-第7章真核基因表达调控课件.ppt
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- 章真核 基因 表达 调控 课件
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1、真核基因表达调控的一般规律真核基因表达调控的一般规律 真核生物的基因组 真核生物基因表达调控的特点和种类 真核生物DNA水平上的基因表达调控 真核生物转录水平上的基因表达调控 真核基因转录后水平上的调控Contents真核基因表达调控的层次真核基因表达调控的层次 DNA和染色体水平的调控和染色体水平的调控 基因扩增、基因丢失、基因重排、基因修基因扩增、基因丢失、基因重排、基因修 饰、基因封闭等。饰、基因封闭等。转录水平的调控转录水平的调控 转录的起始、延伸和终止等。转录的起始、延伸和终止等。转录后转录后RNA前体加工及转运的调控前体加工及转运的调控 基因在核中转录而在胞浆中翻译,转录后基因在核
2、中转录而在胞浆中翻译,转录后需经剪切、拼接、编辑、修饰和转运等过程。需经剪切、拼接、编辑、修饰和转运等过程。翻译水平的调控翻译水平的调控。翻译后水平的调控翻译后水平的调控 翻译产物剪切、修饰、构象形成、转运和翻译产物剪切、修饰、构象形成、转运和装配等。装配等。mRNA降解的调控降解的调控 细胞内有控制细胞内有控制mRNA寿命的机制。寿命的机制。和原核相比真核基因表达调控的一些特点和原核相比真核基因表达调控的一些特点相同点:相同点:都具有转录水平的调控和转录后水平的调控都具有转录水平的调控和转录后水平的调控,并且也以,并且也以转录水平转录水平的调控最为重要;的调控最为重要;真核结构基因的上游和下
3、游也存在着许多特真核结构基因的上游和下游也存在着许多特异的调控成分,并依靠特异蛋白因子与这些调异的调控成分,并依靠特异蛋白因子与这些调控成分的结合与否控制着基因是否转录控成分的结合与否控制着基因是否转录不同点不同点:原核的染色质是裸露的原核的染色质是裸露的DNADNA,而真核的,而真核的染色质则是由染色质则是由DNADNA与组蛋白紧密结合形成的与组蛋白紧密结合形成的核小体。原核中核小体。原核中染色质染色质的结构对基因的表的结构对基因的表达没有明显的达没有明显的调控调控作用,而在真核中这种作用,而在真核中这种作用是明显的。作用是明显的。和原核相比真核基因表达调控的一些特点和原核相比真核基因表达调
4、控的一些特点不同点:不同点:在原核基因转录的调控中,既有激活物的在原核基因转录的调控中,既有激活物的调控,也有阻遏物的调控,二者等同重要。调控,也有阻遏物的调控,二者等同重要。在真核生物中虽然也有正调控成分和负调在真核生物中虽然也有正调控成分和负调控成分,但迄今已知的主要是控成分,但迄今已知的主要是正调控正调控和原核相比真核基因表达调控的一些特点和原核相比真核基因表达调控的一些特点不同点:不同点:原核基因转录和翻译是偶联的,而真核生物的转录原核基因转录和翻译是偶联的,而真核生物的转录和翻译不是偶联的,和翻译不是偶联的,RNARNA在细胞核中合成,只有经在细胞核中合成,只有经转运穿过核膜,到达细
5、胞质后,才能被翻译成蛋白转运穿过核膜,到达细胞质后,才能被翻译成蛋白质。使得真核基因的表达有质。使得真核基因的表达有多种转录的调控机制多种转录的调控机制。如转录的如转录的RNARNA还必须经过加工形成成熟的还必须经过加工形成成熟的RNARNA才能行才能行使各自的功能使各自的功能和原核相比真核基因表达调控的一些特点和原核相比真核基因表达调控的一些特点不同点:不同点:原核生物细胞内基因表达基本一致,且对于外原核生物细胞内基因表达基本一致,且对于外界环境条件变化的反应也基本相同。界环境条件变化的反应也基本相同。真核生物大都是多细胞的复杂有机体,在个体真核生物大都是多细胞的复杂有机体,在个体发育中由一
