基因诊疗和基因治疗培训课件1.ppt
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1、基因诊疗和基因治疗基因诊疗和基因治疗基因诊断基因诊断 用分子生物学技术对生物体的用分子生物学技术对生物体的DNADNA序列序列及其产物(及其产物(RNARNA和蛋白质)进行定性、定量和蛋白质)进行定性、定量分析,为疾病诊断提供依据。分析,为疾病诊断提供依据。基因诊断的前提基因诊断的前提 已明确疾病表型与基因型的关系已明确疾病表型与基因型的关系 2基因诊疗和基因治疗 基因诊断包括定性和定量分析基因诊断包括定性和定量分析lDNADNA、RNARNA或蛋白质水平变化,如病毒基或蛋白质水平变化,如病毒基因及其转录产物在体内从无到有、癌基因及其转录产物在体内从无到有、癌基因表达水平从低到高;因表达水平从
2、低到高;l基因结构变化,如点突变引起基因失活、基因结构变化,如点突变引起基因失活、染色体转位引起基因异常激活或灭活。染色体转位引起基因异常激活或灭活。3基因诊疗和基因治疗 基因诊断的特点基因诊断的特点 高特异性高特异性 高灵敏性高灵敏性 早期诊断性早期诊断性 应用广泛性应用广泛性4基因诊疗和基因治疗基因诊断的基本技术流程基因诊断的基本技术流程样品抽提样品抽提DNARNAcDNAPCRPCR扩增扩增分子杂交分子杂交反转录反转录合成寡核苷酸引物合成寡核苷酸引物制备和标记探针制备和标记探针杂交信号检测杂交信号检测5基因诊疗和基因治疗基因诊断中常用的分子生物学技术基因诊断中常用的分子生物学技术 核酸分
3、子杂交核酸分子杂交(Nucleic acid hybridization)聚合酶链式反应聚合酶链式反应(PCR)单链构象多态性(单链构象多态性(SSCP)限制性片段长度多态性(限制性片段长度多态性(RFLP)DNADNA序列测定(序列测定(DNA sequencing)生物芯片(生物芯片(biochips)Western免疫印迹(免疫印迹(Western blotting)免疫组织化学诊断免疫组织化学诊断 6基因诊疗和基因治疗PCR在基因诊断中的应用在基因诊断中的应用 RT-PCRRT-PCR 荧光定量荧光定量PCRPCR 多重多重-PCR-PCR PCR-ASOPCR-ASO(等位基因特异性
4、寡核苷酸等位基因特异性寡核苷酸探针法)探针法)PCR-SSCPPCR-SSCP(单链构象多态性分析)单链构象多态性分析)PCR-RFLPPCR-RFLP(限制性片段长度多态性限制性片段长度多态性分析)分析)7基因诊疗和基因治疗 多重多重PCR 多重多重PCRPCR示意图示意图 A A:普通:普通PCRPCR;B B:多重:多重PCRPCR8基因诊疗和基因治疗PCR-ASO(等位基因特异性寡核苷酸探针法)等位基因特异性寡核苷酸探针法)N N:正常基因;:正常基因;H H:杂合子基因;:杂合子基因;M M:突变基因:突变基因ASO1ASO2NHM9基因诊疗和基因治疗 单链构象多态性分析单链构象多态
5、性分析(single-strand conformation polymorphism,SSCP)DNADNA的突变造成的突变造成DNADNA片段中碱基序列不片段中碱基序列不同,变性为单链后在中性聚丙烯酰胺凝胶同,变性为单链后在中性聚丙烯酰胺凝胶中的中的构象不同构象不同(单链构象多态性),利用(单链构象多态性),利用迁移率的差别可使各种序列不同的单链分迁移率的差别可使各种序列不同的单链分离开来。离开来。10基因诊疗和基因治疗PCR-SSCPPCR-SSCP分析原理示意分析原理示意11基因诊疗和基因治疗 限制性片段长度多态性分析限制性片段长度多态性分析 (restriction fragment
