第九章外源基因在宿主细胞中的精选课件.ppt
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- 第九 章外源 基因 宿主 细胞 中的 精选 课件
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1、w1.gene silencew2.expression systems of foreign genew3.Isolating and purifying the product of foreign geneswGene Silencing外源基因存在于生物体内,并未丢失或损伤,但该基因不表达或表达量极低的现象。.w Gene silencing can occur at either transcriptional level(TGS,Transcriptional Gene Silencing),or post-transcriptional level(PTGS,Post-Trans
2、criptional Gene Silencing).wTGS:Methylation Induced Repeat-Induced Gene Silencing(RIGC),position effect,and so onwPTGS:cosuppression,and so onHistone:组蛋白组蛋白deacetylase去乙酰化酶去乙酰化酶 基因表达系基因表达系统统原核生物基因表达系统:原核生物基因表达系统:如大肠杆如大肠杆菌表达系统、芽孢杆菌表达系统、菌表达系统、芽孢杆菌表达系统、链霉菌表达系统、蓝藻表达系统等。链霉菌表达系统、蓝藻表达系统等。真核生物基因表达系统:真核生物基因表
3、达系统:如酵母表如酵母表达系统、植物细胞表达系统、昆虫达系统、植物细胞表达系统、昆虫细胞表达系统、哺乳动物细胞表达细胞表达系统、哺乳动物细胞表达系统等。系统等。w欲将外源基因在原核细胞中表达,必须满足以下欲将外源基因在原核细胞中表达,必须满足以下条件:条件:w 通过表达载体将外源基因导人宿主菌,并利用通过表达载体将外源基因导人宿主菌,并利用宿主菌的酶系统合成外源蛋白;宿主菌的酶系统合成外源蛋白;w 外源基因不能带有间隔顺序外源基因不能带有间隔顺序(内含子内含子),因而必,因而必须用须用cDNA或全化学合成基因,而不能用基因组或全化学合成基因,而不能用基因组DNA;w 必须利用原核细胞的强启动子
4、和必须利用原核细胞的强启动子和S-D序列等调序列等调控元件控制外源基因的表达;控元件控制外源基因的表达;w 外源基因与表达载体连接后,必须形成正确的外源基因与表达载体连接后,必须形成正确的开放阅读框架开放阅读框架(open reading frame,ORF);w 利用宿主菌的调控系统,调节外源基因的表达,利用宿主菌的调控系统,调节外源基因的表达,防止外源基因的表达产物对宿主菌的毒害。防止外源基因的表达产物对宿主菌的毒害。w对原核生物来讲,基因表达的调控序列主要涉及对原核生物来讲,基因表达的调控序列主要涉及启动子、启动子、S-D序列、终止子、衰减子等序列。序列、终止子、衰减子等序列。w1.启动
5、子启动子w是是DNA上的能与上的能与RNA聚合酶结合并能起始聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。合成的序列。w大肠杆菌的所有启动子中都有两段一致顺序大肠杆菌的所有启动子中都有两段一致顺序(consensus sequence)。)。w-35 Box 和和-10 BoxTTGACATATAATTranscriptionalstartsite53-35-1016-19bp5-9bpT80A95T45A60A50T96T82T84G78A65C54A45w原核细胞RNA聚合酶不能识别真核基因的启动子。为了表达真核基因,必须将其克隆在原核启动子的下游,才在原核表达系统中被转录。w w 必须是一种强启