6、个受精卵逐步分化形成不同的细胞类发育中由一个受精卵逐步分化形成不同的细胞类型和各种组织,分化是不同基因表达的结果,型和各种组织,分化是不同基因表达的结果,在在不同发育阶段和不同细胞类型中,基因的时空表不同发育阶段和不同细胞类型中,基因的时空表达受到严密的调控。达受到严密的调控。和原核相比真核基因表达调控的一些特点和原核相比真核基因表达调控的一些特点 真核基因表达调控的最显著特征是能在特定时间和特定的细胞中激活特定的基因,从而实现“预定”的、有序的、不可逆转的分化、发育过程,并使生物的组织和器官在一定的环境条件范围内保持正常功能。真核生物基因调控,根据其性质可分为两大类:真核生物基因调控,根据其
7、性质可分为两大类:第一类是瞬时调控或称可逆性调控,第一类是瞬时调控或称可逆性调控,它相当于原它相当于原核细胞对环境条件变化所做出的反应,包括某种底物核细胞对环境条件变化所做出的反应,包括某种底物或激素水平升降及细胞周期不同阶段中酶活性和浓度或激素水平升降及细胞周期不同阶段中酶活性和浓度的调节。的调节。第二类是发育调控或称不可逆调控,第二类是发育调控或称不可逆调控,是真核基因是真核基因调控的精髓部分,它决定了真核细胞生长、分化、发调控的精髓部分,它决定了真核细胞生长、分化、发育的全部进程。育的全部进程。和原核相比真核基因表达调控的一些特点和原核相比真核基因表达调控的一些特点一、真核基因组结构特点
8、 真核基因组结构庞大真核基因组结构庞大 3109bp、染色质、核膜、染色质、核膜 单顺反子单顺反子 基因不连续性基因不连续性 断裂基因(断裂基因(interrupted gene)、)、内含子内含子(intron)、外显子外显子(exon)非编码区较多非编码区较多 多于编码序列多于编码序列(9:1)含有大量重复序列含有大量重复序列第一节 真核生物的基因组 基因组很小,大多只有一条染色体 结构简炼 存在转录单元多顺反子原核生物基因组结构特点 有重叠基因二、真核细胞与原核细胞在基因转录、翻译及DNA的空间结构方面存在以下几个方面的差异 试说明真核细胞与原核细胞在基因转录,翻译及DNA的空间结构方面
9、存在的主要差异,表现在哪些方面?在真核细胞中,一条成熟的mRNA链只能翻译出一条多肽链,很少存在原核生物中常见的多基因操纵子形式。真核细胞DNA与组蛋白和大量非组蛋白相结合,只有一小部分DNA是裸露的。高等真核细胞DNA中很大部分是不转录的,大部分真核细胞的基因中间还存在不被翻译的内含子。真核生物能够有序地根据生长发育阶段的需要进行DNA片段重排,还能在需要时增加细胞内某些基因的拷贝数。在真核生物中,基因转录的调节区相对较大,它在真核生物中,基因转录的调节区相对较大,它们可能远离启动子达几百个甚至上千个碱基对,这些们可能远离启动子达几百个甚至上千个碱基对,这些调节区一般通过改变整个所控制基因调
10、节区一般通过改变整个所控制基因5上游区上游区DNA构构型来影响它与型来影响它与RNA聚合酶的结合能力。聚合酶的结合能力。在原核生物中,转录的调节区都很小,大都位于启在原核生物中,转录的调节区都很小,大都位于启动子上游不远处,调控蛋白结合到调节位点上可直接动子上游不远处,调控蛋白结合到调节位点上可直接促进或抑制促进或抑制RNA聚合酶与它的结合。聚合酶与它的结合。真核生物的RNA在细胞核中合成,只有经转运穿过核膜,到达细胞质后,才能被翻译成蛋白质,原核生物中不存在这样严格的空间间隔。许多真核生物的基因只有经过复杂的成熟和剪接过程,才能顺利地翻译成蛋白质。三、基本概念(一)基因家族(gene fam
