生物化学与分子生物学(人卫版)教材全集(课堂PPT)课件.ppt
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1、.1.2蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能第一章第一章Structure and Function of Protein.3n什么是蛋白质什么是蛋白质?蛋白质蛋白质(protein)是由许多氨基酸是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键通过肽键(peptide bond)相连相连形成的高分子含氮化合物。形成的高分子含氮化合物。.4n蛋白质研究的历史蛋白质研究的历史18331833年年,PayenPayen和和PersozPersoz分离出淀粉酶。分离出淀粉酶。18381838年年,荷兰科学家,荷兰科学家 G.J.MulderG.J.Mulder引入引入“protein”protein
2、”(源自希腊字(源自希腊字proteiosproteios,意为,意为primaryprimary)一词)一词 18641864年年,Hoppe-SeylerHoppe-Seyler从血液分离出血红蛋白,并将从血液分离出血红蛋白,并将其制成结晶。其制成结晶。1919世纪末世纪末,FischerFischer证明蛋白质是由氨基酸组成的,证明蛋白质是由氨基酸组成的,并将氨基酸合成了多种短肽并将氨基酸合成了多种短肽 。.519511951年年,PaulingPauling采用采用X X(射)线晶体衍射发现了蛋白(射)线晶体衍射发现了蛋白质的二级结构质的二级结构-螺旋螺旋(-helix)(-helix
3、)。19531953年年,Frederick SangerFrederick Sanger完成胰岛素一级序列测定。完成胰岛素一级序列测定。19621962年年,John KendrewJohn Kendrew和和Max PerutzMax Perutz确定了血红蛋白确定了血红蛋白的四级结构。的四级结构。2020世纪世纪9090年代以后年代以后,随着人类基因组计划实施,功,随着人类基因组计划实施,功能基因组与蛋白质组计划的展开能基因组与蛋白质组计划的展开 ,使蛋白,使蛋白质结构与功能的研究达到新的高峰质结构与功能的研究达到新的高峰 。.6蛋白质的分子组成蛋白质的分子组成The Molecular
4、 Component of Protein第一节第一节.7n蛋白质的生物学重要性蛋白质的生物学重要性分布广:分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。胞的各个部分都含有蛋白质。含量高:含量高:蛋白质是生物体中含量最丰富的生蛋白质是生物体中含量最丰富的生物大分子,约占人体固体成分的物大分子,约占人体固体成分的45%45%,而在,而在细胞中可达细胞干重的细胞中可达细胞干重的70%70%以上。以上。1.蛋白质是生物体重要组成成分蛋白质是生物体重要组成成分.8作为生物催化剂(酶)作为生物催化剂(酶)代谢调节作用代谢调节作用免疫保护作用免疫保护作用物质
5、的转运和存储物质的转运和存储运动与支持作用运动与支持作用参与细胞间信息传递参与细胞间信息传递2.蛋白质具有重要的生物学功能蛋白质具有重要的生物学功能3.氧化供能氧化供能.9n组成蛋白质的元素组成蛋白质的元素主要有主要有C C、H H、O O、N N和和 S S。有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有碘铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有碘 。.10 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16。由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测定生物样品中的含氮量,就可以此,只
6、要测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:100克样品中蛋白质的含量克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数每克样品含氮克数 6.251001/16%n蛋白质元素组成的特点蛋白质元素组成的特点.11一、组成人体蛋白质的一、组成人体蛋白质的20种种L-氨基酸氨基酸 存在自然界中的氨基酸有存在自然界中的氨基酸有300300余种,但余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有组成人体蛋白质的氨基酸仅有2020种,且均种,且均属属 L-L-氨基酸氨基酸(甘氨酸除外)。(甘氨酸除外)。.12.13H甘氨酸甘氨酸CH3丙氨酸丙氨酸L-L-氨基酸的通
