第3章酶与维生素ppt课件.ppt
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1、酶酶与维生素与维生素第第 三三 章章酶酶 学学第第 二二 部部 分分q酶酶是对其是对其特异底物特异底物具有具有高效催化作用高效催化作用的的蛋白质蛋白质和和核糖核酸核糖核酸。q酶学研究的意义酶学研究的意义公元前公元前21世纪,中国已有酿酒记载;世纪,中国已有酿酒记载;1833年,年,Payen&Persoz 发现发现淀粉酶淀粉酶(diastase);19世纪,对酶的知识来源于世纪,对酶的知识来源于发酵过程发酵过程的研究;的研究;1 Glucose2 alcohol+2CO21878年年,Kuhne首次提出首次提出Enzyme一词;一词;1897年年,Buchner兄弟用酵母提取液兄弟用酵母提取液
2、实现了发酵实现了发酵;1913年年,Michaelis和和Menten提出了提出了“米氏方程米氏方程”1926年,年,Sumner首次从刀豆中提纯出首次从刀豆中提纯出脲酶结晶脲酶结晶;二十世纪中叶,二十世纪中叶,酶学的迅速发展;酶学的迅速发展;1982年,年,Cech提出提出核酶核酶(ribozyme)的概念;的概念;1986年,年,Lerner和和Schultz研制出研制出抗体酶抗体酶(abzyme);1995年,年,Jack W.Szostak报道了报道了脱氧核酶脱氧核酶。酶结构与催化机理的研究:酶结构与催化机理的研究:促进分子生物学及技术的发展。促进分子生物学及技术的发展。第一节第一节结
3、合酶结合酶 (conjugated enzyme)单纯酶单纯酶 (simple enzyme)基本组成仅为基本组成仅为氨基酸氨基酸的一类酶。的一类酶。由由蛋白质蛋白质和和非蛋白非蛋白两部分组成。两部分组成。蛋白质部分蛋白质部分:酶蛋白酶蛋白 (apoenzyme)辅助因子辅助因子(cofactor)金属离子金属离子小分子有机化合物小分子有机化合物全酶全酶(holoenzyme)(coenzyme):(prosthetic group):按其与酶蛋白按其与酶蛋白结合的紧密程度结合的紧密程度分为分为与酶蛋白结合与酶蛋白结合疏松疏松,可用可用透析或超透析或超滤的方法除去。滤的方法除去。与酶蛋白与酶蛋
4、白共价结合共价结合,不能用不能用透析或透析或超滤的方法除去超滤的方法除去。与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。如如Fe2+、Fe3+、Cu2+、Zn2+、Mn2+、Co3+过渡金属离子。过渡金属离子。约约2/3的酶催化活性需要金属离子。的酶催化活性需要金属离子。金属酶金属酶 (metalloenzyme)金属激活酶金属激活酶 (metal-activated enzyme)为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚紧密。为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚紧密。如如Na+、K+、Mg 2+、Ca 2+碱和碱土金属离子。碱和碱土金属离子。l 稳定酶的构象;稳定酶的构象;l
5、参与催化反应,传递电子;参与催化反应,传递电子;l 酶与底物间起桥梁作用;酶与底物间起桥梁作用;l 电荷屏蔽作用电荷屏蔽作用,降低反应中的静电斥力,降低反应中的静电斥力等。等。p 金属离子的电荷屏蔽作用金属离子的电荷屏蔽作用激酶的底物激酶的底物Mg2+-ATP,Mg2+屏蔽磷酸基的负电屏蔽磷酸基的负电荷,减少具有阴离子性质的电子对攻击亲核体。荷,减少具有阴离子性质的电子对攻击亲核体。腺嘌呤腺嘌呤核糖核糖传递传递电子电子、质子质子或或其它基团其它基团的的运载运载体的作用体的作用。l酶的种类繁多,辅酶酶的种类繁多,辅酶(辅基辅基)数目有限。数目有限。l酶蛋白酶蛋白决定反应的决定反应的特异性特异性,
