第六章:病毒的遗传分析课件.ppt
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- 第六 病毒 遗传 分析 课件
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1、教师:张光祥Email:zhgx-教学安排学时数:5噬噬菌菌体体的的重重组组分分析析缺缺失失作作图图病病毒毒概概述述双双突突变变体体的的互互补补测测验验 与末端重复与末端重复环状排列环状排列3 3、一些病毒性疾病、一些病毒性疾病,危,危害很大。如艾滋病、乙型肝炎等害很大。如艾滋病、乙型肝炎等、一些病毒、一些病毒,在宿主范围、毒,在宿主范围、毒性大小等方面发生变异。这些变异都可能使危险性性大小等方面发生变异。这些变异都可能使危险性增大,或原来的预防方法失灵。目前,卫生系统正增大,或原来的预防方法失灵。目前,卫生系统正在密切监控在密切监控SARS病毒、禽流感病毒等的新变异产病毒、禽流感病毒等的新变
2、异产生情况及其侵染、传播特点。生情况及其侵染、传播特点。、病毒除了直接对宿主造成危害(病毒性疾病)以、病毒除了直接对宿主造成危害(病毒性疾病)以外,还能通过外,还能通过,如一些肿瘤就是病毒引起的。,如一些肿瘤就是病毒引起的。、病毒对、病毒对等具有重要作用。等具有重要作用。目前,病毒的研究进展仍然受到国际社会的广泛关注。目前,病毒的研究进展仍然受到国际社会的广泛关注。病毒无细胞结构,不属于原核生物,单独一类烟草花叶病毒烟草花叶病毒 腺病毒腺病毒T4 T4 噬菌体爱滋病病毒噬菌体爱滋病病毒 RNARNA DNA DNA DANDANRNARNAL:L:线状、线状、O:O:环状、环状、M:M:基因组
3、含几个片断、基因组含几个片断、1=1=单链、单链、2=2=双链双链3.0 3.0 kbkbL L1-1-RNARNAR17R17、F2F2、MS2MS25.4 5.4 kbkbO O1-1-DNADNAf fX174X17414.1 14.1 kbkbL(M)L(M)2-2-RNARNAf f6 637.5 37.5 kbkbL L2-2-DNADNAT7T740.5 40.5 kbkbL L2-2-DNADNAP22P2251.9 51.9 kbkbL/OL/O2-2-DNADNA 117.0 117.0 kbkbL L2-2-DNADNAT5T5162.0 162.0 kbkbL L2-2
4、-DNADNA2.2.噬菌体:噬菌体:T2T2、T4T40.2 0.2 kbkbL L1-1-RNARNA1.1.类病毒类病毒核酸长度核酸长度核酸形状核酸形状核酸类型核酸类型病毒类别病毒类别病毒病毒按宿主按宿主按核酸按核酸按侵染周期按侵染周期按存在状态按存在状态核酸长度核酸长度形状形状核酸类型核酸类型病毒病毒 (virus)virus)类别类别21.021.0kbkbL L2-2-RNARNA2.2.植物病毒植物病毒:创伤肿瘤病毒(创伤肿瘤病毒(WTVWTV)9.09.0kbkbL(M)L(M)1-1-RNARNA雀麦花叶病毒(雀麦花叶病毒(BMVBMV)8.678.67kbkbL L1-1-
5、RNARNA马铃薯马铃薯 X X 病毒(病毒(PVXPVX)8.18.1kbkbO O2-2-DNADNA花椰菜花叶病毒(花椰菜花叶病毒(CaMVCaMV)6.36.3kbkbL L1-1-RNARNA烟草花叶病毒(烟草花叶病毒(TMVTMV)6.06.0kbkbL L1-1-RNARNA芜菁黄色花叶病毒芜菁黄色花叶病毒(TYMV)TYMV)4.54.5kbkbO O2-2-DNADNA多瘤病毒多瘤病毒(polyomapolyoma)7.87.8kbkbL(M)L(M)1-1-RNARNA脊髓灰质炎病毒脊髓灰质炎病毒(polio)polio)10.310.3kbkbL L1-1-RNARNA口
6、蹄疫病毒(口蹄疫病毒(FMDVFMDV)3.43.4kbkbL L2-2-RNARNA呼肠孤病毒呼肠孤病毒(reovirusreovirus)15.915.9kbkbL L2-2-DNADNA疱疹病毒疱疹病毒240.0240.0kbkbL L2-2-DNADNA牛痘苗病毒牛痘苗病毒300.0300.0kbkbL?L?2-2-DNADNA3.3.动物病毒动物病毒:鸟痘病毒鸟痘病毒三大特点:繁殖周期短、易得大群体、基因组小。三大特点:繁殖周期短、易得大群体、基因组小。冠状病毒的遗传物质是一个单一的冠状病毒的遗传物质是一个单一的RNARNA分子。这种分子。这种RNARNA和和N N蛋白共同组成病毒,