6、动子必须是一种强启动子w能使外源基因的蛋白产量达到细胞总蛋白能使外源基因的蛋白产量达到细胞总蛋白的的10%-30%以上。以上。w 应呈现低水平的基础转录应呈现低水平的基础转录w便于表达毒性蛋白等。便于表达毒性蛋白等。w应是可诱导型的应是可诱导型的w用温度或化学试剂诱导。用温度或化学试剂诱导。w(2)-35区与区与-10区之间的距离区之间的距离w间隔为间隔为17bp时,启动子最强。时,启动子最强。w(3)-35区和区和-10区的碱基顺序区的碱基顺序w越接近一致顺序,启动子越强。越接近一致顺序,启动子越强。5-TTGACA-3 5-TATAAT-3 -35box -10box(Pribnow Bo
7、x)P tac=3 P trp=11 P lac启动子-35 区序列-10 区序列 P lacT T T A C A T A T A A T P trp T T G A C AT T A A C T P tacT T G A C AT A T A A T P traA T A G A C A T A A T G T P lLT T G A C A G A T A C T P recAT T G A T A T A T A A T 启动子tactac(乳糖和色氨酸的杂合启动子(乳糖和色氨酸的杂合启动子)w在原核生物表达系统中,通常使用的可调控的强启动子有lac(乳糖启动子)、trp(色氨酸启动子
8、)、PL和PR(噬菌体的左向和右向启动子)以及tac(乳糖和色氨酸的杂合启动子)等。w2S-D序列 wmRNA在细菌中的转译效率依赖于是否有核糖体结合位点的存在,即S-D序列以及S-D序列与起始密码子AUG之间的距离。wS-DS-D序列序列(AGGAGG)AGGAGG)后面的后面的4 4个碱基:个碱基:w如果是如果是A A(T T),翻译效率最高;翻译效率最高;w如果是如果是G G(C C),效率只有效率只有50%50%或或25%25%。wSDSD序列与翻译起始密码子之间的距离为序列与翻译起始密码子之间的距离为3 39 9个个碱基。多数情况下为碱基。多数情况下为7bp7bp,此间的碱基多一个或
9、,此间的碱基多一个或少一个都会影响翻译的起始效率。少一个都会影响翻译的起始效率。AUG左侧的三个碱基也有影响。左侧的三个碱基也有影响。-半乳糖苷酶的半乳糖苷酶的mRNA中:中:AUG左侧如果是左侧如果是UAU或或CUU时,最为有效;时,最为有效;如果是如果是UUC、UCA或或AGG时下降时下降20倍。倍。w3终止子终止子w 在一个基因的3端或是一个操纵子的3,端往往还有一特定的核苷酸序列,它有终止转录的功能,这一DNA序列称为转录终止子(terminator)。w 共同的特点,即有一段富含A/T的区域和一段富含GC的区域,GC富含区域又具有回文对称结构,这段终止子转录后形成的RNA具有茎环结构
10、。w在构建表达载体时,为防止由于克隆的外源基因的表达干扰了载体系统的稳定性,一般都在多克隆位点的下游插入一段很强的核糖体RNA的转录终止子。w起始密码子:起始密码子:GUG 为 AUG 的 50%,而 UUG 只及 AUG 的 25%。w主密码子:主密码子:使用的频率高使用的频率高w罕用密码子:罕用密码子:基因组中使用的频率较低。基因组中使用的频率较低。w如果外源目的基因如果外源目的基因mRNAmRNA的主密码子和受体细胞基因组的的主密码子和受体细胞基因组的主密码子相同或接近,则该基因的表达效率就高;反之主密码子相同或接近,则该基因的表达效率就高;反之则低。则低。w构建表达载体时,要对外源基因