7、式氨基酸的通式RC+NH3COO-H.14 除了除了2020种基本的氨基酸外,近年发现硒代半种基本的氨基酸外,近年发现硒代半胱氨酸在某些情况下也可用于合成蛋白质。硒胱氨酸在某些情况下也可用于合成蛋白质。硒代半胱氨酸从结构上来看,硒原子替代了半胱代半胱氨酸从结构上来看,硒原子替代了半胱氨酸分子中的硫原子。硒代半胱氨酸存在于少氨酸分子中的硫原子。硒代半胱氨酸存在于少数天然蛋白质中,包括过氧化物酶和电子传递数天然蛋白质中,包括过氧化物酶和电子传递链中的还原酶等。硒代半胱氨酸参与蛋白质合链中的还原酶等。硒代半胱氨酸参与蛋白质合成时,并不是由目前已知的密码子编码,具体成时,并不是由目前已知的密码子编码,
8、具体机制尚不完全清楚。机制尚不完全清楚。.15体内也存在若干不参与蛋白质合成但具有体内也存在若干不参与蛋白质合成但具有重要生理作用的重要生理作用的L-L-氨基酸,如参与合成尿素的氨基酸,如参与合成尿素的鸟氨酸(鸟氨酸(ornithineornithine)、瓜氨酸()、瓜氨酸(citrullinecitrulline)和精)和精氨酸代琥珀酸(氨酸代琥珀酸(argininosuccinateargininosuccinate)。)。.16非极性脂肪族氨基酸非极性脂肪族氨基酸极性中性氨基酸极性中性氨基酸芳香族氨基酸芳香族氨基酸酸性氨基酸酸性氨基酸碱性氨基酸碱性氨基酸二、氨基酸二、氨基酸可根据侧链结
9、构和理化可根据侧链结构和理化性质进行分类性质进行分类.17(一一)侧链含烃链的氨基酸属于非极性脂肪族侧链含烃链的氨基酸属于非极性脂肪族氨基酸氨基酸.18(二二)侧链有极性但不带电荷的氨基酸是极性侧链有极性但不带电荷的氨基酸是极性中性氨基酸中性氨基酸甲硫氨酸.19(三三)侧链含芳香基团的氨基酸是芳香族氨基酸侧链含芳香基团的氨基酸是芳香族氨基酸.20(四四)侧链含负性解离基团的氨基酸是酸性氨基酸侧链含负性解离基团的氨基酸是酸性氨基酸.21(五五)侧链含正性解离基团的氨基酸属于碱性侧链含正性解离基团的氨基酸属于碱性氨基酸氨基酸.22n几种特殊氨基酸几种特殊氨基酸 脯氨酸脯氨酸(亚氨基酸)(亚氨基酸)
10、CH2CHCOO-NH2+CH2CH2CH2CHCOO-NH2+CH2CH2.23 半胱氨酸半胱氨酸 +胱氨酸胱氨酸二硫键二硫键-HH-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3.24 在蛋白质翻译后的修饰过程中,脯氨酸和赖氨酸在蛋白质翻译后的修饰过程中,脯氨酸和赖氨酸可分别被羟化为羟脯氨酸和羟赖氨酸。可分别被羟化为羟脯氨酸和羟赖氨酸。蛋白质分子中蛋白质分子中2
11、020种氨基酸残基的某些基团还可被种氨基酸残基的某些基团还可被甲基化、甲酰化、乙酰化、异戊二烯化和磷酸化甲基化、甲酰化、乙酰化、异戊二烯化和磷酸化等。等。这些翻译后修饰,可改变蛋白质的溶解度、稳定这些翻译后修饰,可改变蛋白质的溶解度、稳定性、亚细胞定位和与其他细胞蛋白质相互作用的性、亚细胞定位和与其他细胞蛋白质相互作用的性质等,体现了蛋白质生物多样性的一个方面。性质等,体现了蛋白质生物多样性的一个方面。.25三、三、20种氨基酸具有共同或特异的理化性质种氨基酸具有共同或特异的理化性质n两性解离及等电点两性解离及等电点氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处
12、溶液的酸碱度。处溶液的酸碱度。等电点等电点(isoelectric point,pI)在某一在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的中性。此时溶液的pH值值称为该氨基酸的称为该氨基酸的等电点等电点。(一)氨基酸具有两性解离的性质(一)氨基酸具有两性解离的性质.26pH=pI+OH-pHpI+H+OH-+H+pHpI氨基酸的兼性离子氨基酸的兼性离子 阳离子阳离子阴离子阴离子CHNH2COOHR CHNH2COOHRCHNH3+COO-R CHNH3+COO-RCHNH
13、2COO-R CHNH2COO-RCH COOHRNH3+CH COOHRNH3+.27(二)含共轭双键的氨基酸具有紫外吸收性质(二)含共轭双键的氨基酸具有紫外吸收性质色氨酸、酪氨酸色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在的最大吸收峰在 280 nm 附近。附近。大多数蛋白质含大多数蛋白质含有这两种氨基酸残基,有这两种氨基酸残基,所以测定蛋白质溶液所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值是分的光吸收值是分析溶液中蛋白质含量析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。的快速简便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸收芳香族氨基酸的紫外吸收.28(三)氨基酸与茚三酮反应生成蓝紫色化合物(三)氨基酸与茚三酮反应生成蓝紫色化合物氨基
