人卫8版RNA的生物合成.ppt课件.ppt
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- 人卫 RNA 生物 合成 ppt 课件
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1、目录目录目录目录第十六章第十六章RNA的生物合成的生物合成RNA Biosynthesis(Transcription)目录目录n在生物界,在生物界,RNARNA合成有两种方式合成有两种方式 一是一是DNA指导的指导的RNA合成,也叫转录,此为生物体内的合成,也叫转录,此为生物体内的主要合成方式,也是主要合成方式,也是本章介绍的主要内容本章介绍的主要内容。另一种是另一种是RNA指导的指导的RNA合成合成(RNA-dependentRNAsynthesis),也叫,也叫RNA复制复制(RNAreplication),由由RNA依赖依赖的的RNA聚合酶聚合酶(RNA-dependentRNApol
2、ymerase)催化,催化,常见于病毒,是逆转录病毒以外的常见于病毒,是逆转录病毒以外的RNA病毒在宿主细胞以病毒在宿主细胞以病毒的单链病毒的单链RNA为模板合成为模板合成RNA的方式。的方式。目录目录转录转录 (transcription)是是生物体以生物体以DNA为为模板合成模板合成RNA的过程的过程 。转转录录RNADNA 转录产物转录产物除除mRNAmRNA、rRNA rRNA 和和tRNAtRNA外,在真核细胞内还外,在真核细胞内还有有snRNAsnRNA、miRNAmiRNA等非编码等非编码RNARNA。目录目录转录的知识是理解许多生物学现象和医学问题所转录的知识是理解许多生物学现
3、象和医学问题所必需的。必需的。对于对于RNA生物过程的调节可以导致蛋白质合成速生物过程的调节可以导致蛋白质合成速率的改变,以及由此而引发的一系列代谢变化,率的改变,以及由此而引发的一系列代谢变化,因此,了解因此,了解RNA代谢的基本原理就甚为重要。这代谢的基本原理就甚为重要。这些原理既关系到所有生物是如何适应环境变化的,些原理既关系到所有生物是如何适应环境变化的,也关系到细胞结构和功能的分化机制。也关系到细胞结构和功能的分化机制。复制和转录的区别复制和转录的区别A-U,T-A,G-CA-T,G-C配对配对mRNA,tRNA,rRNA子代双链子代双链DNA(半保留复制)半保留复制)产物产物RNA
4、聚合酶(聚合酶(RNA-pol)DNA聚合酶聚合酶酶酶NTPdNTP原料原料模板链转录(不对称转录)模板链转录(不对称转录)两股链均复制两股链均复制模板模板转录转录复制复制A-U,T-A,G-CA-T,G-C配对配对mRNA,tRNA,rRNA子代双链子代双链DNA(半保留复制)半保留复制)产物产物RNA聚合酶(聚合酶(RNA-pol)DNA聚合酶聚合酶酶酶NTPdNTP原料原料模板链转录(不对称转录)模板链转录(不对称转录)两股链均复制两股链均复制模板模板转录转录复制复制目录目录原核生物转录的模板和酶原核生物转录的模板和酶Templates&Enzymes in prokaryotic tr
5、anscription第一节第一节目录目录n参与转录的物质:参与转录的物质:原料原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板模板:DNA酶酶 :RNA聚合酶聚合酶(RNApolymerase,RNA-pol)其他蛋白质因子及其他蛋白质因子及MgMg2+2+和和MnMn2+2+等等合成方向合成方向5 3,核苷酸间的连接方式为核苷酸间的连接方式为3,5-磷酸二酯键。磷酸二酯键。目录目录一、原核生物转录的模板一、原核生物转录的模板 DNA分子上转录出分子上转录出RNA的区段,称为的区段,称为结构基因结构基因(structuralgene)。转录的这种选择性称为转录的这种选择性称为不对称转录不对
6、称转录(asymmetrictranscription),它有两方面含义:在,它有两方面含义:在DNA分子分子双链上,一股链用作模板指引转录,另一股链不双链上,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录;其二是模板链并非总是在同一单链上。转录;其二是模板链并非总是在同一单链上。目录目录5GCAGTACATGTC33cgtgatgtacag55GCAGUACAUGUC3NAlaValHisValC编码链编码链模板链模板链mRNA蛋白质蛋白质转录转录翻译翻译 DNA双链中按碱基配对规律能指引转录生成双链中按碱基配对规律能指引转录生成RNA的一股单链,称为的一股单链,称为模板链模板链(templates
