蛋白质的结构与功能-生物化学与分子生物学课件.ppt
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- 蛋白质 结构 功能 生物化学 分子生物学 课件
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1、目目 录录生物化学课件生物化学课件张丕显目目 录录蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能第第 一一 章章Structure and Function of Protein目目 录录一、什么是蛋白质一、什么是蛋白质?蛋白质蛋白质(protein)是由许多氨基酸是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键通过肽键(peptide bond)相连相连形成的高分子含氮化合物。形成的高分子含氮化合物。概述概述目目 录录二、蛋白质的生物学重要性二、蛋白质的生物学重要性1.蛋白质是生物蛋白质是生物 体重要组成成分体重要组成成分分布广:分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各
2、个部分都含有蛋白质。细胞的各个部分都含有蛋白质。含量高:含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的分子,占人体干重的45,某些组织含量更,某些组织含量更高,例如脾、肺及横纹肌等高达高,例如脾、肺及横纹肌等高达80。目目 录录1 1)作为生物催化剂(酶)作为生物催化剂(酶)2 2)代谢调节作用)代谢调节作用3 3)免疫保护作用)免疫保护作用4 4)物质的转运和存储)物质的转运和存储5 5)运动与支持作用)运动与支持作用6 6)参与细胞间信息传递)参与细胞间信息传递2.蛋白质具有重要的生物学功能蛋白质具有重要的生物学功能3.氧化供能氧化供能目目 录录蛋蛋 白白
3、质质 的的 分分 子子 组组 成成The Molecular Component of Protein第第 一一 节节目目 录录一、一、组成蛋白质的元素组成蛋白质的元素.主要有主要有C、H、O、N和和S。有些蛋白质含有少量有些蛋白质含有少量磷磷或金属元素或金属元素铁、铁、铜、锌、锰、钴、钼铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有,个别蛋白质还含有碘碘。目目 录录 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16。由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测定生物样品中的含氮量,就可以根据以只要测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出
4、蛋白质的大致含量:下公式推算出蛋白质的大致含量:100克样品中蛋白质的含量克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数每克样品含氮克数 6.251001/16%蛋白质元素组成的特点蛋白质元素组成的特点目目 录录二、二、蛋白质的基本单位蛋白质的基本单位-氨基酸氨基酸(一一)氨基酸的结构氨基酸的结构(通式通式)存在自然界中的氨基酸有存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有体蛋白质的氨基酸仅有20种种(20-22),且均属,且均属 L-氨氨基酸基酸(甘氨酸除外)如图示。(甘氨酸除外)如图示。目目 录录H甘氨酸甘氨酸CH3丙氨酸丙氨酸RC+NH3COO-H-氨基酸
5、目目 录录 C H RR:H AA;R:CH3 AAR:CH-OH AA CH3目目 录录1.非极性非极性疏水性疏水性氨基酸氨基酸2.极性氨基酸极性氨基酸3.酸性氨基酸酸性氨基酸4.碱性氨基酸碱性氨基酸(二)氨基酸的分类二)氨基酸的分类*20 20种氨基酸的英文名称、缩写符号及分类如下种氨基酸的英文名称、缩写符号及分类如下:目目 录录甘氨酸甘氨酸 glycine Gly G 5.97丙氨酸丙氨酸 alanine Ala A 6.00缬氨酸缬氨酸 valine Val V 5.96亮氨酸亮氨酸 leucine Leu L 5.98 异亮氨酸异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02 苯
