个体化医学与分子诊断课件.ppt

1、个体化医学与分子诊断个体化医学与分子诊断2022-10-15个体化医学与分子诊断人类个体的遗传变异 31.6亿个碱基对 2-2.5万个基因300万变异疾病相关药物反应差异相关不同个体DNA序列 99.9%相同0.1%个体化医学与分子诊断基于基因组的个体化医学罕见疾病风险查出孟德尔疾病致病基因早期疾病预测孕前/胚胎植入前筛查药物基因组学风险分层药物效应和剂量不良反应预测常见疾病风险风险预测风险分层查出早期的行为异常风险显现1个体化医学与分子诊断发病易感遗传缺陷早期查出针对性预防疾病发展预测对药物的可能反应监测药物反应和发病反复健康状态无症状疾病状态慢病治疗有症状疾病状态个体化医学和个体化药物治疗

2、个体化医学当今医疗保健重点病人分层 /治疗未来医疗保健重点个体化药物治疗疾病基因组学药物基因组学个体化医学与分子诊断药物临床研究和应用的相悖临床试验对象群体用药对象个体基因个体化医学与分子诊断人数药物代谢酶遗传变异引起疗效和毒性个体差异使用相同剂量后体内药物总量酶活性过高酶活性适中酶活性过低无效毒性血内药物浓度个体化医学与分子诊断?均有哮喘急性发作受体遗传变异引起疗效和安全性个体差异哮喘发作终止均吸入2肾上腺素受体激动药沙丁胺醇(Albuterol)沙美特罗 (Salmeterol)死亡2肾上腺素受体基因变异(Arg/Arg16)个体化医学与分子诊断正常细胞无融合蛋白CML细胞融合基因BCR-

3、ABL正常细胞Her2+乳腺癌细胞融合蛋白伊马替尼特异性靶点伊马替尼抑制BCR-ABL络氨酸激酶，用于bcr-abl融合基因阳性的慢性粒细胞性白血病过表达靶点赫赛汀是人源化Her-2单克隆抗体，对 Her-2有高亲合力，用于 Her-2受体过表达的乳腺癌赫赛汀Her2+受体个体化治疗应用之1：作用于特异性或过表达靶点个体化医学与分子诊断维生素K（减少）氯比格雷华法林肠吸收代谢CYP2C9CYP4F2CYP2C19肝氯比格雷GPlla/lll P2Y12受体 受体华法林肝细胞NADH NAD+主动循环药VKORCI维生素K（氧化）功能性凝血因子次功能性凝血因子血小板细胞药物效应动力学 血小板膜糖

4、蛋白(GP)IIa/III和膜蛋白P2Y12受体基因多态性：氯比格雷 VitK环氧化还原酶基因多态性：华法林药物代谢动力学 氯比格雷(前药)：CYP2C19基因多态性 华法林：CYP2C9 基因多态性个体化治疗应用之2：预估药物效应和剂量个体化医学与分子诊断CYP2D6弱代谢者乳腺癌复发显著增加,生存率降低,CYP2D6抑制剂合用,高活性代谢产物去甲他莫昔芬血浆水平减少65-75%欧洲药品管理局药物警戒工作组（PhVWP）认定:CYP2D6弱代谢者对他莫昔芬的治疗应答可能降低避免合用CYP2D6抑制剂他莫昔芬活性:100X4-OH-N-去甲他莫昔芬(Endoxifen)个体化治疗应用之2：预估

5、药物效应和剂量-他莫昔芬:选择性雌激素受体调节剂;女性乳腺癌个体化医学与分子诊断Cellular TGNCellular TGN个体化治疗应用之2：预估药物效应和0102030001020300421086*2,*3A,*3C*1TPMT Activity010203006-10%65%Conventional dose基于TPMT基因型的剂量5000500基因检测常规剂量毒性风险高5000剂量毒性风险低500个体化治疗应用之2：预估药物效应和剂量根据TPMT基因型确定6-MP剂量个体化医学与分子诊断剂 量（%）ABCD依据:PK 值AUCCL常规剂量基因型特异性剂量m/mw/mw/ww/nw

6、常规相同剂量个体化剂量个体化治疗应用之2：预估药物效应和剂量-单因素250-200-150-100-50-0-ABCD理想药物浓度理想药物浓度理想药物浓度理想药物浓度个体化医学与分子诊断药 物 清 除 率（）药理学差异Molecular Psychiatry(2012),1-15个体化治疗应用之2：预估药物效应和剂量个体化医学与分子诊断药物清除率（）药理学差异Molecular Psychiatry(2012),1-15个体化治疗应用之2：预估药物效应和剂量个体化医学与分子诊断N Engl J Med.2009,19;360(8):753764.68.613.37.26.72.61.6Unkn

