结构生物学第二讲-1-核酸的结构与功能课件.ppt
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- 结构 生物学 第二 核酸 功能 课件
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1、第二章核酸的结构与功能第二章核酸的结构与功能 Structure and Function of Nucleic Acid 1.核酸的发现史核酸的发现史 2.核苷酸及其连接核苷酸及其连接 3.DNA的结构与功能的结构与功能 4.RNA的结构与功能的结构与功能 5.核酸的某些理化性质及研究方法核酸的某些理化性质及研究方法 6.小结小结 DNA与与RNA比较比较 蛋白质与核酸比较蛋白质与核酸比较核核 酸酸(nucleic acid)是以核苷酸为基本组成单位的生物大是以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。分子,携带和传递遗传信息。1.核酸的发现史核酸的发现史1.1 核酸的发现和研究
2、史核酸的发现和研究史 1868年年 瑞士外科医生瑞士外科医生Friedrich Miescher首次脓首次脓细胞的胞核中提取到核酸与蛋白质的结合物,当时细胞的胞核中提取到核酸与蛋白质的结合物,当时称为核素称为核素(nuclein),它含磷量极高,酸性很强。,它含磷量极高,酸性很强。1871年他发表了第一篇有关核酸的论文。年他发表了第一篇有关核酸的论文。1928年年Griffith等研究肺炎双球菌的转化实验中提等研究肺炎双球菌的转化实验中提出出“转化因子转化因子”这一物质。这一物质。1944年年Avery提取出提取出“转化因子转化因子”,并证实它就是,并证实它就是DNA,说明传递遗传信息的物质是
3、,说明传递遗传信息的物质是DNA。1952年年Hershey等人用放射性同位素标记技术证明等人用放射性同位素标记技术证明DNA是遗传的物质基础。是遗传的物质基础。20世纪世纪50年代,年代,Chargaff应用紫外分光光度法结应用紫外分光光度法结合纸层析简单技术,发现合纸层析简单技术,发现DNA碱基组成的规律。碱基组成的规律。Wilkins小组用小组用X光衍射法研究了光衍射法研究了DNA的晶体结构。的晶体结构。发现发现DNA分子中的核苷酸是排列成螺旋状,其螺分子中的核苷酸是排列成螺旋状,其螺距为距为3.4nm,每个螺距内含有每个螺距内含有10个碱基对,每个碱个碱基对,每个碱基形成一个平面,而两
4、个平面之间的距离为基形成一个平面,而两个平面之间的距离为0.34nm.Norweger等研究表明:等研究表明:DNA分子中核苷酸的戊分子中核苷酸的戊糖环平面平行于糖环平面平行于DNA螺旋的主轴,而碱基平面于螺旋的主轴,而碱基平面于此轴垂直。此轴垂直。1953年年Watson和和Crick提出了提出了DNA的双螺旋结构。的双螺旋结构。1968年年 Nirenberg发现发现遗传密码遗传密码1975年年 Temin和和Baltimore发发现现逆转录酶逆转录酶1981年年 Gilbert和和Sanger建建立立DNA 测序方法测序方法1985年年 Mullis发明发明PCR 技术技术1990年年
5、美国启动美国启动人类基因组计划人类基因组计划(HGP)1994年年 中国人类基因组计划启动中国人类基因组计划启动2001年年 美、英等国美、英等国完成人类基因组计划基本框架完成人类基因组计划基本框架1.2 核酸的分类及分布核酸的分类及分布 90%90%以上分布于细胞核,其余分布于以上分布于细胞核,其余分布于核外核外如线粒体,叶绿体,质粒等。如线粒体,叶绿体,质粒等。分布于胞核、胞液。分布于胞核、胞液。(deoxyribonucleic acid,DNA)(ribonucleic acid,RNA)脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸 核糖核酸核糖核酸携带遗传信息,决定细胞和个携带遗传信息,决定细胞和个体的