7、trand),也称,也称作作有意义链有意义链或或Watson链链。相对的另一股单链是。相对的另一股单链是编编码链码链(codingstrand),也称为,也称为反义链反义链或或Crick链链。目录目录5 5 3 3 3 3 5 5 模板链模板链编码链编码链编码链编码链模板链模板链结构基因结构基因转录方向转录方向转录方向转录方向n不对称转录不对称转录目录目录二、二、RNA聚合酶催化聚合酶催化RNA合成合成(一)(一)RNA聚合酶能从头启动聚合酶能从头启动RNA链的合成链的合成 DNA依赖的依赖的RNA聚合酶催化合成聚合酶催化合成RNA;RNA合成的化学机制与合成的化学机制与DNA依赖的依赖的DN
8、A聚合酶聚合酶催化催化DNA合成相似。合成相似。(NMP)n+NTP(NMP)n+1+PPiRNA延长的延长的RNA目录目录DNA依赖的依赖的RNA聚合酶催化聚合酶催化RNA合成的机制合成的机制目录目录 DNA聚合酶在启动聚合酶在启动DNA链延长时需要引物存在,而链延长时需要引物存在,而RNA聚合酶聚合酶不需要引物不需要引物就能直接启动就能直接启动RNA链的延长。链的延长。RNA聚合酶和双链聚合酶和双链DNA结合时活性最高,但是只以双结合时活性最高,但是只以双链链DNA中的一股中的一股DNA链为模板。链为模板。RNA聚合酶和聚合酶和DNA的特殊序列的特殊序列启动子启动子(promoter)结合
9、后,就能启动结合后,就能启动RNA合成。合成。目录目录(二)(二)RNA聚合酶由多个亚基组成聚合酶由多个亚基组成 36512决定哪些基因被转录决定哪些基因被转录 150618催化功能催化功能 155613结合结合DNA模板模板 70263辨认起始点辨认起始点亚亚 基基分分 子子 量量功功 能能目录目录核心酶核心酶(coreenzyme)全酶全酶(holoenzyme)转录起始阶段转录起始阶段转录延长阶段转录延长阶段目录目录nRNA聚合酶全酶在转录起始区的结合聚合酶全酶在转录起始区的结合目录目录大肠杆菌内有一些不同的大肠杆菌内有一些不同的RNApol全酶,其全酶,其差异是差异是亚基的不同。目前已
10、发现多种亚基的不同。目前已发现多种亚基,亚基,并用其分子量命名区别,最常见的是并用其分子量命名区别,最常见的是70(分子(分子量量70kDa)。)。70是辨认典型转录起始点的蛋白是辨认典型转录起始点的蛋白质,大肠杆菌中的绝大多数启动子可被含有质,大肠杆菌中的绝大多数启动子可被含有70因子的全酶所识别并激活。因子的全酶所识别并激活。但有些基因的启动子,如热激蛋白(但有些基因的启动子,如热激蛋白(heatshockproteins,Hsp)也为另外的)也为另外的亚基(亚基(32)识别。识别。目录目录三、三、RNA聚合酶结合到聚合酶结合到DNA的启动子的启动子上启动转录上启动转录 转录是不连续、分区
11、段进行的。转录是不连续、分区段进行的。每一转录区段可视为一个转录单位,称为每一转录区段可视为一个转录单位,称为操纵操纵子子(operon)。操纵子包括若干个结构基因及其上。操纵子包括若干个结构基因及其上游游(upstream)的调控序列。的调控序列。5 3 3 5 结构基因结构基因调控序列调控序列RNA-pol目录目录调控序列中的启动子是调控序列中的启动子是RNA聚合酶结合模板聚合酶结合模板DNA的部位,也是控制转录的关键部位。原核生物以的部位,也是控制转录的关键部位。原核生物以RNA聚合酶全酶结合到聚合酶全酶结合到DNA的启动子上而起动转的启动子上而起动转录,其中由录,其中由亚基辨认启动子,
12、其他亚基相互配合。亚基辨认启动子,其他亚基相互配合。对启动子的研究,常采用一种巧妙的方法即对启动子的研究,常采用一种巧妙的方法即RNA聚合酶保护法聚合酶保护法。目录目录nRNA聚合聚合酶保护法酶保护法目录目录开始转录开始转录TTGACAAACTGT-35区区(Pribnowbox)TATAATPuATATTAPy-10区区1-30-5010-10-40-205 3 3 5 RNA-pol辨认位点辨认位点(recognitionsite)5 5 RNA聚合酶保护区聚合酶保护区结构基因结构基因3 3 nRNA聚合酶保护法研究转录起始区聚合酶保护法研究转录起始区目录目录目录目录原核生物的转录过程原核