7、ownVKORC1CYP2C9AgeHigh+BWOthers各因素解释华 Factors药剂量差异原因百分比法林用 for warfarin dosingVKORC1 A/GCYP2C9*1/*3VKORC1 A/ACYP2C9*3/*3ClinicalalgorithmNo geneticvariationPersonalized medication application 2:prediction of drug effect and dosage-Multiple factor Pharmacogenetic dosing algorithm(international multip

8、le center containing 9 contries and4043 subjectsWarfarin dose（mg/d）=5.6044 0.2614(age)+0.0087(height in cm)+0.0128(weight in kg)0.8677(VKORC1-1639 A/G)1.6974(VKORC1-1639 A/A)0.4854(VKORC1 genotype unknown)0.5211(CYP2C9*1/*2)0.9357(CYP2C9*1/*3)1.0616(CYP2C9*2/*2)1.9206(CYP2C9*2/*3)2.3312(CYP2C9*3/*3)

9、0.2188(CYP2C9 genotype unknows)0.1092(Asian race)0.2760(Blacks)0.1032(Mixed race)+1.1816(Enzyme induces)0.5503(Amidarone)2/7The International Warfarin Pharmacogenetics Consortium,N Engl J Med 2009;360:753-64.个体化医学与分子诊断Percentage of predictionXY Gage IW AndPC e Tar o kasn hashi Wen Huang You Miao Ohn

10、o KimChoZ h Scu o Wnc ade elius100500underidealoverAlgorithmsThe dosing calculatedvia Xiang Ya dosingalgorithm is more closeto the actual requiredfor the individualpatient from SouthCentral area of ChinaPersonalized medication application 2:prediction of drug effect and dosage-Multiple factorXiang-Y

11、a PGx dosing algorithmWarfarin stable dose(mg/d)=2.140 0.370(VKORC1-1639GA)0.332(CYP2C9*3)+0.324(BSA)0.004(age in decades)0.231(number of increasing INR drugs)+0.105(smoking habit)0.135(preoperative stroke history)0.108(hypertension)2个体化医学与分子诊断Personalized medication application 2:prediction of drug

12、 effect and dosagePGx research of TCM Tianqi hypoglycemic capsule184 ADMET-related lociSNPrs1142345GeneTPMTAlleleA/GMAF0.229p0.001FDR P0.038rs2306168 SLCO2B1 T/C0.3050.0030.114rs2231142rs717620ABCG2ABCC2A/CC/T0.2600.2300.0210.0230.7980.874rs1799931 NAT2 A/Grs4244285 CYP2C19 A/Grs4124874 UGT1A1 G/T0.

13、1530.3440.3370.0240.0270.0440.91211Li X,Evidence-Based Complementary andAlternative Medicine,2013http:/dx.doi.org/10.1155/2013/327629个体化医学与分子诊断Each group(%)Percentage of each group in rs1142345 heterozygote(AG)and wild-type(AA)patients.Li X,Evidence-Based Complementary andAlternative Medicine,2013ht

14、tp:/dx.doi.org/10.1155/2013/327629HeterozygoteWitt typePersonalized medication application 2:prediction of drug effect and dosage0.7-0.6-0.5-HelthyMaintenlanceDeterioration0.4-0.3-0.20.1-0-个体化医学与分子诊断结肠癌病人(n=59)45级嗜中性白血球低下Innocenti et al,J Clin Oncology 22:1-7,200450%减少剂量或换药*28/*2810%12.5%减少剂量或换药Wt/*

15、280%常规剂量Wt/Wt个体化治疗应用之3：预测和预防药物毒性伊立替康毒性发生率与UGT1A*28基因型个体化医学与分子诊断卡马西平(Cabamazepine)癫痫性发作,神经痛等神经性疾病 HLA-B*1502疱、紫癜、坏死；死亡率3040%多形糜烂性红斑(Stevens-JohnsonSyndrome，SJS)多形性红斑，发热、小别嘌呤醇(Allopurinol)原发性和继发性痛风病人，控制高尿酸血症 HLA-B*5801个体化治疗应用之3：预测和预防药物毒性卡马西平和别嘌呤醇引起的 SJS个体化医学与分子诊断 Allopurinol Primary and secondary gout

16、patients,hyperuricemia HLA-B*5801Allele positive:85/90(94.4%)Rs9263726 AAllele positive:82/90(91.1%)Personalized medication application 3:prediction and prevention of drug toxicityHLA-B*5801 and surrogate SNP rs9263726 areassociated with allopurin-SCAR in mainland ChinesePatientsAllele positive/tota

