X-ray晶体结构分析原理课件.ppt
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1、第二章第二章 X-ray晶体结构分析原理晶体结构分析原理 及其应用及其应用2-1 引言引言1、1895年,德国物理学家伦琴年,德国物理学家伦琴(Rntgen 1845-1923)在研究阴在研究阴极射线时,极射线时,发现发现了一种新的射线了一种新的射线X-ray,初时因为对它的本质初时因为对它的本质还不认识还不认识,故名故名X射线射线.2.X-ray 的应用的应用晶体的周期性结构使晶体能对晶体的周期性结构使晶体能对 X-ray中子流中子流电子流电子流产生衍射效应产生衍射效应X-ray衍射法衍射法中子衍射法中子衍射法电子衍射法电子衍射法这些衍射法能获得有关晶体结构可靠而精确的这些衍射法能获得有关晶
2、体结构可靠而精确的数据,其中最重要、用得最广泛的是数据,其中最重要、用得最广泛的是X-射线衍射线衍射法,是人们认识物质微观结构的重要途径。射法,是人们认识物质微观结构的重要途径。19121912年由劳厄年由劳厄(M.Von.Laue)首先提出用首先提出用X-ray研究晶体结构研究晶体结构 并由他的学生实验证实其在晶体中的衍射现象,并由他的学生实验证实其在晶体中的衍射现象,获得获得19141914年的诺贝尔奖年的诺贝尔奖 19121912年布拉格父子年布拉格父子(W.H.Bragg and W.L.Bragg)第一次用第一次用X-ray衍射法的方法成功地测定了衍射法的方法成功地测定了NaCl晶体
3、结构,晶体结构,19151915年获诺贝尔奖。年获诺贝尔奖。1951年,比沃埃年,比沃埃(J.M.Bijvoet)用用X-ray衍射法测定衍射法测定出出右旋酒石酸钠铷右旋酒石酸钠铷的晶体结构。的晶体结构。19531953年,美国化学家毕生年,美国化学家毕生(J.D.Watson)(J.D.Watson)和英国化学家克里克和英国化学家克里克(F.H.C.Cvick)(F.H.C.Cvick)根根据据X-rayX-ray的衍射数据,提出了的衍射数据,提出了脱氧核糖核脱氧核糖核酸的双螺旋结构酸的双螺旋结构模型。模型。1957年,克里弗特年,克里弗特(D.Crowfoot)测定了测定了维生素维生素B1
4、2的结构。的结构。X X射线衍射使我们了解了蛋白质晶体结构射线衍射使我们了解了蛋白质晶体结构19651965年,我国首次人工合成蛋白质年,我国首次人工合成蛋白质结晶牛胰岛素结晶牛胰岛素,在在19711971 19721972年又成功地进行了胰岛素结构的测定。年又成功地进行了胰岛素结构的测定。到到6060 7070年代,衍射法和计算机技术结合,年代,衍射法和计算机技术结合,实现了收集衍射数据的自动化,发展测定结构实现了收集衍射数据的自动化,发展测定结构的程序,使晶体结构的测定工作从少数晶体学的程序,使晶体结构的测定工作从少数晶体学家手中解放出来,而为广大有机化学家和无机家手中解放出来,而为广大有
5、机化学家和无机化学家所掌握。化学家所掌握。2-2 X-ray 的产生及其性质的产生及其性质1.X-ray 的产生的产生 在适当高真空的条件下在适当高真空的条件下(10-510-7mmHg),高速,高速电子流受金属靶电子流受金属靶(对阴极对阴极)的拦截即可得到的拦截即可得到X-射射线。此中包括线。此中包括三个条件三个条件:(c)通过通过“对阴极对阴极”的金属靶对高速电子实行拦截。的金属靶对高速电子实行拦截。(b)通过高压电通过高压电 (一般高压范围为一般高压范围为101102千伏千伏)使自使自 由电子加速,由阴极射向阳极由电子加速,由阴极射向阳极(对阴极对阴极)。(a)产生自由电子产生自由电子(