13、生物的转录过程The Process of Transcription in Prokaryote第二节第二节目录目录原核生物的转录过程可分为转录起始、原核生物的转录过程可分为转录起始、转录延长和转录终止三个阶段。转录延长和转录终止三个阶段。目录目录 RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。起始区域。DNA双链解开,使其中的一条链作为转录双链解开,使其中的一条链作为转录的模板。的模板。一、转录起始需要一、转录起始需要RNA聚合酶全酶聚合酶全酶n转录起始需解决两个问题:转录起始需解决两个问题:2.D N A 双 链 打 开,形 成双 链 打 开,形 成 开
14、 放 转 录 复 合 体开 放 转 录 复 合 体(o p e ntranscriptioncomplex);DNA分子接近分子接近-10区域的部分区域的部分双螺旋解开后转录开始。双螺旋解开后转录开始。DNA双链解开的范围只在双链解开的范围只在17bp左右,这比复制中形成的复制叉小得多。左右,这比复制中形成的复制叉小得多。1.RNA聚合酶全酶聚合酶全酶(2)识别并结合启动子,形成识别并结合启动子,形成闭合闭合转录复合体(转录复合体(closedtranscriptioncomple);3.在在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成第一聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成第一个磷酸二酯键:个
15、磷酸二酯键:RNApol(2)-DNA-pppGpN-OH3 转录起始复合物转录起始复合物:5-pppG-OH+NTP5-pppGpN-OH3+ppin转录起始过程:转录起始过程:目录目录nE.coli的转录起始和延长的转录起始和延长目录目录第一个磷酸二酯键生成后,第一个磷酸二酯键生成后,转录复合体的构转录复合体的构象发生改变,象发生改变,亚基即从转录起始复合物上脱亚基即从转录起始复合物上脱落,核心酶连同四磷酸二核苷酸,继续结合落,核心酶连同四磷酸二核苷酸,继续结合于于DNA模板上,酶沿模板上,酶沿DNA链前移,进入延长链前移,进入延长阶段。阶段。目录目录二、二、RNApol核心酶独立延长核心
16、酶独立延长RNA链链1.亚基脱落,亚基脱落,RNApol聚合酶核心酶变构,聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着与模板结合松弛,沿着DNA模板前移;模板前移;2.在在核心酶核心酶作用下,作用下,NTP不断聚合,不断聚合,RNA链链不断延长。不断延长。(NMP)n+NTP(NMP)n+1+PPi目录目录大肠杆菌的转录泡局部结构示意大肠杆菌的转录泡局部结构示意转录空泡转录空泡(transcriptionbubble):RNA-pol(核心酶)(核心酶)DNARNA目录目录转录延长以下特点转录延长以下特点 核心酶负责核心酶负责RNA链延长反应;链延长反应;RNA链从链从5-端向端向3 -端延长,新的
17、核苷酸都是加到端延长,新的核苷酸都是加到3-OH上;上;对对DNA模板链的阅读方向是模板链的阅读方向是3-端向端向5-端,合成的端,合成的RNA链链与之呈反向互补,即酶是沿着模板链的与之呈反向互补,即酶是沿着模板链的3 向向5 方向或沿着方向或沿着编码链的编码链的5 向向3 方向前进的;方向前进的;合成区域存在着动态变化的合成区域存在着动态变化的8 bp 的的RNA-DNA杂合双链;杂合双链;模板模板DNA的双螺旋结构随着核心酶的移动发生解链和再的双螺旋结构随着核心酶的移动发生解链和再复合的动态变化。复合的动态变化。目录目录转录过程中转录过程中DNA的超螺旋结构变化的超螺旋结构变化转录过程中D
18、NA的超螺旋结构变化目录目录三、原核生物转录延长与蛋白质的翻译同三、原核生物转录延长与蛋白质的翻译同时进行时进行5 3 DNA核糖体核糖体RNARNA聚合酶聚合酶在同一在同一DNA模板上,有多个转录同时在进行;模板上,有多个转录同时在进行;转录尚未完成,翻译已在进行。转录尚未完成,翻译已在进行。目录目录目录目录依赖依赖 因子的转录终止因子的转录终止非依赖非依赖 因子的转录终止因子的转录终止四、原核生物转录终止分为依赖四、原核生物转录终止分为依赖 因子与因子与非依赖非依赖 因子两大类因子两大类n依据是否需要蛋白质因子的参与,原核生物依据是否需要蛋白质因子的参与,原核生物转录终止分为:转录终止分为
19、:目录目录 因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量基分子量46kD。因子能结合因子能结合RNA,又以对,又以对polyC的结合力最的结合力最强,但对强,但对polydC/dG组成的组成的DNA的结合能力就的结合能力就低得多。低得多。因子还有因子还有ATP酶活性和解螺旋酶酶活性和解螺旋酶(helicase)的的活性。活性。(一)依赖(一)依赖 因子的转录终止因子的转录终止n 因子:因子:目录目录n 因子的作用原理:因子的作用原理:目录目录目录目录(二)(二)非依赖非依赖 因子的转录终止因子的转录终止DNA模板上靠近终止处,有些特殊的碱基序模板上靠近终