17、l(%)OR(95%CI)399.5(74.62139.4)HLA-B*5801Allopurinol-SCARAllopurinol-Tolerated85/90(94.4%)2/49(4.1%)Rs9263726 A240.9(49.11181.7)Allopurinol-SCARAllopurinol-Tolerated82/90(91.1%)2/49(4.1%)个体化医学与分子诊断ADR 发生率Individual risk1000010001001010.11E-101E-091E-081E-070.000001 0.000010.00010.0010.010.115000 不良反应

18、突变基因频率引起ADRs的药物 59%经多态性DME代谢个体化治疗应用之3：预测和预防药物毒性药物不良反应发生率与突变基因频率相关100000个体化医学与分子诊断在下列情况下，药厂必需提供药物基因组学资料(这些必需提交的药物基因组学资料会影响FDA对这些药物的决策);1.对药物标签上的剂量、安全性或有效性有重要参考价值的资料2.在有遗传学标志物的亚组人群中进行的药物临床试验资料3.已知遗传变异与药物反应相关的资料，如细胞色素CYP2D6基因。对于大多数其他的药物基因组学资料，例如这些资料并非作为临床试验或销售申请的一部分，则无强制要求，但FDA鼓励其自愿提交。（2005）个体化医学与分子诊断F

19、DA批准药品说明书中的遗传变异生物标记药物或代表药123456789CC趋化因子受体5(CCR-5)EGFR 表达等Her2/neu 过表达费城染色体阳性反应等C蛋白缺损(遗传性或获得性）TPMT 变异UGT1A1 变异HLA-B*1502 等位基因尿素循环障碍(UCD)马拉维若(抗逆转录病毒药)西妥昔单抗、帕尼单抗、吉非替尼核赛汀(Herceptin,曲妥珠单抗达沙替尼华法林硫唑嘌呤伊立替康卡马西平丙戊酸10 CYP2C9 突变等11 Vit K 环氧化还原酶(VKORC1)变异12 家族性高脂蛋白血症 LDL受体缺损或突变13 G6PD 缺损14 HLA-B*5701 等位基因华法林华法林

20、阿托伐他汀拉布立酶阿巴卡韦个体化医学与分子诊断生物标记药物或代表药1516171819202122232425262728C-KIT 表达PML/RAR(a)表达(维甲酸受体反应/无反应)UGT1A1 变异等CYP2C19 突变CYP2C9 突变CYP2D6 变异CYP2D6 和其他变异第五对染色体长臂间隙基因缺损DPD 缺损EGFR 表达EGFR 表达等G6PD 缺损等NAT 变异费城染色体阳性反应者伊马替尼甲磺酸维甲酸尼罗替尼伏立康唑塞来昔布托莫西汀盐酸氟西汀来那度胺卡培他滨埃罗替尼吉非替尼（头颈癌）伯氨喹异烟肼，马利兰马利兰FDA批准药品说明书中的遗传变异个体化医学与分子诊断 确认期Po

21、C开发期发现期研究商业开发I 期0 期II 期III 期申报上市IV 期选择靶点先导化合物产生与优化试剂盒批文、上市应用与上市后评估量体裁衣给药和监测临床验证体外检测分析生物标记发现和确证靶点确证研究分析伴随诊断的可行性和吸引力选择病人技术验证分析药物和生物标记检测方法和试剂盒同步开发个体化医学与分子诊断Xalkori(crizotinib,克里唑蒂尼)酪氨酸激酶抑制剂，治疗间变性淋巴瘤激酶(ALK)阳性的局部晚期或转移性非小细胞肺癌(NSCLC)。同时还批准了雅培的Vysis ALK Break-Apart FISH检测试剂盒，使用该试剂盒检测ALK阳性的NSCLC患者可采用Xalkori进

22、行治疗。Zelboraf(vemurafenib,威罗菲尼)BRAF抑制剂，用于晚期转移性或不能手术切除的黑色素瘤的治疗。FDA还批准了首个用于检测cobas 4800 BRAFV600突变的诊断试剂。同步开发实例2011年FDA批准的用于有特定基因突变的亚组人群抗癌药个体化医学与分子诊断2004-4：个体化治疗咨询中心2006-2：个体化治疗遗传分析中心2010-9：中南大学湘雅医学检验所1990年代中南大提出个体化用 药物治疗中期：学的个体化中南大学个体化药物治疗的应用和推广2013-8：国家卫生计生委个体化医学检测培训基地个体化医学与分子诊断中南大学药物基因组学(个体化医学)转化医学链临

