细胞的分子基础及基本概念课件.ppt
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- 细胞 分子 基础 基本概念 课件
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1、 第二章第二章 细胞的分子基础细胞的分子基础 及基本概念及基本概念第一节 细胞的化学及分子组成无机化合物有机化合物水水无机盐无机盐蛋白质蛋白质核酸核酸酶酶糖类糖类脂类脂类生物大分子生物大分子一、水与无机盐v(一)水是原生质最基本的物质v存在方式:游离水95;结合水5。随着细胞的衰老,细胞的含水量逐渐下降,活细胞的含水量不低于75。v作用:溶解无机物、调节温度、参加酶反应、参与物质代谢和形成细胞有序结构。水之所以具有这么多的重要功能是和水的特有属性分不开的:1.水分子是偶极子2.水分子间可形成氢键3.水分子可解离为离子(二)无机盐v含量很少,约占1。盐在细胞中解离为离子,离子的浓度除具有调节渗透
2、压和维持酸碱平衡的作用外,还有许多重要的作用。v主要的阴离子有Cl、PO4和HCO3,其中磷酸根离子在细胞代谢活动中最为重要:在细胞的能量代谢中起着关键作用;是核苷酸、磷脂、磷蛋白和磷酸化糖的组成成分;调节酸碱平衡。v主要的阳离子有:Na+、K+、Ca2+、Mg2+、Fe2+、Fe3+、Mn2+、Cu2+、Co2+、Mo2+。阳离子在细胞中的作用离子种类在细胞中的作用Fe2+或Fe3+血红蛋白、细胞色素、过氧化物酶和铁蛋白的成分Na+维持膜电位K+维持膜电位、参与蛋白质合成和某些酶促合成Mg2+叶绿素、磷酸酶、Na+-K+泵Mn2+肽酶Cu2+酪氨酸酶、抗坏血酸氧化酶Co2+肽酶Mo2+硝酸还
3、原酶、黄嘌呤氧化酶Ca2+钙调素、肌动球蛋白、ATP酶细胞中有机物达几千种之多,主要由四大类分子所组成:蛋白质、核酸、脂类和糖,这些分子约占细胞干重的90%以上。(一)蛋白质是细胞的主要结构成分,而且更重要的是,生物专有的催化剂酶是蛋白质,因此细胞的代谢活动离不开蛋白质。1.蛋白质的结构二、细胞的有机分子二、细胞的有机分子-氨基酸的通式氨基酸的通式 肽和肽键的形成肽和肽键的形成肽单位肽单位肽键肽键肽平面肽平面蛋蛋白白质质结结构构的的主主要要层层次次一级结构一级结构四级结构四级结构二级结构二级结构三级结构三级结构primary structureprimary structuresecondar
4、y structuresecondary structureTertiary structureTertiary structurequariernary structurequariernary structure超二级结构超二级结构结构域结构域 supersecondary structure supersecondary structureStructure domanStructure doman蛋白质的一级结构蛋白质的一级结构多肽链中氨基酸的排列顺序,包括二硫键的位置称为蛋白多肽链中氨基酸的排列顺序,包括二硫键的位置称为蛋白质的一级结构质的一级结构(primary structure
5、)(primary structure)。这是蛋白质最基本的结构,。这是蛋白质最基本的结构,它内寓着决定蛋白质高级结构和生物功能的信息。它内寓着决定蛋白质高级结构和生物功能的信息。例:例:牛胰岛素的一级结构牛胰岛素的一级结构蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构()螺旋螺旋(helixhelix)()折叠折叠(-pleated sheet)()转角转角(-turn)()无规则卷曲无规则卷曲(nonregular coil)蛋白质的二级结构(蛋白质的二级结构(secondary structuresecondary structure)指肽链)指肽链主链不同区段通过自身的相互作用,形成氢键,沿某一主主
