-miRNA讲稿学生用-PPT课件.ppt
- 【下载声明】
1. 本站全部试题类文档,若标题没写含答案,则无答案;标题注明含答案的文档,主观题也可能无答案。请谨慎下单,一旦售出,不予退换。
2. 本站全部PPT文档均不含视频和音频,PPT中出现的音频或视频标识(或文字)仅表示流程,实际无音频或视频文件。请谨慎下单,一旦售出,不予退换。
3. 本页资料《-miRNA讲稿学生用-PPT课件.ppt》由用户(三亚风情)主动上传,其收益全归该用户。163文库仅提供信息存储空间,仅对该用户上传内容的表现方式做保护处理,对上传内容本身不做任何修改或编辑。 若此文所含内容侵犯了您的版权或隐私,请立即通知163文库(点击联系客服),我们立即给予删除!
4. 请根据预览情况,自愿下载本文。本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
5. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007及以上版本和PDF阅读器,压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- miRNA 讲稿 学生 PPT 课件
- 资源描述:
-
1、miRNA简介miRNA定义:微小微小RNA(microRNA,miRNA)是一种长度约为是一种长度约为22-28 nt的非编码小分子的非编码小分子RNA,miRNA通过与靶通过与靶mRNA 3UTR(Untranslated Regions,即非翻译即非翻译区,是区,是mRNA分子两端的非编码片段分子两端的非编码片段)完全或不完完全或不完全的互补结合,导致靶全的互补结合,导致靶mRNA降解或翻译抑制,降解或翻译抑制,从而调控靶基因的表达,影响细胞增殖、分化和从而调控靶基因的表达,影响细胞增殖、分化和凋亡凋亡.它们通过它们通过miRNA介导的特异性的基因沉默导致靶介导的特异性的基因沉默导致靶m
2、RNA降解及抑制蛋白质的合成调控转录后基因降解及抑制蛋白质的合成调控转录后基因表达水平。表达水平。miRNA对细胞的增殖、分化和凋亡有对细胞的增殖、分化和凋亡有重要的调节作用。重要的调节作用。miRNA定义:在基因组中有被翻译成蛋白质的区域在基因组中有被翻译成蛋白质的区域也有非翻译的区域也有非翻译的区域而翻译区域仅占而翻译区域仅占全基因组的全基因组的1 1 4 4 。为何存在大部。为何存在大部分非翻译区域呢?分非翻译区域呢?m i R N A m i R N A 是来自非翻译区域的单是来自非翻译区域的单 链链R N A R N A,存在于细胞内部。是基因存在于细胞内部。是基因调控的重要分子。调
3、控的重要分子。miRNA*定义 RNase-III酶酶Dicer将将pre-microRNA剪剪切成不完全配对的双链切成不完全配对的双链RNA双体双体(miRNA:miRNA*),即成熟即成熟microRNA和其互补序列所组成的二和其互补序列所组成的二聚体,起作用的是聚体,起作用的是miRNA,选择性整合选择性整合RISC中设别靶基因而起作用,而中设别靶基因而起作用,而miRNA*会降解。会降解。miRNA和siRNA区别 把疾病相关把疾病相关R N A R N A 作为靶点的药物中,作为靶点的药物中,s i s i R N A R N A 药物药物1515个已经进入实质性的临床研个已经进入实
4、质性的临床研究。究。s i R N A s i R N A 为双链为双链R N A R N A,具有与靶具有与靶点点R N A R N A 互补的结构,完全互补靶向抑制互补的结构,完全互补靶向抑制基因表达,长度与基因表达,长度与m i R N Am i R N A类似,类似,约为约为19-25 19-25 个碱基对。个碱基对。s i R N A s i R N A 在体内由酶在体内由酶解旋为单链解旋为单链 与靶点与靶点mR N A mR N A 结合后降解。结合后降解。s i R N A s i R N A 和和m i R N A m i R N A 都会抑制都会抑制m R N A m R N
5、 A 向蛋白质的翻译向蛋白质的翻译 但是其作用方式却差别但是其作用方式却差别颇大。颇大。一般认为一般认为siRNA siRNA 的特异性很高的特异性很高 不会不会发生结合于非目标发生结合于非目标mR N A mR N A 的脱靶情况的脱靶情况(off(off-targeting)-targeting)。但是。但是 研究发现研究发现miRNAmiRNA的的结合能力存在摆动结合能力存在摆动 1 1 个个miRNAmiRNA可抑制多可抑制多个个mRNA mRNA 的功能。研究人员预测在的功能。研究人员预测在miRNA miRNA 靶靶点药物开发方面点药物开发方面,这一特点具有重要意义这一特点具有重要