7、有三个结构蛋白,属糖蛋白。蛋白共同组成病毒,有三个结构蛋白,属糖蛋白。冠状病毒的特点是冠状病毒的特点是RNARNA和和RNARNA之间重组率非常高,出现变之间重组率非常高,出现变异正是由于这种很高的重组率。异正是由于这种很高的重组率。温和性噬菌体温和性噬菌体中中,T7T7和和P1P1噬菌噬菌体各代表了一种体各代表了一种略有不同的溶源略有不同的溶源性类型。性类型。温和性噬菌体有两个生活周期温和性噬菌体有两个生活周期:.,即在噬菌体侵入后并不裂解细菌即在噬菌体侵入后并不裂解细菌,而是而是将其将其DNADNA分子整合到细菌基因组分子整合到细菌基因组DNADNA上上,这样的噬菌体这样的噬菌体叫叫。带原
8、噬菌体的细菌叫。带原噬菌体的细菌叫。.,即在有关因素诱导下,原噬菌体基因依,即在有关因素诱导下,原噬菌体基因依次表达,产生大量子代噬菌体,并裂解细菌细胞后次表达,产生大量子代噬菌体,并裂解细菌细胞后释放出来。释放出来。.溶源性细菌有溶源性细菌有和和两个特点。两个特点。整合到宿主基因组中的原噬菌体,要表达出阻遏物关闭其它基因,所以仅少数基因活动。red cro cII O p Ori噬噬 菌菌 体体 颗颗 粒粒 的的 形形 成成 头部头部 尾部尾部b2区区与与 存活无关存活无关 晚期晚期控制控制裂裂解解AWBCDENu3F1F2ZUVGT HML K I J int xis exo CIII N
9、 cI Q S RNul噬菌体的附着区噬菌体的附着区 噬菌体的噬菌体的进入宿主进入宿主菌细胞后,两端的菌细胞后,两端的coscos末端互补配末端互补配对,断口由对,断口由DNADNA连接酶接上,连接酶接上,。这时。这时1212bpbp的的coscos末末端序列互补区叫端序列互补区叫coscos位点。位点。多联体多联体的线性的线性DNADNA逐个在逐个在COSCOS位点切开后包装位点切开后包装red cro cII O p Ori噬噬 菌菌 体体 颗颗 粒粒 的的 形形 成成 头部头部 尾部尾部b2区区与与 存活无关存活无关 晚期晚期控制控制裂裂解解AWBCDENu3F1F2ZUVGT HML
10、K I J int xis exo CIII N cI Q S RNul噬菌体的附着区噬菌体的附着区ab+cab+ca+bc+a+bcc+aF F因子因子 原原噬菌体噬菌体带有带有 原噬菌体原噬菌体的的E.coliE.coli Hfr Hfr菌株染色体菌株染色体a+bc+供体:供体:HfrHfr+原原 对对 噬菌体噬菌体敏感的敏感的E.coliE.coli F F菌株染色体菌株染色体ab+c受体:受体:F F-a+a+bc+ab+cbc+ab+ca+bc+a+bc+1 1、条件致死突变型、条件致死突变型能够得到的噬菌体突变型有形态突变型(噬菌斑大小、能够得到的噬菌体突变型有形态突变型(噬菌斑大
11、小、边缘清晰度、透明程度的变化)、寄主范围突变型和边缘清晰度、透明程度的变化)、寄主范围突变型和条件突变型。条件突变型。条件致死突变型:在某些条件下是致死的。使条件致条件致死突变型:在某些条件下是致死的。使条件致死突变型噬菌体不能存活或繁殖的条件叫死突变型噬菌体不能存活或繁殖的条件叫;条件致死突变型噬菌体能够存活或繁殖的条件叫条件致死突变型噬菌体能够存活或繁殖的条件叫常见的条件致死突变型有两种:常见的条件致死突变型有两种:温度敏感突变:热敏突变温度敏感突变:热敏突变限制条件限制条件4040;冷敏突变冷敏突变较低温度下致死。较低温度下致死。抑制因子敏感型突变抑制因子敏感型突变sus:sus:噬菌
12、体发生了无义突变噬菌体发生了无义突变许可条件许可条件宿主菌带有抑制因子(宿主菌带有抑制因子(susu+););限制条件限制条件宿主菌没有抑制因子(宿主菌没有抑制因子(susu-)。)。抑制因子敏感型突变抑制因子敏感型突变sussus实质就是无义突变,即编码实质就是无义突变,即编码氨基酸的正常密码子突变成了终止密码。氨基酸的正常密码子突变成了终止密码。、定义、定义UAA:UAA:赭石突变赭石突变UAG:UAG:琥珀突变琥珀突变UGA:UGA:乳白突变。乳白突变。宿主菌的无义抑制基因宿主菌的无义抑制基因susu+也是一种突变基因,即携也是一种突变基因,即携带某个氨基酸的带某个氨基酸的tRNAtRN