6、 length polymorphism,RFLP)由于由于DNADNA变异产生变异产生新的酶切位点新的酶切位点或原有的或原有的酶切位点消失,在用限制性核酸内切酶消化酶切位点消失,在用限制性核酸内切酶消化时产生不同长度或不同数量的片段。时产生不同长度或不同数量的片段。可借助核酸分子杂交或可借助核酸分子杂交或PCRPCR进行检测进行检测。12基因诊疗和基因治疗ABCDEFGDEFBGCAGAATTCCTTAAGEFBG C+DAEcoREcoR 限制性内切酶位点的变化限制性内切酶位点的变化13基因诊疗和基因治疗左侧:正常;右侧突变左侧:正常;右侧突变 序列分析用于基因诊断研究序列分析用于基因诊断
7、研究14基因诊疗和基因治疗生物芯片生物芯片(biochips)基因芯片(基因芯片(gene chipsgene chips)蛋白质芯片蛋白质芯片(protein chip)(protein chip)15基因诊疗和基因治疗基因诊断中常用的分子生物学方法比较基因诊断中常用的分子生物学方法比较 方法方法 优点与问题优点与问题 解决方案解决方案核酸分子杂交核酸分子杂交结果可靠但操作繁琐结果可靠但操作繁琐选择合适的探针选择合适的探针 PCRPCR灵敏度、特异性高灵敏度、特异性高设计合适的引物设计合适的引物 SSCPSSCP操作简便、检出率不高操作简便、检出率不高选择合适的片段选择合适的片段 RFLPR
8、FLP结果可靠但限制较多结果可靠但限制较多选择合适的限制酶选择合适的限制酶 DNADNA测序测序可自动化,但不适宜广泛可自动化,但不适宜广泛使用使用与与PCRPCR配合使用配合使用生物芯片生物芯片效率高,成本高,不适宜效率高,成本高,不适宜广泛使用广泛使用选择合适的芯片选择合适的芯片16基因诊疗和基因治疗遗传病的基因诊断遗传病的基因诊断Gene Diagnosis of Hereditary Diseases17基因诊疗和基因治疗(一)镰状细胞贫血病(一)镰状细胞贫血病一、血红蛋白病一、血红蛋白病1.镰状红细胞贫血患者基因诊断镰状红细胞贫血患者基因诊断-ASO杂交法杂交法2.2.HBS的限制性
9、内切酶谱分析的限制性内切酶谱分析3.3.HBS的的PCR-RFLP分析分析 18基因诊疗和基因治疗 正常的(正常的(N N)的)的ASOASO探针探针:5-ACT CCT GAG GAG AAG TCT GC-3 突变的(突变的(M M)的)的ASOASO探针探针:5-ACT CCT GTG GAG GAAG TCT GC-3 1.1.镰状红细胞贫血患者基因诊断镰状红细胞贫血患者基因诊断ASOASO杂交法杂交法19基因诊疗和基因治疗斑点杂交结果斑点杂交结果 N N:正常;:正常;M M突变突变镰状红细胞贫血患者镰状红细胞贫血患者ASOASO杂交法检测杂交法检测N-ASOM-ASO正常正常 突变
10、突变 突变突变纯合子纯合子 杂合子杂合子 纯合子纯合子20基因诊疗和基因治疗5 3 正常基因正常基因1.15kb(CCT GAG G)5 3 突变基因突变基因1.35kb(CCT GTG G)镰状红细胞贫病的限制性内切酶谱分析镰状红细胞贫病的限制性内切酶谱分析MstMst酶切位点酶切位点(CCTNAGG)2.HBS2.HBS的限制性内切酶谱分析的限制性内切酶谱分析目目 录录21基因诊疗和基因治疗0.2kb1.15kb1.35kb正常人正常人突变携带者突变携带者患者患者镰状红细胞贫血病的限制性内切酶谱分析镰状红细胞贫血病的限制性内切酶谱分析目目 录录22基因诊疗和基因治疗3.HBS3.HBS的的