6、如通过烧灯丝,热发射自由电子如通过烧灯丝,热发射自由电子)。X光机的简单电路图光机的简单电路图封闭式封闭式X光管的结构图光管的结构图 X-ray 管阴极放出的热电子在高压电场管阴极放出的热电子在高压电场(不同金属(不同金属的阳极靶都有其临界电压,超过此电压可产生特征的阳极靶都有其临界电压,超过此电压可产生特征X-ray,如,如Cu靶的临界电压为靶的临界电压为8.981kV,但随着管电,但随着管电压的加高,特征压的加高,特征X-ray 的强度大幅度增强,所以,的强度大幅度增强,所以,Cu 的工作电压为的工作电压为 3040kV)作用下撞到作用下撞到X-ray源的源的阳极靶上,大部分阳极靶上,大部
7、分动能转化为热动能转化为热(需冷却水),小(需冷却水),小部分却会产生连续部分却会产生连续X-ray。2.X-ray 的波长范围的波长范围范围范围:约:约110000pm(0.01100)之间的电磁波。之间的电磁波。用于测定晶体结构的用于测定晶体结构的 X-ray:波长为:波长为:50250pm(0.52.5),此波长范围与,此波长范围与 晶体点阵面间距大致相当。晶体点阵面间距大致相当。医学上医学上:1400pm(0.014)(波长较短,穿透能波长较短,穿透能 力较强力较强),hard(硬硬),对人体有伤害对人体有伤害可知,小于可知,小于0.05nm(50pm)的波长的的波长的X-ray,其衍
8、射线其衍射线将过分集中在低角度区,不易分辨;而大于将过分集中在低角度区,不易分辨;而大于0.25nm(250pm)的的X-ray又易被样品和空气所吸收,衍射线又易被样品和空气所吸收,衍射线强度降低。强度降低。2dsin=n因由:由布拉格方程因由:由布拉格方程:X射线分析:射线分析:40010000pm(4100)(波长较长波长较长,穿透穿透 能力较低能力较低),soft(软软),对人体组织伤害更大对人体组织伤害更大一部分是由阳极金属材料成分决定的、波长一部分是由阳极金属材料成分决定的、波长确定的确定的特征特征X X射线射线 3.X-ray 的类别(两类)的类别(两类)由由X-射线管产生的射线管
9、产生的X-射线包含两部分:射线包含两部分:一部分是具有连续波长的一部分是具有连续波长的“白色白色”X X射线射线(1).白色白色X射线射线具有连续波长。由于电子与具有连续波长。由于电子与阳极物质撞击时,穿过一层物质,降低一部分动能,阳极物质撞击时,穿过一层物质,降低一部分动能,穿透深浅不同,降低动能不等,波长不同。穿透深浅不同,降低动能不等,波长不同。(2).特征特征X射线(单色)射线(单色)波长确定。并由阳波长确定。并由阳极金属材料成分决定,是由高速电子把原子内层电极金属材料成分决定,是由高速电子把原子内层电子激发,再由外层电子跃迁至内层,势能下降而发子激发,再由外层电子跃迁至内层,势能下降
10、而发生的生的X-射线,它的波长由原子能级决定。射线,它的波长由原子能级决定。LK:K(K1,K2)MK:KNK:K特征特征X射线(单色)射线(单色)KLMNe原子能级以及电子跃迁时产生原子能级以及电子跃迁时产生X-射线的情况射线的情况 1.高速电子流冲高速电子流冲击金属阳极击金属阳极,原子原子内层低能级电子内层低能级电子被击出被击出;n=1(K)n=2(L)n=3(M)K1K2K12.高能级电子跃高能级电子跃迁到低能级补充迁到低能级补充空位空位,多余能量以多余能量以X光放出光放出.X-射线的发生Cu 靶靶X-ray波长波长相应跃迁相应跃迁=(Cu K1)=154.056pm 2P3/22S1/