14、酸与茚三酮水合物共热,可生成氨基酸与茚三酮水合物共热,可生成蓝蓝紫色紫色化合物,其最大吸收峰在化合物,其最大吸收峰在570nm处。处。由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比关系,因此可作为氨基酸定量分析方法。比关系,因此可作为氨基酸定量分析方法。.29四、氨基酸通过肽键连接而形成蛋白四、氨基酸通过肽键连接而形成蛋白质或活性肽质或活性肽肽键肽键(peptide bond)是由一个氨基酸的是由一个氨基酸的-羧基与另一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的-氨基脱水缩合而形成氨基脱水缩合而形成的化学键。的化学键。(一)(一)氨基酸通过肽键连接而形成肽氨基酸通过肽键连接而形成肽
15、.30NH2-CH-CHOOH甘甘氨氨酸酸NH2-CH-CHOOH甘甘氨氨酸酸NH-CH-CHOHO OH甘甘氨氨酸酸+-HOH甘氨酰甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽键NH2-CH-C-N-CH-COOHHHHONH2-CH-C-N-CH-COOHHHHO.31肽肽(peptide)是由氨基酸通过肽键缩合而形是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。成的化合物。两分子氨基酸缩合形成二肽,三分子氨基两分子氨基酸缩合形成二肽,三分子氨基酸缩合则形成三肽酸缩合则形成三肽肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为氨基酸残基不全,被称为氨基酸残基(residue)。由十个以内氨
16、基酸相连而成的肽称为寡肽由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相连形成的肽,由更多的氨基酸相连形成的肽称多肽称多肽(polypeptide)。.32N 末端:多肽链中有末端:多肽链中有游离游离-氨基氨基的一端的一端C 末端:多肽链中有末端:多肽链中有游离游离-羧基羧基的一端的一端n多肽链有两端:多肽链有两端:多肽链多肽链(polypeptide chain)是指许多氨是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。基酸之间以肽键连接而成的一种结构。N末端末端C末端末端牛核糖核酸酶牛核糖核酸酶.34 蛋白质是由许多氨基酸残基组成、折叠蛋白质是由许多氨基酸残基
17、组成、折叠成特定的空间结构、并具有特定生物学功能成特定的空间结构、并具有特定生物学功能的多肽。一般而论,蛋白质的氨基酸残基数的多肽。一般而论,蛋白质的氨基酸残基数通常在通常在50个以上,个以上,50个氨基酸残基以下则仍个氨基酸残基以下则仍称为多肽。称为多肽。.35(二)(二)体内存在多种重要的生物活性肽体内存在多种重要的生物活性肽 1.谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione,GSH).36GSH过氧过氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还原酶还原酶NADPH+H+NADP+nGSH与与GSSG间的转换间的转换 .37 体内许多激素属寡肽或多肽体内许多激素属寡肽或多肽
18、神经肽神经肽(neuropeptide)2.多肽类激素及神经肽多肽类激素及神经肽.38蛋白质的分子结构蛋白质的分子结构The Molecular Structure of Protein 第二节第二节.39n蛋白质的分子结构包括蛋白质的分子结构包括:高级高级结构结构一级结构一级结构(primary structure)二级结构二级结构(secondary structure)三级结构三级结构(tertiary structure)四级结构四级结构(quaternary structure).40n定义定义:蛋白质的一级结构指在蛋白质分子从蛋白质的一级结构指在蛋白质分子从N-端至端至C-端的端的