11、的碱基进行适当置换,构建表达载体时,要对外源基因的碱基进行适当置换,或对克隆载体上的调控序列进行适当的调整以适应宿主或对克隆载体上的调控序列进行适当的调整以适应宿主细胞。细胞。w在细胞内表现为不溶性的包涵体颗粒 包涵体存在于大肠杆菌细胞质中w在细胞内表现为可溶性的蛋白质 包涵体包涵体:在一定条件下,外源基因的表达:在一定条件下,外源基因的表达产物在大肠杆菌中积累并致密地集中在一产物在大肠杆菌中积累并致密地集中在一起形成无膜的裸露结构,这种结构称为包起形成无膜的裸露结构,这种结构称为包涵体。涵体。包涵体包涵体的组成的组成蛋白质蛋白质非蛋白质非蛋白质外源基因的表达产物外源基因的表达产物:占大部分,
12、具有正占大部分,具有正确的氨基酸序列,但空间构相错误,因而包涵确的氨基酸序列,但空间构相错误,因而包涵体蛋白一般体蛋白一般没有生物学活性没有生物学活性。受体细胞本身的表达产物受体细胞本身的表达产物:如如RNA聚合聚合酶、核糖核蛋白、外膜蛋白以及表达载体编码酶、核糖核蛋白、外膜蛋白以及表达载体编码的蛋白等。的蛋白等。:包括包括DNA、RNA和脂多糖等和脂多糖等。包涵体形成的本质包涵体形成的本质是细胞内蛋白质的不断聚集,主要包括是细胞内蛋白质的不断聚集,主要包括三个方面:三个方面:折叠状态的蛋白质的聚集作用;折叠状态的蛋白质的聚集作用;非折叠状态的蛋白质的聚集作用;非折叠状态的蛋白质的聚集作用;蛋
13、白质折叠中间体的作用。蛋白质折叠中间体的作用。使重组蛋白易于分离、免受蛋白酶降解、使重组蛋白易于分离、免受蛋白酶降解、不损害寄主细胞不损害寄主细胞w 缺点缺点:回收的蛋白生物活性差。回收的蛋白生物活性差。w分子伴侣共表达(一类能促使其他蛋白质按正确分子伴侣共表达(一类能促使其他蛋白质按正确的方式组装或折叠,本身却不是最终形成的功能的方式组装或折叠,本身却不是最终形成的功能蛋白质的组成部分的多功能蛋白质)蛋白质的组成部分的多功能蛋白质)w硫氧还蛋白还原酶基因缺陷的寄主菌株硫氧还蛋白还原酶基因缺陷的寄主菌株w降低蛋白质的合成速率降低蛋白质的合成速率w不与细菌的任何蛋白或多肽融合在一起的表达蛋白称为
14、非融合蛋白。w 非融合蛋白(no-fusion protein)(no-fusion protein)的优点在于表达产物的生物学功能更接近于生物体内天然蛋白质。非融合蛋白的最大缺点是容易被细菌蛋白酶所破坏。w融合蛋白融合蛋白(fusion protein)(fusion protein)是将两个或多个基因是将两个或多个基因的编码区首尾连接的编码区首尾连接,由同一调控序列控制构成的由同一调控序列控制构成的基因表达产物。基因表达产物。w含原核细胞多肽的融合蛋白是避免细菌蛋白酶破含原核细胞多肽的融合蛋白是避免细菌蛋白酶破坏的最好措施。而含另外一些多肽的融合蛋白则坏的最好措施。而含另外一些多肽的融合蛋
15、白则为表达产物的分离纯化等提供了极大的方便。为表达产物的分离纯化等提供了极大的方便。1.1.细胞质中表达细胞质中表达2.2.周质中表达周质中表达w优点:优点:w容易被浓缩和纯化、容易被浓缩和纯化、有利于正确折叠、有利于正确折叠、被降解的少。被降解的少。w(2)信号肽()信号肽(signal peptide):能带领蛋白穿):能带领蛋白穿过膜到达周质。但以后需要正确切割掉。过膜到达周质。但以后需要正确切割掉。w(3)常用的原核信号肽)常用的原核信号肽w大肠杆菌的信号肽:大肠杆菌的信号肽:wphoA、OmpA、OmpT、OmpF、LamB、-内内酰胺酶(酰胺酶(lactamase)、)、肠毒素(肠
