第一章绪论蛋白质的结构和功能课件.ppt
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- 第一章 绪论 蛋白质 结构 功能 课件
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1、 延安大学医学院延安大学医学院 生物化学教研室生物化学教研室 生物化学w生命的化学,应用化学的理论、技术及生命的化学,应用化学的理论、技术及物理学、免疫学等原理和方法研究生物物理学、免疫学等原理和方法研究生物体(植物、动物、微生物、人体等)的体(植物、动物、微生物、人体等)的化学组成和生命过程中化学变化规律的化学组成和生命过程中化学变化规律的一门基础生命科学。一门基础生命科学。w分子生物学分子生物学 是从生物化学、生物物理学、是从生物化学、生物物理学、遗传学、微生物学等多种学科经过相互杂遗传学、微生物学等多种学科经过相互杂交、相互渗透而形成的,主要研究核酸和交、相互渗透而形成的,主要研究核酸和
2、蛋白质等生物大分子的结构及其在遗传信蛋白质等生物大分子的结构及其在遗传信息传递和细胞信息转导过程中的作用。息传递和细胞信息转导过程中的作用。生物化学发展史:生物化学发展史:w叙述生物化学阶段叙述生物化学阶段(2020世纪世纪2020年代以前)年代以前)以分析和研究组成生物体的成分及生物以分析和研究组成生物体的成分及生物体的分泌物和排泄物为主。体的分泌物和排泄物为主。w动态生物化学阶段动态生物化学阶段(2020世纪世纪2020年代至年代至5050年代)年代)主要研究体内各种物质的合成和分解途主要研究体内各种物质的合成和分解途径及动态平衡。径及动态平衡。w机能生物化学阶段机能生物化学阶段(近(近5
3、050多年)多年)探讨生物大分子的结构和机能的关系。探讨生物大分子的结构和机能的关系。第第 一一 篇篇 生物大分子的结构与功能生物大分子的结构与功能 构件分子构件分子 生物大分子生物大分子 细胞器细胞器 细胞细胞 组织器官组织器官 生物体生物体 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能第第 一一 章章Structure and Function of Protein一、什么是蛋白质一、什么是蛋白质?蛋白质蛋白质(protein)(protein)是由许多氨基酸是由许多氨基酸(amino acids)(amino acids)通过肽键通过肽键(peptide bond)(peptide bond)相
4、相连形成的高分子含氮化合物。连形成的高分子含氮化合物。二、蛋白质的生物学重要性二、蛋白质的生物学重要性1.1.蛋白质是生物体重要组成成分蛋白质是生物体重要组成成分分布广:分布广:所有器官、组织都含有蛋白所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。质;细胞的各个部分都含有蛋白质。含量高:含量高:是细胞内最丰富的有机分子,是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的占人体干重的4545,某些组织含量更高,某些组织含量更高,例如脾、肺及横纹肌等高达例如脾、肺及横纹肌等高达8080。1 1)作为生物催化剂(酶)作为生物催化剂(酶)2 2)代谢调节作用)代谢调节作用3 3)免疫保护作用)免疫保护作
5、用4 4)物质的转运和存储)物质的转运和存储5 5)运动与支持作用)运动与支持作用6 6)参与细胞间信息传递)参与细胞间信息传递2.2.蛋白质重要的生物学功能蛋白质重要的生物学功能3.3.氧化供能氧化供能蛋蛋 白白 质质 的的 分分 子子 组组 成成The Molecular Component of Protein第第 一一 节节 组成蛋白质的元素组成蛋白质的元素 主要有主要有C C、H H、O O、N N和和S S。有些蛋白质含有少量有些蛋白质含有少量磷磷或金属元素或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质,个别蛋白质还含有还含有碘碘 。各种蛋白质的含氮量很接近,平
6、均为各种蛋白质的含氮量很接近,平均为1616 由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测定生物样品中的含氮量,就可以此,只要测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:100克样品中蛋白质的含量克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数每克样品含氮克数 6.251001/16%蛋白质元素组成的特点蛋白质元素组成的特点一、氨基酸一、氨基酸 组成蛋白质的基本单位组成蛋白质的基本单位存在自然界中的氨基酸有存在自然界中的氨基酸有300300余种,余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有但组成人体蛋白质的氨基酸仅
