科研信息化实践与思考课件.ppt
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- 科研 信息化 实践 思考 课件
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1、科研信息化实践与思考科研信息化实践与思考报告提纲报告提纲n科研信息化科研信息化态势态势n科学大数据科学大数据n科研信息化案例科研信息化案例科研信息化:从2013年诺贝尔化学奖说起20132013年诺贝尔化学年诺贝尔化学奖奖把化学反应“搬进”计算机为为复杂复杂化学系统化学系统创立了多尺度模型创立了多尺度模型对于今天的化学家来说,计算机和试管已经变得同样重要。经过理论化学家不断创新,计算机已经能够逼真地模拟出复杂的化学分子模型,进而预测出化学实验的最终结果。大数据时代下的科研信息化催生重大科技突破施一公施一公:n“2121世纪将是生物学的世纪世纪将是生物学的世纪”这一预言已经在逐步变成现实,生命科
2、学已经这一预言已经在逐步变成现实,生命科学已经发展成为发展成为2121世纪最活跃的学科之一。在美国世纪最活跃的学科之一。在美国科学科学周刊近几年评选的全世周刊近几年评选的全世界十大科技进展中,一半以上的成果都来自生命科学领域。界十大科技进展中,一半以上的成果都来自生命科学领域。n当今,当今,计算机科学及信息技术、生命科学及生物技术成为现代高科技的两大计算机科学及信息技术、生命科学及生物技术成为现代高科技的两大支柱。支柱。清华大学施一公教授荣获清华大学施一公教授荣获20142014年爱明诺夫奖。该奖项是由瑞年爱明诺夫奖。该奖项是由瑞典皇家学院设立的国际奖项,用以奖励世界范围内在晶体学典皇家学院设
3、立的国际奖项,用以奖励世界范围内在晶体学领域做出重大贡献的科学家。自领域做出重大贡献的科学家。自19791979年设立以来,有来自年设立以来,有来自1313个国家的个国家的4646名科学家荣膺该奖项。名科学家荣膺该奖项。20142014年恰逢晶体学一百周年,被命名为国际晶体学年。施一年恰逢晶体学一百周年,被命名为国际晶体学年。施一公教授是首位获得该奖的中国科学家,奖励他过去公教授是首位获得该奖的中国科学家,奖励他过去1515年运用年运用X-X-射线晶体学在细胞凋亡研究领域做出的杰出贡献。射线晶体学在细胞凋亡研究领域做出的杰出贡献。上海光上海光源源17U17U线站功不可没。线站功不可没。科研信息
4、化是科研模式的重大变革经验归纳经验归纳实验观察实验观察理论分析理论分析计算模拟计算模拟科研信息化科研信息化信息通讯技术信息通讯技术农业社会工业社会信息社会科研信息化 英国科学技术办公室主任英国科学技术办公室主任John Taylor首次提出首次提出E-Science 在在E-Science和和Cyberinfrastructure基础上,我国科研工作者提基础上,我国科研工作者提出了出了“科研信息化科研信息化”的概念的概念,即即“科学研究的信息化科学研究的信息化”:美国国家科学基金(美国国家科学基金(NSF)和能源部在)和能源部在计算基础设施(计算基础设施(Cyberinfrastructure
5、)的名义下实)的名义下实施施E-Science项目项目科研信息化的战略意义 美国国家基金会利用信息化基础设施变革科学与工程研究指出:“由于计算、信息通信技术不断进步的推动和今天科学与工程问题不断增长的复杂性、范围和规模挑战的需求牵引,一个科学与工程研究的新时代已经出现”“现在存在着基于信息化基础设施建立新型研究环境的巨大机遇,但是也存在着由于未能迅速行动和给予足够投资而产生的巨大风险和代价。”“抓住这个百年不遇的机会,通过协调发展和广泛应用信息化基础设施来领导这场科学与工程的革命。”科研信息化发展态势科研信息化成为发达国家保持国家竞争力的关键手段科研信息化基础设施发展加速,发达国家不断投入巨资
6、以保持领先地位当前科技创新呈现交叉、开放、协作的新特点,科学研究的复杂性、多学科、国际协作特征显著,越来越离不开科研信息化服务环境的融合性发展信息技术在科研中得到越来越及时和广泛的应用,科研信息化手段本身的发展进入了云计算、大数据为特征的阶段2011年4月,NSF发布面向21世纪科学与工程的网络基础设施框架(简称CIF21),其实质是美国版的“十二五”国家科研信息化发展规划。CIF21是NSF2012年的首要任务,预算1.17亿美元,关注四大领域:数据驱动型科学新型计算基础设施网络基础设施访问与连接社区研究网络面向21世纪科学与工程的网络基础设施框架及其战略规划1.科研信息化成为发达国家保持国