13、A的反密码子突变成了与一个终的反密码子突变成了与一个终止密码互补的特殊反密码子,与噬菌体的无义突变止密码互补的特殊反密码子,与噬菌体的无义突变能互补配对,合成正常长度的蛋白质。能互补配对,合成正常长度的蛋白质。噬菌体基因的sus突变UAAmRNA原因之一:原因之一:正常的终止密码后面是具有特殊发夹结构的正常的终止密码后面是具有特殊发夹结构的3-3-端非编码端非编码区(区(3UTR3UTR),翻译过程到了正常终止密码处会很快被终止,翻译过程到了正常终止密码处会很快被终止,数量相对很少的无义抑制型数量相对很少的无义抑制型tRNAtRNA在多数情况下还来不及在此在多数情况下还来不及在此加上氨基酸。所
14、以,加上氨基酸。所以,。原因之二:原因之二:即使正常基因的翻译即使正常基因的翻译到终止密码处时被加上到终止密码处时被加上了氨基酸,翻译过程进了氨基酸,翻译过程进入入3-3-端非编码区后也会端非编码区后也会很快遇到别的终止密码很快遇到别的终止密码而终止翻译,这样的蛋而终止翻译,这样的蛋白质通常功能正常。白质通常功能正常。大肠杆菌的无义抑制(大肠杆菌的无义抑制(UUAUUAtRNAtRNA氨基酸氨基酸、CUACUAtRNAtRNA氨基酸氨基酸、UCAUCAtRNAtRNA氨基酸氨基酸)由于可以在终止密码)由于可以在终止密码处加上一个氨基酸,在其它正常基因的翻译过程中当然也会处加上一个氨基酸,在其它
15、正常基因的翻译过程中当然也会使其编码的蛋白质变得更长。但是危害不大,原因有:使其编码的蛋白质变得更长。但是危害不大,原因有:2626有各种各样的突变体,最早发现的是一些最容易识别的突变类型,如噬菌斑特征的变异类型、宿主菌条件致死类型等。噬斑形态宿主范围感染 E.coli的不同菌株正常 h 品系1突变 h 品系1和2rrr小噬菌斑小噬菌斑大噬菌斑小噬菌斑无斑(致死)大噬菌斑大噬菌斑大噬菌斑大噬菌斑突变体类型或品 系小噬菌斑小噬菌斑小噬菌斑野生型SK(l)B不同大肠杆菌菌株的菌苔平板T4 噬菌体用 K()和两种平板就可将这四种类型区别开。大、边缘清楚小、边缘模糊Benzer S(1955)用E.C
16、oli 的T4噬菌体突变型双重感染试验。子代噬菌体中出现了野生型噬菌体()。野生型噬菌斑出现频率原比突变率高。突变体侵染细菌后能快速裂解细菌细胞,在相同时间内使更大范围的细菌细胞裂解,产生大而圆的噬菌斑。r r、由于、由于h h和和h h+均能感染品系均能感染品系1,1,用用T T2 2的两个亲本的两个亲本h hr r+和和h h+r r同时同时品系品系1,1,即可得到重组型子代噬菌即可得到重组型子代噬菌体体,在将噬菌斑印迹转移到品系在将噬菌斑印迹转移到品系2 2鉴定出能长的鉴定出能长的h h-。h h-r r+h h+r r-品系品系1 1h h-r r+h h+r r-h h-r r-h
17、h+r r+h h-r r+模糊,小;1+2 h h-r r-透明,大;1+2 h h+r r-透明,大;1 h h+r r+模糊,小;1 重组值重组值 =100%100%(h(h+r r+)+(h)+(h-r r-)4 4 种噬菌斑总数种噬菌斑总数 、噬菌、噬菌体性状体性状形态形态宿主宿主范围范围正常正常 r r+突变突变 r r-感染感染E.coliE.coli的菌株不同的菌株不同大、边缘清楚大、边缘清楚小、边缘模糊小、边缘模糊正常正常 h h+品系品系1 1突变突变h h-品系品系1 1和和2 2、T4噬菌体突变型的三点测验 品系一:小噬菌斑(m)、快速溶菌(r)、浑浊噬菌斑(tu);品
18、系二:野生型。进行双重感染后,将繁殖的噬菌体混合裂解液再次感染E.coli 并观察和记录结果。27.120.812.9重组率:10342合计1.7172+r+3.31.6162tu+m双交换型9.3965tu+17.58.2853+rm单交换4.6474tur+9.65.0520+m单交换36.13729+亲本型69.633.53467turmmturtumr重组率比例()噬菌斑数 目类型根据重组率可绘出连锁图:m r tu0 12.9 33.7Kaiser(1955)最先进行最先进行 噬菌体的重组作图。紫外线照噬菌体的重组作图。紫外线照射处理射处理获获5个个 噬菌体突变系噬菌体突变系,产生不
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