11、ily)真核生物的基因组中有很多来源相同、结构相似、功能相关的基因,将这些基因称为基因家族。同一家族中的成员有时紧密地排列在一起,成为一个基因簇(gene cluster)。如:编码组蛋白、免疫球蛋白和血红蛋白的基因都属于基因家族1、简单多基因家族简单多基因家族中的基因一般以串联方式前后相连。The eukaryotic ribosomal DNA repeating unit2、复杂多基因家族 复杂多基因家族一般由复杂多基因家族一般由几个相关基因家族几个相关基因家族构成,基构成,基因家族之间由间隔序列隔开,并作为独立的转录单因家族之间由间隔序列隔开,并作为独立的转录单位。现已发现存在不同形式
12、的复杂多基因家族。位。现已发现存在不同形式的复杂多基因家族。Organization of histone genes in the animal genome(二)断裂基因 基因的编码序列在DNA分子上是不连续的,为非编码序列所隔开,其中编码的序列称为外显子,非编码序列称内含子。外显子(Exon):真核细胞基因DNA中的编码序 列,这些序列被转录成RNA并进而翻译为蛋白质。内含子(Intron):真核细胞基因DNA中的间插序列,这些序列被转录成RNA,但随即被剪除而不翻译。1、外显子与内含子的连接区 指外显子和内含子的交界或称边界序列,它有两个重要特征:内含子的两端序列之间没有广泛的同源性
13、连接区序列很短,高度保守,是RNA剪接的信号序列 5GTAG 32、外显子与内含子的可变调控 组成型剪接:一个基因的转录产物通过剪接只能产生一种成熟的mRNA。选择性剪接:同一基因的转录产物由于不同的剪接方式形成不同mRNA。PS 外显子 S PL 外显子 L 外显子 2 外显子 3 DNA 50b 2800bp 161bp 4500bp 205bp 327bp 初始转录本:在唾腺中转录 成熟 mRNA:1663nt 初始转录本:在肝中转录 成熟 mRNA:1773nt 图 18-57 小鼠淀粉酶(amy)基因利用不同启动子产生两个不同的 mRNA(三)假基因是基因组中因突变而失活的基因,无蛋
14、白质产物。一般是启动子出现问题。真核生物的基因组 真核生物基因表达调控的特点和种类 真核生物DNA水平上的基因表达调控 真核生物转录水平上的基因表达调控 真核基因转录后水平上的调控Contents第二节 真核生物基因表达调控的特点和种类一、真核生物基因表达调控的特点1、RNA聚合酶 2、多层次3、个体发育复杂4、活性染色体结构变化:对核酸酶敏感、DNA拓扑结构变化、DNA碱基修饰变化、组蛋白变化 5、正性调节占主导6、转录与翻译间隔进行 7、转录后修饰、加工 根据其性质可分为两大类:一是一是瞬时调控或称为可逆性调控瞬时调控或称为可逆性调控,它相当于原核细胞,它相当于原核细胞对环境条件变化所做出
15、的反应。瞬时调控包括某种底对环境条件变化所做出的反应。瞬时调控包括某种底物或激素水平升降时,及细胞周期不同阶段中酶活性物或激素水平升降时,及细胞周期不同阶段中酶活性和浓度的调节。和浓度的调节。二是二是发育调控或称不可逆调控发育调控或称不可逆调控,是真核基因调控的精,是真核基因调控的精髓部分,它决定了真核细胞生长、分化、发育的全部髓部分,它决定了真核细胞生长、分化、发育的全部进程。进程。根据基因调控在同一事件中发生的先后次序又可分为:DNA水平调控水平调控转录水平调控转录水平调控转录后水平调转录后水平调控控翻译水平调控翻译水平调控蛋白质加工水平的调控蛋白质加工水平的调控二、真核生物基因表达调控的