20、止处,有些特殊的碱基序列,转录出列,转录出RNA后,后,RNA产物形成特殊的结构来产物形成特殊的结构来终止转录。终止转录。n茎环结构使转录终止的机制茎环结构使转录终止的机制 使使RNA聚合酶变构,转录停顿;聚合酶变构,转录停顿;局部局部RNA/DNA杂化短链的碱基配对是最不稳定的。杂化短链的碱基配对是最不稳定的。RNA链上的多聚链上的多聚U也是促使也是促使RNA链从模板上脱落的重链从模板上脱落的重要因素。要因素。目录目录目录目录真核生物真核生物RNA的生物合成的生物合成TheBiosynthesisofEukaryoteRNA第三节第三节目录目录真核生物的转录过程比原核复杂。二者的转录真核生物
21、的转录过程比原核复杂。二者的转录起始过程有较大区别,转录终止也不相同。起始过程有较大区别,转录终止也不相同。目录目录一、一、真核生物有三种真核生物有三种DNA依赖的依赖的RNA聚合酶聚合酶n 真核生物具有真核生物具有3种不同的种不同的RNA聚合酶聚合酶:RNA聚合酶聚合酶(RNAPol)RNA聚合酶聚合酶(RNAPol)RNA聚合酶聚合酶(RNAPol)目录目录真核生物的真核生物的RNA聚合酶聚合酶种类种类转录产物转录产物rRNA的前体的前体45SrRNAmRNA前体前体hnRNA,lncRNA,piRNA,miRNAtRNA,5SrRNAsnRNA对鹅膏蕈碱对鹅膏蕈碱的反应的反应耐受耐受敏感
22、敏感高浓度下敏感高浓度下敏感细胞内定位细胞内定位核仁核仁核内核内核内核内目录目录 真核生物真核生物RNA聚合酶的结构比原核生物复杂,所有真核聚合酶的结构比原核生物复杂,所有真核生物的生物的RNA聚合酶都有两个不同的大亚基和十几个小亚聚合酶都有两个不同的大亚基和十几个小亚基基.RNApol在核内转录生成核不均一在核内转录生成核不均一RNA(hnRNA),),然后加工成然后加工成mRNA并输送给胞质的蛋白质合成体系。并输送给胞质的蛋白质合成体系。mRNA是各种是各种RNA中寿命最短、最不稳定的,需经常重中寿命最短、最不稳定的,需经常重新合成。新合成。RNApol还催化合成一些具有重要的基因表还催化
23、合成一些具有重要的基因表达 调 节 作 用 的 非 编 码达 调 节 作 用 的 非 编 码 R N A,如 长 链 非 编 码,如 长 链 非 编 码 R N A(lncRNA)、微)、微RNA(miRNA)和)和piRNA(与(与Piwi蛋蛋白相作用的白相作用的RNA)的合成。)的合成。目录目录RNA聚合酶聚合酶由由12个亚基组成,其最大的亚基称为个亚基组成,其最大的亚基称为RBP1。RNA聚合酶聚合酶最大亚基的羧基末端有一段共有序列最大亚基的羧基末端有一段共有序列(consensussequence)为为Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser的重的重复序列片段,称为羧基末
24、端结构域复序列片段,称为羧基末端结构域(carboxyl-terminaldomain,CTD)。CTD对于维持细胞的活性是必需的。对于维持细胞的活性是必需的。RNApol是真核生物中最活跃、最重要的酶,故本章叙是真核生物中最活跃、最重要的酶,故本章叙述的真核生物的转录主要以述的真核生物的转录主要以RNApol所催化的转录反应所催化的转录反应为例。为例。目录目录二、转录因子在真核生物转录起始中具二、转录因子在真核生物转录起始中具有重要作用有重要作用 真核生物的基因转录过程,同样可以分为真核生物的基因转录过程,同样可以分为3个个阶段:起始阶段:起始阶段(阶段(RNApol和通用转录因子形成转录起
25、始复合体)、和通用转录因子形成转录起始复合体)、延长阶段和转录终止。延长阶段和转录终止。与原核生物的显著不同是,起始和延长过程都需要众多与原核生物的显著不同是,起始和延长过程都需要众多相关的蛋白质因子参与,这些因子被称为相关的蛋白质因子参与,这些因子被称为转录因子转录因子(transcriptionalfactors,TF)或)或反式作用因子反式作用因子(trans-actingfactors)。)。目录目录(一)转录前起始复合体的形成(一)转录前起始复合体的形成不同物种、不同细胞或不同的基因,转录起始不同物种、不同细胞或不同的基因,转录起始点上游都有不同的特异点上游都有不同的特异DNA序列,
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