11、2(8.05Kev)=(Cu K2)=154.439pm2P1/22S1/2(8.03Kev)=(Cu K)=139.222pm2P3/22S1/22P1/22S1/2 等等因波长接近,强度小,所以因波长接近,强度小,所以可近似用可近似用K表示表示。各线强度比例:各线强度比例:I(Cu K2):I(Cu K1)=0.497I(Cu K):I(Cu K1)=0.200当分辨率低时,当分辨率低时,K1和和K2分不开,可用分不开,可用加权平均波长加权平均波长表示:表示:(Cu K)=1154.056pm+0.497 154.439pm1.497=154.18pm为了获得单色为了获得单色X-ray,需
12、将,需将K及白色射线滤去:及白色射线滤去:Cu靶产生的靶产生的X射线谱射线谱 可选择一种金属,它的可选择一种金属,它的吸收限吸收限波长处在波长处在K和和K之间,可吸收掉之间,可吸收掉K射线射线。我们以镍我们以镍(Ni)作为滤波单色器作为滤波单色器,即:即:采用采用0.02mm厚度的镍片厚度的镍片,可使可使K 和和K强度强度比从比从:7.5 :1上升到上升到500 :1 如上图如上图:Ni的吸收曲线在的吸收曲线在148.81pm处有一突变处有一突变,为为Ni的吸收限。的吸收限。2-3.晶体的晶体的X-ray衍射衍射一一、X-ray与晶体的作用与晶体的作用 当当X-ray照射到晶体时,所产生的物理
13、效照射到晶体时,所产生的物理效应比较复杂,应比较复杂,X-ray与与 晶体的作用方式总结:晶体的作用方式总结:x-ray晶体晶体透过(绝大部分),因其穿透能力强透过(绝大部分),因其穿透能力强吸收(小部分)吸收(小部分)反射(极小,可忽略)反射(极小,可忽略)非散射能量转化非散射能量转化(A)散射效应散射效应(B)频率变低,即由原生频率变低,即由原生X射线的光子轰击出原子射线的光子轰击出原子内层电子,再由其它内内层电子,再由其它内层电子补位而产生层电子补位而产生X荧荧光光子。光光子。A热能热能光电效应光电效应光电子光电子次生次生X荧光射线荧光射线(反冲电子及波长和方反冲电子及波长和方 向均改变
14、的次生散射)向均改变的次生散射)次生次生X-ray波长,位相波长,位相 与原生与原生X-ray相同,但相同,但方向部分发生改变。方向部分发生改变。晶体衍射是晶体衍射是相干散射相干散射。B相干散射相干散射不相干散射不相干散射相干散射效应是相干散射效应是X-ray在晶体中产生衍射的基础在晶体中产生衍射的基础X-ray(平面电磁波)(平面电磁波)作用作用晶体晶体晶体中晶体中原子周围的电子作周期性振动原子周围的电子作周期性振动次生波源次生波源(球面波,方向部分改变,频率、位相不变)(球面波,方向部分改变,频率、位相不变)机理如下机理如下:n X晶体晶体:1.大部分透过大部分透过 2.非散射能量非散射能
15、量转换转换:热能热能 光电效应光电效应 3.散射散射:不相干散射不相干散射 相干散射相干散射晶体的晶体的X射线衍射效应属射线衍射效应属于相干散射,次生射线于相干散射,次生射线与入射线的位相、波长与入射线的位相、波长相同,而方向可以改变相同,而方向可以改变.以上现象叫散射,所引起的波与波之间的以上现象叫散射,所引起的波与波之间的 加强加强 或削弱作用叫或削弱作用叫波的相干波的相干 原子核质量较大,在原子核质量较大,在x-ray作用下产生位移极小,作用下产生位移极小,散射效应也很小,故散射效应也很小,故相干散射主要是相干散射主要是x-ray作用于作用于 电子而发生的电子而发生的二、产生衍射的条件及