7、家竞争力的关键手段-1欧盟在科技发展计划第五、第六和第七框架的持续支持下,科研信息化基础设施得到不断发展,逐步形成了明晰的e-Infrastructure架构。第七框架计划的延续,实施时间从2014年至2020年,首次将欧盟的所有科研和创新资金汇集于一个灵活的框架中。Horizon2020科研和创新计划1.科研信息化成为发达国家提升国家竞争力的关键手段-2开发面向2020及以后的欧洲科研基础设施:开发新的世界级科研基础设施整合和开放现有的具有泛欧意义的国家科研基础设施信息化基础设施的开发、部署和运行开发服务于科研的ICT:促进创新想法的FET开放式计划;培育新兴主题的FET前瞻性计划;解决跨学
8、科科技挑战的FET旗舰计划;国家科研基础设施的集成和访问,以及信息化基础设施的开发、部署和运行。2012年年4月底,引领欧月底,引领欧洲数字议程发展的机构洲数字议程发展的机构欧盟信息社会和媒体欧盟信息社会和媒体总司(总司(DG INFSO)宣)宣布将进行机构改革,机布将进行机构改革,机构的名称和组织结构都构的名称和组织结构都将有所变化将有所变化,名称将更名称将更改为改为“通信网络、内容通信网络、内容与技术总司与技术总司”。2.科研信息化基础设施发展加速,发达国家不断投入巨资以保持领先地位高速科研网络能源科学网(ESnet),在美国能源部科学办公室支持下:2011-2012年已将带宽升级至160
9、-400Gbps。高速科研网络向着更高的带宽、高可靠性与个性化的服务方向发展目目 标:标:建设下一代科研网络建设下一代科研网络ESNET4ESNET4高速高速IPIP网网+科研数据网科研数据网SDNSDN(大数(大数据传输)据传输)与国际科研网络广泛高速互联与国际科研网络广泛高速互联试验部署试验部署100Gbps100Gbps,为科学装置与,为科学装置与超算之间超算之间T T比特速率连接比特速率连接2.科研信息化基础设施发展加速,发达国家不断投入巨资以保持领先地位-2 欧洲先进计算合作伙伴(欧洲先进计算合作伙伴(PRACEPRACE)计划部署一个)计划部署一个泛欧泛欧petapeta-scal
10、e-scale生态系统,并计划到生态系统,并计划到20202020年时达年时达到到exaexa-scale-scale的运算性能。的运算性能。20152015年年7 7月月1313日最新发布的日最新发布的Top500Top500超级计算机,超级计算机,中国中国“天河二号天河二号”排名第一,连续第五次获得冠排名第一,连续第五次获得冠军。军。美国进入美国进入TOP500TOP500强的超级计算机强的超级计算机233233台,整体优台,整体优势依然明显,中国势依然明显,中国2727台,日本台,日本3939台。台。高性能计算的峰值计算能力突飞猛进,即将进入百亿亿次计算时代3.当前科技创新呈现交叉、开放
11、、协作的新特点,科学研究的复杂性、多学科、国际协作特征显著,越来越离不开科研信息化的融合性发展LHC(LHC(大型强子对撞机大型强子对撞机)计算网格计算网格(Worldwide LHC Worldwide LHC Computing Grid,Computing Grid,WLCG)WLCG)已连接起已连接起3636个个国家的国家的170170多个计算多个计算中心,可为全球中心,可为全球80008000多位物理学家提供对多位物理学家提供对每年产生的每年产生的25 PB25 PB的的LHCLHC实验数据的实时实验数据的实时访问及相应的数据处访问及相应的数据处理能力理能力。Large Hadron
12、 Collider at CERN4.信息技术在科研中得到越来越广泛的应用,科研信息化技术应用已进入了以云计算和大数据为特征的新阶段2011年8月,欧盟提出欧洲科学云计算基础设施战略规划,提出了2020年欧洲科学云基础设施的发展愿景。欧洲科学云计算基础设施战略规划欧洲科学云计算基础设施战略规划2014年5月,美国白宫发布“大数据:抓住机遇、保存价值”白皮书,通过90天的调查,检验大数据将如何改变我们生活和工作的方式。大数据研究与开发计划大数据研究与开发计划案例:华为公司内部云:桌面云、研发云、培训云,案例:华为公司内部云:桌面云、研发云、培训云,从从2009年开始,华为上海研究所部署全球最大的
