胶板的制备 将有机玻璃内槽、梳子等洗净烘干。将有机玻璃内槽、梳子等洗净烘干。将有机玻璃放置于凝胶槽内,并放好梳子。将有机玻璃放置于凝胶槽内,并放好梳子。将将6060左右的琼脂糖凝胶液缓慢而连续地左右的琼脂糖凝胶液缓慢而连续地 倒入有机玻璃内槽,直至有机
4、玻璃板上形成一层倒入有机玻璃内槽,直至有机玻璃板上形成一层 均匀的胶板(注意:若有气泡产生,用小枪头吸均匀的胶板(注意:若有气泡产生,用小枪头吸出)。出)。待胶凝固后,取出梳子(竖直、迅速待胶凝固后,取出梳子(竖直、迅速 拔出),取有机玻璃内槽(带胶板),放在拔出),取有机玻璃内槽(带胶板),放在 电泳槽内。电泳槽内。加电泳缓冲液至稍没过胶面(不要太加电泳缓冲液至稍没过胶面(不要太 多或太少)。多或太少)。(3 3)加样)加样 用移液枪将样品用移液枪将样品DNADNA与上样缓冲液混匀。与上样缓冲液混匀。操作步骤操作步骤 将吸有混合液的枪头缓慢插入加样孔液面将吸有混合液的枪头缓慢插入加样孔液面
5、以下,缓慢将液体加入(注意:加样后枪头离开以下,缓慢将液体加入(注意:加样后枪头离开 液面后再松开枪)。液面后再松开枪)。注意:记录点样顺序及点样量注意:记录点样顺序及点样量 (4 4)电泳)电泳 接通电泳槽与电泳仪的电源(接通电泳槽与电泳仪的电源(DNADNA带负电)。带负电)。当溴酚蓝染料移动到距胶前沿当溴酚蓝染料移动到距胶前沿1212cmcm处,停处,停 止电泳止电泳。实验实验 八、聚合酶链式反应实验八、聚合酶链式反应实验 随机扩增多态性随机扩增多态性DNADNA分析分析实验目的实验目的学习掌握PCR反应的基本原理与实验技术学习掌握PCR仪的使用方法相关知识及原理相关知识及原理 聚合酶链
6、式反应(聚合酶链式反应(polymerasepolymerase chain chain reaction,PCRreaction,PCR)的原理类似于的原理类似于DNADNA的天然复的天然复 制过程。在待扩增的制过程。在待扩增的DNADNA片段两侧和与两侧片段两侧和与两侧 互补的两个寡核苷酸引物,经变性、退火互补的两个寡核苷酸引物,经变性、退火 和延伸若干个循环后,和延伸若干个循环后,DNADNA扩增扩增2 2n n倍。倍。操作步骤操作步骤1 1、在、在0.20.2m L Eppendorfm L Eppendorf管内配置管内配置2020LL反应体系:反应体系:反应物反应物 体积体积/LL
7、 ddH ddH2 2O 1 2O 1 2 10 10 PCR PCR缓冲缓冲 2.02.0 2.5 2.5 mmolmmol/L/L dNTP dNTP 2.02.0 随机引物随机引物 1.01.0 模版模版DNA 2.0DNA 2.0 Taq Taq酶酶 1.0 1.0(1 1U U)点动混匀,加点动混匀,加10 10 LL矿物油。矿物油。操作步骤2 2、按下述程序进行扩增反应条件:、按下述程序进行扩增反应条件:(1 1)9494C C 预变性预变性 4 4minmin;(2 2)9494C C 变性变性 3030secsec;(3 3)3636C C 退火退火 4040secsec;(4
8、 4)7272C C 延伸延伸 100100s s;(5 5)重复步骤(重复步骤(2 2)(4 4)3535次;次;(6 6)7272C C 延伸延伸 7 7minmin。操作步骤操作步骤3 3、琼脂糖凝胶电泳分析琼脂糖凝胶电泳分析PCRPCR结果配置结果配置1.4%1.4%琼琼 脂糖凝胶,取脂糖凝胶,取10 10 LL扩增产物电泳。扩增产物电泳。实验结果实验结果实验实验 六、动物基因组六、动物基因组DNADNA 的提取和检测的提取和检测实验目的实验目的相关知识及原理相关知识及原理仪器、材料和试剂仪器、材料和试剂操作步骤操作步骤实验结果实验结果实验目的实验目的 学习掌握从动物组织提取基因组学习