7、有2020种,种,且均属且均属 L-L-氨基酸氨基酸(甘氨酸除外)。(甘氨酸除外)。H甘氨酸甘氨酸CH3丙氨酸丙氨酸L-L-氨基酸的通式氨基酸的通式RC+NH3COO-H极性中性氨基酸极性中性氨基酸非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸酸性氨基酸酸性氨基酸碱性氨基酸碱性氨基酸(一)氨基酸的分类(一)氨基酸的分类甘氨酸甘氨酸 glycine Gly G 5.97丙氨酸丙氨酸 alanine Ala A 6.00缬氨酸缬氨酸 valine Val V 5.96亮氨酸亮氨酸 leucine Leu L 5.98 异亮氨酸异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02 苯丙氨酸苯丙氨酸 pheny
8、lalanine Phe F 5.48脯氨酸脯氨酸 proline Pro P 6.301.非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸目目 录录色氨酸色氨酸 tryptophan Try W 5.89丝氨酸丝氨酸 serine Ser S 5.68酪氨酸酪氨酸 tyrosine Tyr Y 5.66 半胱氨酸半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07 蛋氨酸蛋氨酸 methionine Met M 5.74天冬酰胺天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41 谷氨酰胺谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65 苏氨酸苏氨酸 threonine Thr T 5.602.2.极性中
9、性氨基酸极性中性氨基酸目目 录录天冬氨酸天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97谷氨酸谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22赖氨酸赖氨酸 lysine Lys K 9.74精氨酸精氨酸 arginine Arg R 10.76组氨酸组氨酸 histidine His H 7.593.3.酸性氨基酸酸性氨基酸4.4.碱性氨基酸碱性氨基酸目目 录录几种特殊氨基酸几种特殊氨基酸 脯氨酸脯氨酸(亚氨基酸)(亚氨基酸)CH2CHCOO-NH2+CH2CH2CH2CHCOO-NH2+CH2CH2 半胱氨酸半胱氨酸 +胱氨酸胱氨酸二硫键二硫键-HH(二)氨基酸的理化性质(
10、二)氨基酸的理化性质1.1.两性解离及等电点两性解离及等电点氨基酸是两性电解质,其解离程度氨基酸是两性电解质,其解离程度和带电性质取决于其所处溶液的酸碱度。和带电性质取决于其所处溶液的酸碱度。等电点等电点(isoelectric point,pI)(isoelectric point,pI)在某一在某一pHpH的溶液中,氨基酸解离的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的的pHpH值值称为该氨基酸的称为该氨基酸的等电点等电点。pH=pI+OH-pHpI+H+OH-+H+pHpI氨基酸
11、兼性离子氨基酸兼性离子 阳离子阳离子阴离子阴离子CHNH3+COO-R CHNH3+COO-RCHNH2COO-R CHNH2COO-RCH COOHRNH3+CH COOHRNH3+2.2.紫外吸收紫外吸收 色氨酸、酪氨酸色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰分别的最大吸收峰分别280nm280nm和和275nm275nm 附近。附近。大多数蛋白质含大多数蛋白质含有这两种氨基酸残基,有这两种氨基酸残基,所以测定蛋白质溶液所以测定蛋白质溶液280nm280nm的光吸收值是的光吸收值是分析溶液中蛋白质含分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。量的快速简便的方法。3.3.茚三酮反应茚三酮反应 氨基酸与茚三酮水合
12、物共热,可生氨基酸与茚三酮水合物共热,可生成成蓝紫色蓝紫色化合物,其最大吸收峰在化合物,其最大吸收峰在570nm570nm处。由于此吸收峰值与氨基酸的处。由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比关系,因此可作为氨基酸含量存在正比关系,因此可作为氨基酸定量分析方法。定量分析方法。二、肽二、肽 肽键肽键(peptide bond)(peptide bond)是由一个氨基是由一个氨基酸的酸的-羧基与另一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的-氨氨基脱水缩合而形成的化学键。基脱水缩合而形成的化学键。(一)肽(一)肽(peptide)(peptide)NH2-CH-CHOOH甘甘氨氨酸酸NH2-CH-CHOOH甘甘