13、年开始,华为上海研究所部署全球最大的“万人云万人云”,10000用户规模的桌面云用于员工的日常办公用户规模的桌面云用于员工的日常办公,在工作效率、绿色节能、维护管理等方面带来很大改善。华为称,相比传统,在工作效率、绿色节能、维护管理等方面带来很大改善。华为称,相比传统PC办公系统,节省了办公系统,节省了40%的投的投资,降低电力消耗资,降低电力消耗71%,设备的,设备的CPU利用率从利用率从5%提高到了提高到了60%,部署周期从原来的,部署周期从原来的3个月缩短到不到个月缩短到不到1周周,据悉,据悉,“万人云万人云”二期规模将达到二期规模将达到6万人。万人。科研信息化发展新动向1.开放科学:科
14、研方式的转变开放科学:科研方式的转变2.移动应用正在改变科研和教育移动应用正在改变科研和教育3.大数据应用更加广泛大数据应用更加广泛4.百亿亿次计算研发成为新一轮竞争点百亿亿次计算研发成为新一轮竞争点5.高速网络为全球科研提供强大支持高速网络为全球科研提供强大支持6.新型知识库改变知识获取方式新型知识库改变知识获取方式*1.开放科学:科研方式的转变开放科学:科研方式的转变OpenAIRE:科研用开放获取基础设施:科研用开放获取基础设施现已拥有来自现已拥有来自600多位数据提供者的多位数据提供者的1150万可供开放获取的文档;万可供开放获取的文档;2013年,获年,获FP7最成功信息化基础设施案
15、最成功信息化基础设施案例比赛一等奖例比赛一等奖欧洲开放科学共享空间:促进科研资源共享欧洲开放科学共享空间:促进科研资源共享的新方法的新方法四大核心:四大核心:数据数据信息化基础设施信息化基础设施科学工具科学工具知识为四大核心知识为四大核心公众科学:众包研究公众科学:众包研究Galaxy Zoo项目:项目:用户能帮忙对星系进行分用户能帮忙对星系进行分类(类(http:/www.galaxyzoo.org/)Fold It项目:项目:公众通过玩在线游戏助力蛋白公众通过玩在线游戏助力蛋白质 结 构 研 究 及 未 来 的 药 物 开 发(质 结 构 研 究 及 未 来 的 药 物 开 发(https
16、:/fold.it/portal/)Old Weather项目:项目:邀请公众帮助转录来自古邀请公众帮助转录来自古代 航 海 日 志 的 天 气 记 录,以 重 建 气 候(代 航 海 日 志 的 天 气 记 录,以 重 建 气 候(http:/www.oldweather.org/)17*2.移动应用正在改变科研和教育移动应用正在改变科研和教育移动互联网每年创造移动互联网每年创造7000亿美元的收入,创造约亿美元的收入,创造约300万个就业机会。截至万个就业机会。截至2017年,移动互联年,移动互联网收入将增至网收入将增至15500亿美元,年均增长率为亿美元,年均增长率为23%。波士顿咨询全
17、球移动互联网经济增长(波士顿咨询全球移动互联网经济增长(2015.2)移动科研移动科研NIH投建投建“移动传感器数据到知识移动传感器数据到知识”(MD2K)国家卓越中心()国家卓越中心(2014.10)旨在开发创新性工具,更轻松地采集、分析和旨在开发创新性工具,更轻松地采集、分析和解释移动与可穿戴传感器产生的医疗数据。解释移动与可穿戴传感器产生的医疗数据。用于科研数据处理的用于科研数据处理的APP如:如:ChemDoodle、iProtein、DataAnalysis等等基于微信和微博的科学传播基于微信和微博的科学传播移动政务移动政务印度推出印度推出“Mobile Seva”国家移动管理国家移
18、动管理计划,提高电子服务可获性计划,提高电子服务可获性澳大利亚推出澳大利亚推出“移动堪培拉移动堪培拉”计划,帮助计划,帮助民众访问政府提供的地理位置数据与服务民众访问政府提供的地理位置数据与服务移动教育移动教育MOOC及其移动端应用及其移动端应用如:如:Coursera、Udacity、学堂在线等、学堂在线等通过移动端游戏进行学习通过移动端游戏进行学习如:如:Arden(认识莎士比亚)(认识莎士比亚)可穿戴设备在教学中的应用可穿戴设备在教学中的应用18*3.大数据应用更加广泛大数据应用更加广泛欧盟欧盟EarthServer项目创建了先进的数据立方体及自项目创建了先进的数据立方体及自定义的定义的
19、Web门户,帮助研究人员提取和可视化地球科门户,帮助研究人员提取和可视化地球科学大数据。学大数据。美国食品与药品管理局与在线病友社区平台美国食品与药品管理局与在线病友社区平台PatientsLikeMe合作,尝试利用病人的健康数据识别合作,尝试利用病人的健康数据识别危险药物。危险药物。印度税务部门开发的数据库能够更容易地挖掘个人和印度税务部门开发的数据库能够更容易地挖掘个人和商业财务记录,帮助打击逃税行为。商业财务记录,帮助打击逃税行为。剑桥大学开发出剑桥大学开发出“腐败风险指数(腐败风险指数(CRI)”算法,算法,可通过梳理政府采购业务公开数据识别潜在的腐败迹可通过梳理政府采购业务公开数据识
