碱基→核苷酸课件.ppt
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- 碱基 核苷酸 课件
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1、BaseSugarA cidGAATTCGAATTCCTTAAGCTTAAGNNNNHNH2核酸降解代谢CO2,H2O,NH3 核酸核酸在生物体内可以被降解;在生物体内可以被降解;外源核酸外源核酸在动物体内的小肠被降解;在动物体内的小肠被降解;胰胰nuclease 肠粘膜释放的肠粘膜释放的phosphodiest-erase(磷酸二酯酶磷酸二酯酶)降解的产物在小肠内被转化和吸收;降解的产物在小肠内被转化和吸收;核酸降解一般不为生物提供能量;核酸降解一般不为生物提供能量;第一节 核酸降解P387 核酸酶是作用于核酸中核酸酶是作用于核酸中磷酸二酯键磷酸二酯键的水解酶,包括的水解酶,包括核糖核核糖核
2、酸酶酸酶(RNase)和和脱氧核糖核酸酶脱氧核糖核酸酶(DNase)水解核酸分子内部磷酸二酯键的酶又称为水解核酸分子内部磷酸二酯键的酶又称为核酸内切酶核酸内切酶(endonuclease)从核酸的一端逐个水解下核苷酸的酶称为从核酸的一端逐个水解下核苷酸的酶称为核酸外切酶核酸外切酶(exonuclease)。核酸酶(Nuclease)ATCGATCGPOH53PPPPPPP蛇毒磷酸二酯酶蛇毒磷酸二酯酶牛脾磷酸二酯酶牛脾磷酸二酯酶常见的核酸酶专一性常见的核酸酶专一性核酸内切酶核酸内切酶AP核酸内切酶的作用AP核酸内切酶能识别去除了碱基的核苷酸(核酸内切酶能识别去除了碱基的核苷酸(AP核苷酸:核苷酸
3、:无嘌呤酸、无嘧啶酸无嘌呤酸、无嘧啶酸)磷酸二酯键,并切除糖基,使核)磷酸二酯键,并切除糖基,使核酸链断开。酸链断开。限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶是一类是一类高度专一性高度专一性的的DNases,它们,它们是是顺序专一性顺序专一性,或,或结构专一性结构专一性的核酸内切酶。的核酸内切酶。它们不是与它们不是与DNA降解代谢降解代谢有关的酶;有关的酶;是是基因重组用酶基因重组用酶,是胞内,是胞内DNA的的“卫士卫士”。它们是分子。它们是分子生物学的工具酶,在分子生物学中占有非常重要的地位。生物学的工具酶,在分子生物学中占有非常重要的地位。限制性核酸内切酶GCTTAAAATTCG以限制性内切酶及连
4、结酶进行核酸剪接GAATTCCTTAAGGAATTCCTTAAGGCTTAAAATTCGAATTCGGCTTAAGCTTAAAATTCGGCTTAAAATTCGGCTTAAAATTCGEcoRIDNA LigaseEcoRI sticky endEcoRI sticky endJuang RH(2004)BCbasics2.1 核苷酸的分解核苷酸的分解 肠粘膜细胞中有肠粘膜细胞中有nucleotidase,水解,水解Nt为为Ns和和Pi。脾、肝等组织中的脾、肝等组织中的nucleosidase进一步水解进一步水解Ns为戊为戊糖和碱基。糖和碱基。第二节第二节 核苷酸、核苷与碱基的分解代谢核苷酸、
5、核苷与碱基的分解代谢BaseSugarAcidNucleotide核苷酸Nucleoside核苷2.1.1 核苷酸降解为核苷核苷酸降解为核苷 核苷酸核苷酸(Nt)H2O 核苷核苷(Ns)Pi磷酸酯酶磷酸酯酶或核苷酸酶或核苷酸酶生物体普遍存在的生物体普遍存在的磷酸单酯酶磷酸单酯酶或或核苷酸酶核苷酸酶可催化可催化2-,3-和和5-核苷酸的水解,而特异性强的磷酸单酯酶只能水解核苷酸的水解,而特异性强的磷酸单酯酶只能水解3-核苷酸或核苷酸或5-核苷酸,对不同的碱基也有选择性。核苷酸,对不同的碱基也有选择性。2.1 核苷酸的分解BaseSugarA cid核苷酸核苷酸 H2O 碱基碱基 戊糖戊糖-Pi