19、氨基酸排列顺序氨基酸排列顺序。一、一、氨基酸的排列顺序决定蛋白质氨基酸的排列顺序决定蛋白质的一级结构的一级结构n主要的化学键主要的化学键:肽键肽键,有些蛋白质还包括二硫键。,有些蛋白质还包括二硫键。.41一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能功能的基础的基础,但不是决定蛋白质空间构象的但不是决定蛋白质空间构象的唯一因素唯一因素。.42目前已知一级结构的蛋白质数量已相当可观,目前已知一级结构的蛋白质数量已相当可观,并且还以更快的速度增加。并且还以更快的速度增加。国际互联网有若干重要的蛋白质数据库,例如国际互联网有若干重要的蛋白质数据库,例如nEMBL(Eur
20、opean Molecular Biology Laboratory Data Library)nGenbank(Genetic Sequence Databank)nPIR(Protein Identification Resource Sequence Database)收集了大量最新的蛋白质一级结构及其他资料,收集了大量最新的蛋白质一级结构及其他资料,为蛋白质结构与功能的深入研究提供了便利。为蛋白质结构与功能的深入研究提供了便利。.43二、二、多肽链的局部主链构象为蛋白质多肽链的局部主链构象为蛋白质二级结构二级结构蛋白质分子中某一段肽链的局部空间蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该
21、段肽链主链骨架原子的相对空结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。n定义定义:n主要的化学键主要的化学键:氢键氢键 .44 -螺旋螺旋 (-helix)-折叠折叠 (-pleated sheet)-转角转角 (-turn)无规卷曲无规卷曲 (random coil)n蛋白质二级结构蛋白质二级结构n所谓肽链主链骨架原子即所谓肽链主链骨架原子即N N(氨基氮)、(氨基氮)、CC(-碳原子)和碳原子)和CoCo(羰基碳)(羰基碳)3 3个原子个原子依次重复排列。依次重复排列。.45(一)参与肽键形成的(一)参与肽键形成的6个原子在
22、同一平面上个原子在同一平面上参与肽键的参与肽键的6个原子个原子C 1、C、O、N、H、C 2位于同一平位于同一平面,面,C 1和和C 2在平面上所处的位置为反式在平面上所处的位置为反式(trans)构型,此同构型,此同一平面上的一平面上的6个原子构成了所谓的个原子构成了所谓的肽单元肽单元(peptide unit)。.46.47 -螺旋螺旋 (-helix)-折叠折叠 (-pleated sheet)-转角转角 (-turn)无规卷曲无规卷曲 (random coil)(二)(二)-螺旋结构是常见的蛋白质二级结构螺旋结构是常见的蛋白质二级结构n蛋白质二级结构蛋白质二级结构.48(二)(二)-螺
23、旋结构是常见的蛋白质二级结构螺旋结构是常见的蛋白质二级结构.49(三)(三)-折叠使多肽链形成片层结构折叠使多肽链形成片层结构.50.51(四)(四)-转角和无规卷曲在蛋白质分子中转角和无规卷曲在蛋白质分子中普遍存在普遍存在-转角转角无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。分肽链结构。.52(五)(五)二级结构可组成蛋白质分子中的二级结构可组成蛋白质分子中的模体模体在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个个有规则的二级结构组合
24、,被称为有规则的二级结构组合,被称为超二级结构超二级结构。二级结构组合形式有二级结构组合形式有3 3种:种:,。.53二个或三个具有二级结构的肽段,在空间二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,称为上相互接近,形成一个特殊的空间构象,称为模体模体(motif)。模体是具有特殊功能的超二级结构。模体是具有特殊功能的超二级结构。.54钙结合蛋白中结合钙结合蛋白中结合钙离子的模体钙离子的模体锌指结构锌指结构-螺旋螺旋-转角(或转角(或环)环)-螺旋模体螺旋模体链链-转角转角-链模体链模体链链-转角转角-螺旋螺旋-转角转角-链模体链模体n模体常见的形式模体常见的形式.5
25、5(六)氨基酸残基的侧链影响二级结构的形成(六)氨基酸残基的侧链影响二级结构的形成蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成-螺旋螺旋或或-折叠,它就会出现相应的二级结构。折叠,它就会出现相应的二级结构。.56三、三、多肽链在二级结构基础上进一步折叠多肽链在二级结构基础上进一步折叠形成三级结构形成三级结构疏水键、离子键、氢键和疏水键、离子键、氢键和 范德华力等。范德华力等。n主要的化学键主要的化学键:整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在
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