医学文献检索总论课件.pptx
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1、医学文献检索总论医学文献检索总论教材与参考资料教材与参考资料医药信息素养(胡家荣主编医药信息素养(胡家荣主编,人民军医出版社),人民军医出版社)各种电子数据库中的各种电子数据库中的 指南指南帮助帮助医学信息检索实习指导(教研室医学信息检索实习指导(教研室自编,网页)自编,网页)检索效果的评价检索效果的评价 用户相关性判断系统匹配性判断相关文献非相关文献总计被检出文献a(命中)b(误检)a+b未检出文献c(漏检)d(正确拒绝)c+d总计a+cb+da+b+c+d 查全率(R)=a/(a+c)*100%查准率(P)=a/(a+b)*100%概述检索课检索课文献的获取文献的获取文献管理工具文献管理工
2、具文献综合利用文献综合利用文献筛选评价文献筛选评价图书文献获取期刊文献获取特种文献获取生物信息获取馆藏书目信息全文图书信息摘要库全文库事实数据获取中文摘要库外文摘要库中文全文库外文全文库本课程主要内容本课程主要内容:n绪论(基础概念、理论)绪论(基础概念、理论)n馆藏检索、公共图书馆资源检索馆藏检索、公共图书馆资源检索n中文期刊摘要库、中文书刊全文库中文期刊摘要库、中文书刊全文库n外文期刊摘要库、外文期刊全文库外文期刊摘要库、外文期刊全文库n文献管理工具文献管理工具n网络检索工具、特种文献检索网络检索工具、特种文献检索n信息筛选分析及综合利用案例信息筛选分析及综合利用案例n7次上机实习次上机实
3、习n第一部分:基本概念第一部分:基本概念n第二部分:检索技术第二部分:检索技术n第三部分:医学常用数据库第三部分:医学常用数据库n第四部分:检索案例分析第四部分:检索案例分析 涉及人体的医学研究必须遵从普遍接涉及人体的医学研究必须遵从普遍接受的科学原则,受的科学原则,应对科学文献和相关资应对科学文献和相关资料全面了解料全面了解,并有充分的实验和动物试,并有充分的实验和动物试验(如有必要)的基础上进行。验(如有必要)的基础上进行。-世界医学协会赫尔辛基宣言概述第一部分:第一部分:基本概念基本概念1、信息与知识、信息与知识n信息(Information):广义(客观性):信息是事物存在和运动状态及
4、其特性的反映;狭义(主观性):信息是针对一定对象的需要而传递的有参考价值的新信息和新知识。n知识(Knowledge):是信息的一部分,系统化的信息才是知识。概述 信息是使人原有的知识结构发生变化的信息是使人原有的知识结构发生变化的那一小部分内容。那一小部分内容。KS+KS+I I=KS+=KS+SS =KS+=KS+KSKSK=knowledge(K=knowledge(知识知识),S=structure(),S=structure(结构结构),I I=information=information(信息)(信息)-英英 B.C.Brookes 1980 B.C.Brookes 1980 布
5、鲁克斯信息理论布鲁克斯信息理论概述2、信息素养、信息素养n信息素养(Information Literacy)是人们能够判断确定何时需要信息、并能够对信息进行检索、评价和有效利用的能力。信息素养包括信息意识、信息技能和信息伦理三方面。概述信息素养信息素养概述3、文、文 献献n文献(Document,Literature)是指记录着知识的一切载体;n医学文献就是记录着医学知识、信息的物质载体,如医学图书、期刊、会议录等等。概述印刷印刷型型缩微缩微型型电子文献电子文献按载体形式划分文献的类型(按载体形式划分)文献的类型(按载体形式划分)印刷型文献印刷型文献图书图书期刊期刊报纸报纸特种文献特种文献图
6、书图书图书图书图书图书图书图书期刊期刊报纸报纸报纸报纸报纸报纸图书图书图书图书期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊期刊特种文献特种文献特种文献特种文献特种文献特种文献期刊期刊ISBN号内容系统理论成熟新颖性较差图书图书期刊期刊ISSN号内容不系统理论不成熟新颖性较好报纸报纸消息、报道专业性不强不适宜作学术论文引用源电子版电子版书、刊书、刊/e-book,e-journal,及其它文献,及其它文献 印刷版印刷版书、刊书、刊/print,及其它文献及其它文献香港大学香港大学 馆藏缩微型文献示馆藏缩微型文献示例例n一次文献(原始文献)n二次文献(书目文献、索引)n三次文献(教科书、参