16、毒素(enterotoxin)ST-II、LT-B等等w金黄色葡萄球菌的蛋白金黄色葡萄球菌的蛋白A A。w枯草芽孢杆菌的内切葡聚糖酶枯草芽孢杆菌的内切葡聚糖酶(endoglucanaseendoglucanase)。)。w胡萝卜欧氏杆菌的胡萝卜欧氏杆菌的PelBPelB蛋白。蛋白。w(2 2)真核信号肽)真核信号肽w鼠源鼠源RNaseRNase、人生长激素信号肽。、人生长激素信号肽。w也能在细菌中起作用。也能在细菌中起作用。3.胞外表达胞外表达w表达的外源蛋白分泌到细胞外的培养基中。表达的外源蛋白分泌到细胞外的培养基中。w用溶血素(用溶血素(hemolysin)基因构建分泌性融合蛋)基因构建分
17、泌性融合蛋白;白;w或与细菌素释放蛋白(或与细菌素释放蛋白(bacteriocin release protein)共表达。共表达。w由于需要穿过两层膜,大肠杆菌只能分泌极少的由于需要穿过两层膜,大肠杆菌只能分泌极少的蛋白质到培养基中,效果都不太理想。蛋白质到培养基中,效果都不太理想。w 这类载体与其他表达载体不同之处在于S-D序列下游是谷胱甘肽巯基转移酶基因,而克隆的外源基因则与谷胱甘肽巯基转移酶基因相连。当进行基因表达时,表达产物为谷胱甘肽巯基转移酶和目的基因产物的融合体。产物分离产物分离柱(柱(column)GST 外源蛋白外源蛋白凝血酶凝血酶 外源蛋白外源蛋白柱(柱(column)GS
18、TGST洗脱洗脱柱(柱(column)可再利用可再利用w表达质粒的优化和设计w共表达大肠杆菌稀有密码子 tRNA 基因w提高目标基因 mRNA 和目标基因产物的稳定性w优化发酵过程w没有真核转录后加工的功能,只能表达没有真核转录后加工的功能,只能表达cDNAcDNA而不能表达而不能表达真核的基因组基因;真核的基因组基因;w没有真核翻译后加工的功能,因而产生的蛋白质常没有没有真核翻译后加工的功能,因而产生的蛋白质常没有足够的生物学活性;足够的生物学活性;w表达的蛋白质经常是不溶的,会在细菌内聚集成包涵体表达的蛋白质经常是不溶的,会在细菌内聚集成包涵体wRNARNA聚合酶不能识别真核生物的启动子聚
19、合酶不能识别真核生物的启动子 w产生的真核生物的蛋白质产物可以被细菌的蛋白酶所识产生的真核生物的蛋白质产物可以被细菌的蛋白酶所识别和降解别和降解 构建融合蛋白表达系统构建融合蛋白表达系统构建分泌蛋白表达系统构建分泌蛋白表达系统构建包涵体表达系统构建包涵体表达系统选择蛋白水解酶基因缺陷型的受体选择蛋白水解酶基因缺陷型的受体系统系统芽孢杆菌表达系统芽孢杆菌表达系统芽孢杆菌芽孢杆菌属属革兰氏阳性菌革兰氏阳性菌,细胞壁不含内毒素,能将表,细胞壁不含内毒素,能将表达蛋白分泌到细胞外。达蛋白分泌到细胞外。目前常用作基因表达系统的有目前常用作基因表达系统的有枯草杆菌枯草杆菌和和短小芽孢杆菌短小芽孢杆菌等。等
20、。v利用芽孢杆菌作为表达外源基因的受体菌的优点:利用芽孢杆菌作为表达外源基因的受体菌的优点:许多芽孢杆菌是非致病性微生物,培养条件简单,生长迅速;许多芽孢杆菌是非致病性微生物,培养条件简单,生长迅速;表达产物能分泌到细胞外的培养基中,且多数表达产物具有天表达产物能分泌到细胞外的培养基中,且多数表达产物具有天然构相和生物学活性;然构相和生物学活性;某些芽孢杆菌的遗传背景比较清楚,便于进行遗传操作;某些芽孢杆菌的遗传背景比较清楚,便于进行遗传操作;利用芽孢杆菌进行发酵的技术相当成熟。利用芽孢杆菌进行发酵的技术相当成熟。1 芽孢杆菌表达载体芽孢杆菌表达载体复制子复制子金色葡萄球菌的复制子金色葡萄球菌