6、基因型体的基因型(genotype)。参与细胞内参与细胞内DNA遗传信息的表遗传信息的表达。某些病毒达。某些病毒RNA也可作为遗也可作为遗传信息的载体。传信息的载体。1.3 核酸的化学组成核酸的化学组成 1.3.1 元素组成元素组成C、H、O、N、P(910%)1.3.2 分子组成分子组成 碱基碱基(base):嘌呤碱,嘧啶碱:嘌呤碱,嘧啶碱 戊糖戊糖(ribose):核糖,脱氧核糖:核糖,脱氧核糖 磷酸磷酸(phosphate)2.核苷酸及其连接核苷酸及其连接 2.1 碱基碱基 2.2 戊糖戊糖 2.3 磷酸磷酸 2.4 核苷核苷 2.5 核苷酸核苷酸 2.6 核苷酸的连接核苷酸的连接2.1
7、 碱基(碱基(base)参与核苷酸组成的主要碱基参与核苷酸组成的主要碱基:嘌呤嘌呤(purine,Pu):腺嘌呤:腺嘌呤(adenine,A)鸟嘌呤鸟嘌呤(guanine,G)嘧啶嘧啶(pyrimidine,Py):胞嘧啶胞嘧啶(cytosine,C)尿嘧啶尿嘧啶(uracil,U)胸腺嘧啶胸腺嘧啶(thymine,T)DNA和和RNA中的碱基组成中的碱基组成 参与核苷组成的稀有碱基参与核苷组成的稀有碱基表:表:DNA和和RNA中的碱基组成中的碱基组成DNARNA腺嘌呤腺嘌呤(adenine,A)鸟嘌呤鸟嘌呤(guanine,G)胞嘧啶胞嘧啶(cytosine,C)胸腺嘧啶胸腺嘧啶(thymi
8、ne,T)尿嘧啶尿嘧啶(uracil,U)2.2 戊糖戊糖(pentose)-D-核糖核糖(ribose)RNA中存在中存在 -D-2-脱氧核糖脱氧核糖(deoxyribose)DNA中存在中存在2.3 磷酸磷酸(phosphate)磷酸的结构磷酸的结构表:两类核酸分子组成比较表:两类核酸分子组成比较 碱碱 基基戊戊 糖糖磷酸磷酸 嘌嘌 呤呤 嘧嘧 啶啶 核核 糖糖 脱氧核糖脱氧核糖 DNADNAA A、G G C C、T T 脱氧核糖脱氧核糖磷酸磷酸RNARNA A A、G G C C、U U 核核 糖糖磷酸磷酸 两类核酸分子组成比较两类核酸分子组成比较2.4 核苷核苷(nucleoside
9、)定义定义:核糖或脱氧核糖的核糖或脱氧核糖的C-1与嘧啶的与嘧啶的N-1或嘌或嘌呤的呤的N-9相连接构成的化合物。相连接构成的化合物。举例举例:腺苷和脱氧腺苷的结构腺苷和脱氧腺苷的结构 胞苷和脱氧胞苷的结构胞苷和脱氧胞苷的结构 DNA和和RNA中的脱氧核苷和核苷中的脱氧核苷和核苷表:表:DNA和和RNA中的脱氧核苷和核苷中的脱氧核苷和核苷DNARNA腺嘌呤腺嘌呤(adenine,A)脱氧腺苷脱氧腺苷(dA)腺苷腺苷(A)鸟嘌呤鸟嘌呤(guanine,G)脱氧鸟苷脱氧鸟苷(dG)鸟苷鸟苷(G)胞嘧啶胞嘧啶(cytosine,C)脱氧胞苷脱氧胞苷(dC)胞苷胞苷(C)胸腺嘧啶胸腺嘧啶(thymin
10、e)脱氧胸苷脱氧胸苷(dT)尿嘧啶尿嘧啶(uracil,U)尿苷尿苷(U)2.5 核苷酸核苷酸(nucleotide)2.5.1 生物体内的游离核苷酸生物体内的游离核苷酸 2.5.2 多磷酸核苷酸多磷酸核苷酸 2.5.3 环化核苷酸环化核苷酸 2.5.4 辅酶类核苷酸辅酶类核苷酸 2.5.1生物体内的游离核苷酸生物体内的游离核苷酸 2.5.1.1 构成核酸的核苷酸构成核酸的核苷酸 2.5.1.2 生物体内存在的游离核苷酸:生物体内存在的游离核苷酸:黄嘌呤核苷酸黄嘌呤核苷酸(XMP)次黄嘌呤核苷酸次黄嘌呤核苷酸(IMP)2.5.1.1 构成核酸的核苷酸构成核酸的核苷酸 定义定义 核糖或脱氧核糖上