6、意义,因此因此miRNAmiRNA的作用效果可能更高,但是作用的作用效果可能更高,但是作用机理更复杂,对基因调控的网络作用往往机理更复杂,对基因调控的网络作用往往难以研究清楚。难以研究清楚。miRNA作用方式 miRNA对其功能靶点的最低要求是,至少7个碱基与5端互补结合,就可调控其靶基因。miRNA与靶mRNA的作用方式有两种。当两者完全互补时,miRNA的作用方式与RNA干扰相似,即与完全互补的同源mRNA配对结合,导致靶mRNA降解。而当miRNA与靶mRNA不完全互补时,miRNA则通过与靶mRNA的3端非翻译区结合,阻遏转录后翻译。由于许多miRNA与靶mRNA并不完全互补,所以主要
7、的作用模式是转录后的翻译阻遏(调控)。张辰宇张辰宇:吃什么补什么吃什么补什么 发现植物的微小核糖核酸(发现植物的微小核糖核酸(microRNA)可以通过日常食)可以通过日常食物摄取的方式进入人体血液和组织器官。并且,一旦进入物摄取的方式进入人体血液和组织器官。并且,一旦进入体内,它们将通过调控人体内靶基因表达的方式影响人体体内,它们将通过调控人体内靶基因表达的方式影响人体的生理功能,进而发挥生物学作用。这一研究成果公布在的生理功能,进而发挥生物学作用。这一研究成果公布在Cell research杂志上。杂志上。生物通生物通 ebiotrade 这一研究成果公布后吸引了媒体关注,美国这一研究成果
8、公布后吸引了媒体关注,美国大众科学大众科学网站对此也进行了报道,称研究人员发现蔬菜里的核糖核网站对此也进行了报道,称研究人员发现蔬菜里的核糖核酸酸(RNA)在食入后会进入体内循环的血液,而且一旦进入在食入后会进入体内循环的血液,而且一旦进入我们体内,就能改变我们的基因表达。我们体内,就能改变我们的基因表达。证明植物证明植物miRNA可能是食物中的可能是食物中的“第七种营养成分第七种营养成分”(其他六种分别是水、蛋白质、脂肪酸、碳水化合物、维(其他六种分别是水、蛋白质、脂肪酸、碳水化合物、维他命和稀有元素);他命和稀有元素);张辰宇张辰宇:微小微小RNA的人体之旅的人体之旅 在实验中,研究人员给
9、小鼠喂的是生米,而人类日常进食在实验中,研究人员给小鼠喂的是生米,而人类日常进食吃的是熟米,食物经过加热之后是否会破坏其微小吃的是熟米,食物经过加热之后是否会破坏其微小RNA呢?呢?张辰宇指出,煮过的米饭中仍然含有很多微小张辰宇指出,煮过的米饭中仍然含有很多微小RNA,经过,经过油炸才能破坏掉大部分的微小油炸才能破坏掉大部分的微小RNA。他们还发现,中药在经过煎煮之后,药汤里的微小他们还发现,中药在经过煎煮之后,药汤里的微小RNA的的浓度很高。给小鼠喂药之后浓度很高。给小鼠喂药之后24小时,就发现小鼠肺部相应小时,就发现小鼠肺部相应的微小的微小RNA浓度增高。他们认为,这些发现为在传统的中浓度
10、增高。他们认为,这些发现为在传统的中草药中发现一类全新的活性分子提供了依据。草药中发现一类全新的活性分子提供了依据。对于生物学来说,更大的意义可能在于,这些研究为我们对于生物学来说,更大的意义可能在于,这些研究为我们理解跨理解跨“界界”的相互作用提供了新的线索。的相互作用提供了新的线索。“动物、植物动物、植物之间如何的借着微小之间如何的借着微小RNA互相调控的?大家说不定共进化互相调控的?大家说不定共进化(co-evolution)了。)了。”张辰宇说。张辰宇说。miRNA网站 miRNA发挥对约3 0 人类蛋白质的表达调节作用。序列分析表明,至少有1/3的人类基因与miRNA调控相关,而且越
11、来越多的试验证据表明,miRNA还有很多功能未被发现。MiRNA最早在1993年在线虫体内发现。迄今在人体已经发现并命名的miRNA 超过了1万 个。除了早期发现的let一7等保留命名外,一般命名为miR-数字。见网站:mirbase.org/starBase:一个高通量实验数据CLIP-Seq(或称为HITS-CLIP)和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。网址:starbase.sysu.edu/Tarbase:一个收集已被实验验证的microRNA靶标数据库。网址:microrna.gr/tarbase/miRecor
12、ds:一个整合的microRNA靶标数据库。整合多个靶标预测软件的调控关系。网址:mirecords.biolead.org/targetScan:基于靶mRNA序列的进化保守等特征搜寻动物的microRNA靶基因。是预测microRNA靶标假阳性率较低的软件。而且是microRNA领域大牛Bartel实验室开发的。网址targetscan.org/PicTar:基于microRNA或microRNA靶标联合作用等特征开发的搜寻动物的microRNA靶基因的软件,假阳性率也较低。是microRNA领域大牛Rajewsky实验室开发的。该文章位列miRNA相关文章引用Top5。网址:pictar