6、催化该反应的酶称为核苷酸核苷酶;催化该反应的酶称为核苷酸核苷酶;主要在微生物(细菌)中存在;主要在微生物(细菌)中存在;2.1.2 核苷酸中糖苷键的断裂核苷酸中糖苷键的断裂2.1 核苷酸的分解BaseSugarA cid2.1.3 核苷酸的脱氨反应与核苷酸转换核苷酸的脱氨反应与核苷酸转换 带带氨基的核苷酸氨基的核苷酸在在核苷酸脱氨酶核苷酸脱氨酶的作用的作用下可脱掉氨基而转变成另一种核苷酸。下可脱掉氨基而转变成另一种核苷酸。核苷酸的脱氨反应较为普遍核苷酸的脱氨反应较为普遍,如如:5-AMP 5-IMP(次黄嘌呤次黄嘌呤)+NH3 NNNNHNH2嘌呤核苷酸循环中嘌呤核苷酸循环中2.1 核苷酸的分
7、解HNNNNHOIMP(次黄嘌呤次黄嘌呤)核苷的代谢去路:核苷的代谢去路:核苷核苷-N-转糖苷作用转糖苷作用 (主要脱氧核苷(主要脱氧核苷)脱氨反应脱氨反应2.2 核苷的分解代谢B aseSugarA cidBaseSugarAcid2.2.2 核苷的核苷的磷酸解磷酸解作用:作用:核苷核苷+Pi Pu or Py+pentose-1-P Ns phosphorylase存在广泛,反应可逆,糖的构型存在广泛,反应可逆,糖的构型由由-型转变为型转变为-型型;2.2.1 核苷的核苷的水解水解作用:作用:核苷核苷+H2O Pu(嘌呤嘌呤)or Py(嘧啶嘧啶)+pentose Ns hydrolase
8、主要存在于主要存在于植物植物和和微生物微生物,只对,只对核糖核苷核糖核苷起作用,对起作用,对脱氧核糖核苷脱氧核糖核苷无作用无作用。Ns hydrolaseNs phosphorylase2.2 核苷的分解代谢2.2.3 核苷的相互转换核苷的相互转换 核苷核苷-N-转糖苷作用转糖苷作用 主要发生在脱氧核苷中主要发生在脱氧核苷中 脱氨反应脱氨反应 带带氨基的核苷氨基的核苷在核苷脱氨酶的作用下脱掉氨基而转变在核苷脱氨酶的作用下脱掉氨基而转变成另一种核苷成另一种核苷2.2.4 核苷的排泄核苷的排泄 主要为修饰核苷酸,不被分解,也不被利用主要为修饰核苷酸,不被分解,也不被利用嘌呤互换嘌呤互换嘧啶互换嘧啶
9、互换2.2 核苷的分解代谢脱氨作用主要发生在核苷酸和核苷水平脱氨作用主要发生在核苷酸和核苷水平2.3 核苷酸三级水平的降解P388核苷酸核苷酸核苷核苷碱基碱基不同生物嘌呤碱的分解能力不同,代谢产物也不同,人和猿类及一些排尿酸的动物(鸟类、某些爬行类和昆虫)嘌呤的代谢产物为尿酸。O2 +H2OH2O2尿酸尿酸鸟嘌呤脱氨主要在鸟嘌呤脱氨主要在碱基碱基水平水平下进行下进行2.4.1 嘌呤碱的分解嘌呤碱的分解:2.4 碱基的分解代谢嘌呤核苷酸的分解嘌呤核苷酸的分解次黄嘌呤黄嘌呤尿酸 催化催化次黄嘌呤次黄嘌呤和和黄嘌呤黄嘌呤氧化产生氧化产生尿酸尿酸。该酶为该酶为复合黄素酶复合黄素酶,由两个相同的亚基组成
10、,每个亚基,由两个相同的亚基组成,每个亚基含一个含一个FAD、一个、一个钼原子钼原子Mo(IV)Mo(VI)和一个和一个Fe4S4中心。中心。反应要求反应要求分子氧分子氧作为电子受体,还原产物是作为电子受体,还原产物是H2O2,进,进入尿酸的氧来自水。入尿酸的氧来自水。黄嘌呤氧化酶(Xanthine Oxidase)不同生物中嘌呤核苷酸的不同生物中嘌呤核苷酸的分解产物不同分解产物不同尿囊素尿囊素尿囊酸尿囊酸灵长类/鸟类等多数哺乳动物多骨刺鱼两栖动物等无脊椎动物嘌呤碱分解代谢产生嘌呤碱分解代谢产生过多的尿酸过多的尿酸,由于其溶解性很差,由于其溶解性很差,易形成易形成尿酸钠结晶尿酸钠结晶,沉积于关
