外文数据库PUBMED检索-精选ppt课件.ppt

1、外文数据库PUBMED检索 PubMed数据库 PubMed简介简介 PubMed的检索规则的检索规则 PubMed的检索方法的检索方法 PubMed全文获取方式全文获取方式一、PubMed简介 网址：网址：ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/或或 pubmed.gov(com;org;net)世界最具权威性的医学文献数据世界最具权威性的医学文献数据库，由库，由NLM（美国国立医学图书（美国国立医学图书馆）馆）NCBI（美国国家生物技术（美国国家生物技术信息中心）向因特网用户提供信息中心）向因特网用户提供免免费费文献检索服务文献检索服务(自自2019-6-26起起)收录收录70余个

2、国家余个国家5400多种生物医学多种生物医学期刊的题录与文摘，其中收录中文期刊的题录与文摘，其中收录中文刊刊100余种，是世界上最权威的医余种，是世界上最权威的医学数据库。学数据库。现有现有1950年以来的年以来的2200多万篇文献多万篇文献的记录的记录(其中其中MEDLINE记录记录1700多多万条万条)目前每年增加目前每年增加60余万条文献记录余万条文献记录 记录中记录中90%的文献为英文。的文献为英文。PubMed简介MEDLINE IndexedMEDLINE Indexed 1966 to prensent1966 to prensent的的MEDLINEMEDLINE已标引数据，已

3、标引数据，有有MeSHMeSH字段和摘要，每条记录标有：字段和摘要，每条记录标有：PubMed-indexed for MEDLINEPubMed-indexed for MEDLINE OldMEDLINEOldMEDLINE 1949-19651949-1965年间的年间的MEDLINEMEDLINE数据，无数据，无MeSHMeSH字段和摘要，每条记录标有：字段和摘要，每条记录标有：PubMed-PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966OLDMEDLINE for Pre1966 PubMed收录数据MEDLINE InproceMEDLINE Inprocess 最新的

4、最新的MEDLINEMEDLINE处理中数据，未标引，无处理中数据，未标引，无MeSHMeSH字段。每条记录标有：字段。每条记录标有：PubMed-in PubMed-in processprocess。Publisher-SuppliedPublisher-Supplied 出版商提供的电子文献题录，每条记录标有出版商提供的电子文献题录，每条记录标有:PubMed-as supplied by publisherPubMed-as supplied by publisher，分，分为两类：为两类：MEDLINE MEDLINE 收录，逐步转为收录，逐步转为In In ProcessProce

5、ss,IndexedIndexed状态。状态。Not MEDLINENot MEDLINE：PubMed PubMed 收录，收录，MEDLINEMEDLINE不收录，一直标注不收录，一直标注PubMed-as supplied by PubMed-as supplied by publisherpublisher或或PubMedPubMedPubMed收录数据 PubMed数据类型（状态）PubMed除了1966年以前的OldMedline，其余文献按处理过程分4种类型（或状态）PubMed-as supplied by publisher PubMed-in process PubMedP

6、ubMed-indexed for MEDLINE 属于Medline收录范围，建立ti、au、ab等基本书目信息。（暂）不属于Medline收录范围，但也建立ti、au、ab等基本书目信息。赋予MeSH、PT等字段并被index。PubMed主页主页标题标题作者作者出处出处处理状态处理状态 布尔逻辑运算布尔逻辑运算 截词检索截词检索 强制检索强制检索 字段检索字段检索二、二、PUBMED的检索规则的检索规则 可输入可输入单词单词、词组词组或或句子句子进行进行检索检索 可用的逻辑运算符：可用的逻辑运算符：ANDAND、NOTNOT、OROR（必须大写）（必须大写）布尔逻辑运算顺序是从左至右，布

7、尔逻辑运算顺序是从左至右，圆括号优先圆括号优先布尔逻辑运算截词检索截词检索v 可使用截词符*，扩大检索范围，提高查全率。VaccinaVaccineVaccinesVaccinationvaccinatedVaccin*强制检索强制检索 词组强制检索词组强制检索(精确检索精确检索)用双引号，用双引号，例：例：“single cell,系统系统会将其作为一个不可分割的词组在会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。数据库的全部字段中进行检索。词组强制和截词检索时，系统的智词组强制和截词检索时，系统的智能词语匹配功能将不再被执行。例能词语匹配功能将不再被执行。例如：如：liver