6、丙氨酸苯丙氨酸 phenylalanine Phe F 5.48脯氨酸脯氨酸 proline Pro P 6.301.非极性非极性疏水性疏水性氨基酸氨基酸目目 录录目目 录录色氨酸色氨酸 tryptophan Try W 5.89丝氨酸丝氨酸 serine Ser S 5.68酪氨酸酪氨酸 tyrosine Try Y 5.66 半胱氨酸半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07 蛋氨酸蛋氨酸 methionine Met M 5.74天冬酰胺天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41 谷氨酰胺谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65 苏氨酸苏氨酸 threonine
7、 Thr T 5.602.极性中性氨基酸极性中性氨基酸目目 录录目目 录录天冬氨酸天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97谷氨酸谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22赖氨酸赖氨酸 lysine Lys K 9.74精氨酸精氨酸 arginine Arg R 10.76组氨酸组氨酸 histidine His H 7.593.酸性氨基酸酸性氨基酸4.碱性氨基酸碱性氨基酸目目 录录目目 录录几种特殊氨基酸几种特殊氨基酸 脯氨酸脯氨酸(亚氨基酸)(亚氨基酸)CH2CHCOO-NH2+CH2CH2CH2CHCOO-NH2+CH2CH2目目 录录-OOC-CH-CH2
8、-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3 半胱氨酸半胱氨酸 +胱氨酸胱氨酸二硫键二硫键-HH-OOC-CH-CH2-SH+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3目目 录录1.1.两性解离及等电点两性解离及等电点(三三)氨基酸的理化性质氨基酸的理化性质R CHNH2COOHRCHNH3+COO-RCHNH3+COOHRCHNH2COO-+OH+OH+H+H+OH+OH+H+H+pHpIpHpIpHpIpH=pIpH=pI目目 录录等电点等电点(pI
9、)(pI)氨基酸酸性解离和碱性解离的程度相等,分子氨基酸酸性解离和碱性解离的程度相等,分子所带的净电荷为零,此时溶液的所带的净电荷为零,此时溶液的pHpH值就称为该值就称为该氨基酸的等电点氨基酸的等电点除碱性氨基酸外,其余氨基酸等电点均小于除碱性氨基酸外,其余氨基酸等电点均小于7 7pIpI=1/2=1/2(pKpK1 1+pK+pK2 2)若一个若一个aaaa有有3 3个解离基因,则其个解离基因,则其pIpI为兼性离子为兼性离子两边两边pKpK的平均值的平均值目目 录录2.2.紫外吸收性质紫外吸收性质 色氨酸和酪氨酸在色氨酸和酪氨酸在280nm280nm波长附近对紫波长附近对紫外光有最大吸收
10、峰外光有最大吸收峰 据此可以通过测定蛋白质溶液据此可以通过测定蛋白质溶液280nm280nm的的吸光值快速测定其蛋白质含量吸光值快速测定其蛋白质含量目目 录录3.3.茚三酮反应茚三酮反应aaaa与水合茚三酮一起加热,生成蓝紫色的与水合茚三酮一起加热,生成蓝紫色的化合物,在化合物,在570nm570nm处有最大吸收。据此亦处有最大吸收。据此亦可用作可用作aaaa含量分析含量分析目目 录录*以肽键相连接以肽键相连接,肽键肽键(peptide bond)是由一是由一个氨基酸的个氨基酸的-羧基上的羟基羧基上的羟基与另一个氨与另一个氨基酸的基酸的-氨基上的氢原子氨基上的氢原子脱水缩合而形脱水缩合而形成的
11、化学键成的化学键,如图示如图示:三三.氨基酸在蛋白氨基酸在蛋白质中的连接方式质中的连接方式目目 录录NH2-CH-CHOOH甘甘氨氨酸酸NH2-CH-CHOOH甘甘氨氨酸酸NH-CH-CHOHO OH甘甘氨氨酸酸+-HOH甘氨酰甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽键NH2-CH-C-N-CH-COOHHHHONH2-CH-C-N-CH-COOHHHHO目目 录录 目目 录录*肽肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。合物。*两分子氨基酸缩合形成两分子氨基酸缩合形成二肽二肽,三分子氨,三分子氨基酸缩合则形成基酸缩合则形成三肽三肽*肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团肽链中的氨基酸