11、节部位,沉积于关节部位,引起疼痛或灼痛引起疼痛或灼痛痛风痛风。如果发生如果发生HGPRT的缺陷,不能以的缺陷,不能以补救途径补救途径合成嘌呤核苷酸,合成嘌呤核苷酸,吸收或合成的嘌呤碱不完全降解,导致大量尿酸积累,也引吸收或合成的嘌呤碱不完全降解,导致大量尿酸积累,也引起起肾结石和痛风肾结石和痛风。HGPRT:次黄嘌呤鸟嘌呤转磷酸核糖酶次黄嘌呤鸟嘌呤转磷酸核糖酶痛风(Gout)不同生物对不同生物对嘧啶碱嘧啶碱的分解过程不一样;的分解过程不一样;一般情况下含一般情况下含氨基的嘧啶氨基的嘧啶要先水解脱去氨基,要先水解脱去氨基,脱氨基也可以在脱氨基也可以在核苷或核苷酸水平核苷或核苷酸水平上进行。上进行
12、。2.4 碱基的分解代谢2.4.2 嘧啶碱基的分解嘧啶碱基的分解UCMPCRURUMPCdTMPdTRT氧化分解氧化分解还原分解还原分解只在微生只在微生物中发现物中发现2.4 碱基的分解代谢2.4.2 嘧啶碱基的分解嘧啶碱基的分解NH32.4 碱基的分解代谢2.4.2.1 嘧啶碱基分解的还原途径嘧啶碱基分解的还原途径2.4 碱基的分解代谢2.4.2.2 嘧啶碱基分解的氧化途径嘧啶碱基分解的氧化途径3.1 核苷酸合成的基本途径核苷酸合成的基本途径可以通过两条完全不同的途径进行可以通过两条完全不同的途径进行:由非核苷和碱基的前体小分子化合由非核苷和碱基的前体小分子化合物物从头合成从头合成De no
13、vo Synthesis;由现成由现成的的Pu,Py,Pentose及及Pi在酶在酶的作用下直接合成核苷酸的作用下直接合成核苷酸“补救补救合成途径合成途径Salvage Pathway”。第三节 核苷酸的生物合成Biosynthesis of nucleotides3.1 核苷酸合成的基本途径嘌呤环元素的来源嘌呤环元素的来源:3.2 嘌呤核苷酸的从头生物合成甲酸3.2 嘌呤核苷酸的从头生物合成嘌呤核苷酸的全程合成总图嘌呤核苷酸的全程合成总图次黄嘌呤的次黄嘌呤的合成是在核合成是在核苷酸水平进苷酸水平进行的,即产行的,即产物是核苷酸物是核苷酸R磷酸核糖基焦磷酸磷酸核糖基焦磷酸(PRPP)嘌呤核苷酸
14、的全程合成(反应嘌呤核苷酸的全程合成(反应1)构象由构象由a a构型构型转变为转变为b构型构型PRPP转转酰胺酶酰胺酶5-磷酸核糖胺(PRA)嘌呤核苷酸的全程合成(反应嘌呤核苷酸的全程合成(反应2)甘氨酰胺核甘氨酰胺核苷酸合成酶苷酸合成酶甘氨酰胺核苷酸(GAR)嘌呤核苷酸的全程合成(反应嘌呤核苷酸的全程合成(反应3)甘氨酰胺甘氨酰胺核苷酸核苷酸转转氨甲酰酶氨甲酰酶甲酰甘氨酰胺核苷酸(FGAR)嘌呤核苷酸的全程合成(反应嘌呤核苷酸的全程合成(反应4)甲酰甘氨甲酰甘氨脒核苷酸脒核苷酸合成酶合成酶甲酰甘氨眯核苷酸(FGAM)嘌呤核苷酸的全程合成(反应嘌呤核苷酸的全程合成(反应5)氨基咪唑氨基咪唑核苷
15、酸核苷酸合合成酶成酶5-氨基咪唑核苷酸氨基咪唑氨基咪唑核苷酸核苷酸羧羧化酶化酶嘌呤核苷酸的全程合成(反应6)嘌呤核苷酸的全程合成(反应7)5-氨基咪唑-4-羧酸核苷酸嘌呤核苷酸的全程合成(反应嘌呤核苷酸的全程合成(反应8)氨基咪唑氨基咪唑琥珀基氨琥珀基氨甲酰核苷甲酰核苷酸酸合成酶合成酶5-氨基咪唑-4-(N-琥珀基)甲酰胺核苷酸腺苷酸腺苷酸琥珀酸琥珀酸裂解酶裂解酶嘌呤核苷酸的全程合成(反应9)5-氨基咪唑-4-氨甲酰胺核苷酸氨基咪唑氨基咪唑氨甲酰核氨甲酰核苷酸苷酸转甲转甲酰基酶酰基酶嘌呤核苷酸的全程合成(反应10)5-甲酰胺基咪唑-4-氨甲酰胺核苷酸嘌呤核苷酸的合成一直是在嘌呤核苷酸的合成一直
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