11、PCR-RFLPPCR-RFLP分析分析 正常人的扩增产物经正常人的扩增产物经 MstMst 消化可生成消化可生成54bp54bp和和56bp56bp两个片段,而镰状细两个片段,而镰状细胞贫血症患者的胞贫血症患者的DNADNA片段不被酶切,仍为片段不被酶切,仍为110bp110bp,杂合子可见三条带,杂合子可见三条带正常人正常人杂合体杂合体患者患者Marker23基因诊疗和基因治疗传染病的基因诊断传染病的基因诊断 Gene Diagnosis of Infectious Diseases24基因诊疗和基因治疗 一、病毒性疾病一、病毒性疾病 甲型肝炎病毒(甲型肝炎病毒(HAVHAV)HAVHAV
12、系系RNARNA病毒,利用病毒,利用RT-PCRRT-PCR技术可从粪便中检测出技术可从粪便中检测出甲型肝炎病毒的基因组甲型肝炎病毒的基因组RNARNA。乙型肝炎病毒(乙型肝炎病毒(HBVHBV)设计保守区序列引物,扩增各型设计保守区序列引物,扩增各型HBV DNAHBV DNA片段;设计片段;设计位于可变区的引物扩增某一亚型位于可变区的引物扩增某一亚型HBV DNAHBV DNA,以便分型。,以便分型。丙型肝炎病毒(丙型肝炎病毒(HCVHCV)HCVHCV为正链为正链RNARNA病毒,先反转录成病毒,先反转录成cDNAcDNA,再进行巢式,再进行巢式PCRPCR检测检测HCVHCV。25基因
13、诊疗和基因治疗二、细菌引起的疾病二、细菌引起的疾病结核分枝杆菌结核分枝杆菌 先设计一对特异性引物,用先设计一对特异性引物,用PCRPCR技术扩技术扩增出一增出一383 bp383 bp序列,再用探针杂交,灵敏序列,再用探针杂交,灵敏度可达到度可达到100100个细菌水平。个细菌水平。幽门螺杆菌(幽门螺杆菌(HPHP)主要采用主要采用PCRPCR技术:检测技术:检测HPHP染色体染色体DNADNA特异片段;检测特异片段;检测HPHP尿素酶尿素酶A A基因;用基因;用PCR-RFLPPCR-RFLP鉴别鉴别HPHP菌株。菌株。26基因诊疗和基因治疗肿瘤的基因诊断肿瘤的基因诊断Gene Diagno
14、sis of Malignant Tumors27基因诊疗和基因治疗一、原癌基因与抑癌基因的检测一、原癌基因与抑癌基因的检测 二、常见肿瘤的基因诊断二、常见肿瘤的基因诊断 乳腺癌乳腺癌 结肠癌结肠癌 28基因诊疗和基因治疗一、原癌基因与抑癌基因的检测一、原癌基因与抑癌基因的检测1 1原癌基因的检测原癌基因的检测 rasras 基因家族基因家族由由H-rasH-ras、K-rasK-ras和和N-rasN-ras组成。最组成。最常见的突变是第常见的突变是第1212、1313、5959或第或第6161位密码子的点突变。位密码子的点突变。胰腺癌、结肠癌、肺癌以胰腺癌、结肠癌、肺癌以K-rasK-ra
15、s突变为主,如第突变为主,如第1212位密码子突变,由编码甘氨酸的位密码子突变,由编码甘氨酸的GGTGGT突变为突变为TGTTGT、GTTGTT或或GATGAT,少数突变为,少数突变为GCTGCT。急性淋巴细胞白血病,慢性淋巴细胞白血病等以急性淋巴细胞白血病,慢性淋巴细胞白血病等以N-N-rasras突变为主;泌尿系统肿瘤则以突变为主;泌尿系统肿瘤则以H-rasH-ras突变为主。突变为主。29基因诊疗和基因治疗 PCRPCR及及PCR-SSCPPCR-SSCP分析:分析:扩增扩增ras ras 基因第基因第1212位密位密码子点突变部位,再用码子点突变部位,再用SSCPSSCP技术进行分析,