6、链不同区段通过自身的相互作用,形成氢键,沿某一主轴盘旋折叠而形成的局部空间结构,是蛋白质结构的构象轴盘旋折叠而形成的局部空间结构,是蛋白质结构的构象单元主要有以下类型:单元主要有以下类型:特征特征:1 1、每隔每隔3.63.6个个AAAA残残基 螺 旋 上 升 一 圈,螺 距基 螺 旋 上 升 一 圈,螺 距0.54nm;0.54nm;2、螺旋体中所有氨基螺旋体中所有氨基酸残基酸残基R侧链都伸向外侧,侧链都伸向外侧,链中的全部链中的全部C=0 和和N-H几几乎都平行于螺旋轴乎都平行于螺旋轴;3、每个氨基酸残基的、每个氨基酸残基的N-H与前面第四个氨基酸残与前面第四个氨基酸残基的基的C=0形成氢
7、键,肽链上形成氢键,肽链上所有的肽键都参与氢键的形所有的肽键都参与氢键的形成。成。螺旋(螺旋(helix)形成因素形成因素:与与Amino acid组组成和排列顺序直接相关。成和排列顺序直接相关。多态性多态性:多数为右手(较稳多数为右手(较稳定),亦有少数左手螺旋存定),亦有少数左手螺旋存在(不稳定在(不稳定);存在尺寸不同);存在尺寸不同的螺旋。的螺旋。折叠(折叠(-pleated sheet-pleated sheet)特征特征:两条或多两条或多条伸展的多肽链条伸展的多肽链(或一条多肽链(或一条多肽链的若干肽段)侧的若干肽段)侧向集聚,通过相向集聚,通过相邻肽链主链上的邻肽链主链上的N-H
8、N-H与与C=OC=O之间有之间有规则的氢键,形规则的氢键,形成锯齿状片层结成锯齿状片层结构,即构,即折叠折叠片。片。类别类别:平行平行 反平行反平行 转角(转角(-turn-turn)特 征特 征:多 肽多 肽链 中 氨 基 酸链 中 氨 基 酸残基残基n n的羰基的羰基上 的 氧 与 残上 的 氧 与 残基(基(n+3n+3)的)的氮 原 子 上 的氮 原 子 上 的氢 之 间 形 成氢 之 间 形 成氢 键,肽 键氢 键,肽 键回折回折1801800 0。无无规规则则卷卷曲曲示示意意图图无规则卷曲无规则卷曲 蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构 多肽键在二级结构的基础上,通过侧链基团的相互多
9、肽键在二级结构的基础上,通过侧链基团的相互作用进一步卷曲折叠,借助次级键维系使作用进一步卷曲折叠,借助次级键维系使螺旋、螺旋、折叠片、折叠片、转角等二级结构相互配置而转角等二级结构相互配置而形成特定的构象形成特定的构象。三级结构的形成使肽链中所有的原子都达到空间上的。三级结构的形成使肽链中所有的原子都达到空间上的重新排布。重新排布。肌肌红红蛋蛋白白三三级级结结构构核糖核酸酶三级结构示意图核糖核酸酶三级结构示意图 N His12CHis119Lys41蛋白质的四级结构蛋白质的四级结构四级结构是指由相同或不同的称作亚基(四级结构是指由相同或不同的称作亚基(subunitsubunit)的亚单位按照
10、一定排布方式聚合而成的蛋白质结构,维持的亚单位按照一定排布方式聚合而成的蛋白质结构,维持四级结构稳定的作用力是疏水键、离子键、氢键、范得华四级结构稳定的作用力是疏水键、离子键、氢键、范得华力。亚基本身都具有球状三级结构,一般只包含一条多肽力。亚基本身都具有球状三级结构,一般只包含一条多肽链,也有的由二条或二条以上由二硫键连接的肽链组成。链,也有的由二条或二条以上由二硫键连接的肽链组成。实例:实例:血红蛋白血红蛋白 烟草花叶病毒的外壳蛋白四级结构烟草花叶病毒的外壳蛋白四级结构血红蛋白四级结构血红蛋白四级结构烟草花叶病毒外壳蛋白四级结构的自我组装烟草花叶病毒外壳蛋白四级结构的自我组装蛋白质的分类
