影像组学的临床应用研究-课件.ppt
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1、影像组学的临床应用研究郭小芳郭小芳1PPT课件 主要内容 概念 处理流程 影像组学的临床应用 影像组学的优势2PPT课件结构成像结构成像功能成像功能成像 分子生物学分子生物学分子影像学分子影像学数字化医学影像学数字化医学影像学基因组学基因组学影像组学影像组学radiomics医学影像学医学影像学3PPT课件4PPT课件5PPT课件一、概 念最早由荷兰学者在最早由荷兰学者在2012年提出;年提出;指从影像(指从影像(CT、MRI、PET等)中高通量地提取大量影像信息,实现肿等)中高通量地提取大量影像信息,实现肿瘤分割、特征提取与模型建立,凭借对海量影像数据信息进行更深层瘤分割、特征提取与模型建立
2、,凭借对海量影像数据信息进行更深层次的挖掘、预测和分析来辅助医师做出最准确的诊断。次的挖掘、预测和分析来辅助医师做出最准确的诊断。直观地理解为将直观地理解为将视觉影像信息视觉影像信息转化为深层次的特征来进行转化为深层次的特征来进行量化量化研究。研究。6PPT课件大数据定义:一种规模大到在获取、存储、管理和分析等方面都定义:一种规模大到在获取、存储、管理和分析等方面都大大超出了传统数据库软件工具能力范围的数据范围。大大超出了传统数据库软件工具能力范围的数据范围。主要特征:主要特征:“4V”Volume:海量的数据规模:海量的数据规模Velocity:快速的数据流转:快速的数据流转Variety:
3、多样的数据类型:多样的数据类型Value:价值大,价值密度低:价值大,价值密度低 7PPT课件影像组学利用大数据挖掘技术定量肿瘤异质影像组学利用大数据挖掘技术定量肿瘤异质性,实现精准诊疗决策,提高患者的生存期性,实现精准诊疗决策,提高患者的生存期8PPT课件二、处理流程(1)影像数据的获取;)影像数据的获取;(2)图像的分割与绘制;)图像的分割与绘制;(3)特征的提取和量化;)特征的提取和量化;(4)影像数据库的建立;)影像数据库的建立;(5)分类和预测。)分类和预测。9PPT课件 影像数据的获取影像数据的获取 入组数据需要具有相同或相似的采集参数,入组数据需要具有相同或相似的采集参数,保证数
4、据不会受到机型、参数的影响。保证数据不会受到机型、参数的影响。CT:可能是最为直接且最容易进行比对的,信号强度能与组织密可能是最为直接且最容易进行比对的,信号强度能与组织密度联系起来度联系起来 PET-CT:主要的挑战是对示踪剂计量的校对和代谢容量或主要的挑战是对示踪剂计量的校对和代谢容量或VOI的的重建问题重建问题 MRI:磁共振影像信号强度变量,来源于组织各种内在固有属性磁共振影像信号强度变量,来源于组织各种内在固有属性复杂的相互作用复杂的相互作用10PPT课件NSCLC肿瘤中,影像组学特征的可变性与不同的肿瘤中,影像组学特征的可变性与不同的CT扫描的图像有关。应考虑扫描的图像有关。应考虑
5、这些相互扫描的差异,并在未来的研究中尽量减少它们的影响。这些相互扫描的差异,并在未来的研究中尽量减少它们的影响。Measuring Computed Tomography Scanner Variability of Radiomics Features异质性优化框架(异质性优化框架(HOF)降低由于采集降低由于采集MR图像的仪器、方案的不同对肿图像的仪器、方案的不同对肿瘤的异质性分析所造成的影响。瘤的异质性分析所造成的影响。质控指南的开发:质控指南的开发:影像特征影像特征(分辨率、重建以及参数获取分辨率、重建以及参数获取)临床参数临床参数(疾病阶段、疾病的类型和结果疾病阶段、疾病的类型和结果
