环境中的微生物原核课件.ppt
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- 环境 中的 微生物 课件
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1、第二章第二章 环境中的微生物及其特性环境中的微生物及其特性WWW微生物的种类1.非细胞形态的微生物病毒病毒(植物病毒、动物病毒、细菌病毒等)、类病毒、拟病毒2.细胞形态的微生物2.1原核微生物细菌、古菌、放线菌、蓝细菌、细菌、古菌、放线菌、蓝细菌、支原体、衣原体、立克次氏体2.2真核微生物真菌(酵母菌、霉菌)、藻类、原生动物、真菌(酵母菌、霉菌)、藻类、原生动物、微型后生动物WWW2.1 原核微生物一、细菌二、古菌三、放线菌四、其他原核生物WWW一、细菌 Bacteria1.细菌的形态 细菌(bacteria)是自然界分布最广、个体数量最多的有机体 其形态可分为三大类:球形、杆形、螺旋形(弧形
2、),被称为球菌、杆菌、螺球菌、杆菌、螺旋菌旋菌(弧菌)。WWW1)球菌)球菌 细胞呈球形或椭圆形分裂后的空间排列方式,对于分类鉴定上有一定的意义。球菌的排列方式包括单球菌、双球菌、单球菌、双球菌、链球菌、四联球菌、八叠球菌和葡萄链球菌、四联球菌、八叠球菌和葡萄球菌球菌,如图:细菌的形态(模式图和显微照片)球菌的排列类型WWW四联球菌肺炎链球菌肺炎链球菌WWWWWWWWW膨胀活性污泥中的丝状细菌WWW2.细菌的大小细菌的一般都很小,须借助显微镜测微尺测量。球菌直径一般为0.52m,杆菌宽0.51m,长18m,螺旋菌宽0.55m,长550m。如下图:WWW3.细菌细胞的结构 细菌的基本结构:细胞壁
3、、细胞质膜、细胞质和细胞壁、细胞质膜、细胞质和细胞核细胞核等 有些细菌还有特殊结构:荚膜、鞭毛和芽孢荚膜、鞭毛和芽孢等。细菌细胞结构模式图 WWW1)细胞壁 细胞壁(cell wall)位于菌体外表面,较坚韧而略具有弹性。其功能主要有:固定细胞外形;保护细胞免受损伤;阻拦大分子物质进入细胞 其化学组成可使细胞具有一定抗原性、致病性及对噬菌体的敏感性;协助有鞭毛的细菌进行鞭毛运动。WWW革兰氏染色与细胞壁革兰氏染色与细胞壁:细菌细菌染色法染色法死菌死菌正染色正染色革兰氏染色法芽孢染色法芽孢染色法鉴别染色法鉴别染色法简单染色法简单染色法活菌活菌负染色负染色:荚膜染色法等:荚膜染色法等用美蓝或用美蓝
4、或TTCTTC(氧化三苯基四氮唑)(氧化三苯基四氮唑)等作活菌染色等作活菌染色细菌细胞结构WWWG GG G肽聚糖肽聚糖 胞壁酸胞壁酸 细胞膜细胞膜 膜蛋白膜蛋白 外膜外膜 孔蛋白孔蛋白 脂类脂类 周质空间周质空间 肽聚糖肽聚糖 G+和 G-细胞壁结构比较(立体模型)WWWG+和 G-细胞壁结构比较(平面模型)G-Cell Wall没有特殊的肽桥,只形成较为疏稀、机械强度没有特殊的肽桥,只形成较为疏稀、机械强度较差的肽聚糖网套较差的肽聚糖网套内消旋二氨基内消旋二氨基庚二酸庚二酸(m-DAP)大肠杆菌,G-金黄色葡萄球菌,G+A 肽聚糖肽聚糖 是是G-细菌细胞壁所特有的结构,位于细菌细胞壁所特有
5、的结构,位于G-细菌细胞细菌细胞壁外层,由壁外层,由脂多糖脂多糖、磷脂磷脂和和脂蛋白脂蛋白等若干种蛋白质组等若干种蛋白质组成的膜,有时也称为外壁。成的膜,有时也称为外壁。B、外膜外膜(outer membrane)G-Cell Wall外膜肽聚糖脂多糖脂多糖脂蛋白脂蛋白磷脂磷脂细菌的物理化学特性细菌表面电荷和等电点细菌表面电荷和等电点 细菌体含有细菌体含有5050以上的蛋白质。蛋白质由以上的蛋白质。蛋白质由2020种氨基酸按一定的排列顺序由肽键种氨基酸按一定的排列顺序由肽键连接组成。氨基酸是两性电解质,在碱性溶液中表现出带负电荷,在酸性溶液中表连接组成。氨基酸是两性电解质,在碱性溶液中表现出带