6、辅酶辅酶(辅基辅基)决定反应的决定反应的种类和性质种类和性质。l大多数水溶性维生素作为辅酶或辅基。大多数水溶性维生素作为辅酶或辅基。转移基团转移基团辅酶或辅基辅酶或辅基所含维生素所含维生素氢原子氢原子 NAD+(辅酶辅酶)尼克酰胺尼克酰胺(vit pp)NADP+(辅酶辅酶)尼克酰胺尼克酰胺(vit pp)FMN核黄素核黄素(vitB2)FAD核黄素核黄素(vitB2)醛基醛基 TPP硫胺素硫胺素(vitB1)酰基酰基辅酶辅酶A泛酸泛酸烷基烷基钴胺素钴胺素vit(B12)CO2生物素生物素生物素生物素氨基氨基磷酸吡哆醛磷酸吡哆醛吡哆醛吡哆醛(vitB6)一碳单位一碳单位四氢叶酸四氢叶酸叶酸叶酸
7、一些多酶体系在进化过程一些多酶体系在进化过程中由于基因的融合,多种不同催化功能存在于中由于基因的融合,多种不同催化功能存在于一条多肽链中。一条多肽链中。单一肽链仅具有三级结构的酶。单一肽链仅具有三级结构的酶。多个相同或不同亚基组成的酶。多个相同或不同亚基组成的酶。几种不同功能的酶彼此聚合形几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。成的多酶复合物。以一定次序结合,形成催化作用的以一定次序结合,形成催化作用的“流水线流水线”。在合成后分泌到细胞外发生作用的酶在合成后分泌到细胞外发生作用的酶在合成分泌后定位于细胞内发生作用的酶在合成分泌后定位于细胞内发生作用的酶大多数的酶属于此类。大多数的酶属于此类
8、。主要为水解酶。主要为水解酶。酶分子中,酶分子中,与酶活性密切相关的化与酶活性密切相关的化学基团学基团。必需基团必需基团(essential group)酶的特殊催化能力只局限在大分子一酶的特殊催化能力只局限在大分子一定的区域,既只有定的区域,既只有少数氨基酸残基少数氨基酸残基参与参与底底物结合物结合和和催化作用催化作用。与底物相结合与底物相结合催化底物转变成产物催化底物转变成产物位于活性中心以外,维位于活性中心以外,维持酶活性中心空间构象持酶活性中心空间构象所必需。所必需。酶分子中酶分子中 必需基团必需基团在一级结构上可能在一级结构上可能相距甚远,甚至位于不同的肽链上,通过相距甚远,甚至位于
9、不同的肽链上,通过肽链的盘绕、折叠而在空间结构上彼此靠肽链的盘绕、折叠而在空间结构上彼此靠近,组成具有近,组成具有特定空间结构的区域特定空间结构的区域,能,能与与底物特异结合底物特异结合并并将底物转化为产物将底物转化为产物。辅酶辅酶或或辅基辅基往往是活性中心的组往往是活性中心的组成成分。成成分。溶菌酶的三维结构及酶溶菌酶的三维结构及酶-底物复合物底物复合物催化基团:催化基团:Glu35和和Asp52;结合基团:结合基团:Trp62和和63、Asp101、Trp108129个氨基酸残基个氨基酸残基酶酶氨基酸残基数氨基酸残基数活性中心的氨基酸残基活性中心的氨基酸残基核糖核酸酶核糖核酸酶A A溶菌酶
10、溶菌酶胰蛋白酶胰蛋白酶胰凝乳蛋白酶胰凝乳蛋白酶弹性蛋白酶弹性蛋白酶胃蛋白酶胃蛋白酶木瓜蛋白酶木瓜蛋白酶羧肽酶羧肽酶 A A肝乙醇脱氢酶肝乙醇脱氢酶1241241291292232232412412402403483482122123073073743742 2His12His12,His19His19,Lys41Lys41Glu35Glu35,Asp52Asp52His57His57,Asp102Asp102,ser195ser195His57His57,Asp102Asp102,ser195ser195His57His57,Asp102Asp102,ser195ser195Asp32Asp3