11、v蛋白质的种类繁多,结构复杂,迄今为止没有一个理想的分类方法。着眼的侧面不同,分类也就不同,例如从蛋白质形状上,可将它们分为球状蛋白质及纤维状蛋白质;从组成上可分为单纯蛋白质(分子中只含氨基酸残基)及结合蛋白质(分子中除氨基酸外还有非氨基酸物质,后者称辅基);单纯蛋白质又可根据理化性质及来源分为清蛋白(又名白蛋白,albumin)、球蛋白(globulin)、谷蛋白(glutelin)、醇溶谷蛋白(prolamine)、精蛋白(protamine)、组蛋白(histone)、硬蛋白(scleroprotein)等。结合蛋白又可按其辅基的不同分为核蛋白(nucleoprotein)、磷蛋白(ph
12、osphoprotein)、金属蛋白(metalloprotein)、色蛋白(chromoprotein)等。蛋白质的分类v此外,还可以按蛋白质的功能将其分为活性蛋白质(如酶、激素蛋白质、运输和贮存蛋白质、运动蛋白质、受体蛋白质、膜蛋白质等)和非活性蛋白质(如胶原、角蛋白等)两大类。简单蛋白质分类简单蛋白质分类结合蛋白质分类结合蛋白质分类蛋白质在生命活动中的作用:v1.酶的催化作用,已知酶有2000多种;v2.运输和储藏作用;v3.激素的调节作用,肽类和氨基酸类、蛋白类;v4.运动功能,肌肉收缩;v5.结构成分和机械支持物,胶原蛋白和弹性蛋白;v6.免疫功能,抗体(免疫球蛋白);v7.构成生物
13、膜,体现膜功能,膜蛋白、载体、受体;v8.毒素的强调节作用,毒蛋白;v9.与动物生长生殖相关,蛋白质有功能大分子之称。蛋白质组学v随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。由于基因是遗传信息的携带者,而生命活动的执行者却是蛋白质。因此,即使得到人类全部基因序列,也只是解决了遗传信息库的问题。人类揭示整个生命活动的规律,就必须研究基因的产物蛋白质。蛋白质组学(Proteomics),它是以细胞内全部蛋白质的存在及其活动方式为研究对象。可以说蛋白质组研究的开展不仅是生命科学研究进入后基因组
14、时代的里程碑,也是后基因组时代生命科学研究的核心内容之一。蛋白质组学v蛋白质组学(proteomics)就是指研究蛋白质组的技术及这些研究得到的结果。蛋白质组学的研究试图比较细胞在不同生理或病理条件下蛋白质表达的异同,对相关蛋白质进行分类和鉴定。更重要的是蛋白质组学的研究要分析蛋白质间相互作用和蛋白质的功能。(二)核酸v是生物遗传信息的载体分子。由核苷酸单体聚合而成。分为RNA和DNA两大类。DNA的主要构象有三种:vB-DNA:右手螺旋模型,每圈螺旋10个碱基,螺旋扭角为36度,螺距34A,碱基倾角为-2度。vA-DNA:右手螺旋,每圈螺旋10.9个碱基,螺旋扭角为33度,螺距32A,碱基倾
15、角为13度。通过75%适度的B-DNA经X光衍射得到,尚不能肯定自然条件是否存在。vZ-DNA:左手螺旋,每圈螺旋12个碱基,碱基倾角为9度。确切功能未知,可能起调控作用。二、核酸的组成成分二、核酸的组成成分核酸 nucleic acid核苷酸 nucleotide核苷 nucleoside磷酸 phosphate嘌呤碱 purine base 或 嘧啶碱 pyrimidine base(碱基 base)核糖 ribose 或 脱氧核糖脱氧核糖 deoxyribose(戊糖 amyl sugar)5-磷酸核苷酸的基本结构磷酸核苷酸的基本结构OO(N=A、G、C、U、T)HH(O)H1 2 NO
16、HCH2HH5 4 3 PO-OOO-基本碱基结构和命名基本碱基结构和命名嘌呤嘌呤嘧啶嘧啶Adenine (A)Guanine (G)Cytosine (C)Uracil (U)Thymine (T)DNA的结构的结构(一)(一)DNA的一级结构的一级结构因为DNA的脱氧核苷酸只在它们所携带的碱基上有区别,所以脱氧核苷酸的序列常被认为是碱基序列碱基序列(base sequence)。通常碱基序列由DNA链的53方向写。DNA中有4种类型的核苷酸,有n个核苷酸组成的DNA链中可能有的不同序列总数为4n。(二)(二)DNA的双螺旋结构的双螺旋结构1953年,Watson 和Crick 提出。DNA