7、考工具书、综述等)n零次文献(私人笔记、试验记录、设计草图、口头交流的信息等)按加工层次划分文献的类型(按加工层次划分文献的类型(按加工层次划分)4、期刊影响因子:反映期刊的、期刊影响因子:反映期刊的整体水平整体水平n期刊影响因子(Impact Factor,IF)指期刊近两年的平均被引用率,最早是由美国情报学家SCI创始人尤金加菲尔德(Eugene Garfield)博士在1972年提出来的。nIF=(C2+C3)/(A2+A3)n以1996年Science杂志为例:nA21995年出版的文献数1037(篇),nA31994年出版的文献数1054(篇),nC21995年出版的文献在1996年
8、被引用的次数24189(次),nC31994年出版的文献在1996年被引用的次数25170(次)。nIF23.605(次篇)。概述一种新的出版模式:公开获取(一种新的出版模式:公开获取(OA)示例示例OA Journal Successes:PLoS Biologynfeatures works of exceptional significance in all areas of biological science,from molecules to ecosystems,including works at the interface with other disciplines,suc
9、h as chemistry,medicine,and mathematicsnPublic Library of Sciencenimpact factor:14.7概述反映期刊的反映期刊的整体水平整体水平n核心期刊(Core Journal)是指那些发表该学科(或该领域)论文较多、使用率(含被引率、摘转率和流通率)较高、学术影响较大的期刊。n 它们具有数量少(一般占期刊总数的5-15%),但信息量大(占期刊信息量的50%以上);n浏览核心期刊可在较短的时间 内掌握较多的信息,了解最新的科研动态等。概述n国际三大索引:1.SCI科学引文索引:Science Citation Index 2.
10、EI工程索引:The Engineering Index 3.ISTP科技会议录索引:Index to Scientific&Technical Proceedings n国内三大自科核心期刊目录1.中文核心期刊(医学:223种)-北京大学图书馆2.中国科技论文统计源期刊-中国科学技术信息研究所3.中国科学引文数据库(CSCD)-中国科学院文献情报中心 概述医学文献的现状和发展趋势医学文献的现状和发展趋势 n数量大、增长快数量大、增长快n出版类型复杂多种出版类型复杂多种n内容分散、交叉、重复内容分散、交叉、重复 n新陈代谢频繁、传播迅速新陈代谢频繁、传播迅速 n文献发表时滞严重文献发表时滞严重
11、 概述医学文献的增长情况医学文献的增长情况概述n8000 articles published per dayn25,000 biomedical journals in printn1500 medical articles onto Medline per dayWhats so difficult about medical articles?概述6、文献、文献/信息检索信息检索有效地选择和利用信息的科学方法与手段就有效地选择和利用信息的科学方法与手段就是是文献/信息检索。广义:信息存储与信息检索(两个方面)广义:信息存储与信息检索(两个方面)狭义:仅指信息用户查找信息的过程。狭义:仅指
