生物化学下-第33章-核酸的降解与核苷酸代谢-课件.ppt
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- 生物化学 33 核酸 降解 核苷酸 代谢 课件
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1、一、核酸和核苷酸的分解代谢一、核酸和核苷酸的分解代谢二、核苷酸的生物合成二、核苷酸的生物合成三、辅酶核苷酸的生物合成三、辅酶核苷酸的生物合成第第33章章 核酸的降解和核苷酸代谢核酸的降解和核苷酸代谢 核酸的降解和核苷酸代谢核酸的降解和核苷酸代谢第一节第一节 核酸和核苷酸的分解代谢核酸和核苷酸的分解代谢第二节第二节 核苷酸的合成代谢核苷酸的合成代谢(一)核酸的解聚(一)核酸的解聚 核酸核酸磷酸磷酸核苷酸核苷酸核苷核苷水水解解一、核酸和核苷酸的分解代谢一、核酸和核苷酸的分解代谢糖基糖基碱基碱基1、降解核酸的酶降解核酸的酶 按分解按分解底物底物:核糖核酸酶核糖核酸酶和和脱氧核糖核酸酶脱氧核糖核酸酶
2、按按专一性专一性:非特异性非特异性和和特异性特异性两种。两种。按水解按水解方式方式:内切内切和和外切外切两种方式。两种方式。外切:外切:3 -外切、外切、5 -外切外切 AGAGTCTCHO35外切酶外切酶外切酶外切酶内切酶内切酶AGAGTCTCHO35AGATHO35GCTC53 HO5AGATHO3OHGCTC53内切酶内切酶按水解按水解部位部位有:水解有:水解3-OH和磷酸的酯键和磷酸的酯键和和5-OH和磷酸的和磷酸的酯键的酶酯键的酶,产物分别为,产物分别为5-磷酸寡聚核苷酸和磷酸寡聚核苷酸和3-磷酸寡聚核磷酸寡聚核苷酸苷酸 水解水解DNA和和RNA 3 或或5 末端的磷酸二酯键末端的磷
3、酸二酯键如:如:蛇毒磷酸二酯酶蛇毒磷酸二酯酶:3-端外切酶,产物:端外切酶,产物:5-核苷酸核苷酸 牛脾磷酸二酯酶牛脾磷酸二酯酶:5-端外切酶,产物:端外切酶,产物:3-核苷酸核苷酸蛇毒磷酸蛇毒磷酸二酯酶二酯酶牛脾磷酸牛脾磷酸二酯酶二酯酶AGAGTCTCHO35HON5-核苷酸核苷酸OHN3-核苷酸核苷酸2、核酸外切酶、核酸外切酶 催化水解多核苷酸链内部的磷酸二酯键催化水解多核苷酸链内部的磷酸二酯键 1)非特异性)非特异性 (1)核酸酶核酸酶:以以DNA和和RNA为底物为底物产物:产物:3-磷酸寡聚核苷酸(小球菌核酸酶)或磷酸寡聚核苷酸(小球菌核酸酶)或5-磷酸寡聚核苷磷酸寡聚核苷酸(链孢霉菌
4、核酸酶)。酸(链孢霉菌核酸酶)。5AGATHO3OHGCTC533-磷酸寡聚核苷酸AGATHO35GCTC53 HO5-磷酸寡聚核苷酸3、核酸内切酶核酸内切酶(2)脱氧核糖核酸酶)脱氧核糖核酸酶:以以DNA为底物为底物产物:产物:3-磷酸寡聚核苷酸(牛胰脱氧核糖核酸酶)或磷酸寡聚核苷酸(牛胰脱氧核糖核酸酶)或5-磷酸寡磷酸寡聚核苷酸(牛脾核糖核酸酶)聚核苷酸(牛脾核糖核酸酶)(3)核糖核酸酶)核糖核酸酶:水解:水解RNA的磷酸二酯键,产物为的磷酸二酯键,产物为3-磷酸寡核磷酸寡核苷酸(牛胰核糖核酸酶)或苷酸(牛胰核糖核酸酶)或5-磷酸寡核苷酸(核糖核酸酶磷酸寡核苷酸(核糖核酸酶T1)。)。2)
