第09章酶促反应动力学课件.ppt
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- 09 章酶促 反应 动力学 课件
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1、第九章第九章 酶促反应动力学酶促反应动力学一、化学动力学基础一、化学动力学基础二、底物浓度对酶反应速率的影响二、底物浓度对酶反应速率的影响三、酶的抑制作用三、酶的抑制作用四、温度对酶反应速度的影响四、温度对酶反应速度的影响五、五、pHpH对酶反应的影响对酶反应的影响六、激活剂对酶反应的影响六、激活剂对酶反应的影响楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国一、化学动力学基础一、化学动力学基础化学反应的两个基本问题化学反应的两个基本问题:(:(1 1)反应进行的方向、可)反应进行的方向、可能性和限度;(能性和限度;(2 2)反应进行的速率和反应机制。)反应进行的速率和反
2、应机制。(一)反应速率及其测定(一)反应速率及其测定反应速率是以单位时间内反应物或生成物浓度的改变来反应速率是以单位时间内反应物或生成物浓度的改变来表示。用瞬时速率表示反应速率:表示。用瞬时速率表示反应速率:v=dc/dt反应速率的测定实际上就是测定不同时间的反应物或生反应速率的测定实际上就是测定不同时间的反应物或生成物的浓度。成物的浓度。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(二)反应分子数和反应级数(二)反应分子数和反应级数1.1.反应分子数:反应分子数:在反应中真正相互作用的分子的数目。在反应中真正相互作用的分子的数目。单分子反应,双分子反应,单分子反应,
3、双分子反应,判断一个反应是单分子反应还是双分子反应,应先了解判断一个反应是单分子反应还是双分子反应,应先了解反应机制,即反应过程中各个单元反应是如何进行的。反应机制,即反应过程中各个单元反应是如何进行的。2.2.反应级数:反应级数:根据实验结果,整个化学反应的速率服根据实验结果,整个化学反应的速率服从哪种分子反应速率方程式,则这个反应即为几级反应。从哪种分子反应速率方程式,则这个反应即为几级反应。一级反应,二级反应,一级反应,二级反应,零级反应。,零级反应。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(三)各级反应的特征(三)各级反应的特征1.1.一级反应一级反应凡是
4、反应速率只与反应物的浓度的一次方成正比的,这凡是反应速率只与反应物的浓度的一次方成正比的,这种反应就称为一级反应。种反应就称为一级反应。速率常数与半衰期成反比,半衰期与反应物的初浓度无速率常数与半衰期成反比,半衰期与反应物的初浓度无关。关。2.2.二级反应二级反应凡是反应速率与反应物浓度二次方(或两种物质浓度的凡是反应速率与反应物浓度二次方(或两种物质浓度的乘积)成正比的,这种反应就称为二级反应。乘积)成正比的,这种反应就称为二级反应。半衰期与初浓度成反比。半衰期与初浓度成反比。3.3.零级反应零级反应凡是反应速率与反应物浓度无关而受它种因素影响而改凡是反应速率与反应物浓度无关而受它种因素影响
5、而改变的反应。变的反应。半衰期与初始浓度成正比。半衰期与初始浓度成正比。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国二、底物浓度对酶反应速率的影响二、底物浓度对酶反应速率的影响(一)中间络合物学说(一)中间络合物学说02468101214161820020406080100C oncentration of S ubstrate(um ol/L)Rate of Reaction(v)19031903年,年,HenriHenri用蔗糖用蔗糖酶水解蔗糖的实验酶水解蔗糖的实验在低底物浓度时在低底物浓度时,反应速度与反应速度与底物浓度成正比,表现为一级底物浓度成正比,表现为一
6、级反应特征。反应特征。当底物浓度达到一定值,反应当底物浓度达到一定值,反应速度达到最大值(速度达到最大值(V Vmaxmax),此),此时再增加底物浓度,反应速度时再增加底物浓度,反应速度不再增加,表现为零级反应。不再增加,表现为零级反应。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国酶与底物的中间络合物学说(酶与底物的中间络合物学说(HenriHenri和和WurtzWurtz)S+E ES P+E中间产物假说证据:中间产物假说证据:(1)ES复合物已被电子显微镜和X射线晶体结构分析直接观察到。(2)酶和底物的光谱特性在形成ES后发生变化。(3)酶的物理性质经常在形成
7、ES后发生变化。(4)已分离得到ES复合物。(5)平衡透析时,底物浓度在半透膜内外不等。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(二)酶促反应的动力学方程式(二)酶促反应的动力学方程式1.1.米氏方程式的推导米氏方程式的推导推导原则推导原则:从酶被底物饱和的现象出发,按照从酶被底物饱和的现象出发,按照 “稳态平衡稳态平衡”假说的设想进行推导。假说的设想进行推导。1kSE 2kES3kEP SKSVvmmax132kkkKm米氏方程米氏方程:米氏常数米氏常数:132kkkESSESSEt令令:Kmkkk132将将(4)代入代入(3),则,则:SKSVvmmax1kE