6、负电荷,在酸性溶液中表现出带正电荷。在某一定现出带正电荷。在某一定pHpH溶液中,氨基酸所带的正电荷和负电荷相等时的溶液中,氨基酸所带的正电荷和负电荷相等时的pHpH,称,称为该氨基酸的等电点。为该氨基酸的等电点。细菌的等电点在细菌的等电点在pH 2pH 25 5;*革兰氏阳性菌革兰氏阳性菌的等电点为的等电点为pH 2pH 23 3;*革兰氏阴性菌革兰氏阴性菌的等电点为的等电点为pH 4pH 45 5;COOCOO-NHNH2 2+NaOHNaOH HClHCl 革兰氏染色法(Gram stain procedure)18841884年丹麦细菌学家年丹麦细菌学家Christain Gram C
7、hristain Gram 创造。创造。染色步骤:染色步骤:在无菌操作条件下,用接种环挑取少量细菌于载玻片上在无菌操作条件下,用接种环挑取少量细菌于载玻片上涂布涂布均匀,固定。均匀,固定。(1)(1)初染:用初染:用草酸铵结晶紫草酸铵结晶紫染色染色1min1min,水洗去掉浮色。,水洗去掉浮色。(2)(2)媒染:用媒染:用碘碘-碘化钾碘化钾溶液媒染溶液媒染1min1min,倾去多余溶液。,倾去多余溶液。(3)(3)脱色:用中性脱色剂如脱色:用中性脱色剂如乙醇或丙酮脱色乙醇或丙酮脱色,革兰氏,革兰氏阳性菌阳性菌不被褪色而不被褪色而呈紫色呈紫色,革兰氏阴性菌被褪色而呈无色。革兰氏阴性菌被褪色而呈无
8、色。(4)(4)富染:用番红染液复染富染:用番红染液复染1min1min,革兰氏阳性菌仍呈,革兰氏阳性菌仍呈紫色紫色,革兰氏,革兰氏阴性菌阴性菌则呈则呈现现红色。红色。WWW革兰氏染色的原理 在于细菌细胞壁的组成的不同 重要的鉴别细菌染色法。可分为革兰氏阳性(G+)和革兰氏阴性(G-)两大类,前者呈紫色,后者呈红色。WWW革兰氏染色法革兰氏染色法 该染色法由丹麦医生该染色法由丹麦医生C.Gram于于1884年创立。年创立。分为初染、媒染、脱色和复染四步。分为初染、媒染、脱色和复染四步。甲菌 乙菌初染 结晶紫媒染 碘液脱色 乙醇复染 沙黄紫色紫色(G+)红色红色(G-)WWW(1)(1)革兰氏染
9、色与细菌等电点有关系:革兰氏染色与细菌等电点有关系:革兰氏阳性菌的等电点比革兰氏阴性菌的等电点低,说明革兰氏阳革兰氏阳性菌的等电点比革兰氏阴性菌的等电点低,说明革兰氏阳性菌带的负电荷比革兰氏阴性菌多。它与草酸铵结晶紫的结合力大,性菌带的负电荷比革兰氏阴性菌多。它与草酸铵结晶紫的结合力大,用碘用碘-碘化钾媒染后,两者的等电点均得到降低,因革兰氏阳性菌的碘化钾媒染后,两者的等电点均得到降低,因革兰氏阳性菌的等电点降低得多,与草酸铵结晶紫结合得更牢固,对乙醇脱色的抵等电点降低得多,与草酸铵结晶紫结合得更牢固,对乙醇脱色的抵抗力更强。抗力更强。(2)(2)革兰氏染色与细胞壁结构有关系:革兰氏染色与细胞
10、壁结构有关系:革兰氏阳性菌由于脂质含量极低,而肽聚糖含量高,乙醇既是脱色革兰氏阳性菌由于脂质含量极低,而肽聚糖含量高,乙醇既是脱色剂又是脱水剂,使肽聚糖脱水缩小细胞壁的孔径,降低细胞壁的通剂又是脱水剂,使肽聚糖脱水缩小细胞壁的孔径,降低细胞壁的通透性,阻止乙醇分子进入细胞,草酸铵结晶紫和碘碘化钾的复合透性,阻止乙醇分子进入细胞,草酸铵结晶紫和碘碘化钾的复合物被截留在细胞内而不被脱色,仍呈现紫色。物被截留在细胞内而不被脱色,仍呈现紫色。以上两点基本可较圆满地解释革兰氏染色机制。以上两点基本可较圆满地解释革兰氏染色机制。革兰氏染色的原理WWW2)细胞膜 细胞膜(cell membrane)即细胞质