5、特异性酶)特异性酶 限制性内切酶:限制性内切酶:可识别可识别DNA上的碱基序列专一性上的碱基序列专一性位点,其碱基长度是位点,其碱基长度是48个碱基,将两条链同时切开形成粘性末个碱基,将两条链同时切开形成粘性末端端(如如EcoRI)和非粘性末端(如和非粘性末端(如 HaeIII)。)。N-C-T-T-A-A-G-NN-G-A-A-T-T-C-N5335EcoRI5335N-C-C-G-G-NN-G-G-C-C-NHaeIIIN-C-T-T-A-A G-NN-G A-A-T-T-C-N5335N-C-C G-G-NN-G-G C-C-N5335(二)核苷酸的分解(二)核苷酸的分解磷酸磷酸-戊糖戊
6、糖碱基碱基核苷酸核苷酸分解分解合成合成?进入戊糖磷酸途径进入戊糖磷酸途径或或重新合成核酸重新合成核酸磷酸化酶磷酸化酶水解酶水解酶存在广泛存在广泛 存在于植物存在于植物/微生物微生物催化可逆的反应催化可逆的反应 反应不可逆反应不可逆作用于核糖或作用于核糖或脱氧核糖核苷脱氧核糖核苷 作用于核糖核苷作用于核糖核苷再利用再利用一、嘌呤碱的分解代谢一、嘌呤碱的分解代谢GMPAMP(一)嘌呤碱的分解过程(一)嘌呤碱的分解过程1、代谢场所、代谢场所代谢场所:代谢场所:肝脏、小肠及肾脏肝脏、小肠及肾脏生物体内嘌呤的分解可分别在生物体内嘌呤的分解可分别在碱基、核苷、核苷碱基、核苷、核苷酸水平酸水平上进行,进行的
7、反应有上进行,进行的反应有脱氨、氧化脱氨、氧化等。等。2、代谢过程、代谢过程嘌呤碱在各种脱氨酶的作用下水解脱去氨基,反应可嘌呤碱在各种脱氨酶的作用下水解脱去氨基,反应可以在碱基、核苷及核苷酸的水平上进行。以在碱基、核苷及核苷酸的水平上进行。腺腺嘌呤核苷酸嘌呤核苷酸腺腺嘌呤核苷嘌呤核苷腺腺嘌呤嘌呤次黄嘌呤核苷酸次黄嘌呤核苷酸次黄嘌呤核苷次黄嘌呤核苷次黄嘌呤次黄嘌呤核苷酸酶核苷酸酶核苷磷酸化酶核苷磷酸化酶核苷酸酶核苷酸酶核苷磷酸化酶核苷磷酸化酶腺嘌呤核苷酸腺嘌呤核苷酸脱氨酶脱氨酶腺嘌呤核苷腺嘌呤核苷脱氨酶脱氨酶腺嘌呤腺嘌呤脱氨酶脱氨酶鸟嘌呤鸟嘌呤黄嘌呤黄嘌呤鸟嘌呤脱氨酶鸟嘌呤脱氨酶黄嘌呤和次黄嘌呤
8、可继续被分解,不同生物降解的产黄嘌呤和次黄嘌呤可继续被分解,不同生物降解的产物不同。物不同。黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶尿酸氧化酶尿酸氧化酶次黄次黄嘌呤嘌呤黄嘌呤黄嘌呤尿酸(排尿酸动物)尿酸(排尿酸动物)黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶尿囊素尿囊素(除人猿外的哺乳动物)(除人猿外的哺乳动物)尿囊酸尿囊酸(硬骨鱼类)(硬骨鱼类)尿囊素酶尿囊素酶尿素尿素+乙醛酸乙醛酸(鱼类、两栖类)(鱼类、两栖类)尿囊酸酶尿囊酸酶氨氨+二氧化碳二氧化碳(低等动物)(低等动物)AMPGMPHGXNNNHNOHOHHO尿酸黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶(uric acid)嘌呤碱的最终嘌呤碱的最终代谢产物代谢产物小小结结3、代谢产物、