11、的羟基与磷酸脱水缩合形成的化合物核糖或脱氧核糖上的羟基与磷酸脱水缩合形成的化合物,称为核苷酸称为核苷酸。举例举例2-核苷酸、核苷酸、3-核苷酸、核苷酸、5-核苷酸核苷酸3-脱氧核苷酸,脱氧核苷酸,5-脱氧核苷酸脱氧核苷酸 命名命名核苷酸或核苷一磷酸核苷酸或核苷一磷酸(NMP)脱氧核苷酸或脱氧核苷一磷酸脱氧核苷酸或脱氧核苷一磷酸(dNMP)mono-:单一单一,deoxy-:脱氧脱氧 构成核酸的核苷酸一览表构成核酸的核苷酸一览表 表:构成核酸的核苷酸表:构成核酸的核苷酸 DNARNA腺嘌呤腺嘌呤(adenine,A)脱氧腺苷酸脱氧腺苷酸(dAMP)腺苷一磷酸腺苷一磷酸(AMP)鸟嘌呤鸟嘌呤(gu
12、anine,G)脱氧鸟苷酸脱氧鸟苷酸(dGMP)鸟苷一磷酸鸟苷一磷酸(GMP)胞嘧啶胞嘧啶(cytosine,C)脱氧胞苷酸脱氧胞苷酸(dCMP)胞苷一磷酸胞苷一磷酸(CMP)胸腺嘧啶胸腺嘧啶(thymine,T)脱氧胸苷酸脱氧胸苷酸(dTMP)尿嘧啶尿嘧啶(uracil,U)尿苷一磷酸尿苷一磷酸(UMP)说明:说明:mono-:单一单一,deoxy-:脱氧脱氧 2.5.1.2 生物体内存在的游离核苷酸:生物体内存在的游离核苷酸:黄嘌呤核苷酸黄嘌呤核苷酸(XMP)次黄嘌呤核苷酸次黄嘌呤核苷酸(IMP)体内重要的游离核苷酸及其衍生物体内重要的游离核苷酸及其衍生物 含核苷酸的生物活性物质:含核苷酸
13、的生物活性物质:NAD+、NADP+、CoA-SH、FAD 等都含有等都含有 AMPl 多磷酸核苷酸:多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTPl 环化核苷酸环化核苷酸:cAMP,cGMPNADP+NAD+2.5.2 多磷酸核苷酸多磷酸核苷酸 2.5.2.1 定义定义核苷酸在核苷酸在5-磷酸上进一步磷酸化形成的多磷酸磷酸上进一步磷酸化形成的多磷酸化合物为多磷酸核苷酸。化合物为多磷酸核苷酸。2.5.2.1 举例举例 ADP:腺苷二磷酸或二磷酸腺苷:腺苷二磷酸或二磷酸腺苷ATP:腺苷三磷酸或三磷酸腺苷:腺苷三磷酸或三磷酸腺苷(di-:二的、:二的、tri-:三的:三的)2.5.2.3 常见的多磷酸核苷酸
14、一览表常见的多磷酸核苷酸一览表 2.5.2.4 多磷酸核苷酸的相互转换图多磷酸核苷酸的相互转换图 2.5.2.5 能量的转移图能量的转移图 2.5.2.6 三三磷酸核苷的功能一览表磷酸核苷的功能一览表 2.5.2.1 举例举例 ADP:腺苷二磷酸或二磷酸腺苷:腺苷二磷酸或二磷酸腺苷 2.5.2.1 举例举例ATP:腺苷三磷酸:腺苷三磷酸或三磷酸腺苷或三磷酸腺苷表:常见的多磷酸核苷酸表:常见的多磷酸核苷酸核苷二磷酸核苷二磷酸(NMP)三磷酸核苷三磷酸核苷(NTP)腺嘌呤腺嘌呤(adenine,A)腺苷二磷酸腺苷二磷酸(ADP)三磷酸腺苷三磷酸腺苷(ATP)鸟嘌呤鸟嘌呤(guanine,G)鸟苷二
15、磷酸鸟苷二磷酸(GDP)三磷酸鸟苷三磷酸鸟苷(GTP)胞嘧啶胞嘧啶(cytosine,C)胞苷二磷酸胞苷二磷酸(CDP)三磷酸胞苷三磷酸胞苷(CTP)胸腺嘧啶胸腺嘧啶(thymine,T)胸苷二磷酸胸苷二磷酸(TDP)三磷酸胸苷三磷酸胸苷(TTP)尿嘧啶尿嘧啶(uracil,U)尿苷二磷酸尿苷二磷酸(UDP)三磷酸尿苷三磷酸尿苷(UTP)2.5.2.3 常见的多磷酸核苷酸一览表常见的多磷酸核苷酸一览表 2.5.2.4 多磷酸核苷酸的相互转换图多磷酸核苷酸的相互转换图 2.5.2.5 能量的转移图能量的转移图 表:三磷酸核苷的功能表:三磷酸核苷的功能 dATP、dGTP、dCTP、dTTP:DN
