第四章酶--使用课件.ppt
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1、 问答题和计算题问答题和计算题1、为什么说蛋白质是生命活动最重要的物质基础?为什么说蛋白质是生命活动最重要的物质基础?2、试比较、试比较Gly、Pro与其它常见氨基酸结构的异同,它们对多肽链与其它常见氨基酸结构的异同,它们对多肽链二级结构的形成有何影响?二级结构的形成有何影响?3、试举例说明蛋白质结构与功能的关系(包括一级结构、高级结、试举例说明蛋白质结构与功能的关系(包括一级结构、高级结构与功能的关系)。构与功能的关系)。4、为什么说蛋白质水溶液是一种稳定的亲水胶体?、为什么说蛋白质水溶液是一种稳定的亲水胶体?5、什么是蛋白质的变性?变性的机制是什么?举例说明蛋白质变、什么是蛋白质的变性?变
2、性的机制是什么?举例说明蛋白质变性在实践中的应用。性在实践中的应用。6、已知某蛋白质的多肽链的一些节段是、已知某蛋白质的多肽链的一些节段是-螺旋,而另一些节段是螺旋,而另一些节段是-折叠。该蛋白质的分子量为折叠。该蛋白质的分子量为240 000,其分子长,其分子长5.06 10-5,求分子中求分子中-螺旋和螺旋和-折叠的百分率。折叠的百分率。(蛋白质中一个氨基酸的平均分子量为蛋白质中一个氨基酸的平均分子量为120)名词解释名词解释等电点(等电点(pI)肽键和肽链肽键和肽链 肽平面及二面角肽平面及二面角 一级结构一级结构 二级结构二级结构 三级结构三级结构 四级结构四级结构 超二级结构超二级结构
3、 结构域结构域 蛋白质变性与复性蛋白质变性与复性 分子病分子病 肽肽 第四章第四章 酶酶第一节 酶的催化性质第二节 酶的组成第三节 酶的分类与命名第四节 酶催化作用的机理第五节 影响酶反应速度的因素第六节 酶活性的调控 18601897年,Paster等人对酒精发酵的研究,发现酵母细胞液中的某种成分起到了促进发酵的作用,当时称为“酵素”;1878年,Kuhne提出“酶”一词Enzyme,意为“在酵母中”;1926年,Sumner分离并纯化了第一种酶-脲酶结晶,并证明它具有蛋白质性质,获得1946年的诺贝尔化学奖。30年代,Northrop和Kunitz分离纯化了胃蛋白酶,胰蛋白酶等,阐明了酶的
4、化学本质是蛋白质。1963年,Phillips用X射线衍射技术测定并阐明了鸡蛋清溶菌酶的三维结构,获得1989年的诺贝尔化学奖。80年代,Ceck和Altman发现了具有催化功能的RNA核酶,打破了酶一定是蛋白质的传统观念。现已鉴定出4000多种酶,数百种得到了结晶,每年都有新酶发现。酶的发现及酶学发展酶的发现及酶学发展一、酶的概念与化学本质一、酶的概念与化学本质 1、酶的概念:酶是由生物细胞产生的具有催化能力的生物催化剂(Biocatalysts)。2、酶的化学本质是蛋白质或核酸。绝大多数的酶都是蛋白质,但80年代在原生四膜虫体内发现具有自我剪切功能的RNA称为“核酶”。第一节:酶的催化性质
5、第一节:酶的催化性质据酶分子据酶分子组成分类组成分类单纯蛋白质酶类单纯蛋白质酶类结合蛋白质酶类结合蛋白质酶类酶蛋白酶蛋白辅助因子辅助因子金属离子金属离子金属有机物金属有机物小分子有机物小分子有机物酶的化学本质酶的化学本质据酶蛋据酶蛋白特征白特征分类分类单体酶(单体酶(monomeric enzyme):仅有一条具有活性部位的多肽链,全部参与水解反应。寡聚酶寡聚酶(oligomeric enzyme):由几个或多个亚基组成,亚基牢固地联在一起,单个亚基没有催化活性。亚基之间以非共价键结合。多酶复合物多酶复合物(multienzyme system):几个酶镶嵌而成的复合物。这些酶催化将底物转化为
