电子教案与课件:生化分离原理与技术.pptx
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- 电子 教案 课件 生化 分离 原理 技术
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1、生物样品的预处理生物样品的预处理 江南江南大学生物工程学大学生物工程学院院2 2 生物样品的预处理生物样品的预处理概述概述不同来源样品分离的预处理不同来源样品分离的预处理细胞的破碎与分离细胞的破碎与分离沉淀技术沉淀技术2.1 2.1 概述概述 选材选材 提取(预处理)提取(预处理)分离纯化分离纯化浓缩、结晶、干燥浓缩、结晶、干燥 保存保存来源丰富,含量相对较高,杂质尽可能来源丰富,含量相对较高,杂质尽可能少少将目的物从材料中以溶解状态释放将目的物从材料中以溶解状态释放出来,方法与存在部位及状态出来,方法与存在部位及状态有关有关核心操作,须根据目的物的核心操作,须根据目的物的理化理化及生物学及生
2、物学性质及具体条件确定性质及具体条件确定整个整个过程应有快速灵敏准过程应有快速灵敏准确的分析方法来衡量效果确的分析方法来衡量效果(回收率(回收率、纯度)、纯度)生化分离基本步骤生化分离基本步骤选材的重要性之案例:青蒿素的提取选材的重要性之案例:青蒿素的提取中药青蒿的植物来源中药青蒿的植物来源中华人民共和国药典中华人民共和国药典一九七七年一九七七年前版均规定为菊科植物黄花蒿(前版均规定为菊科植物黄花蒿(ArtemesiaArtemesia annuaannua)及青蒿及青蒿(A.A.apiaceaapiacea),二者的亲脂性化合物成分存在很大差异,),二者的亲脂性化合物成分存在很大差异,A.A
3、.annuaannua具抗疟成分青蒿素,而在具抗疟成分青蒿素,而在A.A.apiaceaapiacea中则无此成分中则无此成分因而无抗疟作用因而无抗疟作用本草纲目中的附图本草纲目中的附图2.2 2.2 不同来源样品分离的预处理不同来源样品分离的预处理样品来源:植物、动物、微生物,例如:植物或动样品来源:植物、动物、微生物,例如:植物或动物的细胞培养液、微生物发酵液、动物血液、乳液物的细胞培养液、微生物发酵液、动物血液、乳液和动植物组织器官提取液等。和动植物组织器官提取液等。生物样品中往往含有大量有机物、无机物及各种微生物样品中往往含有大量有机物、无机物及各种微量元素等,因此量元素等,因此将目标
4、物释放到溶液中,对其进行将目标物释放到溶液中,对其进行初步富集和分离,对干扰组分进行初步去除初步富集和分离,对干扰组分进行初步去除等工作等工作都属于预处理。都属于预处理。生物样品的特征生物样品的特征目标产物目标产物浓度普遍较低浓度普遍较低,悬浮液大部分是,悬浮液大部分是“水水”,组分复杂组分复杂,是含有细胞、细胞碎片、蛋白质、核酸、,是含有细胞、细胞碎片、蛋白质、核酸、脂类、糖类、无机盐类等多种物质的混合物;脂类、糖类、无机盐类等多种物质的混合物;分离过程很容易发生分离过程很容易发生失活失活现象,现象,pHpH、离子强度、温、离子强度、温度等变化常常造成产物的失活;度等变化常常造成产物的失活;
5、性质不稳定,性质不稳定,易随时间变化易随时间变化,如受空气氧化,微生,如受空气氧化,微生物污染,蛋白水解作用等。物污染,蛋白水解作用等。2.2.1 2.2.1 植物组织中活性物质的提取植物组织中活性物质的提取植物组织中所存在的植物组织中所存在的酚类化合物酚类化合物使植物中提取生物大分使植物中提取生物大分子的过程变得复杂。子的过程变得复杂。植物组织被破坏时,蛋白质等大分子和酚类处混合接触植物组织被破坏时,蛋白质等大分子和酚类处混合接触状态,很易发生反应。酚类氧化产物醌类和单宁酸类会状态,很易发生反应。酚类氧化产物醌类和单宁酸类会继续和蛋白质反应继续和蛋白质反应,使目的蛋白失去活性。为此去除酚使目