20、别潜在的腐败迹象。象。Google DeepMind公司开发出一种新技术,通过公司开发出一种新技术,通过“阅阅读读”成千上万篇新闻文章来训练深度学习。成千上万篇新闻文章来训练深度学习。Google Trends可跟踪搜索关键词,使用户能够查看可跟踪搜索关键词,使用户能够查看每月超每月超1000亿次亿次Google搜索的实时动态。搜索的实时动态。NIST利用公开的数据应用程序支持科学研究。利用公开的数据应用程序支持科学研究。19*4.百亿亿次计算研发成为新一轮竞争点百亿亿次计算研发成为新一轮竞争点 美国美国新启动国家战略性计算计划,此前能源部推出新启动国家战略性计算计划,此前能源部推出Fast
21、Forward和和Design Forward两个项目;超级计算机两个项目;超级计算机“珊瑚珊瑚”(Coral)和)和“曙光曙光”(Aurora)的研制)的研制 欧盟欧盟6个百亿亿次计算研发项目:已实施数年的个百亿亿次计算研发项目:已实施数年的CRESTA、DEEP/DEEP-ER、Mont-Blanc/Mont-Blanc2;新增的;新增的EPiGRAM、EXA2CT、NUMEXAS 日本日本“京京”的研发被列为的研发被列为“旗舰旗舰2020计划计划”,计划到,计划到2020年建成世界最先进的年建成世界最先进的百亿亿次通用超级计算机。百亿亿次通用超级计算机。2016年预算为年预算为76亿日元
22、,增长近一倍。亿日元,增长近一倍。法国法国2015年年7月月9日,法国源讯公司(日,法国源讯公司(Atos)与法国新能源与原子能委员会()与法国新能源与原子能委员会(CEA)签订合同,约定于)签订合同,约定于2020年向其供应百亿亿次级超级计算机年向其供应百亿亿次级超级计算机“Tera1000”中国中国到到2015年研发出运算性能达到年研发出运算性能达到100 PF的系统,目前正在切实推进中。的系统,目前正在切实推进中。20*5.高速网络为全球科研提供强大支持高速网络为全球科研提供强大支持2014年年10月起,美国能源部能源科学月起,美国能源部能源科学网横跨大西洋部署了网横跨大西洋部署了4条新
23、的条新的100Gbps高速网络连接,为美国研究人员获取高速网络连接,为美国研究人员获取大型强子对撞机和其他科学数据提供大型强子对撞机和其他科学数据提供服务。服务。2 0 1 3 年,年,E S n e t、I n t e r n e t 2、CANARIE、SURFnet、NORDUnet、GEANT六大科教网组织部署了首个横六大科教网组织部署了首个横跨大西洋的跨大西洋的100Gbps研究网络链接。研究网络链接。2014年年10月,欧洲两大科教网组织月,欧洲两大科教网组织DANTE和和TERENA重组成立全新机构重组成立全新机构“GEANT协会协会”,意味着欧洲开,意味着欧洲开始了一个接近始了
24、一个接近30年的教育与科研合作年的教育与科研合作新时代。新时代。Google Fiber:每月支付:每月支付 70 美元,享美元,享受到受到1000Mbps(比传统带宽快(比传统带宽快100倍倍)的网络服务和)的网络服务和 1TB 的的 Google Drive 云存储空间了。云存储空间了。21*6.新型知识库改变知识获取方式新型知识库改变知识获取方式Knowledge Vault:Google 正在建立迄今为止世界上最大的知识库。正在建立迄今为止世界上最大的知识库。该知识库利用算法从网络上自动爬取信息,通过机器学习把数据变成可用该知识库利用算法从网络上自动爬取信息,通过机器学习把数据变成可用
25、知识。知识。截至截至2014年,知识库已收集年,知识库已收集16亿种事实描述,其中亿种事实描述,其中2.71亿被评定为可信赖亿被评定为可信赖的事实,即谷歌将新事实与已掌握的知识进行交叉比对,发现准确性达的事实,即谷歌将新事实与已掌握的知识进行交叉比对,发现准确性达90%。知识库的前身是知识库的前身是“知识图谱知识图谱”(Knowledge Graph)。虽然目前知识库的)。虽然目前知识库的知识量还未达到知识图谱的水平,但它能自动扩充增加知识,超越的时间知识量还未达到知识图谱的水平,但它能自动扩充增加知识,超越的时间指日可待,将很快成为全球最丰富的知识数据库。指日可待,将很快成为全球最丰富的知识
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