9、代谢产物排尿酸动物:灵长类排尿酸动物:灵长类、鸟类、昆虫、排尿酸爬虫类鸟类、昆虫、排尿酸爬虫类排尿囊素动物:排尿囊素动物:哺乳动物(灵长类除外)、腹足类哺乳动物(灵长类除外)、腹足类排尿囊酸动物:硬骨鱼类排尿囊酸动物:硬骨鱼类排尿素动物:大多数鱼类、两栖类排尿素动物:大多数鱼类、两栖类某些低等动物能将尿素进一步分解成某些低等动物能将尿素进一步分解成NH3和和CO2排出。排出。植物分解嘌呤的途径与动物相似,产生各种中间产物植物分解嘌呤的途径与动物相似,产生各种中间产物(尿囊素、尿囊酸、尿素、(尿囊素、尿囊酸、尿素、NH3)。)。微生物分解嘌呤类物质,生成微生物分解嘌呤类物质,生成NH3、CO2及
10、有机酸(甲及有机酸(甲酸、乙酸、乳酸、等)。酸、乙酸、乳酸、等)。4、与嘌呤分解代谢有关的病症、与嘌呤分解代谢有关的病症痛风症痛风症由于体内由于体内嘌呤核苷酸分解代谢嘌呤核苷酸分解代谢异常,可致血异常,可致血中中尿酸尿酸水平升高,以尿酸钠晶体沉积于软骨、水平升高,以尿酸钠晶体沉积于软骨、关节、软组织及肾脏,临床上表现为皮下结关节、软组织及肾脏,临床上表现为皮下结节、关节疼痛等。节、关节疼痛等。高嘌呤饮食高嘌呤饮食体内核酸大量分解体内核酸大量分解肾疾病肾疾病嘌呤核苷酸代谢酶缺陷嘌呤核苷酸代谢酶缺陷血中尿酸含量升高血中尿酸含量升高痛风痛风尿酸盐晶体沉积尿酸盐晶体沉积 血血尿酸尿酸0.48mmol/
11、L鸟嘌呤鸟嘌呤次黄嘌呤次黄嘌呤黄嘌呤黄嘌呤尿酸尿酸黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶别嘌呤醇别嘌呤醇NNNHNOHNNNHNOH78次黄嘌呤别嘌呤醇练习题:练习题:1、GMP和和AMP分解过程中产生的共同中间产物是(分解过程中产生的共同中间产物是()?)?AXMP B黄嘌呤(黄嘌呤(X)C腺嘌呤(腺嘌呤(A)D鸟嘌呤(鸟嘌呤(G)ECO22、痛风症患者血中含量升高的物质是(、痛风症患者血中含量升高的物质是()?)?A尿素尿素 BNH3 C胆红素胆红素 D尿酸尿酸 E肌酸肌酸3、动物体内直接催化尿酸生成的酶是()?、动物体内直接催化尿酸生成的酶是()?A尿酸氧化酶尿酸氧化酶 B腺苷
12、酸脱氨酶腺苷酸脱氨酶 C黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶 D次黄嘌呤氧化酶次黄嘌呤氧化酶 E以上均不是以上均不是4、人体内嘌呤核苷酸分解代谢的主要终产物是、人体内嘌呤核苷酸分解代谢的主要终产物是 A尿素尿素 B肌酸肌酸 C肌酸酐肌酸酐 D尿酸尿酸 E-丙氨酸丙氨酸二、嘧啶碱的分解代谢二、嘧啶碱的分解代谢胞嘧啶胞嘧啶需要先脱氨生成需要先脱氨生成尿嘧啶尿嘧啶后才继续被分解。后才继续被分解。-脲脲基丙酸基丙酸DHUDHU胞嘧啶胞嘧啶NH3尿嘧啶尿嘧啶二氢尿嘧啶二氢尿嘧啶 H2OCO2+NH3-丙氨酸丙氨酸胸腺嘧啶胸腺嘧啶-脲基异丁酸脲基异丁酸-氨基异丁酸氨基异丁酸H2O丙二酸单酰丙二酸单酰CoA乙酰乙酰Co