12、分子因为脱水缩合而基团不全,被称为不全,被称为氨基酸残基氨基酸残基(residue)。*由十个以内氨基酸相连而成的肽称为由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡寡肽肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相连由更多的氨基酸相连形成的肽称形成的肽称多肽多肽(polypeptide)。目目 录录N 末端:多肽链中有末端:多肽链中有自由氨基自由氨基的一端的一端C 末端:多肽链中有末端:多肽链中有自由羧基自由羧基的一端的一端多肽链有两端多肽链有两端*多肽链多肽链(polypeptide chain)是指许多氨基是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。酸之间以肽键连接而成的一种结构。目目 录录N末端
13、末端C末端末端牛核糖核酸酶牛核糖核酸酶目目 录录.几种生物活性肽几种生物活性肽 1.谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione,GSH)目目 录录GSH过氧过氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还原酶还原酶NADPH+H+NADP+目目 录录 体内许多激素属寡肽或多肽体内许多激素属寡肽或多肽 神经肽神经肽(neuropeptide)2.多肽类激素及活性肽多肽类激素及活性肽目目 录录抗利尿素与催产素抗利尿素与催产素(9肽肽)、胰高血糖素、胰高血糖素(29肽)、肽)、脑啡肽脑啡肽(5肽)、肽)、降钙素降钙素(32肽)、肽)、ACTH(39肽)、肽)、胰岛素胰岛素(51肽)肽)
14、肌肽肌肽(2肽)、肽)、P物质(物质(10肽、属神经肽类)、肽、属神经肽类)、(31肽)肽)目目 录录蛋蛋 白白 质质 的的 分分 子子 结结 构构The Molecular Structure of Protein 第第 二二 节节目目 录录蛋白质的分子结构包括蛋白质的分子结构包括 一级结构一级结构(primary structure)二级结构二级结构(secondary structure)三级结构三级结构(tertiary structure)四级结构四级结构(quaternary structure)高级高级结构结构目目 录录.概念:概念:蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列蛋白质的
15、一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。顺序。一、蛋白质的一级结构一、蛋白质的一级结构.主要的化学键主要的化学键(主键主键)肽键肽键,有些蛋白质还包括二硫键。,有些蛋白质还包括二硫键。或.提示提示:一级结构是蛋白质:一级结构是蛋白质空间构象和特异空间构象和特异生物学功能的基础生物学功能的基础。它由遗传密码决定它由遗传密码决定,其上有其上有酶切位点酶切位点,一级结构可测定一级结构可测定,并不同种属间有同并不同种属间有同源性源性.目目 录录目目 录录二、蛋白质的空间结构二、蛋白质的空间结构指蛋白质分子空间的三维结构指蛋白质分子空间的三维结构,即立体即立体,空间的构象,在蛋白质分子中各元素围绕空间的构象
16、,在蛋白质分子中各元素围绕某些化学键进行旋转某些化学键进行旋转,从而形成各种空间排从而形成各种空间排布及相互关系布及相互关系(一一).).蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构1.1.肽键平面肽键平面(肽单元肽单元,肽平面肽平面,酰胺平面酰胺平面)是蛋白质的基本结构单位是蛋白质的基本结构单位.如图如图:目目 录录参与肽键的参与肽键的6个原子个原子C 1、C、O、N、H、C 2位于同一平位于同一平面,此同一平面上的面,此同一平面上的6个原子个原子构成了所谓的构成了所谓的肽单元肽单元(peptide unit)。目目 录录 2.2.二级结构的概念与基本形式二级结构的概念与基本形式A.A.概念概念:一条多