11、膜或质膜(plasma membrane)。细胞膜是紧贴在细胞壁内侧的一层柔软而富有弹性的半透性薄膜。在维持菌体与外界物质的交换方面起重要作用。细胞膜上有丰富的酶系,是细菌重要的代谢活动中心。图图 细菌的细胞质膜结构模式图细菌的细胞质膜结构模式图WWW3)细胞质及其内含物 细胞质(cytoplasm)位于细胞膜内,无色透明,呈粘液状。其主要化学组分为水、蛋白质、脂类、核酸,并有少量糖和无机盐。细胞质中含有核糖体(ribosome)、气泡和其他颗粒状内含物。l 其他内含物的主要类型有:异染粒(Metachromatic granule)、聚-羟基丁酸(poly-hydroxybutyric ac
12、id简称PHB)颗粒、硫粒、多肽结晶、磁粒。WWW4)细胞核 原核生物所特有的原始细胞核或称拟核(nucleoid)。细菌的核质体是一个大型环状的裸露的双链DNA分子,长度为0.253mm,卷曲折叠于核区。核质体是负载细菌遗传信息的物质基础。细胞核细胞核的的功能功能:决定遗传性状决定遗传性状和和传递遗传性状传递遗传性状,是重要的遗传物质。是重要的遗传物质。WWW5)细菌细胞的特殊构造-荚膜 荚膜(capsule)是某些细菌在新陈代谢过程中形成的,分泌于细胞壁外的粘液状物质。荚膜可以保护细胞免受干燥的影响,并且作为细胞外的碳源和能源性的贮藏物质,还能够增强某些病原菌的致病能力。产生荚膜是微生物的
13、一种遗传特性,种的特征之一。WWW菌胶团菌胶团(zoogloea)(zoogloea)有些细菌由于其遗传特性决定,细菌之间按一定的排列有些细菌由于其遗传特性决定,细菌之间按一定的排列方式互相黏集在一起,方式互相黏集在一起,被一个被一个公共荚膜公共荚膜包围形成一定形状的包围形成一定形状的细菌集团,叫做细菌集团,叫做菌胶团菌胶团。菌胶团的形状菌胶团的形状(图图2-14)2-14)有球形、蘑菇形、椭圆形、分枝有球形、蘑菇形、椭圆形、分枝状、垂丝状及不规则形。上述各种菌胶团在活性污泥中均有,状、垂丝状及不规则形。上述各种菌胶团在活性污泥中均有,典型的有动胶菌属典型的有动胶菌属(Zoogloea Zoo
14、gloea),它有两个种:生枝状动胶,它有两个种:生枝状动胶菌菌(Zoogloea ramigera Zoogloea ramigera)和垂和垂(悬悬)丝动胶菌丝动胶菌(Zoogloea Zoogloea filipendula filipendula)。图图 2-14 2-14 菌胶团的几种形态菌胶团的几种形态A.A.活性污泥中的指状菌胶团活性污泥中的指状菌胶团,B1.B1.在低倍显微镜下的生枝动胶菌(在低倍显微镜下的生枝动胶菌(Z Z.ramigeraramigera)纯培养絮状物,)纯培养絮状物,B2.B2.在光学相差在光学相差833833下的生枝动胶菌(下的生枝动胶菌(Z.ramig
15、eraZ.ramigera)细胞)细胞C.C.在印染废水活性污泥中的菌胶团在印染废水活性污泥中的菌胶团WWW6)细菌细胞的特殊构造-鞭毛和菌毛 鞭毛(flagellum)是某些细菌长在体表的细长、波曲的丝状物。具有推动细菌运动的功能。鞭毛的化学成分主要是蛋白质,占99以上,碳水化合物、类脂和矿物质的总和不超过1。图图 2-15 2-15 细菌鞭毛的着生位置细菌鞭毛的着生位置A.A.杆菌:杆菌:极端生极端生 亚极端生亚极端生 两极端生两极端生 两束极端生两束极端生 周身周身B.B.弧菌:弧菌:单根极端生单根极端生 两束极端生两束极端生 束极端生束极端生鞭毛的着生方式:多样有一端单生,如铜绿假单胞