8、S 2kES3kEP ESEt SESES生成速度生成速度:SESEkvt11,ES分解速度分解速度:ESkESkv322即即:ESkESkSESEkt321则则:SSESESKmtE(1)经整理得经整理得:SKSEmtES由于酶促反应速度由由于酶促反应速度由ES决定,即决定,即ESkv22kvES,所以所以(2)将将(2)代入代入(1)得得:SKSEkvmt2 SKSEkmt2v(3)当酶反应体系处于当酶反应体系处于恒态恒态时时:21vv 当当Et=ES时时,mVv tmEkV2(4)所以所以 当S Km时maxmaxSKKSVSKSVVmm当SKm时当S=Km时2maxmaxVSKSVVm
9、maxmaxmaxVSSVSKSVVm楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国2.2.动力学参数的意义动力学参数的意义(1 1)米氏常数的意义)米氏常数的意义a a.不同的酶具有不同不同的酶具有不同K Km m值,它是酶的一个重要的特征物值,它是酶的一个重要的特征物理常数理常数,只与酶的性质有关,而与其浓度无关。只与酶的性质有关,而与其浓度无关。b b.K.Km m值只是在固定的底物,一定的温度和值只是在固定的底物,一定的温度和pHpH条件下,一条件下,一定的缓冲体系中测定的,不同条件下具有不同的定的缓冲体系中测定的,不同条件下具有不同的K Km m值。值。c c
10、.K.Km m值表示酶与底物之间的亲和程度:值表示酶与底物之间的亲和程度:K Km m值大表示亲和值大表示亲和程度小,酶的催化活性低程度小,酶的催化活性低;K Km m值小表示亲和程度大值小表示亲和程度大,酶的催化活性高。酶的催化活性高。(同一种酶有几种底物就有几个(同一种酶有几种底物就有几个K Km m值,其中值,其中K Km m值最小的值最小的底物一般称为该酶的最适底物或天然底物)底物一般称为该酶的最适底物或天然底物)一般情况下,一般情况下,1/K1/Km m可以近似地表示酶对底物的亲和可以近似地表示酶对底物的亲和力大小,力大小,1/K1/Km m愈大,表明亲和力愈大。愈大,表明亲和力愈大
11、。所以所以1/K1/Km m表示形成表示形成ESES的趋势大小的趋势大小特例:特例:K Km m=K=K2 2/K/K1 1=K=Ks s(在在K K3 3K K1 1,K K2 2时时)d d.K.Km m与与K Ks s K Km m不等于不等于K Ks s。在。在K K3 3K1K1、K K2 2时,时,K Km m看作看作K Ks s,也只,也只有此时有此时1/1/K Km m 才可以近似表示酶与底物结合的难易程度。才可以近似表示酶与底物结合的难易程度。e.e.K Km m与与K Km m 无抑制剂时,无抑制剂时,ESES的分解速度与形成速度的比值的分解速度与形成速度的比值符合米氏方程
12、,为符合米氏方程,为K Km m;而有抑制剂时发生变化,则不符合而有抑制剂时发生变化,则不符合米氏方程,为米氏方程,为K Km m 。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国f f.K.Km m和米氏方程和米氏方程的实际应用的实际应用 若已知某个酶的若已知某个酶的K Km m值,可以计算在某一个底物浓度值,可以计算在某一个底物浓度时,反应速度相当于最大反应速度的百分率。时,反应速度相当于最大反应速度的百分率。g g.K.Km m可以帮助推断某一反应的方向和途径可以帮助推断某一反应的方向和途径楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(2
13、 2)V Vmaxmax和和k k3 3(k(kcatcat)的意义的意义在一定的酶浓度下,在一定的酶浓度下,V Vmaxmax是一个常数,它只与底物的种是一个常数,它只与底物的种类及反应条件有关。类及反应条件有关。当当SS很大时,很大时,V Vmaxmax=K=K3 3 E EK K3 3代表酶被底物饱和时每秒钟每个酶分子转换底物的分代表酶被底物饱和时每秒钟每个酶分子转换底物的分子数,称为转换数(或催化常数,子数,称为转换数(或催化常数,K Kcatcat),),表明酶的最表明酶的最大催化效率。大催化效率。转换数的倒数即为催化周期:一个酶分子每催化一个底转换数的倒数即为催化周期:一个酶分子每
14、催化一个底物分子所需的时间。物分子所需的时间。乳糖脱氢酶转换数为1000/秒,则它的催化周期为10-3秒楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(3 3)K Kcatcat/K/Km m 的意义的意义在生理条件下,在生理条件下,S/Km=0.011.0 maxSKmSEKcatSKmSVvSKm 时:SEKmKcatv 13213kkkkkKKmcatK Kcatcat/K/Km m的上限是的上限是K K1 1,即生成,即生成ESES复合物的速度复合物的速度(酶促反应的速度酶促反应的速度不会超过不会超过ESES的形成速度的形成速度K K1 1,在水相中不会超过,在