12、信息用户查找信息的过程。7、文献、文献/信息检索的基本原理信息检索的基本原理 信息存储时,将采集到的大量分散的源信息存储时,将采集到的大量分散的源信息(一次文献),经过标引著录,加工信息(一次文献),经过标引著录,加工整理,使之有序化后形成各类信息集合(整理,使之有序化后形成各类信息集合(数据库);数据库);信息检索时,将要查找的信息特征标识信息检索时,将要查找的信息特征标识与信息集合中已存储的信息特征标识进行与信息集合中已存储的信息特征标识进行比较、匹配,双方特征标识完全一致或部比较、匹配,双方特征标识完全一致或部分一致时,检索即为命中。分一致时,检索即为命中。检索原理示意图检索原理示意图
13、文献信息检索标识数据库标引存储检索表达式检索提问规范检索语言检索匹配运算输出检索结果采集文献文献/信息检索的分类信息检索的分类按检索对象划分:按检索对象划分:数据检索数据检索(data retrieval)事实检索事实检索(fact retrieval)文献检索文献检索(literature retrieval)按检索技术手段划分:按检索技术手段划分:手工检索手工检索 计算机检索计算机检索 网络查询与交流网络查询与交流确定性检索,可确定性检索,可直接获得解答。直接获得解答。数据检索数据检索 又称数值检索,检索对象为特定的又称数值检索,检索对象为特定的数值数据,主要回答数值数据,主要回答“是多少
14、是多少”一类的一类的问题,属于确定性检索的范围。如:问题,属于确定性检索的范围。如:物质的各种参数、电话号码、银行帐物质的各种参数、电话号码、银行帐号、各类统计数字、化学药物的理化号、各类统计数字、化学药物的理化常数,常用计量等。常数,常用计量等。数据检索需借助相关的参考工具书数据检索需借助相关的参考工具书或通过数值型数据库。或通过数值型数据库。事实检索事实检索 又称事项检索,检索对象为特定的又称事项检索,检索对象为特定的事实,主要回答事实,主要回答“是谁是谁”或或“是什么是什么”一类一类的问题,也属于确定性检索。如:名词的问题,也属于确定性检索。如:名词、概念、标准、法律法规等。、概念、标准
15、、法律法规等。事实检索主要借助参考工具书或事事实检索主要借助参考工具书或事实型数据库。如美国实型数据库。如美国MedlinePlus平台平台的的drug information,dictionary等数等数据库。据库。文献(型)检索文献(型)检索 以某些特定的文献为检索对象,检索结果以某些特定的文献为检索对象,检索结果是关于某一课题的切题文献或相关文献。如是关于某一课题的切题文献或相关文献。如:查国内外近五年关于:查国内外近五年关于“早老素与老年痴呆早老素与老年痴呆的关系的关系”方面的研究文献。方面的研究文献。文献检索属于相关性检索,系统仅提供相文献检索属于相关性检索,系统仅提供相关的文献线索
16、、文献摘要或全文以供检索者关的文献线索、文献摘要或全文以供检索者参考阅读和分析研究。参考阅读和分析研究。文献检索借助手工检索工具或大型期刊文文献检索借助手工检索工具或大型期刊文献数据库(书目型或全文型数据库)。献数据库(书目型或全文型数据库)。检索方式检索方式n手工检索手工检索(1879-1879-)(印刷型检索工具)(印刷型检索工具)美国医学索引中文科技资料目录美国医学索引中文科技资料目录n计算机检索计算机检索(1960-1960-)(包括计算机,操(包括计算机,操作系统,数据库,检索软件)如:作系统,数据库,检索软件)如:CBMMEDLINEn网络查询与交流网络查询与交流(1990-199
17、0-)(利用各种搜(利用各种搜索引擎,访问各类信息资源站点、查询索引擎,访问各类信息资源站点、查询网络数据库、通过电子邮件、讨论组等)网络数据库、通过电子邮件、讨论组等)n数值数据库数值数据库(Numeric Database)(Numeric Database)存储各种统计、实验、测量等方面的存储各种统计、实验、测量等方面的数据。数据。n事实数据库事实数据库(Fact Database)(Fact Database)存储描述事物等信息的情况过程和现存储描述事物等信息的情况过程和现象的事实。(如各类电子版字辞典)象的事实。(如各类电子版字辞典)n文献数据库文献数据库(Literature Da