16、A合成的原料合成的原料ATP、GTP、CTP、UTP:RNA合成的原料合成的原料ATP:生物体内能量的直接供体生物体内能量的直接供体GTP:参与蛋白质的生物合成参与蛋白质的生物合成CTP:参与磷脂的生物合成参与磷脂的生物合成UTP:参与糖原的生物合成参与糖原的生物合成2.5.2.6 三磷酸核苷的功能一览表三磷酸核苷的功能一览表2.5.3 环化核苷酸环化核苷酸2.5.3.1环化核苷酸的结构环化核苷酸的结构和和cAMP模型模型2.5.3.2cAMP、cGMP的功能的功能-充当第二信充当第二信使使第一信使:激素本身是第一信使。第一信使:激素本身是第一信使。因激素是多细胞在细胞间传递信息的一因激素是多
17、细胞在细胞间传递信息的一种化学信使。种化学信使。第二信使:将细胞外信息传递到细胞内第二信使:将细胞外信息传递到细胞内的物质,在生物体内具有广泛的调节作用的物质,在生物体内具有广泛的调节作用2.5.3.1环化核苷酸的结构环化核苷酸的结构2.5.3.1cAMP模型模型2.5.4 辅酶类核苷酸辅酶类核苷酸 2.5.4.1 辅酶辅酶A 2.5.4.2 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸烟酰胺腺嘌呤二核苷酸NAD+结构图结构图和和模型图模型图 2.5.4.3 黄素腺嘌呤二核苷酸黄素腺嘌呤二核苷酸 2.5.4.1 辅酶辅酶A 2.5.4.2 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 NAD+结构图结构图和和模型图模型图
18、 2.5.4.3 黄素黄素腺嘌呤二核苷酸腺嘌呤二核苷酸2.6 核苷酸的连接核苷酸的连接 2.6.1 磷酸二酯链磷酸二酯链 形成形成:构成核酸的磷酸二酯键为构成核酸的磷酸二酯键为3,5-磷酸二酯链磷酸二酯链 分解分解:磷酸二酯键可被许多核酸水解酶作用而磷酸二酯键可被许多核酸水解酶作用而 水解,水解,如核糖核酸酶如核糖核酸酶I、多种限制性内切酶等。、多种限制性内切酶等。2.6.2 多核苷酸链多核苷酸链部分部分RNA链链部分部分DNA链链几个概念几个概念 2.6.3 多腺苷酸多腺苷酸 2.6.1 磷酸二酯链磷酸二酯链 形成形成:构成核酸的磷酸二酯键为构成核酸的磷酸二酯键为3,5-磷酸二酯链磷酸二酯链
19、 分解分解:磷酸二酯键可被许多核酸水解酶作用而磷酸二酯键可被许多核酸水解酶作用而 水解,如核糖核酸酶水解,如核糖核酸酶I、多种限制性内切酶等。、多种限制性内切酶等。2.6.2 多核苷酸链多核苷酸链有关核苷酸链的几个概念有关核苷酸链的几个概念 寡核苷酸:寡核苷酸:十几个或几十个核苷酸连接起十几个或几十个核苷酸连接起来的分子来的分子 核酸:核酸:由几十多到上千个核苷酸彼此相连由几十多到上千个核苷酸彼此相连而成的多核苷酸链而成的多核苷酸链 5-末端与末端与3-末端末端 核苷酸残基核苷酸残基 2.6.3 多腺苷酸多腺苷酸3.DNA的结构与功能的结构与功能 3.1 DNA的碱基组成的碱基组成 3.2 D
20、NA的一级结构的一级结构 3.3 DNA的二级结构的二级结构 3.4 DNA的三级结构的三级结构 3.5 DNA的生物学功能的生物学功能3.1 DNA的碱基组成的碱基组成 Chargaff规则的内容规则的内容.所有所有DNA:A=T、G=C,即,即A+G=T+C.DNA的碱基组成具有种的特异性,即不同种的的碱基组成具有种的特异性,即不同种的DNA碱基组成不一样碱基组成不一样.对同一生物物种,对同一生物物种,DNA的碱基组成没有组织和器的碱基组成没有组织和器官的特异性官的特异性.DNA的碱基组成不随年龄、营养状况及环境的改的碱基组成不随年龄、营养状况及环境的改变而改变变而改变 Chargaff规
