第二次课第二章DNA结构和染色体课件.ppt
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- 第二次 第二 DNA 结构 染色体 课件
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1、n 第一节第一节 DNA的结构的结构n 第二节第二节 染色体染色体n 第三节第三节 DNA的复制的复制n 第四节第四节 DNA的复制特点的复制特点n 第五节第五节 DNA的修复的修复n 第六节第六节 DNA的转座的转座第二章第二章 染色体与染色体与DNA遗传物质的本质遗传物质的本质 一、一、DNA携带两类不同的遗传信息携带两类不同的遗传信息 1 1、遗传物质必须具有的特性遗传物质必须具有的特性 DNA DNA的特征的特征 a a、贮存并表达遗传信息、贮存并表达遗传信息 各异的碱基序列储存大量的遗各异的碱基序列储存大量的遗 传信息传信息1kb DNA1kb DNA序列序列4 410001000
2、种遗传信息种遗传信息 b b、能把信息传递给子代、能把信息传递给子代 DNA DNA的复制是其表达和的复制是其表达和传递遗传信息的基础传递遗传信息的基础 c c、物理和化学性质稳定、物理和化学性质稳定 生理状态下物理、化学性质生理状态下物理、化学性质 稳定稳定 d d、具有遗传变化的能力、具有遗传变化的能力 有突变和修复能力,可稳定遗有突变和修复能力,可稳定遗 传是生物进化的基础传是生物进化的基础2、DNADNA携带两种遗传信息携带两种遗传信息 a a、编码蛋白质和、编码蛋白质和RNARNA的信息的信息(编码编码tRNAtRNA、rRNArRNA)6464个三联体密码子个三联体密码子 3 3个
3、终止密码子个终止密码子 编码氨基酸的编码氨基酸的6161个密码子有简并性、通用性个密码子有简并性、通用性 b b、编码基因选择性表达的信息、编码基因选择性表达的信息基因选择性表达基因选择性表达表现在:表现在:细胞周期的不同时相中细胞周期的不同时相中 个体发育不同阶段个体发育不同阶段 不同的器官和组织不同的器官和组织 不同的外界环境下基因的表达与否以及量的不同的外界环境下基因的表达与否以及量的差异差异 *原核生物的结构基因占原核生物的结构基因占GenomeGenome的比例很大的比例很大 x174phage 5386bp x174phage 5386bp 结构基因用去结构基因用去5169bp51
4、69bp 比例达比例达9696*真核生物的结构基因占真核生物的结构基因占GenomeGenome的比例很小的比例很小 哺乳动物中结构基因只占哺乳动物中结构基因只占10101515 其余其余8080以上的以上的DNADNA起什么作用目前还无起什么作用目前还无法精确解释,法精确解释,但可以肯定其中大部分但可以肯定其中大部分DNADNA序列是编码基因选择性表达的遗传信息序列是编码基因选择性表达的遗传信息 所以又称调控序列所以又称调控序列二、二、RNARNA也可作为遗传物质也可作为遗传物质 *RNA病毒病毒 传染媒介是病毒颗粒(病毒基因组传染媒介是病毒颗粒(病毒基因组RNA、蛋白质外壳)、蛋白质外壳)
5、如如:烟草花叶病毒烟草花叶病毒(Tobacco Mosaic Virus,TMV)*类病毒类病毒(viroid):使高等植物产生疾病的传染性因子使高等植物产生疾病的传染性因子 只由只由RNA组成组成,无蛋白质外壳保护无蛋白质外壳保护,游离的共价闭合环游离的共价闭合环状单链状单链RNA分子分子 三、三、是否存在核酸以外的遗传物质是否存在核酸以外的遗传物质 PrionPrion(proteinaccousproteinaccous infections particle)infections particle)朊病毒蛋白质样的感染因子朊病毒蛋白质样的感染因子羊搔痒病羊搔痒病(scripie)人类库
