新编-核酸attach-精品课件.ppt
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1、(一)(一)核酸的分类和组成核酸的分类和组成l核酸分为两大类核酸分为两大类.l脱氧核糖核酸(脱氧核糖核酸(DNADNA)lDeoxyribonucleic AcidDeoxyribonucleic Acidl核糖核酸(核糖核酸(RNARNA)lRibonucleic AcidRibonucleic Acid。lDNADNA分子含有生物物分子含有生物物种的所有遗传信息,种的所有遗传信息,分子量一般都很大。分子量一般都很大。lDNADNA为双链分子,其为双链分子,其中大多数是链状结中大多数是链状结构大分子,也有少构大分子,也有少部分呈环状结构。部分呈环状结构。lRNARNA主要是负责主要是负责DN
2、ADNA遗传信息的翻译和表遗传信息的翻译和表达,分子量要比达,分子量要比DNADNA小得多。小得多。RNARNA为单链为单链分子。分子。l根据根据RNARNA的功能,可以分为的功能,可以分为mRNAmRNA、tRNAtRNA和和rRNArRNA三种。三种。l约占总约占总RNARNA的的5%5%。l不同细胞的不同细胞的mRNAmRNA的链长和分子量差异很的链长和分子量差异很大。大。l它的功能是将它的功能是将DNADNA的遗传信息传递到蛋白的遗传信息传递到蛋白质合成基地质合成基地 核糖核蛋白体。核糖核蛋白体。Messenger RNAl约占总约占总RNARNA的的10-15%10-15%。l它在蛋
3、白质生物合成中起翻译氨基酸信它在蛋白质生物合成中起翻译氨基酸信息,并将相应的氨基酸转运到核糖核蛋息,并将相应的氨基酸转运到核糖核蛋白体的作用。白体的作用。l已知每一个氨基酸至少有一个相应的已知每一个氨基酸至少有一个相应的tRNAtRNA。lRNARNA分子的大小很相似,链长一般在分子的大小很相似,链长一般在73-73-7878个核苷酸之间。个核苷酸之间。lTransfer RNATransfer RNAl约占全部约占全部RNARNA的的80%80%,l是核糖核蛋白体的主要组成部分。是核糖核蛋白体的主要组成部分。lrRNA rRNA 的功能与蛋白质生物合成相关。的功能与蛋白质生物合成相关。Rib
4、osome RNARibosome RNAl核酸(核酸(DNADNA和和RNARNA)是一种线性多聚核苷)是一种线性多聚核苷酸,它的基本结构单元是酸,它的基本结构单元是核苷酸核苷酸。l核苷酸本身由核苷和磷酸组成核苷酸本身由核苷和磷酸组成,l而核苷则由戊糖和碱基形成而核苷则由戊糖和碱基形成lDNADNA与与RNARNA结构相似,但在组成成份上略结构相似,但在组成成份上略有不同。有不同。l一、核酸的一级结构一、核酸的一级结构l多聚核苷酸是由四种不同的核苷酸单元按特定的顺序多聚核苷酸是由四种不同的核苷酸单元按特定的顺序组合而成的线性结构聚合物,因此,它具有一定的核组合而成的线性结构聚合物,因此,它具
5、有一定的核苷酸顺序,即碱基顺序。苷酸顺序,即碱基顺序。l核酸的碱基顺序是核酸的一级结构。核酸的碱基顺序是核酸的一级结构。lDNADNA的碱基顺序本身就是遗传信息存储的分子形式。生的碱基顺序本身就是遗传信息存储的分子形式。生物界物种的多样性即寓于物界物种的多样性即寓于DNADNA分子中四种核苷酸千变万分子中四种核苷酸千变万化的不同排列组合之中。化的不同排列组合之中。l而而mRNA(mRNA(信息信息RNA)RNA)的碱基顺序,则直接为蛋白质的氨基的碱基顺序,则直接为蛋白质的氨基酸编码,并决定蛋白质的氨基酸顺序。酸编码,并决定蛋白质的氨基酸顺序。lRNARNA一级结构研究最多的是一级结构研究最多的