17、的双螺旋模型特点的双螺旋模型特点 两条反向平行的多聚核苷酸链沿一个假设两条反向平行的多聚核苷酸链沿一个假设的中心轴右旋相互盘绕而形成。的中心轴右旋相互盘绕而形成。磷酸和脱氧核糖单位作为不变的骨架组成磷酸和脱氧核糖单位作为不变的骨架组成位于外侧,作为可变成分的碱基位于内侧。位于外侧,作为可变成分的碱基位于内侧。链间碱基按链间碱基按AT,GC配对(碱基配对原则配对(碱基配对原则,Chargaff定律)定律)螺旋直径螺旋直径2nm,相邻碱基平面垂直距离,相邻碱基平面垂直距离0.34nm,螺旋结构每隔螺旋结构每隔10个碱基对(个碱基对(base pair,bp)重复一次,间隔为)重复一次,间隔为3.4
18、nm 氢键氢键 碱基堆集力碱基堆集力 磷酸基上负电荷被胞内磷酸基上负电荷被胞内组蛋白或正离子中和组蛋白或正离子中和 碱基处于疏水环境中碱基处于疏水环境中DNA的双螺旋结构稳定因素的双螺旋结构稳定因素DNA的双螺旋结构的双螺旋结构的意义的意义 该模型揭示了该模型揭示了DNA作为遗传物质的稳定性作为遗传物质的稳定性特征,最有价值的是确认了特征,最有价值的是确认了碱基配对碱基配对原则,这原则,这是是是是DNA复制、转录和反转录的分子基础,亦复制、转录和反转录的分子基础,亦是遗传信息传递和表达的分子基础。该模型的是遗传信息传递和表达的分子基础。该模型的提出是本世纪生命科学的重大突破之一,它奠提出是本世
19、纪生命科学的重大突破之一,它奠定了生物化学和分子生物学乃至整个生命科学定了生物化学和分子生物学乃至整个生命科学飞速发展的基石。飞速发展的基石。RNA的一级结构的一级结构 RNA分子中各核苷分子中各核苷之间的连接方式(之间的连接方式(3-5 磷磷酸二酯键酸二酯键)和排列顺序叫)和排列顺序叫做做RNA的一级结构的一级结构OHOHOH5 3 RNA与与DNA的差异的差异 DNA RNA糖糖 脱氧核糖脱氧核糖 核糖核糖碱基碱基 AGCT AGCU 不含稀有碱基不含稀有碱基 含稀有碱基含稀有碱基RNA的类别的类别 信使信使RNA(messenger RNA,mRNA):在蛋白):在蛋白质合成中起模板作用
20、;质合成中起模板作用;核糖体核糖体RNA(ribosoal RNA,rRNA):与蛋白):与蛋白质结合构成核糖体(质结合构成核糖体(ribosome),核糖体是蛋白质合成核糖体是蛋白质合成的场所;的场所;转移转移RNA(transfor RNA,tRNA):在蛋白质):在蛋白质合成时起着携带活化氨基酸的作用。合成时起着携带活化氨基酸的作用。RNA催化剂v也叫核酶Ribozyme。vT.Cech 1982发现四膜虫rRNA的前体物能在没有任何蛋白质参与下进行自我加工,产生成熟的rRNA产物。这种加工方式称为自我剪接(self splicing)。v后来陆续发现,具有催化活性的RNA不只存在于四膜
21、虫,而是普遍存在于原核和真核生物中。一个典型的例子核糖体的肽基转移酶。核酶核酶v大部分核酶参加RNA的加工和成熟,也有催化C-N键的合成。23SrRNA具肽酰转移酶活性。vRNA在DNA复制、转录、翻译中均有一定的调控作用,与某写物质的运输与定位有关。(三)酶与生物催化剂1.酶是蛋白质性的催化剂,主要作用是降低化学反应的活化能,增加了反应物分子越过活化能屏障和完成反应的概率。2.某些酶需要有一种非蛋白质性的辅因子(cofactor)结合才能具有活性。辅因子可以是一种复杂的有机分子,也可以是一种金属离子,或者二者兼有。3.作用机制:在反应中与底物暂时结合,形成了酶底物复合物。降低活化能。反应完成
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