6、)大数据大数据11PPT课件 图像的分割与绘制图像的分割与绘制 将图像分割为感兴趣容量将图像分割为感兴趣容量(volumes-of-interest VOI)人工手动人工手动:精度最高精度最高,费时费力,重复性低,费时费力,重复性低 半自动:半自动:速度提高速度提高,准确性较低,依赖操作者经验,准确性较低,依赖操作者经验 自动:自动:重复性好重复性好,研究阶段研究阶段12PPT课件13PPT课件 图像分割算法图像分割算法 基于阈值的分割方法:广泛基于阈值的分割方法:广泛 基于边缘的分割方法基于边缘的分割方法 基于区域的分割方法基于区域的分割方法14PPT课件 特征提取与量化特征提取与量化 广义
7、:通过变换的方法用低维空间表示高维度特征数据;广义:通过变换的方法用低维空间表示高维度特征数据;狭义:将狭义:将ROI分割完成后,就可以对其进行特征提取。分割完成后,就可以对其进行特征提取。特征:特征:常见描述病变的术语(形状、大小、密度、边缘等)常见描述病变的术语(形状、大小、密度、边缘等)病变定性的描述病变定性的描述 通过计算机分析提取的不可视特征(直方图、纹理、分形通过计算机分析提取的不可视特征(直方图、纹理、分形维等)维等)定量描述病变的异质性(肿瘤)定量描述病变的异质性(肿瘤)15PPT课件16PPT课件 数据库的建立与共享数据库的建立与共享 个体化数据分析个体化数据分析17PPT课
8、件 在分析定量在分析定量Radiomics特征时特征时,需要考虑影像采集参数不需要考虑影像采集参数不同、呼吸运动位移带来的干扰同、呼吸运动位移带来的干扰,使用合理的方法使用合理的方法筛选抗筛选抗噪声能力强的噪声能力强的Radiomics特征特征,并通过调整参数并通过调整参数,提高影提高影像特征的稳定性。像特征的稳定性。ROI的勾画应具有较好的的勾画应具有较好的可重复性及准确性可重复性及准确性。模型的建立应通过努力扩大样本数量、选择合适的机器模型的建立应通过努力扩大样本数量、选择合适的机器学习演算法学习演算法,提高预测效能、提高预测效能、尽量降低过拟合风险尽量降低过拟合风险。Radiomics的
9、研究结果必须具有可重复性的研究结果必须具有可重复性,得到多中心研得到多中心研究的验证。为了实现较高的可靠性与可重复性究的验证。为了实现较高的可靠性与可重复性,在在Radiomics研究流程的各个步骤和临床上研究流程的各个步骤和临床上,均有不同的困均有不同的困难需要克服难需要克服。18PPT课件三、影像组学的临床应用 1、良恶性病变的鉴别诊断及肿瘤分期、良恶性病变的鉴别诊断及肿瘤分期 辅助诊断肺结节的良恶性辅助诊断肺结节的良恶性:Radiomics可以提高肺部结节可以提高肺部结节诊断的准确性。诊断的准确性。与良性结节相比与良性结节相比,恶性结节的恶性结节的CT密度直方图具有更高的峰密度直方图具有
10、更高的峰度和更低的偏度度和更低的偏度,ROC曲线下面积曲线下面积0.710.83。利用肺结节。利用肺结节的分形维度可以将肺癌与肺炎、结核区分开。综合利用形的分形维度可以将肺癌与肺炎、结核区分开。综合利用形状、大小、直方图特征状、大小、直方图特征,可以将判断结节良恶性质的可以将判断结节良恶性质的ROC曲线下面积从曲线下面积从0.79提高到提高到0.84Radiomics of Lung Nodules:A Multi-Institutional Study of Robustness and Agreement of Quantitative Imaging FeaturesRadiologic
11、al Image traits Predictive of Cancer Status in Pulmonary NodulesEffects of contrast-enhancement,reconstruction slice thickness and convolution kernel on the diagnostic performance of radiomics signature in solitary pulmonary noduleA Clinical Model To Estimate the Pretest Probability of Lung Cancer i
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