基因诊断和基因治疗教学课件.pptx
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- 基因 诊断 基因治疗 教学 课件
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1、基因诊断基因诊断(gene diagnosis)(gene diagnosis):以以DNADNA和和RNARNA为诊断材料,为诊断材料,应用分子生物应用分子生物学技术方法,直接检查基因的结构、或表达是否学技术方法,直接检查基因的结构、或表达是否异常,对人体状态和疾病作出诊断的方法。异常,对人体状态和疾病作出诊断的方法。一、诊断下列两种类型疾病:一、诊断下列两种类型疾病:1 1、内源基因的变异、内源基因的变异 基因结构的异常基因结构的异常基因致病基因致病 基因表达的异常基因表达的异常2 2、外来生物的入侵、外来生物的入侵 基因诊断的特点:基因诊断的特点:1.1.特异性高,针对性强:特异性高,针
2、对性强:使用基因探针通过分子杂交使用基因探针通过分子杂交进行高特异性分析以基因作为检测对象,属于病因诊进行高特异性分析以基因作为检测对象,属于病因诊断或发病原因分析。断或发病原因分析。2.2.灵敏度高灵敏度高:用放射性同位素、酶或化学发光试剂标用放射性同位素、酶或化学发光试剂标记探针,有很高的检测灵敏度,记探针,有很高的检测灵敏度,PCRPCR扩增也有很高的扩增也有很高的灵敏度。灵敏度。3.3.早期诊断:早期诊断:无临床表现无临床表现4.4.取样方便:取样方便:不受组织时相限制不受组织时相限制5.5.安全高效:安全高效:不必培养高危病菌病毒,还可分亚型不必培养高危病菌病毒,还可分亚型6.6.适
3、应范围广:适应范围广:可检测内源性基因和外来基因。可检测内源性基因和外来基因。二、基因诊断的遗传标记n1.人类基因组中存在三类主要的遗传变异n(1)第一代多态性标记是RFLP(限制性片段长度多态性)n(2)第二代短串联重复多态性(short tandem repeat polymorphism STRP)n(3)第三代多态性标记是单核苷酸的多态性SNP第一代多态性标记是RFLP(restriction fragment length polymorphism,限制性片段长度多态性)第二代多态性标记是短的串联重复序列 包括小卫星DNA和微卫星DNA,其多态性主要来自重复序列拷贝数的变化小卫星DN
4、A由15-65bp的基本单位串联重复而成,长度一般不超过20kb。重复次数(小卫星DNA区的长度)在人群中是高度变异的;按照孟德尔的规律遗传微卫星DNA/简短串联重复(STR、STRP或SSLP)重复单元2-8bp,通常重复10-60次CTAGCTTATATATATATATATATATATATAAGCTTGC第三代多态性标记是单核苷酸的多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)SNP:是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。人类999的基因密码是相同的,而差异不到01,不同人群仅有140万个核苷酸差异。这些差异是由“单一核苷酸多样性”(SNP)产生的,它构
5、成了不同个体的遗传基础,从而说明人类不同“种属”之间并没有本质上的区别。SNP与RFLP和STR标记的主要不同之处在于,它不再以DNA片段的长度变化作为检测手段,而直接以序列变异作为标记。三、人类疾病与基因密切相关n1、基因结构改变导致蛋白质的结构或数量发生变化导致疾病n2、基因表达异常n3、病原生物基因入侵导致疾病n4、可遗传的基因组变异导致人类疾病易感性差异四、基因诊断中常用的分子生物学技术四、基因诊断中常用的分子生物学技术n核酸分子杂交(核酸分子杂交(Nucleic acid hybridizationNucleic acid hybridization)n聚合酶链式反应聚合酶链式反应(
6、PCR)(PCR)n单链构象多态性(单链构象多态性(SSCPSSCP)n限制性片段长度多态性(限制性片段长度多态性(RFLPRFLP)nDNADNA序列测定(序列测定(DNA sequencingDNA sequencing)n生物芯片(生物芯片(biochipsbiochips)nWesternWestern免疫印迹(免疫印迹(Western blottingWestern blotting)n免疫组织化学诊断免疫组织化学诊断 基因诊断中常用的分子生物学方法比较基因诊断中常用的分子生物学方法比较 方法方法 优点与问题优点与问题 解决方案解决方案核酸分子杂交核酸分子杂交结果可靠但操作繁琐结果可
