第四章-连锁遗传分析与染色体作图--第三章-连锁遗传分析与染色体作图课件(1).ppt
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- 第四 连锁 遗传 分析 染色体 作图 第三 课件
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1、第一节第一节 连锁与交换定律连锁与交换定律问题问题:基因在染色体上如何排列?基因在染色体上如何排列?同一条染色体上的基因之间在遗传时如何相同一条染色体上的基因之间在遗传时如何相互作用?互作用?内容:内容:I.连锁交换定律连锁交换定律 II.基因定位与染色体作图基因定位与染色体作图III.人类基因组和染色体作图人类基因组和染色体作图 相引与相斥相引与相斥 1906,贝特逊贝特逊(Bateson,W.)庞尼特庞尼特(Punnet,R.C)香豌豆香豌豆(Lathyrus doratus)一、一、连锁交换定律连锁交换定律(一)(一)连锁交换定律的发现连锁交换定律的发现Bateson-Punnet 香豌
2、豆杂交试验香豌豆杂交试验P:紫花长花粉紫花长花粉红花圆花粉红花圆花粉 F1:紫花长花粉紫花长花粉 表型表型 观察数观察数(O)期望比例期望比例 期望值期望值(E)F2:紫长紫长 4831 9 3910.5紫圆紫圆 390 3 1303.5红长红长 393 3 1303.5红圆红圆 1338 1 434.5 总计总计 6952 2=(Oi-Ei)2/Ei=3371.58 df=4-1=3,差异极显著,差异极显著,结果不符合自由组合定结果不符合自由组合定律,律,F2代中性状的亲组合类型远远多于重组类型。代中性状的亲组合类型远远多于重组类型。P:紫花圆花粉紫花圆花粉红花长花粉红花长花粉 F1:紫花长
3、花粉紫花长花粉 表型表型 观察数观察数(O)期望比例期望比例 期望值期望值(E)F2:紫长紫长 226 9 235.8紫圆紫圆 95 3 78.5红长红长 97 3 78.5红圆红圆 1 1 26.2 总计总计 419 2=(Oi-Ei)2/Ei=32.4 df=4-1=3,差异极显著,差异极显著,结果不符合自由结果不符合自由组合定律。组合定律。Batson等:等:互引相互引相(coupling phase)前一种亲本组合前一种亲本组合 互斥相互斥相(repulsion phase)后一种亲本组合后一种亲本组合1912年,年,摩尔根:摩尔根:连锁交换定律连锁交换定律 凡是伴性遗传的基因,相互之
4、间总是连锁的。凡是伴性遗传的基因,相互之间总是连锁的。描述亲本花色花粉粒形状两个显性性状连在一起遗传P1紫花(显)长花粉粒(显)两个隐性性状连在一起遗传P2红花(隐)圆花粉粒(隐)一个显性性状与另一个隐性性状P1紫花(显)圆花粉粒(隐)一个隐性性状与另一个显性性状P2红花(隐)长花粉粒(显)相引相相斥相描述亲本花色花粉粒形状两个显性性状连在一起遗传P1紫花(显)长花粉粒(显)两个隐性性状连在一起遗传P2红花(隐)圆花粉粒(隐)一个显性性状与另一个隐性性状P1紫花(显)圆花粉粒(隐)一个隐性性状与另一个显性性状P2红花(隐)长花粉粒(显)相引相相斥相 连锁连锁(linkage):1、摩尔根的试验
5、、摩尔根的试验:P:灰体长翅灰体长翅(BBVV)黑体残翅黑体残翅(bbvv)F1:灰体长翅灰体长翅(BbVv)测交测交1:灰体长翅灰体长翅(BbVv)黑体残翅黑体残翅(bbvv)灰体长翅灰体长翅(BbVv):黑体残翅黑体残翅(bbvv)=1 :1测交测交2:灰体长翅灰体长翅(BbVv)黑体残翅黑体残翅(bbvv)灰体长翅灰体长翅(BbVv):0.42 黑体长翅黑体长翅(bbVv):0.08 灰体残翅灰体残翅(Bbvv):0.08 黑体残翅黑体残翅(bbvv):0.42 测交子代虽然出现了四种类型,但是重组类型测交子代虽然出现了四种类型,但是重组类型显著少于亲本类型。显著少于亲本类型。l摩尔根的
6、解释:摩尔根的解释:l 基因基因B、V处于同一条染色体上,而处于同一条染色体上,而其等位基因其等位基因b、v位于同源染色体的另一位于同源染色体的另一条上。减数分裂时不能独立分配和自由条上。减数分裂时不能独立分配和自由组合。组合。2、完全连锁、完全连锁(Complete linkage):如如测交测交1:基因完全:基因完全连锁,不能发生重组。例连锁,不能发生重组。例雄果蝇雄果蝇和和雌家蚕雌家蚕P:灰体长翅灰体长翅(BBVV)黑体残翅黑体残翅(bbvv(bbvv)F1:灰体长翅灰体长翅(BbVv)黑体残翅黑体残翅(bbvv(bbvv)灰体长翅灰体长翅(BbVv):黑体残翅黑体残翅(bbvv(bbv