23、床服务基因检测方法建立、临床个体化治疗咨询、培训、基因检测服务湘雅医学检验所产品生产药物相关基因变异检测试剂盒后期，即产品申报和生产长沙、武汉、上海生物产业公司已提供企业11个成熟前期产品供企业申报，其中已有获批者基础研究遗传变异发现、确证、实验研究、(小样本大样本)临床研究临床药理研究所30年基础研究：300篇SCI论文57个基因81个位点前期产品药物相关基因变异检测方法的建立和标准化及试剂盒前期湖南个体化医学产品培育基地已经积淀212个成熟检测项目，待研发成前期产品12个分中心个体化医学与分子诊断产品名称CYP2D6*10、CYP2C9*3、ADRB1(1165GC)、AGTR1(1166

24、AC)、ACE(I/D)检测试剂盒(基因芯片法)产品标准 YZB/国 4686-2012基因芯片、洗涤母液A、洗涤母液B、阳性参照、阴性参照、杂交液；PCR反应液1、产品性能结 PCR反应液2、PCR反应液3、PCR反应液4、PCR反应液5、酶1、酶2、定位参照。构及组成 产品有效期：A盒：2-8；B盒：-20，有效期6个月。附件：注册产品标准，产品说明书。有效期 2016.10.28批准日期 2012.10.29检测五种基因多态性：CYP2D6*10(CYP2D6*1/*1、CYP2D6*1/*10、产品适用范 CYP2D6*10/*10)、CYP2C9*3(CYP2C9*1/*1、CYP2

25、C9*1/*3、围 CYP2C9*3/*3)、ADRB1(1165G/G、1165G/C、1165C/C)、AGTR1(1166A/A 、1166A/C、1166C/C)、ACE(II、ID、DD)。规格型号 20 人份/套个体化药物治疗基因芯片http:/ 国食药监械(准)字2012第3401324号生产单位 湖南宏灏基因生物科技有限公司个体化医学与分子诊断开发成熟的个体化药物治疗基因芯片1.YZYMT-001-A人类KRAS基因突变检测试剂盒（PCR-荧光探针法)12人份/盒2.YZYMT-002-A人类EGFR基因突变检测试剂盒（PCR-荧光探针法）12人份/盒3.YZYMT-003-A

26、人类BRAF基因突变检测试剂盒（PCR-荧光探针法）12人份/盒4.YZYMT-006人类CYP2C19基因多态性检测试剂盒（PCR-荧光探针法20人份/盒5.YZYMT-007人类CYP2C9和VKORC1基因多态性检测试剂盒（PCR-荧光探针法）20人份/盒6.YZYMT-008人类UGT1A1基因多态性检测试剂盒（PCR-荧光探针法)20人份/盒7.YZYMT-009人类CYP2D6和SULT1A1基因多态性检测试剂盒（PCR-荧光探针法）20人份/盒8.YZYMT-010人类TPMT基因多态性检测试剂盒（PCR-荧光探针法)20人份/盒9.YZYMT-011人类SLCO1B1和ApoE

27、基因多态性检测试剂盒（PCR-荧光探针法)20人份/盒个体化医学与分子诊断我国个体化医学发展三个阶段基础理论研究基因导向个体化药物治疗的提出和推动推动国家管理体系和个体化医疗技术标准化和法规化年代启动年代启动年代启动个体化医学与分子诊断疾病相关基因疾病预测与诊断药物作用相关基因个体化药物治疗罕见孟德尔遗传病致病基因常见复杂疾病易感基因药物代谢/作用基因药物代谢/作用SNPs疾病预测-对疾病的新认识和控制个体化用药-最佳药物反应伦理、法律、社会问题分子诊断是实施个体化医学的必需基因检测个体化医学与分子诊断发现生物标记假说候选生物标记确证开发原型检测方法确证候选生物标记临床确证体外诊断试剂分析方法

28、优化和开发管理部门批准应用各实验室采用审核实验室结果的室间差临床和实验室培训生物标记和分子诊断方法的发现、确证和应用个体化医学与分子诊断BRACAnalysisCampath(坎帕斯)CD52人源化单克隆抗体Herceptin(赫赛汀)Camptosar(伊立替康)Gleevec(格列卫)Oncotype DX乳腺癌判断病情慢性淋巴细胞性白血病选药乳腺癌确定剂量结肠直肠癌判断药物疗效慢性髓细胞性白血病复发风险乳腺癌基因测序,风险分析轻微后遗症HER2基因表达UGT1A1多态性分析BCR-ABL荧光定量多变量分析个体化医学分子诊断临床应用分类及举例疾病易感个体化医学与分子诊断Oncotype D