6、产物的一系列顺序反应。酶的化学本质酶的化学本质 (multienzyme(multienzyme system)system):由由几种不同功能几种不同功能的酶的酶彼此聚合形成的多酶彼此聚合形成的多酶复合物。复合物。v多酶体系多酶体系(一)酶和一般催化剂的共性:(一)酶和一般催化剂的共性:用量少而催化率高。用量少而催化率高。它能够改变化学反应的速度,但是不能改变化学反应它能够改变化学反应的速度,但是不能改变化学反应平衡。酶本身在反应前后也不发生变化。平衡。酶本身在反应前后也不发生变化。酶能够稳定底物形成的过渡状态,降低反应的活化能,酶能够稳定底物形成的过渡状态,降低反应的活化能,从而加速反应的
7、进行从而加速反应的进行。二、酶的催化特点(二)酶作为生物催化剂的特性(二)酶作为生物催化剂的特性 1、高效性、高效性 酶具有极高的催化效率,可使反应速度提高酶具有极高的催化效率,可使反应速度提高1010 10101 1倍。例如:倍。例如:H H2 2O O2 2分解分解,过氧化氢酶的催化效率是铁粉过氧化氢酶的催化效率是铁粉的的10101010倍倍.2 酶促反应的可调节性酶促反应的可调节性酶促反应受多种因素的调控,以适应机体对酶促反应受多种因素的调控,以适应机体对不断变化的内外环境和生命活动的需要。不断变化的内外环境和生命活动的需要。对酶生成与降解量的调节对酶生成与降解量的调节 酶催化效力的调节
8、酶催化效力的调节 通过改变底物浓度对酶进行调节等通过改变底物浓度对酶进行调节等3 3、专一性、专一性 酶的专一性:酶的专一性:又称为特异性,是指酶在催化生又称为特异性,是指酶在催化生化反应时对底物和反应类型有严格的选择性,即化反应时对底物和反应类型有严格的选择性,即一种酶只能催化某一类或某一种化学底物,催化一种酶只能催化某一类或某一种化学底物,催化某一类或某一种化学反应。例如:蛋白酶催化蛋某一类或某一种化学反应。例如:蛋白酶催化蛋白质的水解;淀粉酶催化淀粉的水解;核酸酶催白质的水解;淀粉酶催化淀粉的水解;核酸酶催化核酸的水解。根据专一程度分为:化核酸的水解。根据专一程度分为:酶的专一性酶的专一
9、性绝对专一性:一种酶只能催化一种底物发生一种类型的反应绝对专一性:一种酶只能催化一种底物发生一种类型的反应。相对专一性相对专一性键专一性:只对底物分子中某种化学键有要求。键专一性:只对底物分子中某种化学键有要求。基团专一性:除了对底物分子中的化学键有严格基团专一性:除了对底物分子中的化学键有严格的要求外,还对该键一端的基团有严格的要求。的要求外,还对该键一端的基团有严格的要求。立体异构专一性立体异构专一性旋光异构专一性:对旋光异物体的底物构型有严旋光异构专一性:对旋光异物体的底物构型有严格的选择性,例:格的选择性,例:D-,L-型氨基酸氧化酶。型氨基酸氧化酶。几何异构专一性:对选择性催化某种几
10、何异几何异构专一性:对选择性催化某种几何异构体底物的反应,如:顺反异构。构体底物的反应,如:顺反异构。潜手性专一性:酶对底物中的两个对称原子只潜手性专一性:酶对底物中的两个对称原子只能催化一个起反应,对另一个不起作用,如:能催化一个起反应,对另一个不起作用,如:酵母醇脱氢酶。酵母醇脱氢酶。绝对专一性绝对专一性:举例:举例:脲酶只水解尿素,而不能水解甲基脲酶只水解尿素,而不能水解甲基尿素尿素。OCNH2NH2+H2O2NH3 +CO2尿素脲酶OCNHNH2+H2O甲基尿素CH3脲酶酯酶酯酶:RCOR+H2OORCOO-+R OH+H+OCH2OHOHOHOH15-葡萄糖葡萄糖苷酶苷酶O R+H2