16、种类:真核生物的基因组 真核生物基因表达调控的特点和种类 真核生物DNA水平上的基因表达调控 真核生物转录水平上的基因表达调控 真核基因转录后水平上的调控Contents第三节 真核生物DNA水平上的基因表达调控基因丢失基因丢失基因扩增基因扩增基因重排基因重排DNA甲基化状态与调控甲基化状态与调控染色体结构与调控染色体结构与调控一、基因丢失:一、基因丢失:在细胞分化过程中,可以通过丢失掉某些基因而去除这些在细胞分化过程中,可以通过丢失掉某些基因而去除这些基因的活性。某些原生动物、线虫、昆虫和甲壳类动物在基因的活性。某些原生动物、线虫、昆虫和甲壳类动物在个体发育中,许多体细胞常常丢失掉整条或部分
17、的染色体,个体发育中,许多体细胞常常丢失掉整条或部分的染色体,只有将来分化产生生殖细胞的那些细胞一直保留着整套的只有将来分化产生生殖细胞的那些细胞一直保留着整套的染色体。染色体。目前,在高等真核生物(包括动物、植物)中尚未发现类目前,在高等真核生物(包括动物、植物)中尚未发现类似的基因丢失现象。似的基因丢失现象。二、基因扩增:二、基因扩增:基因扩增是指某些基因的拷贝数专一性增大的现象,基因扩增是指某些基因的拷贝数专一性增大的现象,它使得细胞在短期内产生大量的基因产物以满足生长它使得细胞在短期内产生大量的基因产物以满足生长发育的需要,是基因活性调控的一种方式。发育的需要,是基因活性调控的一种方式
18、。如如非洲爪蟾非洲爪蟾在卵裂期和胚胎期需大量蛋白质,在卵裂期和胚胎期需大量蛋白质,rDNArDNA原原有拷贝为有拷贝为500500个,在卵母细胞发育过程中,由于个,在卵母细胞发育过程中,由于rDNArDNA的扩增使核仁数达几百个。的扩增使核仁数达几百个。rDNArDNA的拷贝数可由原来单的拷贝数可由原来单个核仁中的个核仁中的500500个扩增到个扩增到2 210106 6个个 将一个基因从远离启动子的地方移到距它很近的位将一个基因从远离启动子的地方移到距它很近的位点从而启动转录,这种方式被称为点从而启动转录,这种方式被称为基因重排基因重排。非定向重排非定向重排 例如转座子在染色体上的移动,转座
19、子的插入可激例如转座子在染色体上的移动,转座子的插入可激活或抑制某些基因。如顺向末端重复序列的转座可活或抑制某些基因。如顺向末端重复序列的转座可能导致某些片段的缺失而使启动子邻近结构基因而能导致某些片段的缺失而使启动子邻近结构基因而使其转录。使其转录。定向重排与变换定向重排与变换 定向重排可使一个基因从远离其启动子的位置移到定向重排可使一个基因从远离其启动子的位置移到启动子附近位点而被启动。启动子附近位点而被启动。如小鼠免疫球蛋白结构基因的表达。如小鼠免疫球蛋白结构基因的表达。三、基因重排:三、基因重排:四、四、DNA的甲基化与基因调控:的甲基化与基因调控:1 1、DNADNA的甲基化的甲基化
20、 DNA DNA甲基化能关闭甲基化能关闭某些基因的活性某些基因的活性 X X染色体上染色体上DNADNA的的高度甲基化可引起高度甲基化可引起X X染色体的失活。染色体的失活。研究证实,研究证实,CpGCpG二二核苷酸中胞嘧啶的核苷酸中胞嘧啶的甲基化导致了人体甲基化导致了人体1 13 3以上由于碱基转以上由于碱基转换而引起的遗传病换而引起的遗传病。真核生物细胞内存在两种甲基化酶活性:日常型甲基转移酶 从头合成型甲基转移酶 2 2、DNADNA甲基化抑制基因转录的机理甲基化抑制基因转录的机理DNA甲基化导致某些区域DNA构象变化,从而影响了蛋白质与DNA的相互作用,抑制了转录因子与启动区DNA的结