9、掌握从动物组织提取基因组 DNA的原理和方法,以及相对分的原理和方法,以及相对分 子质量较大的子质量较大的DNA的琼脂糖凝胶的琼脂糖凝胶 电泳技术。电泳技术。相关知识及原理相关知识及原理 在在EDTAEDTA和和SDSSDS等去污剂存在下,用蛋等去污剂存在下,用蛋 白酶白酶K K消化细胞,随后用酚抽提,可以得消化细胞,随后用酚抽提,可以得 到哺乳动物基因组到哺乳动物基因组DNADNA,用此方法得到的用此方法得到的 DNADNA长度为长度为100100150150kbkb,适用于适用于噬菌体噬菌体 构建基因组文库和构建基因组文库和SouthernSouthern分析。分析。仪器、材料和试剂仪器、
10、材料和试剂仪器仪器 台式离心机台式离心机 玻璃匀浆器玻璃匀浆器 高压灭菌锅高压灭菌锅 恒温水浴器恒温水浴器材料材料 兔肝兔肝试剂试剂 蛋白酶蛋白酶K K 组织匀浆液组织匀浆液 酶解液酶解液 RNARNA酶酶 TETE溶液溶液实验结果实验结果提取的提取的DNADNA应为一条带应为一条带实验实验 七、植物基因组七、植物基因组DNADNA 的提取和检测的提取和检测实验目的实验目的相关知识及原理相关知识及原理仪器、材料和试剂仪器、材料和试剂操作步骤操作步骤实验结果实验结果实验目的实验目的学习掌握从植物组织中提取DNA的 方法学习掌握液氮的使用相关知识及原理相关知识及原理 利用液氮对植物组织进行研磨破碎
11、利用液氮对植物组织进行研磨破碎 细胞。细胞提取液中含有的细胞。细胞提取液中含有的SDSSDS溶解膜蛋溶解膜蛋 白而破坏细胞膜,使蛋白变性而沉淀下白而破坏细胞膜,使蛋白变性而沉淀下 来。来。EDTAEDTA抑制抑制DNADNA酶的活性。再用酚、氯酶的活性。再用酚、氯 仿提取的方法去除蛋白,得到的仿提取的方法去除蛋白,得到的DNADNA溶液溶液 经乙醇沉淀。经乙醇沉淀。仪器、材料和试剂仪器、材料和试剂仪器仪器 低温离心机低温离心机 恒温水浴器恒温水浴器 台式离心机台式离心机 琼脂糖凝胶系统琼脂糖凝胶系统材料材料 试剂试剂 CTABCTAB提取缓冲液提取缓冲液 TETE实验步骤实验步骤 CTABCT
12、AB提取法:提取法:(1 1)称取)称取0.50.5克植物材料放入预冷至克植物材料放入预冷至-20-20的研钵中的研钵中 (提前灭菌),加入少量石英沙,再倒入液氮(提前灭菌),加入少量石英沙,再倒入液氮 (分批加入分批加入),研成粉末状,置于灭菌的,研成粉末状,置于灭菌的1010mlml离离 心管心管 中。中。(2 2)加入加入2 2ml 65ml 65预热的预热的CTABCTAB提取缓冲提取缓冲液液充分混匀充分混匀 后在后在6565保温保温9090minmin;实验步骤实验步骤 CTABCTAB提取缓冲液提取缓冲液:2%2%(w/vw/v)十六烷基三甲基溴化铵(十六烷基三甲基溴化铵(CTAB
13、CTAB):1.4M NaCl 1.4M NaCl;20mM EDTApH8.020mM EDTApH8.0;100Mm 100Mm TrisTris-HCl HCl pH8.0 pH8.0;2%(2%(w/vw/v)聚乙烯吡咯烷酮(聚乙烯吡咯烷酮(PVPPVP););5%5%(v/vv/v)巯基乙醇(使用前加入)巯基乙醇(使用前加入)(3)加入等体积氯仿:异戊醇(24:1)充分摇 匀后,4 6000r/min离心15 min。实验步骤实验步骤(4)用扩口吸头取上清液移入另一10ml离心管中,加入2/3体积-20预冷的异丙醇,轻轻颠倒摇 匀后,-20放置20min,在冷冻离心机上于 4 500
14、0r/min离心10 min,缓慢倾倒出上清 液。(5)在沉淀中加入1ml65预热的CTAB提取缓冲液 ,温浴1h,待沉淀充分溶解后,加入等体积氯 仿:异戊醇,充分混匀,4 6000r/min离心 10 min。实验步骤实验步骤(6)重复第4步;(7)用70%乙醇洗沉淀两次,在室温晾干,加入200l TE缓冲液溶解 DNA 2h。(8)配制0.7%的琼脂糖凝胶电泳分析,取 5l的样品电泳。实验结果提取的DNA应为靠近点样孔的一条带,操作步骤操作步骤1、取0.4g兔肝,用冰冷的生理盐水洗3次,然后 置于4ml匀浆液中,用玻璃匀浆器匀浆至无明 显组织块存在(冰浴操作)。2、将组织细胞移至10ml离