7、靠但操作繁琐选择合适的探针选择合适的探针 PCRPCR灵敏度、特异性高灵敏度、特异性高设计合适的引物设计合适的引物 SSCPSSCP操作简便、检出率不高操作简便、检出率不高选择合适的片段选择合适的片段 RFLPRFLP结果可靠但限制较多结果可靠但限制较多选择合适的限制酶选择合适的限制酶 DNADNA测序测序可自动化,但不适宜广泛使可自动化,但不适宜广泛使用用与与PCRPCR配合使用配合使用生物芯片生物芯片效率高,成本高,不适宜广效率高,成本高,不适宜广泛使用泛使用选择合适的芯片选择合适的芯片 遗传病的基因诊断遗传病的基因诊断 Gene Diagnosis of Hereditary Gene
8、Diagnosis of Hereditary DiseasesDiseases(一)镰状细胞贫血病(一)镰状细胞贫血病一、血红蛋白病一、血红蛋白病1.1.镰状红细胞贫血患者基因诊断镰状红细胞贫血患者基因诊断-ASO-ASO杂交法杂交法2.HBS2.HBS的限制性内切酶谱分析的限制性内切酶谱分析3.HBS3.HBS的的PCR-RFLPPCR-RFLP分析分析 n正常的(正常的(N N)的)的ASOASO探针:探针:5 5-ACT CCT G-ACT CCT GA AG GAG AAG TCT GC-3G GAG AAG TCT GC-3 n突变的(突变的(M M)的)的ASOASO探针:探针:
9、5 5-ACT CCT G-ACT CCT GT TG GAG GAAG TCT GC-3G GAG GAAG TCT GC-3 1.1.镰状红细胞贫血患者基因诊断镰状红细胞贫血患者基因诊断ASOASO杂交法杂交法M NM NM NM NM NM NM NM N5 5 3 3 正常基因正常基因1.15kb1.15kb(CCT GAG G)(CCT GAG G)5 3 突变基因突变基因1.35kb1.35kb(CCT G(CCT GT TG G)G G)镰状红细胞贫病的限制性内切酶谱分析镰状红细胞贫病的限制性内切酶谱分析MstMst酶切位点酶切位点(CCTNAGGCCTNAGG)2.HBS2.H
10、BS的限制性内切酶谱分析的限制性内切酶谱分析目目 录录0.2kb0.2kb1.15kb1.15kb1.35kb1.35kb正常人正常人突变携带者突变携带者患者患者镰状红细胞贫血病的限制性内切酶谱分析镰状红细胞贫血病的限制性内切酶谱分析目目 录录 PCR-SSCP技术检测技术检测DNA突变突变 传染病的基因诊断传染病的基因诊断 Gene Diagnosis of Infectious Gene Diagnosis of Infectious DiseasesDiseases 一、病毒性疾病一、病毒性疾病n甲型肝炎病毒(甲型肝炎病毒(HAVHAV)HAVHAV系系RNARNA病毒,利用病毒,利用R
11、T-PCRRT-PCR技术可从粪便中检技术可从粪便中检测出甲型肝炎病毒的基因组测出甲型肝炎病毒的基因组RNARNA。n乙型肝炎病毒(乙型肝炎病毒(HBVHBV)设计保守区序列引物,扩增各型设计保守区序列引物,扩增各型HBV DNAHBV DNA片段;片段;设计位于可变区的引物扩增某一亚型设计位于可变区的引物扩增某一亚型HBV DNAHBV DNA,以便分型。以便分型。n丙型肝炎病毒(丙型肝炎病毒(HCVHCV)HCVHCV为正链为正链RNARNA病毒,先反转录成病毒,先反转录成cDNAcDNA,再进行,再进行巢式巢式PCRPCR检测检测HCVHCV。肿瘤的基因诊断肿瘤的基因诊断Gene Dia
12、gnosis of Malignant TumorsGene Diagnosis of Malignant Tumors一、原癌基因与抑癌基因的检测一、原癌基因与抑癌基因的检测1 1原癌基因的检测原癌基因的检测 rasras 基因家族基因家族由由H-rasH-ras、K-rasK-ras和和N-rasN-ras组成。最组成。最常见的突变是第常见的突变是第1212、1313、5959或第或第6161位密码子的点突变。位密码子的点突变。胰腺癌、结肠癌、肺癌以胰腺癌、结肠癌、肺癌以K-rasK-ras突变为主,如第突变为主,如第1212位密码子突变,由编码甘氨酸的位密码子突变,由编码甘氨酸的GGTG
13、GT突变为突变为TGTTGT、GTTGTT或或GATGAT,少,少数突变为数突变为GCTGCT。急性淋巴细胞白血病,慢性淋巴细胞白血病等以急性淋巴细胞白血病,慢性淋巴细胞白血病等以N-N-rasras突变为主;泌尿系统肿瘤则以突变为主;泌尿系统肿瘤则以H-rasH-ras突变为主。突变为主。PCRPCR及及PCR-SSCPPCR-SSCP分析:分析:扩增扩增ras ras 基因第基因第1212位密码位密码子点突变部位,再用子点突变部位,再用SSCPSSCP技术进行分析,或者直接技术进行分析,或者直接测序确定患者测序确定患者rasras原癌基因的点突变。原癌基因的点突变。核苷酸杂交技术(如核苷酸