29、X(基因表达谱-21)筛选乳腺癌相关基因临床研究(n=400)验证确定与无转移生存最有关的21个基因基因表达谱-21试剂盒(RT-PCR技术)结果以复发风险评分(0-100):18分:低；18-31：中；31：高250/25000基因多(3)中心临床试验16个癌基因5个癌基因正常表达参考基因(reference genes)个体化医学与分子诊断胰腺癌分子诊断：PathFinderTG2010年1月1日启用由于标本量不足，或组织细胞学结果不能肯定作出病理学诊断时的辅助方法。可视为“分子解剖病理学”可确定诊断和预后，也可预测多器官系统的治疗反应检测步骤：1.显微解剖，从病理组织确定和获得异常细胞2

30、.抽提DNA和扩增(如PCR)3.DNA测序，确认致癌性基因突变4.整合分子诊断结果和病理学家提供的细胞或组织学发现，作出肯定诊断Jian Shen,J,et al,Cancer Cytopathol,2009;117:21727.个体化医学与分子诊断Jian Shen,J,et al,Cancer Cytopathol,2009;117:21727.包括3个检测项目：1.k-ras基因突变2.15个抑癌基因杂合性丢失(LOH)分析3.胰腺囊肿液中DNA 质量检定符合下述标准者定为“异常”1.k-ras 基因突变2.LOH 有两个位点突变3.高质量 DNA如无上述异常，则定为良性非黏蛋白胰腺囊

31、肿胰腺癌分子诊断：PathFinderTG个体化医学与分子诊断PathFinderTG 分子诊断标准分子诊断（MDx）良性非黏蛋白囊肿良性黏蛋白囊肿恶性（原位或浸润癌）标准1.DNA质量低到中等，和：2.未见k-ras基因点突变，和：3.LOH75%),或：2.LOH2个位点，高幅度(75%)个体化医学与分子诊断分子诊断改善胰腺癌的治疗Rina Wolf Testimony before House Committee on Small Business,Subcommittee on Regulations,Healthcare and Trade,May 14,2008可疑胰腺癌观察与等待

32、胰切除术可疑胰腺癌良性，不处理风险增高胰岛素不足胰腺癌积极治疗两种坏结果正确选择理想结果70%30%分子诊断PathFinderTG个体化医学与分子诊断过去 宏观水平检测检测只是判断有无疾病根据部位和改变程度诊断疾病实验室诊断技术的进步今天 分子水平检测根据细胞生物学或DNA诊断疾病检测可区分疾病类别预测特定治疗结果预测不良反应监测疾病进展明天 预测性检测多技术平台，更高精确度多因素分析常见和复杂疾病多基因信息作为疾病诊断标准新的检测标本:尿、唾液、呼吸气、其他更多应用诊断性影像学个体化医学与分子诊断分子诊断的今天与明天当今形态学检查稳定、基本的方法单个基因检测组织标本时间不定，取决与病理学家

33、病理学报告和解释结果未来分子检查许多新出现和建立的方法-包括芯片多基因 /多方法多种类型的标本时间点可控 （试剂盒）分子学实验室直接向临床医生提供诊断结果个体化医学与分子诊断个体化药物治疗的伦理、法律、社会问题（1）保护个人基因信息隐私权未经本人同意，均不能获知相关的个人基因信息。尊重被检者本人因种种原因而不愿知道自己某些基因信息的选择。基因检测单位应制定合理获得、转移、保留个人遗传信息的程序和规定。（2）尊重个人基因知情权检测前，必须告知被检者检测的目的、意义、程序、结果及风险，由本人同意。经本人同意而得出的检测结果，应当真实地告知个人。科学地、全面地、正面地向其解释在疾病发生中的风险评估以及在药物治疗当中的积极意义，使病人能正确地、积极地对待个体的基因信息。(3)反对基因歧视原则个人的基因信息可能带来基因歧视。要保护个体不受基因歧视，在当今首要的是要保护个人基因信息的隐私，其次就是要建立完善的法律体系和社会道德体系。在个体化治疗的基因检测中，虽然不是以遗传性疾病检测和疾病预测为目的，但因其仍需检测基因突变且存在潜在的疾病易感性和预后预测的可能，会带来社会、心理及经济的风险。因此，除体细胞突变检测外，在采集标本前应告知患者以上风险并签署知情同意书。个体化医学与分子诊断2022-10-15个体化医学与分子诊断