6、鲁(人类库鲁(kuru)病病 牛海绵状脑炎牛海绵状脑炎(疯牛病疯牛病)均由均由传染性病原蛋白颗粒传染性病原蛋白颗粒引起引起统称统称Prion(朊病毒朊病毒)Prion 复制复制?转录转录?翻译翻译?疾病疾病症状症状发病机理发病机理发现病例发现病例库鲁病(Kuru)共济失调、继发痴呆通过同类相食(人)传染约2600例医源性克雅氏病(iCJD)痴呆,共济失调通过朊病毒污染的HGH,或通过角膜移植约80例家 族 性 克雅氏病同上PrP基因种系突变约100个家族零星发生克雅氏病同上体细胞突变PrPc自发转变为PrPsc?每年发生率约百万分之一克雅氏病新突变体vCJD共济失调,常伴有痴呆牛朊病毒传染?4
7、6例G S 综 合 症(GSS)共济失调,常伴有痴呆PrP基因种系突变约50个家族致死性家族失眠症(FFI)睡眠隔离,接着失眠,痴呆P r P 基 因 种 系 突 变(D178N和M129)9个家族 人类朊病毒疾病、症状及发病机理人类朊病毒疾病、症状及发病机理 致死性中枢神经致死性中枢神经系统的慢性退化系统的慢性退化病理表现:大病理表现:大脑皮层的神经脑皮层的神经原细胞退化、原细胞退化、空泡变性、死空泡变性、死亡、消失,最亡、消失,最终被星状细胞终被星状细胞取代,因而造取代,因而造成海棉状态成海棉状态朊病毒带来了诺贝尔生理朊病毒带来了诺贝尔生理/医学奖医学奖 1997 Stanley B.Pr
8、usiner发现朊病毒是作发现朊病毒是作为老年性痴呆症为老年性痴呆症等疾病的病原并等疾病的病原并能在寄主细胞中能在寄主细胞中繁殖传播繁殖传播第一节第一节 DNA的结构的结构嘧啶嘧啶Pyrimidines嘌呤嘌呤Purines 一、一、碱基、核苷、核苷酸碱基、核苷、核苷酸 碱基碱基Nitrogenous basesUracil(U)核苷(核苷(nucleotide)糖苷键糖苷键Glycosidic bond嘧啶的嘧啶的1 1位位NN原子、嘌呤的原子、嘌呤的9 9位位NN原子原子核糖是戊糖核糖是戊糖 RNA核糖核苷核糖核苷 DNA脱氧核糖核苷脱氧核糖核苷19 核苷酸(核苷酸(nucleotide
9、acid)核苷的磷酸酯核苷的磷酸酯 脱氧核糖核苷酸脱氧核糖核苷酸 核糖核苷酸核糖核苷酸其中其中和和、和和之间是之间是高高能磷酸键能磷酸键dNTP碱基戊糖碱基戊糖核苷核苷 核苷磷酸核苷核苷磷酸核苷酸酸 二、二、DNA分子的一级结构分子的一级结构 (DNA sequence)1 1、多聚核苷酸链多聚核苷酸链 主链是核糖和磷酸主链是核糖和磷酸 侧链为碱基侧链为碱基由由3 3,5,5磷酸二酯键磷酸二酯键连接连接2 2、链的方向:同一个磷酸基链的方向:同一个磷酸基 的的3 3酯键到酯键到5 5酯键的方向酯键的方向 (5(53)5-UCAGGCUA-3 =UCAGGCUA 默认书写顺序默认书写顺序5335
10、三、三、DNA的二级结构的二级结构*1953.1953.WatsosnWatsosn&Crick&Crick 右手右手 B-DNA Double helix ModelB-DNA Double helix Model (一)(一)DNA双螺旋模型的提出(双螺旋模型的提出(double helix model)每一单链具有每一单链具有 5 35 3极性极性 两条单链极性相反两条单链极性相反 反向平行反向平行 两条单链间以氢键两条单链间以氢键连接连接 以中心为轴以中心为轴,向向 右右 盘盘 旋旋 (直径直径2nm2nm)双双 螺螺 旋旋 中中 存存 在在大、小大、小 沟沟 *双螺旋的主链双螺旋的主