6、是tRNAtRNA、rRNArRNA以及一以及一些小分子的些小分子的RNARNA。其中。其中ltRNAtRNA分子具有以下特点:分子具有以下特点:l分子量分子量2500025000左右,大约由左右,大约由70709090个核苷酸组个核苷酸组成,沉降系数为成,沉降系数为4S4S左右。左右。l分子中含有较多的修饰成分。分子中含有较多的修饰成分。l3-3-末端都具有末端都具有CpCpAOHCpCpAOH的结构。的结构。l真核细胞真核细胞mRNAmRNA的的3-3-末端有一段长达末端有一段长达200200个核个核苷酸左右的聚腺苷酸苷酸左右的聚腺苷酸(polyA)(polyA),称为,称为“尾结尾结构构
7、”,5-5-末端有一个甲基化的鸟苷酸,称末端有一个甲基化的鸟苷酸,称为为”帽结构帽结构“。lRNARNA是单链分子,因此,在是单链分子,因此,在RNARNA分子中,并不遵守碱基分子中,并不遵守碱基种类的数量比例关系,即分子中的嘌呤碱基总数不一种类的数量比例关系,即分子中的嘌呤碱基总数不一定等于嘧啶碱基的总数。定等于嘧啶碱基的总数。lRNARNA分子中,部分区域也能形成双螺旋结构,不能形成分子中,部分区域也能形成双螺旋结构,不能形成双螺旋的部分,则形成突环。这种结构可以形象地称双螺旋的部分,则形成突环。这种结构可以形象地称为为“发夹型发夹型”结构。结构。l在在RNARNA的双螺旋结构中,碱基的配
8、对情况不象的双螺旋结构中,碱基的配对情况不象DNADNA中严中严格。格。G G 除了可以和除了可以和C C 配对外,也可以和配对外,也可以和U U 配对。配对。G-U G-U 配对形成的氢键较弱。不同类型的配对形成的氢键较弱。不同类型的RNA,RNA,其二级结构有其二级结构有明显的差异。明显的差异。ltRNAtRNA中除了常见的碱基外,还存在一些稀有碱基,这中除了常见的碱基外,还存在一些稀有碱基,这类碱基大部分位于突环部分类碱基大部分位于突环部分l1 1,tRNAtRNA的二级结构的二级结构ltRNAtRNA的二级结构都呈的二级结构都呈”三叶草三叶草”形状,形状,在结构上具有某些共同之处,一般
9、可将在结构上具有某些共同之处,一般可将其分为五臂四环:包括氨基酸接受区、其分为五臂四环:包括氨基酸接受区、反密码区、二氢尿嘧啶区、反密码区、二氢尿嘧啶区、T T C C区和可变区和可变区。除了氨基酸接受区外,其余每个区区。除了氨基酸接受区外,其余每个区均含有一个突环和一个臂。均含有一个突环和一个臂。(3)(3)二氢尿嘧啶区二氢尿嘧啶区该区含有二氢尿嘧啶。该区含有二氢尿嘧啶。(4)T(4)T C C区区该区与二氢尿嘧啶区相对,各种该区与二氢尿嘧啶区相对,各种tRNAtRNA在此区均含有在此区均含有T T C C。(5)(5)可变区可变区位于反密码区与位于反密码区与T T C C区之间,不同的区之
10、间,不同的tRNAtRNA该区变化较大。该区变化较大。l在三叶草型二级结构的基础上,突环上在三叶草型二级结构的基础上,突环上未配对的碱基由于整个分子的扭曲而配未配对的碱基由于整个分子的扭曲而配成对,目前已知的成对,目前已知的tRNAtRNA的三级结构均为的三级结构均为倒倒L L型型l19531953年,年,J.WatsonJ.Watson和和F.Crick F.Crick 在前人在前人研究工作的基础上,根据研究工作的基础上,根据DNADNA结晶的结晶的X-X-衍衍射图谱和分子模型,提出了著名的射图谱和分子模型,提出了著名的DNADNA双双螺旋结构模型,并对模型的生物学意义螺旋结构模型,并对模型