7、v)=)=1 :1B VB Vb vb vB Vb vb vb vB Vb vb vb v3、不完全连锁不完全连锁(Incomplete linkage):如如测交测交2,基因可以发生部分重组,但亲,基因可以发生部分重组,但亲本类型多于重组类型。本类型多于重组类型。灰体长翅灰体长翅(BbVv)黑体残翅黑体残翅(bbvv(bbvv)灰体长翅灰体长翅:黑体黑体长翅长翅:灰体灰体残翅残翅:黑体残翅黑体残翅 (BbVv)(b bbVv)(Bbvv)(bbvvbvv)(bbvv)B Vb vB vb VB Vb vb vb vb vb vb vb v42%8%8%42%Results of gamate
8、 formation where two hererozygous genes are(a)on two different pairs of chromoses;Results of gamate formation where two hererozygous genes are(b)on the same pair of homologs,but where no exchange occurs between themResults of gamate formation where two hererozygous genes are(c)on the same pairs of h
9、omologs,where an exchange occurs between two nonsister chromatids.(1)相引相引是两个基因位于同一条染色体上,相斥相斥则反之。(2)同源染色体在减数分裂时发生交换交换 (crossing-over)(3)位置相近的因子相互连锁连锁。(孟德尔遗传的随机分离与相引Science,191134.384)1).交换的机制交换的机制:Janssens,1909 交叉型假设交叉型假设(chiasmatype hypothesis)要点:要点:(1).减数分裂前期的粗线期,非姊妹染色减数分裂前期的粗线期,非姊妹染色单体之间由于在粗线期发生交换
10、单体之间由于在粗线期发生交换(crossing over)而在双线期出现而在双线期出现交叉交叉(chiasma)。(2).相互连锁的两个基因之间如发生交换,会相互连锁的两个基因之间如发生交换,会导致这两个基因发生重组。导致这两个基因发生重组。A Ba bA ba B交换交换A BA ba Ba bA Ba bA Ba bA Ba b复制复制 交换交换发生过交换的性母细胞产生的配子,只有一半是发生过交换的性母细胞产生的配子,只有一半是重组子,另一半是亲组合型。重组子,另一半是亲组合型。交换的特点交换的特点:2)交换率)交换率(crossoverrate):):又称交换值或又称交换值或重组率重组率
11、(RF,recombination frequency)。l 交换率交换率=重组合重组合(亲组合重组合亲组合重组合)100100单位单位:图距单位图距单位 m.um.u.(map unit)或厘摩或厘摩(centimorgan cM)以玉米的测交实验为例说明交换率测定方法。以玉米的测交实验为例说明交换率测定方法。总配子数重组型配子数交换值100(%)C与与Sh连锁,亲本为互引相时:连锁,亲本为互引相时:分析:分析:不论哪种基因组合的交配方式,测交后代中亲不论哪种基因组合的交配方式,测交后代中亲组合的频率都是组合的频率都是97%左右(高),重组合的频率仅左右(高),重组合的频率仅占占3%左右(低
12、)。左右(低)。RF值越小,基因间的连锁强度越大。值越小,基因间的连锁强度越大。RF值越大,基因间的连锁强度越小;接近值越大,基因间的连锁强度越小;接近50%时,基因间的连锁关系难以判断,必须用大量时,基因间的连锁关系难以判断,必须用大量的测交后代的数据方可鉴别。的测交后代的数据方可鉴别。连锁现象在生物界普遍存在。连锁现象在生物界普遍存在。连锁群连锁群(linkage group):连锁群的数目连锁群的数目=单倍体染色体数单倍体染色体数(n)人类人类 果蝇果蝇l 摩尔根摩尔根l遗传学第三大定律遗传学第三大定律:连锁交换定律连锁交换定律。l内容内容:l 处在同一染色体上的两个或多个基因联合处在同