13、.mdc-berlin.de/PITA:基于靶位点的可接性(target-site accessibility)和自由能预测microRNA的靶标。是著名的生物信息学家Segal实验室开发的。网址:genie.weizmann.ac.il/pubs/mir07/mir07_data.html RNA22:基于序列特征预测microRNA的结合位点。是几个流行的microRNA靶标预测软件的其中一个。IBM公司的研究团队开发的。网址:cbcsrv.watson.ibm/rna22.html miRanda和microRNA.org:是著名的Memorial Sloan-Kettering 癌症研
14、究中心的研究人员开发的软件和数据库。miRanda的最新版本又叫mirSVR。网址:MicroCosm:EMBL-EBI的Enright 实验室开发的microRNA靶标数据库。网址:miRTarBase:整合实验证实的microRNA靶标的数据库。网址:miRGator v2.0:整合microRNA表达、靶标和疾病相关信息的数据库。网址:MiRNAMap:动物的microRNA基因及其靶标的数据库。网址:miRDB:动物microRNA靶标预测和功能注释数据库。网址:RNAhybrid:一个基于miRNA-target配对自由能预测microRNA的靶标的软件。网址:miRGen:micr
15、oRNA基因和microRNA靶标数据库。网址:m i R N A与肿瘤研究 m i R N A 的研究普遍集中于监测肿瘤的发生发展的研究普遍集中于监测肿瘤的发生发展和靶向肿瘤治疗。和靶向肿瘤治疗。(1)m i R N A 在肿瘤的发生发展中具有重要的在肿瘤的发生发展中具有重要的作用,作用,参与了肿瘤发生发展的各个阶段。结肠癌参与了肿瘤发生发展的各个阶段。结肠癌发生发展的各个阶段,发生发展的各个阶段,经历了不典型增生、腺瘤、经历了不典型增生、腺瘤、癌及肿瘤转移等一系列变化,癌及肿瘤转移等一系列变化,每一个阶段都有相每一个阶段都有相应的基因发生改变,应的基因发生改变,同时也有调控这些基因的同时也
16、有调控这些基因的m i R N A 发生变化。事实上,发生变化。事实上,m i R N A 与基因之与基因之间相互调控,共同突破平衡,间相互调控,共同突破平衡,才导致肿瘤的发生才导致肿瘤的发生发展。作为肿瘤发生的重要信号通路。发展。作为肿瘤发生的重要信号通路。m i R N A与肿瘤研究 (2)m i R N A 具有很好的组织特异性。经筛查具有很好的组织特异性。经筛查检测检测4 8 个个m i R N A 确定肿瘤的组织来源准确率确定肿瘤的组织来源准确率达达9 0 。(3)m i R N A 具有肿瘤发生的阶段特异性,具有肿瘤发生的阶段特异性,同一同一种肿瘤在发生发展不同分期阶段具有不同的种
17、肿瘤在发生发展不同分期阶段具有不同的m i R N A 表达谱。表达谱。(4)m i R N A 分子较小,分子较小,在石蜡包埋的组织中在石蜡包埋的组织中较较m R N A 更为稳定,更为稳定,对于石蜡保存的组织检测对于石蜡保存的组织检测m i R N A 将更为准确。将更为准确。(5)最近有报道证实血清或者血浆中游离最近有报道证实血清或者血浆中游离m i R N A 也是有价值的肿瘤监测指标,也是有价值的肿瘤监测指标,能够稳定地被检能够稳定地被检测并且提示肿瘤状态,使测并且提示肿瘤状态,使m i R N A 作为新的肿瘤作为新的肿瘤标志物具有较好的应用前景。标志物具有较好的应用前景。m i
18、R N A与肿瘤研究 部分肿瘤与miRNA变化(2倍高,0.5低)癌 症 类 型 MiRNA过 高 表 达 MiRNA过 少 表 达 脑 肿 瘤 MiR-10b,21,221 MiR-128,181 乳 腺 癌 MiR-21,155 MiR-125,145 肺 癌 MiR17-3p,93,106a,155 Let-7,miR-145 大 肠 癌 MiR-21,31,96,135b,183 MiR-133b,143,145 肝 细 胞 癌 MiR-18,224 MiR-122,125a,195,199a,200a 胰 腺 癌 MiR-21,103,107,196a MiR-204 B淋 巴 细