11、的生物学意义作出了科学的解释和预测。作出了科学的解释和预测。lDNADNA分子由两条分子由两条DNADNA单链组成。单链组成。lDNADNA的双螺旋结构是分子中两条的双螺旋结构是分子中两条DNADNA单链单链之间基团相互识别和作用的结果。之间基团相互识别和作用的结果。l双螺旋结构是双螺旋结构是DNADNA二级结构的最基本形式。二级结构的最基本形式。l(1 1)DNADNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称简称DNADNA单链单链)组成组成。两条链沿着同一根轴平两条链沿着同一根轴平行盘绕,形成右手双螺旋结构。螺旋中的两条行盘绕,形成右手双螺旋结构。螺旋中的两条链方
12、向相反链方向相反,即其中一条链的方向为,即其中一条链的方向为5353,而另一条链的方向为而另一条链的方向为3535。l(2 2)嘌呤碱和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,磷嘌呤碱和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。碱基环平面与酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。碱基环平面与螺旋轴垂直,螺旋轴垂直,糖基环平面与碱基环平面成糖基环平面与碱基环平面成9090角。角。l(3 3)螺旋横截面的直径约为)螺旋横截面的直径约为2 nm2 nm,每条链相,每条链相邻两个碱基平面之间的距离为邻两个碱基平面之间的距离为3.4 nm3.4 nm,每,每1010个个核苷酸形成一个螺旋,其螺矩(即螺旋旋转一核苷酸形成
13、一个螺旋,其螺矩(即螺旋旋转一圈)高度为圈)高度为34 nm34 nm。l(4 4)两条)两条DNADNA链相互结合以及形成双螺旋的力链相互结合以及形成双螺旋的力是链间的碱基对所形成的氢键。碱基的相互结是链间的碱基对所形成的氢键。碱基的相互结合具有严格的配对规律,即腺嘌呤(合具有严格的配对规律,即腺嘌呤(A A)与胸)与胸腺嘧啶(腺嘧啶(T T)结合,鸟嘌呤()结合,鸟嘌呤(G G)与胞嘧啶()与胞嘧啶(C C)结合,这种配对关系,称为碱基互补。结合,这种配对关系,称为碱基互补。A A和和T T之之间形成两个氢键,间形成两个氢键,G G与与C C之间形成三个氢键。之间形成三个氢键。l在在DNA
14、DNA分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。总数相等。lDNADNA双螺旋结构在生理条件下是很稳定的。双螺旋结构在生理条件下是很稳定的。l维持这种稳定性的因素包括:两条维持这种稳定性的因素包括:两条DNADNA链之间链之间形成的氢键;形成的氢键;l由于双螺旋结构内部形成的疏水区,消除了介由于双螺旋结构内部形成的疏水区,消除了介质中水分子对碱基之间氢键的影响;介质中的质中水分子对碱基之间氢键的影响;介质中的阳离子(如阳离子(如NaNa+、K K+和和MgMg2+2+)中和了磷酸基团的)中和了磷酸基团的负电荷,降低了负电荷,降低了DNADNA链之间的排斥力、
15、范德华链之间的排斥力、范德华引力等。引力等。l改变介质条件和环境温度,将影响双螺旋的稳改变介质条件和环境温度,将影响双螺旋的稳定性。定性。lDNADNA的三螺旋结构与双螺旋结构相似,都是通的三螺旋结构与双螺旋结构相似,都是通过过DNADNA单链之间形成氢键实现的。单链之间形成氢键实现的。l一、含氮碱基的性质一、含氮碱基的性质l嘌呤碱基和嘧啶碱基是核酸中最重要的组分。嘌呤碱基和嘧啶碱基是核酸中最重要的组分。它们的性质对于核酸的性质和生物功能具有重它们的性质对于核酸的性质和生物功能具有重要影响作用。要影响作用。l含氮碱基具有芳香环的结构特点。由于环上极含氮碱基具有芳香环的结构特点。由于环上极性基团