21、的复制子:如:如pUB110、pC194和和pE194等等短小芽孢杆菌的复制子短小芽孢杆菌的复制子:如:如pHY481pHY481和和pWT481pWT481等等含金色葡萄球菌复制子的质粒表达载体在宿主细胞中含金色葡萄球菌复制子的质粒表达载体在宿主细胞中拷贝数高,但不稳定,原因是质粒载体与宿主染色体拷贝数高,但不稳定,原因是质粒载体与宿主染色体DNA之间发生遗传重组。之间发生遗传重组。短小芽孢杆菌型复制子的质粒表达载体在宿主细胞短小芽孢杆菌型复制子的质粒表达载体在宿主细胞中的拷贝数较低,但能稳定存在于宿主细胞中,甚至在中的拷贝数较低,但能稳定存在于宿主细胞中,甚至在没有抗生素选择压力下也不易造
22、成质粒的丢失。没有抗生素选择压力下也不易造成质粒的丢失。表达载体表达载体自主复制质粒自主复制质粒:是一类:是一类穿梭质粒穿梭质粒,能在,能在大肠杆菌大肠杆菌中复制,中复制,同时含有能在芽孢杆菌中复制的起始序列,因而也能在同时含有能在芽孢杆菌中复制的起始序列,因而也能在芽芽孢杆菌孢杆菌中进行自主复制。中进行自主复制。整合质粒整合质粒:在大肠杆菌质粒基础上构建而成,不含在芽孢杆:在大肠杆菌质粒基础上构建而成,不含在芽孢杆菌进行复制的起始序列,因而不能在芽孢杆菌中自主复制,菌进行复制的起始序列,因而不能在芽孢杆菌中自主复制,但它能插入到宿主染色体并将外源基因和标记基因整合到染但它能插入到宿主染色体并
23、将外源基因和标记基因整合到染色体上,随细胞染色体复制而复制,该方式表达外源基因解色体上,随细胞染色体复制而复制,该方式表达外源基因解决了芽孢杆菌中质粒不能稳定遗传的问题。决了芽孢杆菌中质粒不能稳定遗传的问题。噬菌体噬菌体:以芽孢杆菌温和型噬菌体构建的表达载体能将外源:以芽孢杆菌温和型噬菌体构建的表达载体能将外源基因定位整合到染色体上,并且在合适条件下(温度)诱导基因定位整合到染色体上,并且在合适条件下(温度)诱导外源基因表达。外源基因表达。1.2 宿主菌宿主菌常用的宿主菌常用的宿主菌枯草芽孢杆菌枯草芽孢杆菌短小芽孢杆菌短小芽孢杆菌地衣芽孢杆菌地衣芽孢杆菌外源基因在芽孢杆菌中的分泌表达外源基因在
24、芽孢杆菌中的分泌表达芽孢杆菌的细胞膜不同与大肠杆菌,通常只有一层细胞芽孢杆菌的细胞膜不同与大肠杆菌,通常只有一层细胞膜,当分泌型蛋白质跨膜后就进入到培养基中,因此,外源膜,当分泌型蛋白质跨膜后就进入到培养基中,因此,外源蛋白的表达量可以达到很高的水平,其表达量可达蛋白的表达量可以达到很高的水平,其表达量可达30g/L。在芽孢杆菌中高效表达外源基因的策略在芽孢杆菌中高效表达外源基因的策略提高表达质粒在细胞中的稳定性提高表达质粒在细胞中的稳定性灭活芽孢杆菌胞外蛋白酶灭活芽孢杆菌胞外蛋白酶链霉菌表达系统链霉菌表达系统链霉菌链霉菌是一种是一种革兰氏阳性细菌革兰氏阳性细菌,广泛分布于土壤中,能,广泛分布
25、于土壤中,能够产生多种生理活性物质。够产生多种生理活性物质。v链霉菌作为外源基因表达的受体细胞所具有的特点:链霉菌作为外源基因表达的受体细胞所具有的特点:为非致病性细菌,不产生内毒素;为非致病性细菌,不产生内毒素;可进行外源蛋白的分泌表达;可进行外源蛋白的分泌表达;可进行高密度培养,具有丰富的次级代谢途径和初、次级可进行高密度培养,具有丰富的次级代谢途径和初、次级代谢调控体系,表达外源蛋白的时间较长;代谢调控体系,表达外源蛋白的时间较长;链霉菌在传统发酵工业中应用历史悠久,有良好的工业化链霉菌在传统发酵工业中应用历史悠久,有良好的工业化基础。基础。3.1 链霉菌基因表达载体链霉菌基因表达载体启
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