13、ATCA肝肝尿素尿素甲基丙二酸单酰甲基丙二酸单酰CoA琥珀酰琥珀酰CoATCA糖异生糖异生小小结结练习题:练习题:嘧啶核苷酸分解代谢产物有嘧啶核苷酸分解代谢产物有()?ANH3 B尿酸尿酸 CCO2 D-丙氨酸丙氨酸 E-氨基异丁酸氨基异丁酸第二节第二节 核苷酸的合成代谢核苷酸的合成代谢从头合成途径从头合成途径(de novo synthesis pathway)利用利用氨基酸氨基酸等作为原料合成等作为原料合成补救合成途径补救合成途径(salvage synthesis pathway)利用利用体内游离的碱基或核苷体内游离的碱基或核苷合成合成核苷酸生物合成的基本途径核苷酸生物合成的基本途径一、
14、嘌呤核苷酸的合成一、嘌呤核苷酸的合成(一)嘌呤碱的元素来源(一)嘌呤碱的元素来源谷氨酰胺(酰胺氮)谷氨酰胺(酰胺氮)一碳基团一碳基团(甲酸盐)(甲酸盐)一碳基团一碳基团(甲酸盐)(甲酸盐)甘氨酸甘氨酸二氧化碳二氧化碳天冬氨酸天冬氨酸CO2天冬氨酸天冬氨酸甲酸盐甲酸盐(一碳单位)(一碳单位)甘氨酸甘氨酸甲酸盐甲酸盐(一碳单位)(一碳单位)谷氨酰胺谷氨酰胺(酰胺基)(酰胺基)“甘氨酸中间站,甘氨酸中间站,谷 碳 坐 两 边。谷 碳 坐 两 边。左 上 天 冬 氨,左 上 天 冬 氨,头顶二氧化碳头顶二氧化碳”。嘌呤环上的四个氮原子来源于(嘌呤环上的四个氮原子来源于()?)?A.天冬氨酸、谷氨酰胺、
15、天冬氨酸、谷氨酰胺、甘甘氨酸氨酸B.天冬氨酸、谷氨酰胺、氨天冬氨酸、谷氨酰胺、氨C.天冬氨酸、天冬氨酸、甘甘氨酸氨酸D.甘甘氨酸、谷氨酰胺、氨氨酸、谷氨酰胺、氨E.尿素、氨尿素、氨(二)嘌呤核苷酸的合成(二)嘌呤核苷酸的合成1、从头合成的概念及部位从头合成的概念及部位利用利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及二氧化碳磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及二氧化碳等简单物质为原料,经过一系列酶促反应,合成等简单物质为原料,经过一系列酶促反应,合成嘌呤核苷酸的途径。嘌呤核苷酸的途径。肝肝是体内从头合成嘌呤核苷酸的主要器官,其是体内从头合成嘌呤核苷酸的主要器官,其次是次是小肠和胸腺小肠和胸腺,而脑、骨髓则无法进行此