13、一染色体上的两个或多个基因联合在一起传入子代的频率大于重新组合的频率在一起传入子代的频率大于重新组合的频率.重组类型的产生是由于配子形成时,同源染色重组类型的产生是由于配子形成时,同源染色体的非姊妹染色单体间发生了局部交换的结果体的非姊妹染色单体间发生了局部交换的结果。1.分离定律是自由组合定律和连锁交换定律的基础;分离定律是自由组合定律和连锁交换定律的基础;2.自由组合定律和连锁交换定律是生物体遗传性状发自由组合定律和连锁交换定律是生物体遗传性状发生生变异变异的主要机制;的主要机制;3.自由组合与连锁交换的区别:自由组合与连锁交换的区别:(1)染色体间重组染色体间重组(interchromo
14、somal recombination)染色体内重组染色体内重组(intrachromosomal recombination)(2)自由组合受生物染色体对数的限制,而连锁交换自由组合受生物染色体对数的限制,而连锁交换则受其染色体本身长度的限制。则受其染色体本身长度的限制。生理学及遗传学家生理学及遗传学家JBSHaldane(英)(英)凡是较少发生交换的个体必定是异配性别凡是较少发生交换的个体必定是异配性别个体。个体。霍尔丹定律。霍尔丹定律。在一定条件下,相同基因之间的交换值是在一定条件下,相同基因之间的交换值是相对稳定的。相对稳定的。双交换(双交换(double crossingover)双
15、交换特点(双交换特点(1)()(2)()(3)A ba B 单交换单交换A Ba b A Ba b双交换双交换A Ba bA C Ba c b A c Ba C b双交换双交换Consequences of a double exchange between two nonsister chromatids.基因在染色体上的位置是相对恒定的。根据是两基因在染色体上的位置是相对恒定的。根据是两个基因之间的重组值个基因之间的重组值(率率)的相对恒定性。不同基因间的相对恒定性。不同基因间的重组值不同。的重组值不同。摩尔根摩尔根(1911):重组值重组值(交换值交换值)的大小反映着的大小反映着基因座在
16、染色体上距离的远近。于是将交换的百分率基因座在染色体上距离的远近。于是将交换的百分率直接定为染色体上基因座之间的距离单位。直接定为染色体上基因座之间的距离单位。AHSturtevant:“基因的直线排列基因的直线排列”原理原理任何任何3个距离较近的个距离较近的a、b、c连锁基因,若已分别测得连锁基因,若已分别测得a、b和和b、c间的距离,间的距离,那么那么a、c的距离,就必然等于前二者距离的和或差。的距离,就必然等于前二者距离的和或差。1基因定位基因定位(gene mapping)2染色体图染色体图(chromosome map)3图距图距(map distance)图距单位图距单位(map
17、unit,mu):“厘摩厘摩”(centimorgan,cM),l cM=l%重组值去掉重组值去掉%的数值。的数值。1).测交并计算重组值:测交并计算重组值:bi-w:5.3cM w-y:1.1 cM (1)w-y-bi (2)y-w-bi y-bi:5.5 cM2).画出基因连锁图。画出基因连锁图。(1)w y bi 1.1 cM 4.2cM (2)y w bi 1.1 cM 5.3cM 1.工作量大,需要作三次杂交,三次测交;工作量大,需要作三次杂交,三次测交;2.不能排除不能排除双交换的影响,准确性不够高双交换的影响,准确性不够高。当两基因位点间超过当两基因位点间超过5个遗传单位时,两点
18、测验的个遗传单位时,两点测验的准确性就不够高。准确性就不够高。MorganSturtevant:用用3个基因的杂合体个基因的杂合体abc/+与与3个基因的隐性纯合体个基因的隐性纯合体abc/abc做测交。做测交。以下用实验说明其遗传分析的方法:以下用实验说明其遗传分析的方法:表型表型 个体数目个体数目 比例比例 类型类型ec ct+2125+cv 2207ec+cv 273 +ct+265ec+217 +ct cv 223+5 ec ct cv 3 合计合计 5318 100%81.5%亲本型亲本型 10.1%单交换型单交换型 8.3%单交换型单交换型 0.1%双交换型双交换型 ec-ct间的
19、重组值是间的重组值是18.4%,但不等于,但不等于ec-cv及及cv-ct间两间两个重组值分量之和,即个重组值分量之和,即10.2%+8.4%=18.6%=/=18.4%。计。计算的算的ec-ct重组值为什么低于重组值为什么低于ec-cv及及cv-ct间重组值之和间重组值之和?因为在双交换类型中,末端两个基因因为在双交换类型中,末端两个基因(ec和和ct)之间虽同时之间虽同时发生了两次交换,但看不到重组,对于发生了两次交换,但看不到重组,对于ec-ct来讲,双交来讲,双交换的结果等于不交换。只有当基因换的结果等于不交换。只有当基因cv存在时,才能从表存在时,才能从表型上辨认出双交换。型上辨认出