16、或技术进行分析,或者直接测序确定患者者直接测序确定患者rasras原癌基因的点突变。原癌基因的点突变。核苷酸杂交技术(如核苷酸杂交技术(如ASOASO):):检测检测rasras基因第基因第1212位密码子点突变。位密码子点突变。2.2.ras ras原癌基因突变常用的检测方法原癌基因突变常用的检测方法30基因诊疗和基因治疗3 3抑癌基因抑癌基因p53p53的检测的检测 p53p53基因以密码子第基因以密码子第175175位、第位、第248248位、第位、第249249位、位、第第273273位及位及 第第282282位点突变率最高。在结直肠位点突变率最高。在结直肠癌、乳腺癌、小细胞肺癌,都可
17、见异常的癌、乳腺癌、小细胞肺癌,都可见异常的p53p53基因蛋白。基因蛋白。p53p53的基因诊断方法有的基因诊断方法有 (1 1)PCR-SSCPPCR-SSCP分析技术分析技术 (2 2)DNADNA序列分析序列分析 (3 3)PCR-RFLPPCR-RFLP分析分析31基因诊疗和基因治疗基因治疗基因治疗Gene Therapy32基因诊疗和基因治疗 基因治疗基因治疗 指将目的基因通过基因转移技术(病毒指将目的基因通过基因转移技术(病毒载体介导或者非病毒载体介导的基因转载体介导或者非病毒载体介导的基因转移技术)导入靶细胞内,目的基因表达移技术)导入靶细胞内,目的基因表达产物对疾病起治疗作用
18、。产物对疾病起治疗作用。33基因诊疗和基因治疗基因治疗分类基因治疗分类体细胞体细胞(somatic cell)基基因治疗因治疗生殖细胞生殖细胞(germline)基基因治疗因治疗v只限于某一体细胞的只限于某一体细胞的基因的改变基因的改变v只限于某个体的当代只限于某个体的当代v对缺陷的生殖细胞进对缺陷的生殖细胞进行矫正行矫正v当代及子代当代及子代34基因诊疗和基因治疗 一、基因治疗的策略一、基因治疗的策略35基因诊疗和基因治疗 (一)基因置换(一)基因置换(gene replacement)定义:定义:指将特定的目的基因导入特定细胞,通过指将特定的目的基因导入特定细胞,通过定位重组,定位重组,导
19、入的正常基因导入的正常基因,以置换基因组内原,以置换基因组内原有的缺陷基因。有的缺陷基因。目的:目的:将缺陷基因的异常序列进行桥正。将缺陷基因的异常序列进行桥正。对缺陷基因的缺陷部位进行精确的原位修复,对缺陷基因的缺陷部位进行精确的原位修复,不涉及基因组的任何改变。不涉及基因组的任何改变。36基因诊疗和基因治疗转导基因的载体与基因组转导基因的载体与基因组DNADNA具有相同具有相同的序列。带有目的基因的载体就能找到的序列。带有目的基因的载体就能找到同源重组的位点,进行部分基因序列的同源重组的位点,进行部分基因序列的交换。交换。基因同源重组技术又称为基因同源重组技术又称为基因打靶基因打靶(gen
20、e targeting)基因同源重组技术基因同源重组技术37基因诊疗和基因治疗(二)(二)基因添加基因添加(gene augmentation)定义定义:通过导入外源基因使靶细胞表达其本身通过导入外源基因使靶细胞表达其本身 不表达的基因。不表达的基因。类型类型:n在有缺陷基因的细胞中在有缺陷基因的细胞中导入相应的正常基因导入相应的正常基因,而细胞内的缺陷基因并未除去,通过导入正而细胞内的缺陷基因并未除去,通过导入正常基因的表达产物,补偿缺陷基因的功能;常基因的表达产物,补偿缺陷基因的功能;n向靶细胞中向靶细胞中导入靶细胞本来不表达的基因导入靶细胞本来不表达的基因,利用其表达产物达到治疗疾病的目
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