11、链磷酸二酯链磷酸二酯链(PhosphodiesterBackbone)C-GT-A 碱基互补碱基互补 直径直径20 *双螺旋模型参数双螺旋模型参数 螺距为螺距为34(任一条链(任一条链 绕轴一周所升降的距离)绕轴一周所升降的距离)每圈有每圈有1010个核苷酸个核苷酸 (碱基)(碱基)有大沟和小沟有大沟和小沟 配对碱基并不充满双配对碱基并不充满双 螺旋空间,且碱基对螺旋空间,且碱基对 占据的空间不对称占据的空间不对称 两个碱基之间的垂直两个碱基之间的垂直 距离是距离是3.43.4。螺旋转。螺旋转 角是角是36度度Pitch 34 Rise3.4 Width 20 Major GrooveMino
12、r Groove10.4 bp/turn 大、小沟的差异大、小沟的差异 大沟中碱基差异容易识别大沟中碱基差异容易识别 ,往往是蛋,往往是蛋白质因子结合特异白质因子结合特异DNADNA序列的位点序列的位点 小沟相对体现的信息较少小沟相对体现的信息较少(二)(二)影响双螺旋结构稳定性的因素影响双螺旋结构稳定性的因素 l 氢键氢键(Hydrogen bond 46(Hydrogen bond 46 kckc/mol)/mol)消除消除DNA单链上磷酸基团间的静电斥力单链上磷酸基团间的静电斥力 弱键弱键,可加热解链可加热解链氢键堆积氢键堆积,有序排列有序排列(线性线性,方向方向)l 磷酸酯键磷酸酯键(
13、phosphoesterphosphoester bond 8090 bond 8090 kckc/mol)mol)l 0.15 mol/L Na0.15 mol/L Na+生理盐条件生理盐条件 强键强键,需酶促解链需酶促解链 *维持稳定性的因素维持稳定性的因素l 碱基堆积力碱基堆积力(非特异性结合力非特异性结合力)(1(1 kckc/mol 0.6kc/mol)/mol 0.6kc/mol)n n 范德华力(范德华力(Van de Van de waalswaals force force)(1.7A/嘌呤环与嘧啶环嘌呤环与嘧啶环 作用半径作用半径)(0.34 nm/碱基对间距碱基对间距)3
14、.4A 疏水作用力疏水作用力(Hydrophobic interaction)不溶于水的非极性分子在水中相互联合不溶于水的非极性分子在水中相互联合,成串结合的趋势力成串结合的趋势力.l 磷酸基团间的静电斥力磷酸基团间的静电斥力l 碱基内能增加碱基内能增加(温度温度),使氢键使氢键因碱基排列有序状态的破坏因碱基排列有序状态的破坏 而减弱而减弱 *不稳定因素不稳定因素(三)双螺旋结构的基本形式(三)双螺旋结构的基本形式 B-DNA B-DNA 资料来自相对湿度为资料来自相对湿度为9292所得到的所得到的DNADNA钠盐纤维钠盐纤维 此外人们还发现了此外人们还发现了A A、C C、D D、E E等右
15、手双螺旋和左手双螺旋等右手双螺旋和左手双螺旋 Z Z构象等形式构象等形式DNADNA结构的多态性:几种不同的结构的多态性:几种不同的DNADNA双螺旋结构以及同双螺旋结构以及同 一种双螺旋结构内参数存在差异的现象一种双螺旋结构内参数存在差异的现象 原因:多核苷酸链的骨架含有许多可转动的单键原因:多核苷酸链的骨架含有许多可转动的单键 磷酸二酯键的两个磷酸二酯键的两个P-OP-O键、糖苷键、戊糖环各个键键、糖苷键、戊糖环各个键ABZHandednessBase InclinationABZ大沟宽大沟宽小沟窄小沟窄小沟窄小沟窄大沟变深大沟变深小沟宽浅小沟宽浅大沟不存在大沟不存在小沟窄而深小沟窄而深左
16、手螺旋左手螺旋左手螺旋是对右手螺旋的一个补充和发展,左手螺旋左手螺旋是对右手螺旋的一个补充和发展,左手螺旋具有调控基因转录的生物活性。具有调控基因转录的生物活性。控制区启动子控制区启动子不转录不转录邻近调控转录区与调节区相邻邻近调控转录区与调节区相邻转录转录控制区控制区负超螺旋低无扭转张力负超螺旋低无扭转张力不转录不转录负超螺旋程度高有扭转力负超螺旋程度高有扭转力转录转录远距离调控转录区可在上千个碱基对以外远距离调控转录区可在上千个碱基对以外 1、反向重复序列与二级结构、反向重复序列与二级结构 反向重复序列(反向重复序列(inverted inverted repeatitiverepeati