20、双交换。后代后代8种个体中,种个体中,+和和ec ct cv为双交换产物,计为双交换产物,计算算ec-cv及及cv-ct重组值时都用了此数值,但计算重组值时都用了此数值,但计算ec-ct的的重组值时却未用到,因为重组值时却未用到,因为ec-ct间双交换的结果并不出间双交换的结果并不出现重组,所以现重组,所以ec-ct之间的实际交换值为重组值加之间的实际交换值为重组值加2倍倍双交换值,即双交换值,即18.4%+2*0.1%=18.6%。对。对ec-ct的交换的交换值作上述校正之后,它们之间的图距就是值作上述校正之后,它们之间的图距就是18.6cM,正,正好等于好等于 ec-cv和和cv-ct图距
21、之和。因此当三点测交后代图距之和。因此当三点测交后代出现出现8种表型时,表明相距较远的末端两个基因间必种表型时,表明相距较远的末端两个基因间必定有双交换发生,而末端两基因间的重组值往往会低定有双交换发生,而末端两基因间的重组值往往会低估了交换值,此时需要用两倍双交换值来作校正。若估了交换值,此时需要用两倍双交换值来作校正。若相距较近的相距较近的3个基因的三点测交,往往不出现双交换个基因的三点测交,往往不出现双交换类型,测交后代只有类型,测交后代只有6种表型,无需校正。种表型,无需校正。1).干涉干涉(interference,I)在三点测交中每发生一次在三点测交中每发生一次 单交换都会影响它邻
22、近发生另一次单交换,这单交换都会影响它邻近发生另一次单交换,这种现象称作干涉或染色体干涉。种现象称作干涉或染色体干涉。2).正干涉和负干涉正干涉和负干涉 第一次交换发生后,引起邻近发生第二次交换第一次交换发生后,引起邻近发生第二次交换机会降低的情况称为正干涉机会降低的情况称为正干涉(positive interference),引起第二次交换机会增加的为负干涉引起第二次交换机会增加的为负干涉(negative interference)。观察到的双交换率与预期的双交换率的比值称做观察到的双交换率与预期的双交换率的比值称做并发系数并发系数(coefficient of coincidence,C
23、)。干涉干涉I=l-C。C愈大,干涉愈小;愈大,干涉愈小;C=l时,时,I=0,没没有干涉;有干涉;I=1表示干涉完全,实验中无双交换,后代表示干涉完全,实验中无双交换,后代只有只有6种表型,一般是由于基因间相距很近,双交换种表型,一般是由于基因间相距很近,双交换不易发生。不易发生。A partial genetic map of the four chromosome of Drosophila melanogaster.关于遗传学图的补充说明关于遗传学图的补充说明:(1).一般以最左瑞的基因位置为一般以最左瑞的基因位置为0,随研究进展,发现有,随研究进展,发现有新基因在更左端时,把新基因在
24、更左端时,把0点的位置让给新基因,其余的基因点的位置让给新基因,其余的基因座相应移动。座相应移动。(2).重组率在重组率在0%-50%之间,但遗传学图上可出现之间,但遗传学图上可出现50个单个单位以上的图距。这是因为这两个基因之间距离较远,发生多位以上的图距。这是因为这两个基因之间距离较远,发生多次交换的缘故,但实际上它们之间的重组率不会超过次交换的缘故,但实际上它们之间的重组率不会超过50%。要从图上得知基因之间的重组率只限于邻近的基因座间。相要从图上得知基因之间的重组率只限于邻近的基因座间。相距较远基因之间的重组率要通过测交才能得知。距较远基因之间的重组率要通过测交才能得知。y w v m
25、 r 0.0 1.0 30.7 33.7 57.6基因间的距离与交换值、遗传距离、连锁强度基因间的距离与交换值、遗传距离、连锁强度 一一.链孢霉(链孢霉(Neurospora crassa)的生活史)的生活史l 分生孢子(conidia)l交配型交配型(matig type)l子囊果子囊果(peri thecium)子实体子实体l子囊子囊(ascus)l子囊孢子子囊孢子(ascospore)分生孢子(分生孢子(n)菌丝菌丝(n)子实体子实体核融合核融合合子核合子核(2n)交配型交配型A交配型交配型B减数分裂减数分裂I减数分裂减数分裂II有丝分裂有丝分裂萌发萌发(n)子囊孢子(子囊孢子(n)粗糙
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