11、2,Asp215Asp215Cys25Cys25,His159His159Arg127Arg127,Glu270Glu270,Tyr248Tyr248,Zn+Zn+Ser48Ser48,His51His51,NAD+NAD+,Zn+Zn+某些酶活性中心的催化基团某些酶活性中心的催化基团n您用什么方法证明酶活性中心的存在?您用什么方法证明酶活性中心的存在?纸上谈兵,请设计您的实验。纸上谈兵,请设计您的实验。三、三、催化的化学反应催化的化学反应相同相同,而,而酶蛋白的分子结酶蛋白的分子结构构、理化性质理化性质乃至乃至免疫学性质免疫学性质不同的一组酶。不同的一组酶。同工酶属于不同基因编码的多肽链,或
12、同工酶属于不同基因编码的多肽链,或由同一基因转录产生上的由同一基因转录产生上的mRNA翻译的不同翻译的不同多肽链组成的蛋白质。多肽链组成的蛋白质。乳酸脱氢酶的同工酶乳酸脱氢酶的同工酶LDH1 (H4)LDH2(H3M)LDH3(H2M2)LDH4(HM3)LDH5 (M4)乳酸乳酸+NAD+丙酮酸丙酮酸+NADH+H+LDHq生理及临床意义生理及临床意义n在代谢调节上起着在代谢调节上起着重要的作用;重要的作用;n解释发育过程阶段解释发育过程阶段特有的代谢特征;特有的代谢特征;n同工酶谱的改变于同工酶谱的改变于 用对疾病的诊断;用对疾病的诊断;n作为遗传标志,用作为遗传标志,用于遗传分析研究。于
13、遗传分析研究。心肌梗死和肝病病人血清心肌梗死和肝病病人血清LDHLDH同工酶谱的变化同工酶谱的变化1 1酶酶活活性性心肌梗死酶谱心肌梗死酶谱正常酶谱正常酶谱肝病酶谱肝病酶谱2 23 34 45 5酶的工作原理酶的工作原理第二节第二节l能显著改变化学反应速度;能显著改变化学反应速度;l在反应前后没有质和量的变化;在反应前后没有质和量的变化;l只能催化热力学允许的化学反应;只能催化热力学允许的化学反应;l只加速可逆反应的进程,而不改变反应只加速可逆反应的进程,而不改变反应的平衡点。的平衡点。A BK1=10-4s-1K2=10-6s-1K=100BAk1k210-410-6l催化效率比非催化反应高
14、催化效率比非催化反应高1081020倍倍,比,比一般催化剂高一般催化剂高1071013倍倍。l不需要较高的反应温度。不需要较高的反应温度。l加速反应的机理都是加速反应的机理都是降低反应的活化能降低反应的活化能。酶比一般催化剂酶比一般催化剂更有效地降低反应的活化能更有效地降低反应的活化能。一种酶仅作用于一种酶仅作用于一种一种或或一类一类化合物,化合物,或或一定的化学键一定的化学键,催化,催化一定的化学反应一定的化学反应并并生成一定的产物生成一定的产物。酶的特异性酶的特异性(specificity)酶对所作用酶对所作用底物底物的的选择性选择性。酶的酶的专一性专一性 作用作用立体异构体立体异构体中的
15、一种中的一种(光学、几何异构体光学、几何异构体)只能作用于一种只能作用于一种特定结构的底物特定结构的底物。作用于作用于一类底物一类底物(一类化合物一类化合物或或一种化学键一种化学键)l对酶生成对酶生成(诱导与阻遏)(诱导与阻遏)与降解量的调节与降解量的调节l酶催化效力的调节酶催化效力的调节(别构调节和共价修饰)(别构调节和共价修饰)l不同组织、亚细胞同工酶不同组织、亚细胞同工酶l酶原激活酶原激活酶促反应受多种因素的调控:酶促反应受多种因素的调控:l使蛋白质变性的因素都可引起酶失活。使蛋白质变性的因素都可引起酶失活。l降低化学反应的活化能降低化学反应的活化能 l注入能量注入能量酶比一般催化剂酶比