16、菌(Pseudomonas aeruginosa);两端单生;一端丛生,如荧光假单胞菌(P.fluorescens);两端丛生,如蔓延螺菌(Spirillumserpen)以及周生,如大肠杆菌(Escherichia coli)等。WWW 菌毛(fimbria或pilus):是长在细菌体表的一种纤细(直径79nm)、中空、短直、数量较多(250根300根)的蛋白质附属物,主要见于革兰氏阴性细菌。WWW7)细菌细胞的特殊构造-芽孢 某些细菌生长到一定时期,细胞质浓缩凝集,在细胞内形成一个抗逆性休眠体,称为芽孢(spore)或内生孢子(endospore)。能否形成芽孢,芽孢的形状、大小及其在细胞
17、内的位置,是细菌种的特征,在分类鉴定上有一定意义。芽孢衣芽孢衣皮层皮层芽孢壁芽孢壁芽孢外壁芽孢外壁WWW芽孢(spore)好氧芽孢杆菌属好氧芽孢杆菌属(BacillusBacillus)和厌氧的梭状芽孢杆菌属和厌氧的梭状芽孢杆菌属(ClostridiumClostridium)的所有细菌都具有芽孢。的所有细菌都具有芽孢。球菌中只有芽孢八叠球菌属球菌中只有芽孢八叠球菌属(SporosarcinaSporosarcina)产芽孢。产芽孢。弧菌中只有芽孢弧菌弧菌中只有芽孢弧菌(SporovibrioSporovibrio)产芽孢。产芽孢。、位于细胞的中间,如枯草芽孢杆菌位于细胞的中间,如枯草芽孢杆菌
18、。位于菌体中间,位于菌体中间,直径大于菌体呈梭状,如梭状芽孢杆菌直径大于菌体呈梭状,如梭状芽孢杆菌。芽孢位于菌体的一端,使菌体成鼓锤状。如破伤风杆菌。芽孢位于菌体的一端,使菌体成鼓锤状。如破伤风杆菌。菌菌 体体芽孢芽孢芽胞的大小、形状、位置等随菌种而异,有芽胞的大小、形状、位置等随菌种而异,有重要的鉴别意义。重要的鉴别意义。炭疽芽胞杆菌肉毒梭菌肉毒梭菌破伤风梭菌破伤风梭菌WWW 芽孢的特点 (1 1)芽孢的芽孢的含水率低含水率低,38384040。(2 2)芽孢芽孢壁厚而致密。壁厚而致密。(3 3)芽孢中的芽孢中的2,6-2,6-吡啶二羧酸吡啶二羧酸(dipicolinic acid(dipi
19、colinic acid,简,简称称DPA)DPA)含量高,为芽孢干重的含量高,为芽孢干重的 5 51515。2,6-2,6-吡啶二羧酸吡啶二羧酸的存在使芽孢的存在使芽孢具有耐热性。具有耐热性。(4 4)含有耐热性酶。含有耐热性酶。以上四个特点使芽孢对不良环境如:高温、低温、干燥、以上四个特点使芽孢对不良环境如:高温、低温、干燥、光线和化学药物有很强的抵抗力。芽孢在光线和化学药物有很强的抵抗力。芽孢在120120140140还能生还能生存几小时,营养细胞在体积分数存几小时,营养细胞在体积分数5 5苯酚溶液中很快死亡,芽苯酚溶液中很快死亡,芽孢却能存活孢却能存活15d15d。芽孢芽孢不易着色,可
20、用孔雀绿染色。不易着色,可用孔雀绿染色。WWW4.细菌的繁殖 裂殖是细菌最普遍、最主要的繁殖方式。少数细菌进行出芽繁殖。还有少数细菌能进行有性结合,通过性菌毛传递遗传物质,但频率很低。动画演示杆菌二分裂过程模式图WWW5.细菌的培养特征1)细菌在固体培养基上的培养特征细菌在固体培养基上的培养特征 细菌在固体培养基上的培养特征就是菌落特征。细菌在固体培养基上的培养特征就是菌落特征。菌落菌落(colony)是由一个细菌繁殖起来的,由无数细菌是由一个细菌繁殖起来的,由无数细菌组成具有一定形态特性的细菌集团。组成具有一定形态特性的细菌集团。将含菌样品或菌种点种在平板上或在斜面上画线,大量微生物细胞在固