21、合效率。甲基化达到一定程度时会发生从常规的B-DNA到Z-DNA的转变。由于Z-DNA结构收缩,螺旋加深,使许多蛋白质因子赖以接合的元件缩入小沟而不利于基因转录的起始。启动子启动子DNADNA分子上分子上的的甲基化密度甲基化密度与基因与基因转录受抑制的程度密转录受抑制的程度密切相关。切相关。对于弱启动子来说,稀少的甲基化就能使其完全失去转对于弱启动子来说,稀少的甲基化就能使其完全失去转录活性。录活性。当这一类启动子被增强时当这一类启动子被增强时(带有增强子带有增强子),即使不去甲基,即使不去甲基化也可以恢复其转录活性。化也可以恢复其转录活性。若进一步提高甲基化密度,即使增强后的启动子仍无转若进
22、一步提高甲基化密度,即使增强后的启动子仍无转录活性。录活性。DNA甲基化还提高了该位点的突变频率甲基化还提高了该位点的突变频率嘧啶嘧啶(Pyrimidines)(Pyrimidines)胸腺嘧啶胸腺嘧啶胞嘧啶胞嘧啶由于由于CGCG甲基化增加了胞嘧啶残基突变的甲基化增加了胞嘧啶残基突变的可能性,可能性,5-mC 5-mC 也作为内源性诱变剂或也作为内源性诱变剂或致癌因子调节基因表达致癌因子调节基因表达五、染色质结构与基因表达调控:五、染色质结构与基因表达调控:按功能状态的不同可将染色质分为按功能状态的不同可将染色质分为活性染色质和非活性染活性染色质和非活性染色质色质,所谓活性染色质是指具有转录活
23、性的染色质;非活,所谓活性染色质是指具有转录活性的染色质;非活性染色质是指没有转录活性的染色质。性染色质是指没有转录活性的染色质。活性染色质由于核小体构型发生构象的改变,往往具有疏活性染色质由于核小体构型发生构象的改变,往往具有疏松的染色质结构从而便于转录调控因子与顺式调控元件结松的染色质结构从而便于转录调控因子与顺式调控元件结合和合和RNARNA聚合酶在转录模板上滑动。聚合酶在转录模板上滑动。活性染色质真核细胞中真核细胞中基因转录的模板是染色质基因转录的模板是染色质而不是裸而不是裸露的露的DNA,因此染色质呈疏松或紧密结构,即,因此染色质呈疏松或紧密结构,即是否处于活化状态是决定是否处于活化
24、状态是决定RNA聚合酶能否有效聚合酶能否有效行使转录功能的关键。行使转录功能的关键。活性染色质的主要特点在结构上:在结构上:活性染色质上具有DNaseI超敏感位点活性染色质上具有基因座控制区活性染色质上具有核基质结合区(MAR序列)染色质结构对转录的影响染色质结构对转录的影响 转录发生之前,染色质常常在特定的区域转录发生之前,染色质常常在特定的区域被解旋或松弛,形成自由被解旋或松弛,形成自由DNADNA。这种变化可能。这种变化可能包括核小体结构的消除或改变,包括核小体结构的消除或改变,DNADNA本身局部本身局部结构的变化,导致结构基因暴露,促进转录因结构的变化,导致结构基因暴露,促进转录因子
25、与启动区子与启动区DNADNA的结合,从而使基因转录。的结合,从而使基因转录。真核生物的基因组 真核生物基因表达调控的特点和种类 真核生物DNA水平上的基因表达调控 真核生物转录水平上的基因表达调控 真核基因转录后水平上的调控Contents第四节 真核生物转录水平上的基因表达调控原核生物基因表达以操纵子为单位启动或关闭结构基因转录。转录的调控区很小,调控蛋白结合到调节位点上可直接促进或抑制RNA聚合酶的结合而调控转录。真核生物基因组中无操纵子结构。基因转录的调节区相对较大,转录调控是通过顺式作用元件和反式作用因子的相互作用实现的。“基因”的分子生物学定义:产生一条多肽链或功能RNA所必需的全
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