11、OOCH2OHOHOHOHOH15+ROH键专一性:键专一性:基团专一性:基团专一性:立体异构立体异构专一性酶专一性酶举例:举例:乳酸脱氢酶只作用于乳酸脱氢酶只作用于L-乳酸,而对乳酸,而对D-乳酸无作乳酸无作用。用。几何异构专一性:几何异构专一性:潜手性专一性:潜手性专一性:4、反应条件温和、反应条件温和 酶促反应一般在酶促反应一般在pH 5-8 pH 5-8 水溶液中进行,水溶液中进行,反应温度范围为反应温度范围为20-4020-40 C C。5、酶易变性失活、酶易变性失活 凡能使蛋白质变性的因素如强酸、强凡能使蛋白质变性的因素如强酸、强碱、高温等条件都能使酶破坏而完全失碱、高温等条件都能
12、使酶破坏而完全失去活性。所以酶作用一般都要求比较温去活性。所以酶作用一般都要求比较温和的条件如常温、常压和接近中性的酸和的条件如常温、常压和接近中性的酸碱度。碱度。第二节:酶的命名及分类第二节:酶的命名及分类一、酶的命名一、酶的命名(一)习惯命名法(一)习惯命名法 根据底物命名根据底物命名:如脂肪酶、蔗糖酶、蛋白酶等;根据所催化的化学反应命名:根据所催化的化学反应命名:如水解酶、转氨酶等。根据酶作用的底物和催化的化学反应来命名根据酶作用的底物和催化的化学反应来命名:如乙醇脱氢酶、乳酸脱氢酶、磷酸丙糖异构酶等。注明酶的来源及一些其他特点:注明酶的来源及一些其他特点:唾液淀粉酶、碱性磷酸酯酶等。(
13、二)国际系统命名法(二)国际系统命名法I 系统命名法系统命名法:包括所有底物的名称和反应类型。包括所有底物的名称和反应类型。乳酸乳酸+NAD+丙酮酸丙酮酸+NADH+H+乳酸:乳酸:NAD+脱氢酶脱氢酶二、酶的分类二、酶的分类G 19611961年国际酶学委员会(年国际酶学委员会(Enzyme Committee,ECEnzyme Committee,EC)根据酶所催化的反应类型和机理,把酶分成根据酶所催化的反应类型和机理,把酶分成6 6大类:大类:1 1、氧化、氧化-还原酶类(还原酶类(xido-reductasesxido-reductases)v氧化氧化-还原酶催化氧化还原酶催化氧化-还
14、原反应。还原反应。v主要包括脱氢主要包括脱氢酶酶(dehydrogenase(dehydrogenase)和氧化酶和氧化酶(Oxidase(Oxidase)。如,乳酸。如,乳酸(Lactate)(Lactate)脱氢酶催化乳脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。酸的脱氢反应。CH3CHCOOHOHNAD+H+CH3CCOOHONADH通式:通式:AH2+BBH2+A2 2、转移、转移(移换移换)酶类(酶类(TransferasesTransferases)v转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。的基团或原子转移到另一个底物的分
15、子上。通式通式:AR+BBR+A例如,谷丙转氨酶催化的氨基转移反应例如,谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。3 3、水解酶类(、水解酶类(hydrolaseshydrolases)v水解酶催化底物的加水分解反应。水解酶催化底物的加水分解反应。v主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。v例如,脂肪酶例如,脂肪酶(Lipase)(Lipase)催化的脂的水解反应:催化的脂的水解反应:H2OCOOCH2CH3RRCOOHCH3CH2OHAB+H2OAOH+BH4、裂合(裂解)酶类裂合(裂解)酶类(Lyase(Lyase)n裂合酶催化从底物分裂合酶催化从底物分子中移去
