基因功能分析课件.ppt
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- 基因 功能分析 课件
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1、第八章 基因注释与功能分类第一节 引 言背景随着后基因组(post-genomics)时代的来临,基因组学的研究重心开始从阐明所有遗传信息转移到在整体分子水平对功能进行研究。这种转变的一个重要标志是产生了功能基因组学(functional genomics)。任务功能基因组学的主要任务之一是进行基因组功能注释(Genome annotation),了解基因的功能,认识基因与疾病的关系,掌握基因的产物及其在生命活动中的作用等。意义快速有效的基因注释对进一步识别基因,研究基因的表达调控机制,研究基因在生物体代谢途径中的地位,分析基因、基因产物之间的相互作用关系,预测和发现蛋白质功能,揭示生命的起源
2、和进化等具有重要的意义。第二节 基因注释数据库 一、研究人员已经掌握了大量的全基因组数据,同时关于基因、基因产物以及生物学通路的数据也越来越多,解释生物学实验的结果,尤其从基因组角度,需要系统的方法。基因注释数据库产生的原因基因注释数据库产生的原因 二、在基因组范围内描述蛋白质功能十分复杂,最好的工具就是计算机程序,提供结构化的标准的生物学模型,以便计算机程序进行分析,成为从整体水平系统研究基因及其产物的一项基本需求。一、一、基因本体(基因本体(Gene Ontology,GO)数据库)数据库 基因本体数据库是GO组织(Gene Ontology Consortium)在2000年构建的一个结
3、构化的标准的标准生物学模型,旨在建立基因及其产物知识的标准词汇体系,涵盖了基因的细胞组分(细胞组分(cellular component)、分子功能()、分子功能(molecular function)、生物学过程生物学过程(biological process)。人民卫生出版社8年制及7年制临床医学等专业用生物信息学GO数据库收录的基因组数据列表数据库收录的基因组数据列表 人民卫生出版社8年制及7年制临床医学等专业用生物信息学人民卫生出版社8年制及7年制临床医学等专业用生物信息学人民卫生出版社8年制及7年制临床医学等专业用生物信息学一、使用一、使用GO数据库数据库 人民卫生出版社8年制及7年
4、制临床医学等专业用生物信息学举例举例 人民卫生出版社8年制及7年制临床医学等专业用生物信息学此图显示了该基因产物的基本信息,包括类型、物种、此图显示了该基因产物的基本信息,包括类型、物种、别名来源和序列别名来源和序列 人民卫生出版社8年制及7年制临床医学等专业用生物信息学此图显示了该基因产物此图显示了该基因产物的术语关联(的术语关联(Term Associations)图,图中)图,图中记录名称记录名称“Term”是是GO记录的名字,记录的名字,“Ontology”是该基因是该基因产物的特性,如要查看产物的特性,如要查看其分子功能,可点击其其分子功能,可点击其中的一条记录中的一条记录“nerv
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