15、心管中,4 4000 rpm离心1.5min,弃上清。3、沉淀加1ml无菌水迅速吹散,再加1ml酶解液,翻转混匀(动作一定要轻)55水浴处理12 18h。操作步骤操作步骤4、加RNase至终浓度100g/m(222l),37水 浴2h。5、加入等体积酚(约2ml)抽提一次,(慢慢旋转 混匀,水平摇床摇10min),4 8000 rpm离 心10min。6、用扩口吸头移出含DNA的 水相(注意勿吸出 双相界面蛋白层),加等体积(约2ml)氯仿:异戊醇(24:1)4 10min,8000 rpm离心 10min。(有时如果DNA含量过高,水相在下 层,实验时注意观察)操作步骤操作步骤7、用扩口吸头
16、小心吸出上层含DNA的水相,移入 10ml离心管,加入250l 5mol/l NaCI(终浓 度0.1-0.25mol/l),小心混匀(要充分),在向每管中加入2.5倍体积(约6ml)的无水乙 醇-20 2h。8、12000rpm离心15min,弃上清,70%冷乙醇洗 涤一次,12000rpm离心15min,室温干燥,加入100l TE缓冲液,轻摇混匀,存放4 过夜(或2h)。9、电泳鉴定(0.7%的琼脂糖凝胶)。仪器、材料和试剂仪器、材料和试剂仪器 PCR仪 琼脂糖凝胶电泳系统材料 兔基因组DNA 随机引物 试剂 PCR缓冲(10)dNTP Taq酶 矿物油实验五、实验五、DNADNA的酶切
17、、连接的酶切、连接 与转化与转化实验目的实验目的相关知识及原理相关知识及原理仪器、材料和试剂仪器、材料和试剂操作步骤操作步骤实验结果实验结果实验目的实验目的v学习掌握重组学习掌握重组DNADNA连接以及鉴定重连接以及鉴定重组子的方法。组子的方法。v学习掌握学习掌握X-gal X-gal 等试剂的配制保存。等试剂的配制保存。v重组子重组子vT4T4噬菌体噬菌体DNADNA连接酶催化连接酶催化DNADNA连接反应连接反应:(1 1)酶)酶 +ATP=ATP=酶酶-AMPAMP复合物复合物 (2 2)酶)酶-AMPAMP复合物结合复合物结合DNADNA切口上,使切口上,使 DNADNA腺苷化腺苷化
18、(3 3)形成新的磷酸二酯键,封闭切口)形成新的磷酸二酯键,封闭切口v蓝白斑选择蓝白斑选择(XgalXgal 、IPTG IPTG)、)、互补互补仪器、材料和试剂仪器、材料和试剂v仪器仪器 电热恒温水浴电热恒温水浴 台式台式/低温离心机低温离心机 恒温摇床恒温摇床 恒温培养箱恒温培养箱 恒温水浴恒温水浴v材料材料 DH5DH5、TOP10TOP10 pUC18/19 pUC18/19 植物植物DNADNAv试剂试剂 X-gal IPTG X-gal IPTG BamHIBamHI T T4 4DNADNA连接酶连接酶操作步骤操作步骤v制备重组制备重组DNA DNA(1 1)在灭菌的在灭菌的Ep
19、pendorfEppendorf管(管(0.0.5ml5ml)中中,加入加入15l 15l pUC18,2l pUC18,2l酶切缓冲液,酶切缓冲液,1l1l(2U2U)BamHIBamHI酶酶,2l BSA 2l BSA (酶和缓冲液放在冰上酶和缓冲液放在冰上),),混合物总体混合物总体 积积2020ll,离心混匀离心混匀,37 37 反应反应3h3h。(2 2)在另一无菌管中,加入植物在另一无菌管中,加入植物DNA 1.5gDNA 1.5g,1l1l 酶切缓冲液,酶切缓冲液,1 1ll(2U2U)BamHIBamHI酶酶,2l BSA 2l BSA ,无菌水无菌水6 6.5l.5l,混合物
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