16、原理二、产生衍射的条件及原理 从从X-射线是波长在射线是波长在1一一10之间的一种电磁辐之间的一种电磁辐射,这个波长范围正好与晶体中的原子间距射,这个波长范围正好与晶体中的原子间距(1)数量级相同,因此,可以用晶体来作为数量级相同,因此,可以用晶体来作为X射线的天然的衍射光栅,从对衍射现象的分析,射线的天然的衍射光栅,从对衍射现象的分析,我们可以得到有关晶体结构的信息。我们可以得到有关晶体结构的信息。1 1、X射线与晶体光栅射线与晶体光栅2 2、X-射线在晶体中的衍射方向射线在晶体中的衍射方向直线点阵的衍射原理示意图直线点阵的衍射原理示意图 次生次生X X射线射线(球面波球面波)的相互加强形成
17、衍射的相互加强形成衍射如前图如前图:X射线从垂直于射线从垂直于 直线点阵的方向射入,每个直线点阵的方向射入,每个 原子的核外电子产生的相干波彼此发生干涉。原子的核外电子产生的相干波彼此发生干涉。当每两个相邻波源在某一方向的光程差当每两个相邻波源在某一方向的光程差等于波长等于波长的整数倍时,它们的波峰与波峰将互相叠加而得到最的整数倍时,它们的波峰与波峰将互相叠加而得到最大限度的加强。这种波的加强叫做衍射,相应的方向叫大限度的加强。这种波的加强叫做衍射,相应的方向叫衍射方向衍射方向在衍射方向上前进的波叫在衍射方向上前进的波叫衍射波衍射波。=0 的衍射方向与入射线的方向一致,叫的衍射方向与入射线的方
18、向一致,叫零次衍射零次衍射;=的衍射叫的衍射叫一次衍射一次衍射;=n 的衍射叫的衍射叫n次衍射次衍射.显然,显然,n不同,衍射方向也不相同不同,衍射方向也不相同.通过对衍射方向的测定通过对衍射方向的测定 可得到晶体的可得到晶体的点阵结构或晶胞的点阵结构或晶胞的大小大小和和形状形状的信息。的信息。3 3、X-射线在晶体中的衍射强度射线在晶体中的衍射强度 晶胞内部各原子或电子所散射的次生晶胞内部各原子或电子所散射的次生X射射线间相互干涉,可能会使部分衍射波减弱。甚至线间相互干涉,可能会使部分衍射波减弱。甚至相互抵消。相互抵消。衍射强度衍射强度与衍射方向有关与衍射方向有关与晶胞中原子的数目和位置有关
19、与晶胞中原子的数目和位置有关 设有一直线点阵的周期为设有一直线点阵的周期为a,一个结构基元中有,一个结构基元中有两个原子两个原子A、B,B位置在以位置在以A为原点的为原点的1/4 1/4 a 处。处。设入射设入射X射线的方向与射线的方向与a a垂直,在垂直,在A与与A、B与与B原子间散射的次生原子间散射的次生X 射线的波程差为波长的整数射线的波程差为波长的整数倍倍(即即AA=h 与与BB=h,h=0,1,2,)的方向,波的方向,波相互得到最大加强。相互得到最大加强。相干波的加强和减弱相干波的加强和减弱 衍射衍射h=1AB=1/4(削弱削弱)衍射衍射h=2AB=1/2(完全抵消完全抵消)衍射衍射
20、h=0 AB=0 对结构基元中原子对结构基元中原子A与原子与原子B所散射的次生所散射的次生x 射射线来说,当线来说,当h0,4,时,也是相互时,也是相互 加强的。但加强的。但当当h1 1时,二者的时,二者的AB=1/4 。由图可见,二波间。由图可见,二波间发生干涉而减弱;当发生干涉而减弱;当h2 2时,时,AB=1/2 ,正好波正好波峰与波谷叠加,相互完全抵消。峰与波谷叠加,相互完全抵消。2-4.衍射方向与晶胞参数衍射方向与晶胞参数晶体衍射方向晶体衍射方向是指晶体在入射是指晶体在入射x-射线照射下产射线照射下产 生的衍射线偏离入射线的角度。生的衍射线偏离入射线的角度。衍射方向决定于衍射方向决定