16、合成,而脑、骨髓则无法进行此合成途径。途径。合成部位合成部位定义定义1)合成原料:)合成原料:天冬氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、一天冬氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、一碳基团、碳基团、CO2、磷酸核糖磷酸核糖。2)合成特点:)合成特点:磷酸核糖为起始物磷酸核糖为起始物,逐步加原料合,逐步加原料合成成嘌呤环嘌呤环,形成重要中间产物,形成重要中间产物 IMP(次黄嘌呤核次黄嘌呤核苷酸),再转变为苷酸),再转变为AMP和和GMP。3)合成过程)合成过程合成过程合成过程I.IMP的合成的合成II.AMP和和GMP的生成的生成I.次黄嘌呤核苷酸的合成次黄嘌呤核苷酸的合成磷酸核糖焦磷酸激酶磷酸核糖焦磷酸激酶155-磷酸
17、核糖磷酸核糖-1-焦磷酸(焦磷酸(PRPP)磷酸核糖焦磷酸激酶磷酸核糖焦磷酸激酶(1)第一阶段的反应第一阶段的反应酰胺转移酶酰胺转移酶5-5-磷酸核糖胺磷酸核糖胺谷氨酰胺谷氨酰胺谷氨酸谷氨酸PRPP-构构型型-构构型型5-磷酸核糖胺磷酸核糖胺甘氨酰胺核苷酸甘氨酰胺核苷酸甘氨酰胺核糖甘氨酰胺核糖核苷酸合成酶核苷酸合成酶甘氨酰胺核苷酸甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨酰胺核苷酸转甲酰基酶转甲酰基酶来自甲酸(盐)来自甲酸(盐)N10-甲酰四氢叶酸甲酰四氢叶酸四氢叶酸四氢叶酸甲酰甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨酰胺核苷酸甲酰甘氨脒核苷酸甲酰甘氨脒核苷酸合成酶合成酶谷氨酰胺谷氨酰胺谷氨酸谷氨酸甲酰甘氨脒核苷
18、酸甲酰甘氨脒核苷酸5-氨基氨基-咪唑核苷酸咪唑核苷酸合成酶合成酶(2)第二阶段的反应第二阶段的反应N5-羧基氨基咪唑核苷酸羧基氨基咪唑核苷酸5-氨基氨基-咪唑核苷酸咪唑核苷酸氨基咪唑核苷酸氨基咪唑核苷酸合成酶合成酶5-氨基氨基-4-羧酸咪唑核苷酸羧酸咪唑核苷酸N5-羧基氨基咪唑核苷酸羧基氨基咪唑核苷酸氨基咪唑核苷酸氨基咪唑核苷酸变位酶变位酶N-琥珀酸琥珀酸-5-氨基咪唑氨基咪唑-4-羧酰胺羧酰胺核苷酸核苷酸5-氨基氨基-4-羧酸咪唑核苷酸羧酸咪唑核苷酸合成酶合成酶5-氨基咪唑氨基咪唑-4-羧酰胺核苷酸羧酰胺核苷酸延胡索酸延胡索酸N-琥珀酸琥珀酸-5-氨基咪唑氨基咪唑-4-羧酰羧酰胺核苷酸胺核苷
19、酸腺苷酸琥珀酸腺苷酸琥珀酸裂合酶裂合酶N-甲酰氨基咪唑甲酰氨基咪唑-4-羧酰胺核苷酸羧酰胺核苷酸5-氨基咪唑氨基咪唑-4-羧酰胺核苷酸羧酰胺核苷酸N10-甲酰四氢叶酸甲酰四氢叶酸四氢叶酸四氢叶酸次黄嘌呤核苷酸次黄嘌呤核苷酸N-甲酰氨基咪唑甲酰氨基咪唑-4-羧酰胺核苷酸羧酰胺核苷酸II.AMP和和GMP的合成的合成(1)AMP的合成的合成IMPAsp腺苷酸琥珀酸腺苷酸琥珀酸延胡索酸延胡索酸AMP腺苷酸琥珀酸合成酶腺苷酸琥珀酸合成酶腺苷酸琥珀酸裂合酶腺苷酸琥珀酸裂合酶(2)GMP的合成的合成IMP次黄嘌呤核苷酸脱氢酶次黄嘌呤核苷酸脱氢酶XMP黄嘌呤核苷酸黄嘌呤核苷酸黄嘌呤核苷酸黄嘌呤核苷酸鸟苷酸鸟
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