17、肽链中局部原子一条多肽链中局部原子的空间排佈的空间排佈B.B.二级结构的基本形式二级结构的基本形式(1 1)-螺旋螺旋 (-helix)(2 2)-折叠折叠 (-pleated sheet)(3 3)-转角转角 (-turn)(4 4)不规则卷曲不规则卷曲 (random coil)-螺旋螺旋目目 录录目目 录录主链原子构成螺旋的主体主链原子构成螺旋的主体,侧链侧链在其外部在其外部目目 录录折叠折叠 肽键平面呈伸展的锯齿状排列肽键平面呈伸展的锯齿状排列,形成的结构称形成的结构称折叠。折叠。常为两条或两条以上伸展的多肽链侧常为两条或两条以上伸展的多肽链侧向聚集在一起形成扇面状,故又称向聚集在一起
18、形成扇面状,故又称折叠片或折叠片或片层片层目目 录录目目 录录转角转角(turn)turn)肽链出现肽链出现1801800 0回折的转角处结构回折的转角处结构称为称为转角转角结构特征结构特征*第一个残基的第一个残基的C=OC=O与第四个与第四个残基的残基的N-HN-H形成形成氢键氢键*常见于球状蛋常见于球状蛋白质分子表面白质分子表面目目 录录环或卷曲结构环或卷曲结构 :无规卷曲是用来阐述没无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。有确定规律性的那部分肽链结构。:目目 录录.模体模体在许多蛋白质分子中,可发现二个或在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互三个具
19、有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,被称为接近,形成一个特殊的空间构象,被称为模体模体(motif)。目目 录录钙结合蛋白中结钙结合蛋白中结合钙离子的模体合钙离子的模体 锌指结构锌指结构 目目 录录(二二)、蛋白质的三级结构、蛋白质的三级结构氢键、氢键、离子键、疏水键离子键、疏水键等。等。2.主要的化学键主要的化学键(维系力)(维系力)一条多肽链中全部氨基酸残基一条多肽链中全部氨基酸残基(全部元素全部元素)的的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。包括排布位置。包括主链,側链主链,側链的全部内容的全部内容1.概念概
20、念 目目 录录目目 录录 肌红蛋白肌红蛋白(Mb)肌红蛋白为单肽链肌红蛋白为单肽链蛋白质,含蛋白质,含153个个氨基酸残基,它含氨基酸残基,它含有有8个个螺旋区,依螺旋区,依次称为次称为A到到H螺旋,螺旋,并含有并含有转角及环转角及环-卷曲等二级结构。卷曲等二级结构。目目 录录2.2.维系力维系力 亚基之间的结合力有亚基之间的结合力有疏水作用,疏水作用,以及氢键和离子键。以及氢键和离子键。(三)蛋白质的四级结构(三)蛋白质的四级结构(或蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚或蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的蛋白质的四级结构四级结
21、构。)1.1.概念概念 有些蛋白质分子含有二条或多条多有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链,每一条多肽链都有完整的三级结构,称肽链,每一条多肽链都有完整的三级结构,称为蛋白质的四级结构为蛋白质的四级结构.而每条多肽链被称为而每条多肽链被称为亚基亚基 (subunit)。目目 录录血红蛋白目目 录录第三节第三节 蛋白质的分类蛋白质的分类1 1根据蛋白质的形状分为:根据蛋白质的形状分为:纤维蛋白质。纤维蛋白质。如丝蛋白、角蛋白等。如丝蛋白、角蛋白等。球蛋白。球蛋白。如蛋清蛋白、酪蛋白等。如蛋清蛋白、酪蛋白等。2 2根据蛋白质的化学组成分为:根据蛋白质的化学组成分为:单纯蛋白质单纯蛋白质(其水解最终产
22、物是其水解最终产物是-氨基酸)。氨基酸)。结合蛋白质结合蛋白质(-氨基酸氨基酸 +非蛋白质(辅基)非蛋白质(辅基)。辅基为糖时称为糖蛋白;辅基为糖时称为糖蛋白;辅基为核酸时称为核蛋白;辅基为核酸时称为核蛋白;辅基为血红素时称为血红素蛋白等。辅基为血红素时称为血红素蛋白等。目目 录录第四节第四节 蛋白质结构与功能的关系蛋白质结构与功能的关系一、一、蛋白质的一级结构与功能的关系蛋白质的一级结构与功能的关系 二、二、蛋白质的空间结构与功能的关系蛋白质的空间结构与功能的关系目目 录录.一级结构是空间构象的基础一级结构是空间构象的基础 一、蛋白质一级结构与功能的关系一、蛋白质一级结构与功能的关系 牛核糖
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