18、tabase)Literature Database)数据库类型数据库类型文献型数据库文献型数据库n书目数据库书目数据库(Bibliographic Database)(Bibliographic Database)存储文献的外部特征,主要包括文献存储文献的外部特征,主要包括文献的的题名题名、著者著者、著者单位、所载期刊、著者单位、所载期刊刊名刊名,出版年出版年、卷、期和起止页码卷、期和起止页码,可以包括可以包括摘要摘要,但不包括文献的全文。,但不包括文献的全文。n全文数据库全文数据库(Full Text Database)(Full Text Database)与书目数据库相对而言。主要存储
19、原与书目数据库相对而言。主要存储原始文献的全文,如期刊论文、报纸新始文献的全文,如期刊论文、报纸新闻、法律法规、政府出版物等。闻、法律法规、政府出版物等。文献型数据库的一般结构文献型数据库的一般结构n数据库数据库(data bankdata bank)文档文档(filefile,通常按年限划分)通常按年限划分)记录记录(recordrecord,单元单元论文)论文)字段字段(fieldfield)v字段用来记录和描述每篇文献的外表特征字段用来记录和描述每篇文献的外表特征和内容特征。(如:题名、作者、摘要)和内容特征。(如:题名、作者、摘要)数据库常见字段数据库常见字段 题名(题名(Title,
20、Title,TITI)著者(著者(Author,Author,AU AU)著者单位地址(著者单位地址(Address,Address,ADAD)出处(出处(Source,Source,SOSO)摘要(摘要(Abstracts,Abstracts,ABAB)文献类型文献类型(Publication type,Publication type,PTPT)n文献题录三要素(线索):文献题录三要素(线索):题名题名 著者著者 出出处处题题录录第二部分:第二部分:检索技术检索技术n不论是最早的不论是最早的单机或联机单机或联机检索,或是目检索,或是目前流行的前流行的网络查询网络查询,一般使用的检索技,一般
21、使用的检索技术主要包括:术主要包括:布尔逻辑检索布尔逻辑检索 截词检索截词检索 邻近检索(位置检索)邻近检索(位置检索)字段限定检索字段限定检索网络信息检索规则网络信息检索规则1.布尔逻辑检索技术n布尔逻辑检索布尔逻辑检索是建立最早、应用最为广是建立最早、应用最为广泛的检索理论和检索技术,也是最简单、泛的检索理论和检索技术,也是最简单、最基本的计算机检索的匹配模式。最基本的计算机检索的匹配模式。n逻辑检索以布尔逻辑表达式来表达用户逻辑检索以布尔逻辑表达式来表达用户的检索要求,并通过的检索要求,并通过逻辑运算符逻辑运算符连接两连接两个以上的检索词,从而实现两个以上概个以上的检索词,从而实现两个以
22、上概念的逻辑组配检索。念的逻辑组配检索。布尔逻辑示意图运算符:运算符:AND,*起缩小检索范围,起缩小检索范围,提高查准率的作用。提高查准率的作用。运算符:运算符:OR,+起扩大检索范围,起扩大检索范围,提高查全率的作用。提高查全率的作用。运算符:运算符:NOT,-起缩小检索范围,起缩小检索范围,用于去除检出文献中用于去除检出文献中不需要的部分。不需要的部分。逻辑与逻辑与逻辑或逻辑或逻辑非逻辑非布尔逻辑表达式nchild and asthma 小儿哮喘小儿哮喘nlung cancer and smoking 吸烟与肺癌吸烟与肺癌ntrace elements not zinc 除锌以外的微量元
23、素除锌以外的微量元素n肝癌或肝细胞瘤的诊断肝癌或肝细胞瘤的诊断 (肝癌肝癌 or 肝细胞瘤肝细胞瘤)and 诊断诊断n优先级:优先级:()NOT AND ORn布尔运算符在不同的检索系统中有不同的表达方式(在线浏览)清华同方的“中国学术期刊全文库”CBM PubMed Google et al.2.截词检索技术n截词检索截词检索(Truncation)是将检索词截断,是将检索词截断,取其中的一部分片段,再加上截词符号一取其中的一部分片段,再加上截词符号一起输入计算机,系统自动将词片段与数据起输入计算机,系统自动将词片段与数据库中的索引词匹配,凡含有该词片段的文库中的索引词匹配,凡含有该词片段的
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