16、(如羰基、氨基等)的存在,碱基能够性基团(如羰基、氨基等)的存在,碱基能够发生酮式发生酮式烯醇式或氨式烯醇式或氨式亚氨式的互变异构。亚氨式的互变异构。因此,碱基既有芳香环的特性,也具有氨、酮因此,碱基既有芳香环的特性,也具有氨、酮和烯醇等相应的化学性质。和烯醇等相应的化学性质。l嘌呤碱基和嘧啶碱基都具有弱碱性。嘌呤碱基和嘧啶碱基都具有弱碱性。l环内氨基的环内氨基的p pK Ka a值约为值约为9.59.5。l碱基环外的氨基(存在于碱基环外的氨基(存在于A A、G G和和C C)的碱性很)的碱性很弱,在生理弱,在生理pHpH条件下不能被质子化。这种情况条件下不能被质子化。这种情况与苯胺分子中的氨
17、基相似。与苯胺分子中的氨基相似。l因此嘌呤和嘧啶碱基的碱性主要是环内氨基的因此嘌呤和嘧啶碱基的碱性主要是环内氨基的贡献。贡献。l由于含氮碱基中的嘌呤环和嘧啶环具有芳香环由于含氮碱基中的嘌呤环和嘧啶环具有芳香环的结构特点,因而可以发生环上的亲电取代反的结构特点,因而可以发生环上的亲电取代反应。应。l环上的氮原子在亲电取代反应中具有定位基的环上的氮原子在亲电取代反应中具有定位基的功能。嘧啶环中反应活性最高的是功能。嘧啶环中反应活性最高的是C C5 5,嘌呤环,嘌呤环中反应活性最高的是中反应活性最高的是C C8 8。(2 2)尿嘧啶核苷的氯代)尿嘧啶核苷的氯代NRNHOOCl Cl尿嘧啶核苷NRNH
18、OOClH+NRNHOOClHNRNHOOCl5-氯尿嘧啶核苷NNRNNNH2Br BrNNBrRNNNH2CH3ONaNH2NH2NaN38-甲基腺苷8-肼基腺苷8-叠氮腺苷腺苷8-溴代腺苷l(1 1)水解反应)水解反应l含有羰基的碱基(含有羰基的碱基(G G、C C、T T和和U U),具有酰胺键),具有酰胺键的结构特点,因此在碱性条件下,能够发生水的结构特点,因此在碱性条件下,能够发生水解开环反应。解开环反应。l腺嘌呤碱基不含羰基,对碱比较稳定。腺嘌呤碱基不含羰基,对碱比较稳定。HNNOOROH-NORNH2COO-l嘧啶碱基能够与肼作用,得到碱基环分解的产物。嘧啶碱基能够与肼作用,得到
19、碱基环分解的产物。l此反应只发生在嘧啶碱基,而嘌呤碱基不发生这类反此反应只发生在嘧啶碱基,而嘌呤碱基不发生这类反应,因此在核酸分析中有重要应用价值。应,因此在核酸分析中有重要应用价值。HNNOORNH2NH2HNNOORNHNH2HNNORNHNHONHNHOHNNHOR+H2Ol在一定条件下,碱基环上的氮原子可以发生烷基化反在一定条件下,碱基环上的氮原子可以发生烷基化反应。应。l在同样条件下,在同样条件下,U U和和T T基本上不起反应。应用基本上不起反应。应用CHCH2 2N N2 2作为作为烷基化剂,则所有碱基都能发生上述反应。烷基化剂,则所有碱基都能发生上述反应。HNN+H2NOCH3
20、NNRNNRN+NNH2CH3NN+NH2CH3NNRNNNH2N+NRCH3N+NRCH3HNNH2NON+NNH2ORCH3l环外氨基在适当条件下,也可以发生化学反应。环外氨基在适当条件下,也可以发生化学反应。l胞嘧啶核苷在亚硝酸作用下,可以形成重氮盐,再转胞嘧啶核苷在亚硝酸作用下,可以形成重氮盐,再转变为尿嘧啶核苷。因此生物体内亚硝酸的存在有可能变为尿嘧啶核苷。因此生物体内亚硝酸的存在有可能改变改变DNADNA的碱基组成。的碱基组成。l腺嘌呤核苷和鸟嘌呤核苷也能发生类似的反应,分别腺嘌呤核苷和鸟嘌呤核苷也能发生类似的反应,分别形成次黄嘌呤核苷(形成次黄嘌呤核苷(I I)和黄嘌呤核苷()和