8、cancer将不映射到将不映射到 MeSH 词词 Liver Neoplasms字段限定检索字段限定检索 可在检索词后加可在检索词后加字段名字段名，进行限，进行限定字段检索。如：查找作者为定字段检索。如：查找作者为crick在在1993年发表的有关年发表的有关DNA方方面的文献面的文献.检索式：检索式：DNAmh AND crickau AND 1993dp 缩写缩写全称全称缩缩写写全称全称ABAbstractLA LanguageADAffiliation（机构）（机构）MHMeSH TermsAUAuthor（作（作者）者）PT Publication TypeDPPublication

9、DateSO SourceCPPublication countryTAJournal Title（刊（刊名）名）常用字段常用字段（检索时大小写都可以检索时大小写都可以）三、PUBMED的检索方法基本检索基本检索主题检索主题检索高级检索高级检索（一）基本检索（一）基本检索 检索某主题的文献检索某主题的文献 检索某一作者发表的文献检索某一作者发表的文献 检索发表在某期刊上的文献检索发表在某期刊上的文献.1.某一主题的检索某一主题的检索 检索有关肿瘤检索有关肿瘤(cancer)的文献的文献cancerneoplasmsMeSH Terms OR neoplasmsAll Fields OR can

10、cerAll Fields书写规则：书写规则：姓前名后姓前名后,姓用全称，名缩写。姓用全称，名缩写。考虑到作者姓名的不同形式，考虑到作者姓名的不同形式，PubMedPubMed采用自采用自动转换功能进行作者姓名检索，如：动转换功能进行作者姓名检索，如：smith jsmith j将将检索成检索成smith ja,smith jb,smith jr smith ja,smith jb,smith jr 等。等。精确检索：可以用双引号将作者名引起来，精确检索：可以用双引号将作者名引起来，再加作者字段限定再加作者字段限定AUAU，如：，如：smith jausmith jau，实现精确查找。实现精确

11、查找。2.检索某一作者发表的文献检索某一作者发表的文献 规则：全称或规则：全称或ISSN号或号或MEDLINE认可的标准缩写认可的标准缩写,ta 如：检索如：检索细胞生物分子细胞生物分子期刊，在检索框中键入期刊期刊，在检索框中键入期刊名，名，molecular biology of the cellmolecular biology of the cell，系统会将它转换成，系统会将它转换成mol biol celljournalmol biol celljournal进行检索。或直接输入进行检索。或直接输入MedlineMedline的的期刊标准缩写形式（期刊标准缩写形式（mol biol

12、cellmol biol cell），输入刊物的），输入刊物的ISSNISSN：1059-15241059-1524。如果一个杂志名恰好是主题词或关键词，如：如果一个杂志名恰好是主题词或关键词，如：cancercancer，sciencescience，cellcell等，等，PubMedPubMed会首先将这些词转换成会首先将这些词转换成MeSHMeSH词表词表中的主题词进行检索。因此，需要将检索请求进行标准化中的主题词进行检索。因此，需要将检索请求进行标准化处理，即在杂志名后面加处理，即在杂志名后面加TATA。如：。如：“cell”tacell”ta 3.检索某一期刊上的文献检索某一期刊上

13、的文献 mol biol cell FilterFilter是一个条件限定，可以进行年龄组、是一个条件限定，可以进行年龄组、性别、人或动物、出版类型、时间、语言等性别、人或动物、出版类型、时间、语言等方面的选择，将检索的文献限定在一定范围方面的选择，将检索的文献限定在一定范围内。内。4.Filter 限定检索限定检索 文献年限文献年限文献可获取性文献可获取性文献类型文献类型 研究对象类研究对象类型型 清除清除我不记得字段我不记得字段我想看看之我想看看之前的操作前的操作有高级检索呢有高级检索呢 （二）高级检索（advanced search)字段选择字段选择检索历史检索历史1 1、点击主页右下角

14、的、点击主页右下角的MeSH DatabaseMeSH Database进入主题词检索界面；进入主题词检索界面；2 2、输入检索词后，点击、输入检索词后，点击gogo按钮，系统将显示与该词有关主按钮，系统将显示与该词有关主题词；题词；3 3、点击该主题词进一步显示该主题词的定义、树状结构、点击该主题词进一步显示该主题词的定义、树状结构、组配的副主题词；组配的副主题词；4 4、选择合适的主题词与副主题词后，点击、选择合适的主题词与副主题词后，点击send tosend to按钮，按钮，进入检索表达式浏览窗口；进入检索表达式浏览窗口；5 5、点击、点击Search PubMedSearch PubMed将显示检索结果。将显示检索结果。（三）主题检索（Mesh Database)比较主题词检索举例1、检索肾衰竭（Kidney Failure）治疗（therapy）方面的文献。2、缺血性心脏病（ischemic heart disease）引起心力衰竭（heart failure）老年人方面的带文摘的文献。四、PUBMED全文获取学校已订购学校已订购bdpubmed