16、一个基团或子中移去一个基团或原子而形成双键的反原子而形成双键的反应及其逆反应。主要应及其逆反应。主要包括醛缩酶、水化酶包括醛缩酶、水化酶(脱水酶)及脱氨酶(脱水酶)及脱氨酶等。等。通式:通式:AB A+B5 5、异构酶类、异构酶类(Isomerases(Isomerases)v异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即底物异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即底物分子内基团或原子的重排过程。分子内基团或原子的重排过程。通式:通式:A Bv例如,例如,6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。6 6、合成酶类、合成酶类(Ligases orSynthetases(Ligases o
17、rSynthetases)v合成酶,又称为连接酶,能够催化合成酶,又称为连接酶,能够催化C-CC-C、C-OC-O、C-N C-N 以及以及C-S C-S 键的形成反应。这类反应必须与键的形成反应。这类反应必须与ATPATP分解反应相互偶联。分解反应相互偶联。通式:通式:A+B+ATP=AA+B+ATP=A-B+ADP+PiB+ADP+Pi 例:乙酰CoA羧化酶催化的反应三、酶的编号三、酶的编号酶的系统编号酶的系统编号:4 4位数字位数字第一位:代表六大类反应类型第一位:代表六大类反应类型第二位:亚类(作用的基团或键的特点)第二位:亚类(作用的基团或键的特点)第三位:亚亚类(精确表示底物第三位
18、:亚亚类(精确表示底物/产物的性质)产物的性质)第四位:在亚亚类中的序号第四位:在亚亚类中的序号乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶 EC 1.1.1.27第1大类,氧化还原酶第1亚类,氧化基团CHOH第1亚亚类,H受体为NAD+该酶在亚亚类中的编号酶的活性中心酶的活性中心一、酶的活性中心一、酶的活性中心第三节第三节 酶催化作用的机理酶催化作用的机理必需基团必需基团(essential group)(essential group)酶分子中氨基酸残基侧酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中,一些链的化学基团中,一些与酶活性密切相关的化与酶活性密切相关的化学基团。学基团。或称或称活性部位活性部位(active si
19、te)(active site),指必需指必需基团在基团在一级结构上可能相距遥远,但在一级结构上可能相距遥远,但在空间空间结构上彼此靠近,组成具有结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的特定空间结构的区域区域,能,能与底物特异结合与底物特异结合并并将底物转化为产将底物转化为产物物。酶的活性中心酶的活性中心(active center)(active center)活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团结合基团结合基团binding group催化基团催化基团(catalytic group)催化底物转变成产物催化底物转变成产物 位于活性中心以外,维持酶活性中心应有位于活性中心以外,维持酶活性中
20、心应有的空间构象所必需。的空间构象所必需。活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团酶的活性中心常位于酶蛋白分子表面,为含有酶的活性中心常位于酶蛋白分子表面,为含有较多疏水氨基酸残基,形成较多疏水氨基酸残基,形成疏水性疏水性“裂缝裂缝”或或“口袋口袋”,形成了利于酶促反应发生的疏水环,形成了利于酶促反应发生的疏水环境境溶菌酶的活性溶菌酶的活性中心中心*谷氨酸谷氨酸35和天和天冬氨酸冬氨酸52是催化是催化基团;基团;*色氨酸色氨酸62和和63、天冬氨酸天冬氨酸101和和色氨酸色氨酸108是结是结合基团;合基团;*AF为底物多为底物多糖链的糖基,位糖链的糖基,位于酶的活性中心于酶的活性中心形成的裂隙