13、氨氨酸酸NH-CH-CHOHO OH甘甘氨氨酸酸+-HOH甘氨酰甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽键NH2-CH-C-N-CH-COOHHHHONH2-CH-C-N-CH-COOHHHHO 肽肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。化合物。两分子氨基酸缩合形成两分子氨基酸缩合形成二肽二肽,三分子,三分子氨基酸缩合则形成氨基酸缩合则形成三肽三肽 肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为团不全,被称为氨基酸残基氨基酸残基(residue)(residue)。由十个以内氨基酸相连而成的肽称为由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽寡肽(oligo
14、peptide)(oligopeptide),由更多的氨基,由更多的氨基酸相连形成的肽称酸相连形成的肽称多肽多肽(polypeptide)(polypeptide)。N N 末端:有末端:有自由氨基自由氨基的一端的一端C C 末端:有末端:有自由羧基自由羧基的一端的一端多肽链有两端多肽链有两端 多肽链多肽链(polypeptide chain)(polypeptide chain)是指许多是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。构。N末端末端C末端末端牛核糖核酸酶牛核糖核酸酶(二)(二)几种生物活性肽几种生物活性肽 1.1.谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathi
15、one,GSH)(glutathione,GSH)GSH过氧过氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还原酶还原酶NADPH+H+NADP+体内许多激素属寡肽或多肽体内许多激素属寡肽或多肽 神经肽神经肽(neuropeptide)(neuropeptide)2.2.多肽类激素及神经肽多肽类激素及神经肽蛋蛋 白白 质质 的的 分分 子子 结结 构构The Molecular Structure of Protein 第第 二二 节节蛋白质的分子结构包括蛋白质的分子结构包括 一级结构一级结构(primary structure)(primary structure)二级结构二级
16、结构(secondary structure)(secondary structure)三级结构三级结构(tertiary structure)(tertiary structure)四级结构四级结构(quaternary structure)(quaternary structure)高高 级级 结结 构构定义定义 指多肽链中氨基酸的排列顺序。指多肽链中氨基酸的排列顺序。一、蛋白质的一级结构一、蛋白质的一级结构主要的化学键主要的化学键 肽键肽键,有些蛋白质还包括二硫键。,有些蛋白质还包括二硫键。一级结构是蛋白质空间构象和特异一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。生物学功能的基础。目
17、目 录录二、蛋白质的二级结构二、蛋白质的二级结构 蛋白质分子中某一段肽链的局部蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象基侧链的构象。定义定义 主要的化学键:主要的化学键:氢键氢键 (一)肽单元(一)肽单元参与肽键的参与肽键的6 6个原子个原子C C 1 1、C C、O O、N N、H H、C C 2 2位于同一位于同一平面,平面,C C 1 1和和C C 2 2在平面上所在平面上所处的位置为反式处的位置为反式(trans)(trans)构构型,此同一平面上的型,此同一
18、平面上的6 6个原个原子 构 成 了 所 谓 的子 构 成 了 所 谓 的 肽 单 元肽 单 元 (peptide unit)peptide unit)。蛋白质二级结构的主要形式蛋白质二级结构的主要形式 -螺旋螺旋(-helix)-helix)-折叠折叠(-pleated sheet)-pleated sheet)-转角转角(-turn)-turn)无规卷曲无规卷曲(random coil)(random coil)(二)(二)-螺旋螺旋目目 录录(三)(三)-折叠折叠(四)(四)-转角和无规卷曲转角和无规卷曲-转角转角无规卷曲是指没有规律性的那部分肽无规卷曲是指没有规律性的那部分肽链结构。链
19、结构。(五)模体(五)模体在许多蛋白质分子中,可发现二个在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个具有特殊功能的空相互接近,形成一个具有特殊功能的空间构象,被称为模体间构象,被称为模体(motif)(motif)。钙结合蛋白中结钙结合蛋白中结合钙离子的模体合钙离子的模体 锌指结构锌指结构 三、蛋白质的三级结构三、蛋白质的三级结构疏水键、离子键、氢键等。疏水键、离子键、氢键等。主要的化学键主要的化学键整条肽链中全部氨基酸残基的相对空整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置间位置,即肽链中所有原子在三维空间的即肽链中所有原子在
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