6、的蛋白失去活性。为此去除酚类化合物或避免反应是必须进行的步骤。类化合物或避免反应是必须进行的步骤。在提取酶、核酸、多糖等生物大分子时,其他大分子的在提取酶、核酸、多糖等生物大分子时,其他大分子的存在会对提取产生干扰,需要有效手段去除。存在会对提取产生干扰,需要有效手段去除。预处理需要注意预处理需要注意温度尽可能低温度尽可能低提取液的量要保证提取液的量要保证“充分浸入充分浸入”加入足量加入足量酚类吸附剂酚类吸附剂加入足量加入足量氧化酶抑制剂氧化酶抑制剂搅拌转速要恰当搅拌转速要恰当pHpH要控制在合适范围,一般要控制在合适范围,一般5.55.57 7 酚类吸附剂的种类酚类吸附剂的种类聚乙烯吡咯烷酮
7、聚乙烯吡咯烷酮-可溶的(可溶的(PVPPVP)和聚乙烯聚吡咯烷酮)和聚乙烯聚吡咯烷酮-不溶的(不溶的(PVPPPVPP):):PVPPVP和和PVPPPVPP中的中的COCON N基有很基有很强的结合多酚化合物的能力,其结合能力随着多酚化强的结合多酚化合物的能力,其结合能力随着多酚化合物中芳环羟基数量的增加而加强合物中芳环羟基数量的增加而加强聚乙烯和聚丙烯树脂,如离子交换树脂聚乙烯和聚丙烯树脂,如离子交换树脂XAD-2XAD-2、-4-4和和-7-7聚苯乙烯的离子交换树脂,包括阴离子交换树脂(聚苯乙烯的离子交换树脂,包括阴离子交换树脂(Bio-Bio-Rad AG1-X8,AG2-X8Rad
8、AG1-X8,AG2-X8和和Dowex-1Dowex-1)和阳离子交换树脂)和阳离子交换树脂(Dowex-50Dowex-50)TrisTris-硼酸硼酸 硼酸可与酚类靠氢键形成复合物,抑制了酚类物质的硼酸可与酚类靠氢键形成复合物,抑制了酚类物质的氧化及其与生物分子的结合氧化及其与生物分子的结合 牛血清白蛋白(牛血清白蛋白(BSABSA)法)法 原花色素类物质与原花色素类物质与BSABSA间可产生类似于抗原抗体间间可产生类似于抗原抗体间的相互作用,形成可溶性的或不溶性的复合物,减小的相互作用,形成可溶性的或不溶性的复合物,减小了原花色素类物质与了原花色素类物质与RNARNA结合的机会结合的机
9、会 其他聚合物如尼龙粉其他聚合物如尼龙粉氧化酶抑制剂的种类氧化酶抑制剂的种类抗氧化剂:抗氧化剂:2-2-巯基乙醇,二硫苏糖醇巯基乙醇,二硫苏糖醇(DTT)(DTT),二硫赤藓,二硫赤藓糖醇糖醇(DTE)(DTE),半胱氨酸,半胱氨酸(CysCys),抗坏血酸盐,抗坏血酸盐前三种既是多酚氧化酶的抑制剂又是醌的清除剂前三种既是多酚氧化酶的抑制剂又是醌的清除剂抗坏血酸盐在低浓度的醌存在下就很易被消耗,因此抗坏血酸盐在低浓度的醌存在下就很易被消耗,因此须在相对较高的浓度条件下使用(须在相对较高的浓度条件下使用(50 50 mmolmmol/L/L)硼氢化钠(硼氢化钠(NaBHNaBH4 4)是还原剂,
10、可以还原醌)是还原剂,可以还原醌2.2.2 2.2.2 动物组织预处理注意事项动物组织预处理注意事项 匀浆前的预处理匀浆前的预处理 (冷冻冷冻)提取缓冲液的选择提取缓冲液的选择(缓冲物质、缓冲物质、pHpH、离子强度、离子强度)蛋白酶抑制剂蛋白酶抑制剂的添加的添加 蛋白酶分为丝氨酸蛋白酶(如弹性蛋白酶,凝血酶,蛋白酶分为丝氨酸蛋白酶(如弹性蛋白酶,凝血酶,枯草杆菌蛋白酶,胰蛋白酶等),天冬氨酸蛋白酶,半枯草杆菌蛋白酶,胰蛋白酶等),天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸蛋白酶和金属蛋白酶四个家族,各有对应的抑制胱氨酸蛋白酶和金属蛋白酶四个家族,各有对应的抑制剂,如常用的苯甲基磺酰氟(剂,如常用的苯甲基磺酰氟