21、中。形成的裂隙中。AspHisSer胰胰凝凝乳乳蛋蛋白白酶酶的的活活性性中中心心活性中心重要基团活性中心重要基团:His57,Asp102,Ser195为为Tyr 248为为Arg 145为为Glu 270为底物为底物Zn羧肽酶活性中心示意图羧肽酶活性中心示意图二、酶原激活二、酶原激活 酶以酶原的形式合成和分泌,酶原是没有活性的酶的前体。使无活性的酶原转变成活性酶的过程,称为酶原激活。原原胰蛋白酶胰蛋白酶1 酶比一般催化剂更有效地降低反应活化能酶比一般催化剂更有效地降低反应活化能酶和一般催化剂一样,加速反应的作用都是通过降低酶和一般催化剂一样,加速反应的作用都是通过降低反应的活化能反应的活化能
22、(activation energy)实现的。实现的。活化能:底物分子从初态转变到活化态所需的能量。活化能:底物分子从初态转变到活化态所需的能量。二二 酶的催化机理酶的催化机理活化能:使低能活化能:使低能(底物底物)分子达到活化状态分子达到活化状态(过渡态)所需要的能量。所需要的能量。化学反应:A+BABC+D反应物(初态)中间产物(过渡态)产物(终态)活化能也就是底物分子从初态转化成过渡态所需的能量活化能也就是底物分子从初态转化成过渡态所需的能量2.酶能显著降低反应活化能的原因n酶催化的中间产物理论酶催化的中间产物理论n 锁钥学说锁钥学说n 诱导契合学说诱导契合学说酶催化的中间产物理论酶催化
23、的中间产物理论1kSE 1kES 2kEP E+SP+EES能能量量水水平平反应过程反应过程 G E1 E2 酶(酶(E)与底物()与底物(S)结合生成不稳定的中间结合生成不稳定的中间物(物(ES),再分解成产),再分解成产物(物(P)并释放出酶,使)并释放出酶,使反应沿一个低活化能的反应沿一个低活化能的途径进行,降低反应所途径进行,降低反应所需活化能,所以能加快需活化能,所以能加快反应速度。反应速度。锁钥学说锁钥学说:将酶的活性中心比喻作锁孔,底物分:将酶的活性中心比喻作锁孔,底物分子象钥匙,底物能专一性地插入到酶的活性中心。子象钥匙,底物能专一性地插入到酶的活性中心。诱导契合学说诱导契合学
24、说:酶的活性中心在结构上具柔性,底:酶的活性中心在结构上具柔性,底物接近活性中心时,可诱导酶蛋白构象发生变化,这物接近活性中心时,可诱导酶蛋白构象发生变化,这样就使使酶活性中心有关基团正确排列和定向,使之样就使使酶活性中心有关基团正确排列和定向,使之与底物成互补形状有机的结合而催化反应进行。与底物成互补形状有机的结合而催化反应进行。酶专一性的酶专一性的“锁钥学说锁钥学说”酶专一性的酶专一性的“诱导契合学说诱导契合学说”羧肽酶的诱导契合模式羧肽酶的诱导契合模式 底物底物酶受底物诱导发生构象改变,特别是活性中心的酶受底物诱导发生构象改变,特别是活性中心的功能基团位移或改向,呈现一种高活性功能状态。
25、功能基团位移或改向,呈现一种高活性功能状态。加之,由于酶的活性中心关键性电荷基团可使底加之,由于酶的活性中心关键性电荷基团可使底物分子电子云密度改变,产生张力作用使底物扭物分子电子云密度改变,产生张力作用使底物扭曲,削弱有关的化学键,从而使底物从基态转变曲,削弱有关的化学键,从而使底物从基态转变成过渡态,有利于反应进行。成过渡态,有利于反应进行。X-射线晶体衍射证明,溶菌酶与底物结合后,底射线晶体衍射证明,溶菌酶与底物结合后,底物中的乙酰氨基葡糖中吡喃环可从椅式扭曲成沙物中的乙酰氨基葡糖中吡喃环可从椅式扭曲成沙发式,导致糖苷键断裂,实现溶菌酶的催化作用发式,导致糖苷键断裂,实现溶菌酶的催化作用
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