19、胞 白 血 病 MiR-21,23a,23b,24-2,MiR-15a,16,29c,192,222 146,150,155,181a,221 Table 2.miRNAs differentially expressed in SGC7901/VCR cell line and SGC7901 cell line miRNA decreased Fold change miRNA increased Fold change hsa-let-7d _3.97 hsa-miR-129-5p 2.07 hsa-let-7f _7.58 hsa-miR-182-3p 2.01 hsa-let-7g
20、_9.28 hsa-miR-494 2.77 hsa-miR-101 _9.22 hsa-miR-503 2.65 hsa-miR-105 _4.59 hsa-miR-565 2.55 hsa-miR-10a _12.77 hsa-miR-602 2.14 hsa-miR-125b _4.40 hsa-miR-663 3.39 hsa-miR-181a _14.31 hsa-miR-668 2.30 hsa-miR-181b _2.16 hsa-miR-801 3.09 hsa-miR-181c _6.70 hsa-miR-886-3p 3.21 hsa-miR-181d _26.56 hsa
21、-miR-886-5p 3.62 hsa-miR-15a-3p _5.41 hsa-miR-15b _34.04 hsa-miR-16 _7.99 hsa-miR-216a _22.43 hsa-miR-220 _32.49 hsa-miR-33a _35.58 hsa-miR-451 _9.80 hsa-miR-497 _7.86 hsa-miR-507 _16.05 hsa-miR-543 _4.90 hsa-miR-612 _43.06 hsa-miR-758 _6.96 hsa-miR-96 _8.28 A549/T与A549细胞miRNA芯片的qPCR验证miRNA在肿瘤治疗中的希望
22、miRNAsmiRNAs在肿瘤发生发展中所起的重在肿瘤发生发展中所起的重要作用给新型抗癌药物的开发带来要作用给新型抗癌药物的开发带来了希望。改变肿瘤中了希望。改变肿瘤中miRNAsmiRNAs的表达的表达量被视为一种新的治疗策略,主要量被视为一种新的治疗策略,主要包括引入抑癌基因性包括引入抑癌基因性miRNAsmiRNAs、敲除、敲除或削减癌基因性或削减癌基因性miRNAsmiRNAs早期发现的miRNA miRNA可以作为肿瘤抑制因子或者癌基因,在癌症中发挥其功能,let一7在肺癌中表达降低,是肿瘤预后较差的生物标记。在体外转染let一7g可以抑制肿瘤细胞增殖,促进肿瘤细胞死亡。在免疫缺陷小
23、鼠体内,let-7g可以抑制肿瘤形成。let-7对一些癌基因(如Kras、HMGA2)以及抑癌基因(如BRCA1)均可起到重要的调节作用,miR-200在肿瘤表达低,生存率低,表达高,生存率高。作为肿瘤抑制因子 miRmiR一一122122可以抑制癌细胞的某些特性,例可以抑制癌细胞的某些特性,例如克隆存活、不依赖支持物生长、转移、如克隆存活、不依赖支持物生长、转移、侵袭、上皮侵袭、上皮-间质转化、裸鼠成瘤。这些结间质转化、裸鼠成瘤。这些结果表明,在肝脏中果表明,在肝脏中miR-122miR-122作为肿瘤抑制因作为肿瘤抑制因子行使其功能。在体外子行使其功能。在体外miR-122miR-122可
24、以直接抑可以直接抑制内皮细胞生成血管。在鼠肝细胞癌模型制内皮细胞生成血管。在鼠肝细胞癌模型中,证实了中,证实了miR-122miR-122以以ADAM17ADAM17为靶点发挥其为靶点发挥其抑瘤活性。抑瘤活性。作用机理 miR-143miR-143和和miR-145miR-145在结肠腺瘤形成早期,在结肠腺瘤形成早期,表达下调,促使腺瘤形成。对其表达下调,促使腺瘤形成。对其3 3端突起端突起 处进行化学修饰,使其活性增强、抵抗核处进行化学修饰,使其活性增强、抵抗核酸酶。这种经化学修饰后的酸酶。这种经化学修饰后的miR-143miR-143复合物复合物可以抑制人可以抑制人DLDDLD一一1 1结
25、肠癌细胞移植瘤形成,结肠癌细胞移植瘤形成,有可能成为治疗结肠癌的有可能成为治疗结肠癌的RNARNA药物药物 作为癌基因 m i R-2 1 m i R-2 1 是目前唯一的在几乎所有肿瘤中表是目前唯一的在几乎所有肿瘤中表达上调的达上调的m i R N A m i R N A,其参与了肿瘤细胞的增殖、其参与了肿瘤细胞的增殖、迁移、浸润以及肿瘤的血管生成等多个环节,并迁移、浸润以及肿瘤的血管生成等多个环节,并且在体外已经证实与多个抗肿瘤药物的敏感性有且在体外已经证实与多个抗肿瘤药物的敏感性有关。目前认为,关。目前认为,m i R-2 1 m i R-2 1 调控肿瘤细胞的多种调控肿瘤细胞的多种药物
展开阅读全文