11、(PMSFPMSF)是丝氨酸蛋白酶)是丝氨酸蛋白酶的抑制剂的抑制剂保护剂的添加保护剂的添加(-(-巯基乙醇、巯基乙醇、EDTAEDTA、辅酶等、辅酶等)提取液的澄清提取液的澄清 (高速离心、沉淀、吸附等高速离心、沉淀、吸附等)2.2.3 2.2.3 微生物物质的提取制备微生物物质的提取制备各种发酵产品,由于菌种不同和发酵液特性不同,其各种发酵产品,由于菌种不同和发酵液特性不同,其预处理方法的选择也有所不同。预处理方法的选择也有所不同。有的发酵产物存在于发酵液中,也有的产物存在于菌有的发酵产物存在于发酵液中,也有的产物存在于菌体中,或发酵液和菌体中都含有。体中,或发酵液和菌体中都含有。对于对于胞
12、外产物胞外产物,经预处理应尽可能使目的产物转移到,经预处理应尽可能使目的产物转移到液相,然后经固液分离除去固相;液相,然后经固液分离除去固相;对于对于胞内产物胞内产物,则应首先收集菌体或细胞,经细胞破,则应首先收集菌体或细胞,经细胞破碎后,目的产物进入液相,随后再将细胞碎片分离。碎后,目的产物进入液相,随后再将细胞碎片分离。2.2.3.1 2.2.3.1 微生物发酵液预处理微生物发酵液预处理主要包括主要包括(1 1)发酵液杂质的去除)发酵液杂质的去除(2 2)改善发酵液的处理性能)改善发酵液的处理性能(1 1)发酵液杂质的去除)发酵液杂质的去除发酵液成分复杂,对提取影响较大的是高价无机离子、发
13、酵液成分复杂,对提取影响较大的是高价无机离子、杂蛋白和色素物质,影响后期离子交换、萃取、膜过滤、杂蛋白和色素物质,影响后期离子交换、萃取、膜过滤、测定等测定等无机离子的去除无机离子的去除u钙离子:加入草酸形成沉淀,酸化发酵液,草酸钙还钙离子:加入草酸形成沉淀,酸化发酵液,草酸钙还能促使蛋白质凝固能促使蛋白质凝固u镁离子:加入三聚磷酸钠可与之形成可溶性络合物,镁离子:加入三聚磷酸钠可与之形成可溶性络合物,可不再干扰离子交换可不再干扰离子交换u铁离子:加黄血盐使其形成普鲁士蓝沉淀铁离子:加黄血盐使其形成普鲁士蓝沉淀可溶性蛋白质的去除可溶性蛋白质的去除u盐析盐析u等电点沉淀等电点沉淀u加热法加热法u
14、有机溶剂沉淀法有机溶剂沉淀法u吸附法吸附法u其它沉淀法其它沉淀法有色物质的去除:常用脱色方法为吸附法,如活性炭有色物质的去除:常用脱色方法为吸附法,如活性炭吸附、树脂吸附等吸附、树脂吸附等(2 2)改善发酵液的处理性能)改善发酵液的处理性能细菌及某些放线菌菌体细小,发酵液粘度大,往细菌及某些放线菌菌体细小,发酵液粘度大,往往不能直接过滤,直接用离心法除菌体,则能耗往不能直接过滤,直接用离心法除菌体,则能耗很大,应用微滤的方法,又容易产生膜堵塞。很大,应用微滤的方法,又容易产生膜堵塞。需要通过一些简单手段需要通过一些简单手段降低发酵液粘度降低发酵液粘度,改善处,改善处理性能。理性能。降低发酵液的
15、粘度的方法降低发酵液的粘度的方法加热法加热法加水稀释法加水稀释法调节调节pHpH值值 因因pHpH直接影响发酵液中某些物质的电离度和电荷直接影响发酵液中某些物质的电离度和电荷性质,通过调节性质,通过调节pHpH值可以改善过滤特性。值可以改善过滤特性。细胞絮凝技术细胞絮凝技术u絮凝指在某些高分子絮凝剂存在下,基于架桥作用,絮凝指在某些高分子絮凝剂存在下,基于架桥作用,使胶粒形成粗大的絮凝团的过程,是一种以物理的使胶粒形成粗大的絮凝团的过程,是一种以物理的集合为主的过程。集合为主的过程。u通常需控制通常需控制絮凝剂浓度絮凝剂浓度保持在较窄的范围内保持在较窄的范围内,如胶体如胶体的颗粒表面吸附大量的