21、于:晶体内部结构周期重复的方式晶体内部结构周期重复的方式 和晶体安置的方位。和晶体安置的方位。测定晶体的衍射方向,可以求得晶胞的大小和形状。测定晶体的衍射方向,可以求得晶胞的大小和形状。联系联系衍射方向衍射方向晶胞大小、形状晶胞大小、形状 的的两个方程两个方程:Laue:以以直线点阵直线点阵为出发点为出发点Bragg:以以平面点阵平面点阵为出发点为出发点二者等效二者等效一、一、Laue(劳埃)方程(劳埃)方程 Laue方程是联系衍射方向与晶胞大小、形状的方程是联系衍射方向与晶胞大小、形状的方程方程.它的出发点是将晶体的空间点阵分解成三组互它的出发点是将晶体的空间点阵分解成三组互不平行的直线点阵
22、不平行的直线点阵,考察直线点阵上的衍射条件考察直线点阵上的衍射条件.每每一组直线点阵上得到一个方程,整个空间点阵上就一组直线点阵上得到一个方程,整个空间点阵上就有三个形式相似的方程,构成一个方程组有三个形式相似的方程,构成一个方程组.若把空间点阵看成互不平行的三组直线点阵的组若把空间点阵看成互不平行的三组直线点阵的组合,则可把衍射方向合,则可把衍射方向(h k l)与三组直线点阵的点阵与三组直线点阵的点阵常数常数(a、b、c)联系起来。联系起来。1 1、直线点阵、直线点阵衍射条件衍射条件直线点阵的衍射方向直线点阵的衍射方向 注:注:其中其中S 的方向是:的方向是:以直线点阵为轴,交角为以直线点
23、阵为轴,交角为(顶角为(顶角为2 )的)的圆锥面圆锥面。其中其中:周期为周期为a.S0、S 分别代表入射线方向和反射线方向的分别代表入射线方向和反射线方向的X-射线(单位向量)射线(单位向量)若要求每个点阵点所代表的结构基元间散射的次生若要求每个点阵点所代表的结构基元间散射的次生X-射线迭加后加强,相邻点阵点的光程差应该是波射线迭加后加强,相邻点阵点的光程差应该是波长的长的整数倍整数倍,即:,即:光程差光程差:=PA-OB=a(cos-cos0)=h h=0,1,2,.0、分别代表分别代表S0、S与直线点阵的交角与直线点阵的交角直线点阵的衍射方向直线点阵的衍射方向 直线点阵上衍射圆锥的形成直线
24、点阵上衍射圆锥的形成当当0=90 时,时,=acos=h,h=n 的两套圆锥面对称,可得的两套圆锥面对称,可得一组双曲线一组双曲线当当0 90 时,时,=a(cos-cos0)=h,h=n 的两套的两套圆锥面不对称圆锥面不对称平面点阵的衍射方向必须同时满足平面点阵的衍射方向必须同时满足 x 和和 y 方向的方向的衍射条件,衍射条件,故应为两个方向的故应为两个方向的圆锥面的交线方向圆锥面的交线方向S0 是入射方向是入射方向S1 和和S2 是衍射方向。是衍射方向。a(cos-cos0)=hb(cos-cos 0)=kh,k=0,1,22、平面点阵衍射条件、平面点阵衍射条件设:平面点阵的周期设:平面
25、点阵的周期为为a和和b,点阵方向为点阵方向为 x 和和 y.入射入射x-射线与射线与 x 和和 y 的交角分别为的交角分别为0 和和0 衍射衍射x-射线与射线与 x 和和 y 的交角为的交角为 和和.平面点阵的衍射方向平面点阵的衍射方向3 3、空间点阵衍射条件、空间点阵衍射条件劳埃方程劳埃方程a(cos-cos0)=hb(cos-cos0)=kh,k,l=0,1,2c(cos-cos0)=l a(s s0)=hb(s s0)=kc(s s0)=l 或或其中:其中:a,b,c 晶胞参数,素单位,素向量晶胞参数,素单位,素向量0,0,0 原生与三组直线点阵的交角原生与三组直线点阵的交角,次生与三组
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