21、则的意义规则的意义 该规则为后来建立该规则为后来建立DNA双螺旋结构模型奠定的基双螺旋结构模型奠定的基础,础,并为阐明并为阐明DNA的生物学功能提供了重要依据。的生物学功能提供了重要依据。3.2 DNA的一级结构的一级结构 定义:定义:脱氧核苷酸在长链上的排列顺序就是脱氧核苷酸在长链上的排列顺序就是DNA的一级结构的一级结构。不同种不同种DNA之间的千差万别只是在碱基排列顺序不同。之间的千差万别只是在碱基排列顺序不同。DNA的一级结构也称为核苷酸序列或碱基序列。的一级结构也称为核苷酸序列或碱基序列。举例:举例:1977年测定了由年测定了由5375个核苷酸组成的噬菌体个核苷酸组成的噬菌体X174
22、 DNA的核苷酸顺序。人的的核苷酸顺序。人的DNA包含包含3109个碱基对个碱基对(如如 果连接起来其长度约为地球到月亮的距离,即果连接起来其长度约为地球到月亮的距离,即20万英万英里里),因此它所容纳的信息量极大。,因此它所容纳的信息量极大。核酸的一级结构核酸的一级结构 定义:定义:核酸中核苷酸的排核酸中核苷酸的排列顺序。列顺序。由于核苷酸间的差由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所异主要是碱基不同,所以也称为以也称为碱基序列碱基序列。55端端3端端CGA3.3 DNA的二级结构的二级结构 3.3.1 右手双螺旋结构右手双螺旋结构 3.3.2 DNA的其它构象的其它构象3.3.1 右手双螺旋结
23、构(右手双螺旋结构(B-DNA)3.3.1.1 提出提出:Watson和和Crick于于1953年根据年根据 DNA晶体的晶体的X-射线衍射图谱和射线衍射图谱和Chargaff规则等数据规则等数据提出。提出。X-射线衍射原理图射线衍射原理图和和DNA晶体的晶体的X-射线衍射图谱射线衍射图谱 3.3.1.2 要点:要点:1.由两条反向平行的脱氧多核苷酸链围绕同一中心轴由两条反向平行的脱氧多核苷酸链围绕同一中心轴构成右手双螺旋结构。构成右手双螺旋结构。2.两股单链两股单链糖糖-磷酸磷酸构成骨架,居双螺旋外侧。碱构成骨架,居双螺旋外侧。碱基位于双螺旋内侧,并与中心轴垂直。基位于双螺旋内侧,并与中心轴
24、垂直。3每圈螺旋含每圈螺旋含10个核苷酸残基,螺距:个核苷酸残基,螺距:3.4nm,直直径径:2nm,有两个沟:大沟有两个沟:大沟(major groove)及小沟及小沟(minor groove)相间。相间。4.碱基严格配对碱基严格配对:A与与T、C与与G互补碱基与互补链互补碱基与互补链 5.DNA双螺旋结构稳定因素:双螺旋结构稳定因素:碱基堆积力、氢键、离子链碱基堆积力、氢键、离子链u氢键氢键维持双链维持双链横向稳定性横向稳定性,碱基堆积力碱基堆积力维维持双链持双链纵向稳定性纵向稳定性。3.3.1.3 意义意义 DNA双螺旋结构支配了近代核酸结构功能的研双螺旋结构支配了近代核酸结构功能的研
25、究和发展,是生物科学发展史上的杰出贡献。究和发展,是生物科学发展史上的杰出贡献。3.3.2 DNA的其它构象的其它构象:DNA双螺旋结构的多样性双螺旋结构的多样性DNA Structures:A,B and ZDNA Structures:B-DNAd(CGCGAATTCGCG)d(CGCGAATTCGCG)3.3.2.1 A-DNADNA Structures:A-DNAd(AGCTTGCCTTGAG)d(CTCAAGGCAAGCT)3.3.2.2 Z-DNA DNA Structures:Z-DNAd(CGCGCGCGCGCG)d(CGCGCGCGCGCG)3.3.2.3 小结小结表:各种
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