14、杂交技术(如ASOASO):):检测检测rasras基因第基因第1212位位密码子点突变。密码子点突变。2.2.ras ras原癌基因突变常用的检测方法原癌基因突变常用的检测方法3 3抑癌基因抑癌基因p53p53的检测的检测 np53p53基因以密码子第基因以密码子第175175位、第位、第248248位、第位、第249249位、位、第第273273位及位及 第第282282位点突变率最高。在结直肠癌、位点突变率最高。在结直肠癌、乳腺癌、小细胞肺癌,都可见异常的乳腺癌、小细胞肺癌,都可见异常的p53p53基因蛋白。基因蛋白。np53p53的基因诊断方法有的基因诊断方法有 (1 1)PCR-SS
15、CPPCR-SSCP分析技术分析技术 (2 2)DNADNA序列分析序列分析 (3 3)PCR-RFLPPCR-RFLP分析分析基因治疗基因治疗Gene TherapyGene Therapyn基因治疗:基因治疗:指将目的基因通过基因转移技指将目的基因通过基因转移技术(病毒载体介导或者非病毒载体介导的术(病毒载体介导或者非病毒载体介导的基因转移技术)导入靶细胞内,目的基因基因转移技术)导入靶细胞内,目的基因表达产物对疾病起治疗作用。表达产物对疾病起治疗作用。(一)基因置换(一)基因置换(gene replacementgene replacement)定义:定义:指将特定的目的基因导入特定细胞
16、,通过指将特定的目的基因导入特定细胞,通过定位重组,导入的正常基因,以置换基因组内原定位重组,导入的正常基因,以置换基因组内原有的缺陷基因。有的缺陷基因。目的:目的:将缺陷基因的异常序列进行桥正。将缺陷基因的异常序列进行桥正。对缺陷基因的缺陷部位进行精确的原位修复,对缺陷基因的缺陷部位进行精确的原位修复,不涉及基因组的任何改变。不涉及基因组的任何改变。一、基因治疗的策略一、基因治疗的策略n转导基因的载体与基因组转导基因的载体与基因组DNADNA具有相同的序具有相同的序列。带有目的基因的载体就能找到同源重列。带有目的基因的载体就能找到同源重组的位点,进行部分基因序列的交换。组的位点,进行部分基因
17、序列的交换。n基因同源重组技术又称为基因同源重组技术又称为基因打靶(基因打靶(gene gene targeting)targeting)基因同源重组技术基因同源重组技术(二)(二)基因添加基因添加(gene augmentationgene augmentation)定义定义:通过导入外源基因使靶细胞表达其本身通过导入外源基因使靶细胞表达其本身 不表达的基因。不表达的基因。类型类型:在有缺陷基因的细胞中在有缺陷基因的细胞中导入相应的正常基因导入相应的正常基因,而细胞内的缺陷基因并未除去,通过导入正常基而细胞内的缺陷基因并未除去,通过导入正常基因的表达产物,补偿缺陷基因的功能;因的表达产物,补
18、偿缺陷基因的功能;n向靶细胞中向靶细胞中导入靶细胞本来不表达的基因导入靶细胞本来不表达的基因,利用,利用其表达产物达到治疗疾病的目的。其表达产物达到治疗疾病的目的。(三)基因干预(三)基因干预(gene interferencegene interference)定义:定义:采用特定的方式采用特定的方式抑制某个基因的表达抑制某个基因的表达,或,或者通过破坏某个基因的结构而使之不能表达,者通过破坏某个基因的结构而使之不能表达,以达到治疗疾病的目的。以达到治疗疾病的目的。反义反义RNARNA,核酶,核酶,RNAiRNAi等等n定义:定义:将将“自杀自杀”基因导入宿主细胞中,这种基基因导入宿主细胞中
19、,这种基因编码的酶能使无毒性的药物前体转化为细胞毒因编码的酶能使无毒性的药物前体转化为细胞毒性代谢物,诱导靶细胞产生性代谢物,诱导靶细胞产生“自杀自杀”效应,从而效应,从而达到清除肿瘤细胞的目的。达到清除肿瘤细胞的目的。n应用:应用:是恶性肿瘤基因治疗的主要方法之一。是恶性肿瘤基因治疗的主要方法之一。(四)自杀基因治疗(四)自杀基因治疗(Suicide Gene Therapy(Suicide Gene Therapy)自杀基因的作用机制自杀基因的作用机制 (五)基因免疫治疗(五)基因免疫治疗 通过将抗癌免疫增强的细胞因通过将抗癌免疫增强的细胞因子或子或MHCMHC基因导入肿瘤组织,以增强肿基
20、因导入肿瘤组织,以增强肿瘤微环境中的抗癌免疫反应。瘤微环境中的抗癌免疫反应。THANK YOUSUCCESS2022-10-1439可编辑二、基因转移技术二、基因转移技术 基因治疗的两种途径基因治疗的两种途径n体内法基因治疗体内法基因治疗n体外法基因治疗体外法基因治疗 基因转移基因转移(gene transfer)gene transfer)技术技术 1.1.病毒介导的基因转移病毒介导的基因转移 2.2.非病毒介导的基因转移非病毒介导的基因转移 1.1.病毒介导的基因转移系统病毒介导的基因转移系统 病毒载体病毒载体 介导的基因转移效率较高,也是使用最介导的基因转移效率较高,也是使用最多的基因治
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