16、一般催化剂更有效地更有效地降低反应的活化能降低反应的活化能。反应总能量改变反应总能量改变 非催化反应活化能非催化反应活化能 酶促反应活化能酶促反应活化能 一般催化剂催一般催化剂催化反应的活化能化反应的活化能 能能量量 反反 应应 过过 程程 底物底物 产物产物 一定温度下,一定温度下,1mol底物分子从底物分子从初初态态转变到转变到活化态活化态所需要的自由能所需要的自由能。结论:结论:催化剂降低反应活化能催化剂降低反应活化能蔗糖水解蔗糖水解催化剂催化剂活化能活化能(kj/mol)无无1339.8H+104.7蔗糖酶蔗糖酶39.4E+S E+P ES 酶底物复合物酶底物复合物 有利于底物转变成过
17、渡态有利于底物转变成过渡态酶蛋白受底物分子的诱导,其构象发酶蛋白受底物分子的诱导,其构象发生有利于底物结合的变化;底物在酶的诱生有利于底物结合的变化;底物在酶的诱导下也发生变形,处于不稳定的过渡态,导下也发生变形,处于不稳定的过渡态,底物过渡态底物过渡态与与酶的活性中心互补酶的活性中心互补。酶与底物相互接近时,其酶与底物相互接近时,其结构相互诱导结构相互诱导、相互变形相互变形和和相互适应相互适应,进而进而相互结合相互结合。酶和底物复合物形成既是专一性的识别过程,也是酶和底物复合物形成既是专一性的识别过程,也是使底物分子间反应变为使底物分子间反应变为分子内反应分子内反应的过程。的过程。底物和底物
18、底物和底物(双分子反应双分子反应),酶的催化基团与,酶的催化基团与底物之间结合于同一分子,使底物之间结合于同一分子,使底物有效浓度底物有效浓度得得以以极大提高极大提高而使反应大大增加的一种效应。而使反应大大增加的一种效应。底物反应基团之间或酶的催化基团与底底物反应基团之间或酶的催化基团与底物的反应基团之间的物的反应基团之间的正确取位正确取位产生的效应。产生的效应。酶活性中心存在着酶活性中心存在着广义的酸碱基团广义的酸碱基团,能在近中性的能在近中性的pH范围内,作为催化性的范围内,作为催化性的质质子供体子供体或或受体受体。酶诱导底物分子内敏感键中某些基团的酶诱导底物分子内敏感键中某些基团的电子云
19、密度发生变化,产生电子云密度发生变化,产生电子张力电子张力。底物。底物更接近过渡态,更接近过渡态,降低反应活化能降低反应活化能。l活性中心疏水环境中,较低的介电常数易于活性中心疏水环境中,较低的介电常数易于底物分子与催化基团的相互作用。底物分子与催化基团的相互作用。l活性中心中的微环境影响催化基团的解离。活性中心中的微环境影响催化基团的解离。酶活性中心酶活性中心亲核基团亲核基团或或亲电子基团亲电子基团,作用,作用于底物的于底物的缺电子中心缺电子中心或或负电中心负电中心,形成不稳定,形成不稳定的共价中间复合物,的共价中间复合物,降低反应活化能降低反应活化能。第三节第三节酶促反应动力学酶促反应动力
20、学酶浓度、底物浓度、酶浓度、底物浓度、pH、温度、抑制、温度、抑制剂、激活剂等。剂、激活剂等。研究一种因素影响时,其余各因素均恒定。研究一种因素影响时,其余各因素均恒定。研究研究酶促反应速度酶促反应速度以及影响以及影响酶促反酶促反应速度各种因素应速度各种因素的学科。的学科。n单位时间单位时间内内底物减少量底物减少量或或产物生成量产物生成量来表示,来表示,通常测定通常测定单位时间单位时间内内产产物的生成量物的生成量。Pt酶促反应时间进程曲线酶促反应时间进程曲线反应速度反应速度初速度初速度,取底物取底物的消耗量很小(一般在的消耗量很小(一般在5以内)的反应速度。以内)的反应速度。-dSdtV=dt