21、体培养基上密集地长成一片,则称为菌苔(lawn)WWW图图 2-16 2-16 几种细菌菌落的特征几种细菌菌落的特征A.A.纵剖面:纵剖面:.扁平扁平 隆起隆起 低凸起低凸起 高凸起高凸起 脐状脐状 草帽状草帽状 乳头状乳头状B.B.表面结构、形状及边缘:表面结构、形状及边缘:圆形,边缘整齐圆形,边缘整齐 不规则,边缘波浪不规则,边缘波浪 不规则,颗粒状,叶状不规则,颗粒状,叶状 规则,放射状,边缘花瓣形规则,放射状,边缘花瓣形 规则,边缘整齐,表面光滑规则,边缘整齐,表面光滑 规则,边缘齿状规则,边缘齿状 规则,有同心环,边缘完整规则,有同心环,边缘完整 不规则,似毛毯状不规则,似毛毯状 规
22、则,似菌丝状规则,似菌丝状 不规则,卷发状,边缘波状不规则,卷发状,边缘波状 不规则,丝状不规则,丝状 不规则,根状不规则,根状细菌在固体培养基上的培养特征WWW大肠杆菌菌落(平板划线法)细菌在液体培养基中的生长情况菌膜菌沉淀均匀浑浊对照WWW3)在液体培养基中的培养特征 细菌在液体培养基中生长,使培养基混浊,混浊情况因细菌对氧气要求不同而有别:兼性厌氧菌培养液均匀混浊,需氧菌培养液仅上部混浊,厌氧菌培养液仅下部混浊。图图2-20 细菌在肉汤培养基中的生长特征细菌在肉汤培养基中的生长特征A.絮状絮状 B.环状环状 C.菌膜菌膜 D.薄膜状薄膜状WWW 本节复习思考题本节复习思考题1研究微生物的
23、形态构造有何重要性?试举例说明之。2试举几个实例来说明:即使不用显微镜,也可证明在我们日常生活的环境中,到处有细菌在活动着。3观察细菌形态时为何要用染色法?常用的染色法有几类?4试绘出细菌细胞构造的模式图,注明其一般构造和特殊构造,并扼要注明各部分的生理功能。5什么是芽孢,产芽孢的细菌主要有哪几类?6什么叫菌落,细菌的菌落有何特点?WWW二、古菌 古菌(Archaea)又称古细菌,是原核生物中的一大类。古菌这一概念是C.R.Woese及他的同事们对代表性细菌类群的16S rRNA碱基序列进行研究比较后于1977年提出来的。他们认为,生物界的发育不是一个简单的由原核生物发育到更完全更复杂的真核生
24、物的过程,而是明显地存在三个发育不同的基因系统:细菌细菌(Bacteria)、古菌、古菌(Archaea)和真核生物和真核生物(Eukarya)。WWW1.古菌的概述1)古菌的定义 古菌是在系统发育上与细菌不同的一群相关的原核生物。多数生存在极端的生态环境中,如温泉、深海热喷口、滚沸的泥淖、酸性土壤、极端的盐水、间歇泉、海底黑烟囱和很冷的环境。古菌形态各异,分子结构独特。WWW2)古菌的主要特点 形态学上的不同。古菌细胞壁成分独特而多样。古菌核糖体16S rRNA上的核苷酸顺序独特。中间代谢上,古菌有独特的辅酶,且代谢方式单纯,不似真细菌那样多样性。古细菌比真细菌进化缓慢,保留了较原始的特性。
25、WWW 二、古菌的分类l从rRNA进化树上,古菌分为两类:泉古菌(Crenarchaeota)和广古菌(Euryarchaeota)。在伯杰氏系统细菌学手册第二版介绍了两个门,分为6纲12目。l根据不同的生理特性根据不同的生理特性分为分为五大群五大群:群群1.产甲烷古菌产甲烷古菌(methanogenic archaeobacteria),群群2.古生硫酸盐还原菌(还原硫酸盐的古菌)(古生硫酸盐还原菌(还原硫酸盐的古菌)(archaeobacterial sulfate reducers),),群群3.极端嗜盐古菌极端嗜盐古菌(extremely halophilic Archaeobacte
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