16、高分子物质的颗粒表面吸附大量的高分子物质,反而会在表面形反而会在表面形成空间保护层。成空间保护层。絮凝剂分类絮凝剂分类无机絮凝剂无机絮凝剂 无机盐类絮凝剂无机盐类絮凝剂(如硫酸铝、硫酸亚铁、氯化铝等如硫酸铝、硫酸亚铁、氯化铝等)无机高分子絮凝剂无机高分子絮凝剂(如聚合氯化铝、聚合铝铁等如聚合氯化铝、聚合铝铁等)有机絮凝剂有机絮凝剂 天然高分子絮凝剂天然高分子絮凝剂(如淀粉的改性产物如淀粉的改性产物)人工合成高分子絮凝剂人工合成高分子絮凝剂 (如阳离子聚丙烯酰胺如阳离子聚丙烯酰胺)无机与有机复合絮凝剂往往效果更好无机与有机复合絮凝剂往往效果更好微生物絮凝剂具较好发展潜力,主要以多糖、微生物絮凝剂
17、具较好发展潜力,主要以多糖、多聚氨基酸或糖蛋白为主,还有少量的多聚氨基酸或糖蛋白为主,还有少量的DNADNA和和脂类絮凝剂脂类絮凝剂絮凝效果与加入量、分子量和类型,溶液的絮凝效果与加入量、分子量和类型,溶液的pHpH值、搅拌速率和时间等因素有关值、搅拌速率和时间等因素有关絮凝机理絮凝机理(1 1)胶体理论)胶体理论 细菌可看做胶粒,因细胞表面的极性基团引起的表面细菌可看做胶粒,因细胞表面的极性基团引起的表面吸附吸附(2 2)高聚物架桥理论)高聚物架桥理论 细胞表面分泌的高聚物形成的胞外纤丝通过架桥交联细胞表面分泌的高聚物形成的胞外纤丝通过架桥交联而使细胞絮凝而使细胞絮凝(3 3)双电层理论)双
18、电层理论 细胞表面本身有电荷,加入的电解质的排斥作用而促细胞表面本身有电荷,加入的电解质的排斥作用而促使细胞产生聚并作用使细胞产生聚并作用2.2.3.2 2.2.3.2 大肠杆菌重组蛋白的提取制备大肠杆菌重组蛋白的提取制备多拷贝质粒上强启动子过量表达重组蛋白质使整个细多拷贝质粒上强启动子过量表达重组蛋白质使整个细胞的蛋白质表达水平提高,但大多情形下会导致诸如胞的蛋白质表达水平提高,但大多情形下会导致诸如包含体的不溶性蛋白聚集的形成包含体的不溶性蛋白聚集的形成重组菌重组菌E.coli M15(pQE32-AGN)外源基因的诱导表达外源基因的诱导表达(A未诱导,未诱导,B诱导诱导)重组蛋白的提取步
19、骤重组蛋白的提取步骤大肠杆菌的酶解大肠杆菌的酶解 采用溶菌酶或超声破碎方法来破壁采用溶菌酶或超声破碎方法来破壁包含体的清洗包含体的清洗 用溶剂清洗包含体能进一步除去杂蛋白用溶剂清洗包含体能进一步除去杂蛋白从包含体中溶解重组蛋白(变性)从包含体中溶解重组蛋白(变性)选择和优化溶解液(一般为尿素和盐酸胍),使包含选择和优化溶解液(一般为尿素和盐酸胍),使包含体中重组蛋白溶解体中重组蛋白溶解重组蛋白的复性重组蛋白的复性 稀释法、透析法、层析法、分子伴侣等稀释法、透析法、层析法、分子伴侣等2.3 2.3 细胞的破碎与分离细胞的破碎与分离细胞的破碎细胞的破碎 用一定方法(用一定方法(机械法、物理法、化学
20、法、酶法机械法、物理法、化学法、酶法等)打等)打开开细胞壁或膜细胞壁或膜,使细胞内含物有效地释放出来,使细胞内含物有效地释放出来提取提取 目的物从胞内转移到外界溶液中。目的物从胞内转移到外界溶液中。2.3.1 2.3.1 细胞的破碎方法细胞的破碎方法2.3.1.1 2.3.1.1 机械法机械法 原理:机械运动产生原理:机械运动产生剪切力剪切力的作用破细胞的作用破细胞组织捣碎组织捣碎利用高速旋转的叶片所产生利用高速旋转的叶片所产生的剪切力将组织细胞破碎的剪切力将组织细胞破碎(1000020000 r/min1000020000 r/min)适用:动植物组织适用:动植物组织DS-1高速组织捣碎高速