21、黄嘌呤核苷(X X)。)。l这种变化,将影响或改变碱基形成氢键的能力和方向,这种变化,将影响或改变碱基形成氢键的能力和方向,导致导致DNADNA复制错误,是引起基因突变的重要原因之一。复制错误,是引起基因突变的重要原因之一。NNNH2ORHONONNN2+ORH2ONNOHORHNNOROl胸腺嘧啶碱基在紫外光照射下,可以发生二聚加成反胸腺嘧啶碱基在紫外光照射下,可以发生二聚加成反应:应:l l在在DNADNA分子中,如果两个胸腺嘧啶碱基相邻,在紫外光分子中,如果两个胸腺嘧啶碱基相邻,在紫外光照射下,可能发生上述聚合反应,其结果是破坏了正照射下,可能发生上述聚合反应,其结果是破坏了正常复制或转
22、录。常复制或转录。NCH3HNOORNHNOORCH3NHNOORCH3NCH3HNOOROHNHNORCH3OHUVROOHNCH3NH2Ol由于含氧碱基存在酮式和烯醇式的互变由于含氧碱基存在酮式和烯醇式的互变异构,烯醇式中的羟基可以被烷基化转异构,烯醇式中的羟基可以被烷基化转变为稳定的烯醇醚。变为稳定的烯醇醚。l鸟嘌呤核苷烷基化形成鸟嘌呤核苷烷基化形成6-6-甲氧基鸟嘌呤甲氧基鸟嘌呤核苷后,不再与核苷后,不再与C C配对,而与配对,而与T T配对。配对。l这种情况将引起这种情况将引起DNADNA的复制、转录及信息的复制、转录及信息表达出现错误。表达出现错误。l1 1核酸的两性性质及等电点核
23、酸的两性性质及等电点l与蛋白质相似,核酸分子中既含有酸性基团(磷酸基)与蛋白质相似,核酸分子中既含有酸性基团(磷酸基)也含有碱性基团(氨基),因而核酸也具有两性性质。也含有碱性基团(氨基),因而核酸也具有两性性质。l由于核酸分子中的磷酸是一个中等强度的酸,而碱性由于核酸分子中的磷酸是一个中等强度的酸,而碱性(氨基)是一个弱碱,所以核酸的等电点比较低。如(氨基)是一个弱碱,所以核酸的等电点比较低。如DNADNA的等电点为的等电点为4 44.54.5,RNARNA的等电点为的等电点为2 22.52.5。lRNARNA的等电点比的等电点比DNADNA低的原因,是低的原因,是RNARNA分子中核糖基分
24、子中核糖基2-2-OHOH通过氢键促进了磷酸基上质子的解离。通过氢键促进了磷酸基上质子的解离。DNADNA没有这种没有这种作用。作用。l(1 1)酸或碱水解)酸或碱水解 l核酸分子中的磷酸二酯键可在酸或碱性条件下水解切核酸分子中的磷酸二酯键可在酸或碱性条件下水解切断。断。lDNADNA和和RNARNA对酸或碱的耐受程度有很大差别。例如,在对酸或碱的耐受程度有很大差别。例如,在0.1 mol/L NaOH0.1 mol/L NaOH溶液中,溶液中,RNARNA几乎可以完全水解,生成几乎可以完全水解,生成2-2-或或3-3-磷酸核苷;磷酸核苷;DNADNA在同样条件下则不受影响。在同样条件下则不受
25、影响。这种水解性能上的差别,与这种水解性能上的差别,与RNARNA核糖基上核糖基上2-OH2-OH的邻基的邻基参与作用有很大的关系。在参与作用有很大的关系。在RNARNA水解时,水解时,2-OH2-OH首先进首先进攻磷酸基,在断开磷酯键的同时形成环状磷酸二酯,攻磷酸基,在断开磷酯键的同时形成环状磷酸二酯,再在碱的作用形成水解产物。再在碱的作用形成水解产物。l生物体内存在多种核酸水解酶。这些酶可以催化水解生物体内存在多种核酸水解酶。这些酶可以催化水解多聚核苷酸链中的磷酸二酯键。多聚核苷酸链中的磷酸二酯键。l以以DNADNA为底物的为底物的DNADNA水解酶(水解酶(DNasesDNases)和以
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