21、dPS较低时,反应速度较低时,反应速度与底物浓度成正比;反与底物浓度成正比;反应为应为一级反应一级反应。VmaxS增高,反应速度不再增高,反应速度不再成正比例加速;为成正比例加速;为混合混合级反应级反应。S达一定程度,反应达一定程度,反应速度不再增加,达最速度不再增加,达最大速度;为大速度;为零级反应零级反应。底物浓度对反应速度的影响呈底物浓度对反应速度的影响呈SV中间产物中间产物酶促反应模式酶促反应模式E+S k1k2k3ESE+P1903年,年,Henri根据蔗糖酶水解蔗糖实验根据蔗糖酶水解蔗糖实验SEE不变时不变时VmaxS Km+S S:底物浓度底物浓度V:不同不同S时的反应速度时的反
22、应速度Vmax:最大反应速度最大反应速度(maximum velocity)Km:米氏常数米氏常数(Michaelis constant)与与度度关系的数学方程式关系的数学方程式1.E与与S形成形成ESES复合物复合物的反应是快速平衡反应,的反应是快速平衡反应,而而ES分解为分解为E及及P的反应为慢反应,反应速度的反应为慢反应,反应速度取决于慢反应即取决于慢反应即 V=K3ES。(1)E+S k1k2k3ESE+P2.S的总浓度远远大于的总浓度远远大于E的总浓度,因此在反应的总浓度,因此在反应的初始阶段,的初始阶段,S的浓度可认为不变的浓度可认为不变 S=St指指ESES的的生成速度生成速度与
23、与分解速度相分解速度相 等,即等,即 ES恒定恒定E+S k1k2k3ESE+PK1(E-ES)S=K2 ES+K3 ES=K1(E-ES)SdESdt-dESdt=K2 ES+K3 ESK2+K3 Km(米氏常数)(米氏常数)K1令:令:则则(2)(2)变为变为:(E-ES)S Km ES整理:整理:K1(E-ES)S=K2 ES+K3 ES(2)=(E-ES)SK2+K3ES K1得:得:ES=ESKm+S(3)整理得:整理得:将将(3)(3)代入代入(1)(1):V=K3 ES Vmax=K3ES=K3E (5)将将(5)(5)代入代入(4)(4)得得米氏方程式:米氏方程式:VmaxS
24、Km+S V=K3ES Km+S(4)V=得得:在底物浓度远远大于酶浓度时,当酶的活性中心在底物浓度远远大于酶浓度时,当酶的活性中心全部饱和时,即全部饱和时,即EEESES,反应达最大速度,反应达最大速度 当反应速度为最大反应速度一半时:当反应速度为最大反应速度一半时:Km=S 2=Km+S Vmax VmaxSVmaxVSKmVmax1/2 底物的浓度底物的浓度Km值值u Km是酶的特性常数之一;是酶的特性常数之一;u 当当K2K3时,时,Km=K2/K1=Ks(ES解离常数解离常数)1/Km可近似表示可近似表示酶酶对对底物底物的的亲和力亲和力;u 同一酶对于不同底物有不同的同一酶对于不同底
25、物有不同的Km值。值。Vm:酶完全被底物饱和时的反应速度:酶完全被底物饱和时的反应速度K3:酶的转换数酶的转换数(turnover number),催化常数催化常数kcatVmax=K3 EK3=VmE 当酶被底物充分饱和时,单位时间内每个当酶被底物充分饱和时,单位时间内每个酶分子催化底物转变为产物的分子数。酶分子催化底物转变为产物的分子数。与酶浓度成正比。与酶浓度成正比。用来比较每单位酶的催化能力。用来比较每单位酶的催化能力。(Lineweaver-Burk作图法)作图法)Vmax S Km+SV=两边同取倒数两边同取倒数(林林贝氏方程贝氏方程)+1VKmVmax 1Vmax 1S=1/Vm
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