21、组织捣碎机机(常用于实验室规模常用于实验室规模)笼式笼式粉碎机(工业规模)粉碎机(工业规模)原理图原理图高速匀浆法高速匀浆法特点特点 相对温和相对温和,其机械剪切力对生物大分子的破坏较,其机械剪切力对生物大分子的破坏较少,少,处理量大处理量大原理原理 利用高压使细胞悬浮液通过针性阀,由于突然减利用高压使细胞悬浮液通过针性阀,由于突然减压和高速冲击撞击环使细胞破裂压和高速冲击撞击环使细胞破裂适用适用 较柔软、易分散的组织细胞较柔软、易分散的组织细胞高速匀浆法为大规模细胞破碎的常用方法,设备高速匀浆法为大规模细胞破碎的常用方法,设备由高压泵和匀浆阀组成由高压泵和匀浆阀组成高压匀浆阀的结构高压匀浆阀
22、的结构 不同规格的高速匀浆机不同规格的高速匀浆机研磨法与珠磨法研磨法与珠磨法研磨法研磨法(实验室规模实验室规模)由陶瓷的研钵和研杆组成,加入少量研磨剂(如精制由陶瓷的研钵和研杆组成,加入少量研磨剂(如精制石英砂、玻璃粉、硅藻土)石英砂、玻璃粉、硅藻土)研磨?研磨?特点:费时费力,规模小特点:费时费力,规模小珠磨法珠磨法(工业规模工业规模)进入珠磨机的细胞悬浮液与极细的玻璃小珠、石英进入珠磨机的细胞悬浮液与极细的玻璃小珠、石英砂、氧化铝等研磨剂(直径砂、氧化铝等研磨剂(直径1mm1mg/ml1mg/ml(2 2)吸附法)吸附法目的物浓度目的物浓度1mg/ml1mg/ml时可用此法时可用此法(3
23、3)膜分离技术)膜分离技术超滤超滤属加压膜分离技术之一属加压膜分离技术之一(4 4)干胶溶涨法)干胶溶涨法加入具一定孔径微孔能吸水的凝胶,如葡聚糖凝胶、加入具一定孔径微孔能吸水的凝胶,如葡聚糖凝胶、聚丙烯酰胺聚丙烯酰胺方式:直接加入或在半透膜外吸收方式:直接加入或在半透膜外吸收(5 5)多聚物吸水法)多聚物吸水法PEGPEG、PVPPVP、CMCCMC等具强大吸水力,可在半透膜等具强大吸水力,可在半透膜外吸收外吸收(6 6)减压蒸馏(真空旋转浓缩)减压蒸馏(真空旋转浓缩)2.4 2.4 沉淀技术沉淀技术2.4.1 2.4.1 概念和分类概念和分类概念概念 溶液中溶质由液相变成固相析出的过程溶液
24、中溶质由液相变成固相析出的过程本质本质 通过改变条件使胶粒发生聚结,降低其在液相中的溶通过改变条件使胶粒发生聚结,降低其在液相中的溶解度,增加了固相中的分配率解度,增加了固相中的分配率作用作用 分离、澄清、浓缩、保存分离、澄清、浓缩、保存沉淀方法分类沉淀方法分类盐析盐析有机溶剂沉淀有机溶剂沉淀等电点沉淀等电点沉淀其他沉淀技术其他沉淀技术 非离子聚合物沉淀非离子聚合物沉淀 生成盐复合物生成盐复合物 选择性变性选择性变性 亲和沉淀亲和沉淀2.4.2 2.4.2 盐析盐析2.4.2.1 2.4.2.1 原理原理“盐溶盐溶”低浓度中性盐离子对蛋白质分子表面极低浓度中性盐离子对蛋白质分子表面极性基团及水
25、活度的影响,增加蛋白质与溶剂相互性基团及水活度的影响,增加蛋白质与溶剂相互作用力,使其溶解度增大。作用力,使其溶解度增大。“盐析盐析”中性盐浓度增加至一定值时,水分子定中性盐浓度增加至一定值时,水分子定向排列,活度大大减少,蛋白质表面电荷被中和,向排列,活度大大减少,蛋白质表面电荷被中和,水膜被破坏,从而聚集沉淀。水膜被破坏,从而聚集沉淀。影响盐析的因素影响盐析的因素盐离子种类和浓度盐离子种类和浓度生物分子种类和浓度生物分子种类和浓度pHpH值值温度温度2.4.2.2 2.4.2.2 公式和讨论公式和讨论纯蛋白质有盐析经验公式:纯蛋白质有盐析经验公式:Log S=Log S=k kS SI I
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