17、tive sequence or inverted sequence or inverted repeats repeats IRIR)又称回文序列()又称回文序列(廻廻文):指两段同样的核苷酸序列同文):指两段同样的核苷酸序列同时存在于一个分子中,但具有相反的方向时存在于一个分子中,但具有相反的方向.有时也有不完全相同的情况有时也有不完全相同的情况 RNARNA和和DNADNA中都可能存在中都可能存在 此外还可有此外还可有directed directed repeatitiverepeatitive sequence-sequence-正向重复序列正向重复序列(四)一些(四)一些DNA序列
18、的不寻常结构序列的不寻常结构C反向重复序列间间隔较短或无间隔反向重复序列间间隔较短或无间隔反向重复序列间间隔较长反向重复序列间间隔较长 *较短的回文序列可能是作为一种信号较短的回文序列可能是作为一种信号 如:如:限制性内切酶的识别位点限制性内切酶的识别位点 一些调控蛋白的识别位点一些调控蛋白的识别位点 例如限制性内切酶例如限制性内切酶 EcoREcoR的识别位点的识别位点 5 5GAATTCGAATTC3 3 3 3CTTAAGCTTAAG5 5 (1 1)形成条件形成条件 一股为嘌呤,另一股为嘧啶的核苷酸双链能够形成三链一股为嘌呤,另一股为嘧啶的核苷酸双链能够形成三链 如:如:polyA/p
19、olyU polydA/polydT polyd(AG)/polyd(CT)2、三螺旋、三螺旋DNA DNA(Trible Helix DNA,T.S DNA)可能与基因调控区域的功能和染色体重组有关可能与基因调控区域的功能和染色体重组有关PolyT/A TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAA PolyT/A TTTTTTTTTTT AAAAAAAAAATTTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAD.S.DNA+D.S.DNA T.S.DNA+S.S.DNA (2 2)组成形式组成形式l第三条链位于第三条链位于B-DNA的的 Major groov
20、e中中 T.S.DNA 的连接键的连接键 Watson bonding A T G C (D.S.DNA)H+Hoogsteen 氢键氢键G C+(质子化质子化)(第三链第三链,pH 小于小于7)(Hoogsteen氢键:在酸性溶液氢键:在酸性溶液中,胞嘧啶的中,胞嘧啶的N-3原子被质子化,原子被质子化,可与鸟嘌呤可与鸟嘌呤N-7原子形成氢键,原子形成氢键,同时胞嘧啶的同时胞嘧啶的N-4氢原子也可与氢原子也可与鸟嘌呤的鸟嘌呤的O-6形成氢键,这种氢形成氢键,这种氢键被称为键被称为Hoogsteen氢键。氢键。)三股螺旋三股螺旋DNA结构特点总结结构特点总结第三条单链第三条单链DNA分子分子 位
21、于位于B-DNA大沟内大沟内 与与B-DNA以以 Hoogsteen 键连接键连接 A T,G C两氢两氢键配对,键配对,C必需质子必需质子化化 poly(Py):(Pu):(Py)为常见类型为常见类型Trible helixMajor groove Py :Pu :Py3ed3、四股螺旋四股螺旋DNA (tetraplex DNA,Tetrable Helix DNA)均有形成均有形成四股螺旋四股螺旋DNA的可能的可能 5-TTAGGGTTAGGGTTAGGG-33-AATCCCAATCCC-5 Poly(G)染色体端粒高度重复的染色体端粒高度重复的 DNA序列序列形成条件串联重复的鸟苷酸形
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