15、水相中不会超过10108 810109 9)楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国只有只有K Kcatcat/K/Km m可以客观地比较不同的酶或同一种酶催化可以客观地比较不同的酶或同一种酶催化不同底物的催化效率不同底物的催化效率楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国3.3.利用作图法测定利用作图法测定K Km m和和V Vmaxmax值值(1 1)LineweaverLineweaver-Burk -Burk 双倒数作图法双倒数作图法米氏方程的双倒数形式:米氏方程的双倒数形式:基本原则基本原则:将米氏方程变化成相当于将米氏方程变
16、化成相当于y=ax+by=ax+b的直线方的直线方程,再用作图法求出程,再用作图法求出K Km m。1 K Km m 1 1 =.+v Vmax S Vmax 楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(2 2)Eadie-HofsteeEadie-Hofstee 作图法作图法vv/S/S作图法作图法v=Vmax Km vSSvSvVmax-Km楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(3 3)Hanes-WoolfHanes-Woolf 作图法作图法SSSSvVmaxVmaxKm 1 K Km m 1 1 =.+v Vmax S Vm
17、ax 在在两边均乘以两边均乘以SS:以以 SS作图作图Sv-KmSvSSVmax1 1楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(4 4)EisenthalEisenthal 作图法作图法楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(5 5)Hill Hill 作图法作图法mLogKSLognVVVLogmax(寡聚酶)mLogKSLognYYLog1-LogKmLogS)(VVVLogYYLogmax1楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(三)多底物的酶促反应(三)多底物的酶促反应1.1.多底物酶促反应按
18、动力学机制分类多底物酶促反应按动力学机制分类有序反应有序反应只有Leading substrate(领先底物A)首先与酶结合,然后B才能与酶结合,形成的三元复合物EAB(ternary complex)转变为EPQ,B 的产物P先释放,A的产物Q后释放。在缺少A时,B不能与E结合E+A+BE+A+BAEBPEQE+P+QAEBPEQE+P+Q(1 1)序列反应)序列反应楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国E AE AEB QEP QE EABPQPEAAEAEBQEPBQEQA A与其产物与其产物Q Q相互竞争地结合相互竞争地结合E E,但,但A A和和B B
19、互不竟争互不竟争反应的总方向决定于A、Q的浓度和反应的平衡常数楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国NAD 与NADH相互竞争E上的NAD结合部位楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国随机反应随机反应底物A、B与酶结合的顺序是随机的,形成的三元复合物AEB QEP,产物P、Q的释放顺序也是随机的。限速步骤是限速步骤是AEB QEPAEB QEPA A与与Q Q相互竞争相互竞争E E上的底物结合部位上的底物结合部位A A,B B 与与P P相互竞争相互竞争E E上的上的底物结合部位底物结合部位B B反应的总方向决定于反应的总方向决定
20、于A A、B B、Q Q、P P的浓度和反应的平衡常数的浓度和反应的平衡常数楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(2 2)乒乓反应)乒乓反应底物A先与E结合成AE二元复合物,AE PF(修饰酶形式),释放第一个产物P,接着底物B与F形成FB,FB EQ,释放第二个产物Q。A与Q 竞争自由酶形式E,B与P竞争修饰酶形式F。整个反应历程中只有二元复合物形式,没有三元复合物形式。楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国2.2.双底物反应的动力学方程双底物反应的动力学方程(1 1)乒乓机制的动力学方程)乒乓机制的动力学方程 maxBAAK
21、BKBAVVBmAmmaxmaxmax1111VBVKAVKVBmAmK Km mA A:BB达到饱和浓度时达到饱和浓度时A A的米氏常数的米氏常数K Km mA A:A A的表观米氏常数的表观米氏常数V Vmaxmax:ABAB都达到饱和浓度时的最大反应速度都达到饱和浓度时的最大反应速度楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国乒乓机制的动力学曲线是两组平行直线表观米氏常数KmA(KmB)随B(A)浓度的增大而增大表观最大反应速度Vmax随B(A)的增大而增大楚雄师范学院化学与生命科学系楚雄师范学院化学与生命科学系 范树国范树国(2 2)序列机制的底物动力学方程)
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