干扰RNA文库在功能基因筛选中的应用课件.ppt
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- 关 键 词:
- 干扰 RNA 文库 功能 基因 筛选 中的 应用 课件
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1、RNARNA干扰文库及其应用干扰文库及其应用 RNAi的概况 SiRNA类型 RNAi文库(RNAi library)RNAi文库的分类 RNAi文库的构建策略 RNAi文库在功能基因组研究中的应用 RNAi library技术需要注意的问题RNAiRNAi概况概况 RNAi(RNA interference,RNA干扰):短双链RNA(dsRNA)诱导靶基因mRNA特异性降解,或阻止mRNA翻译,产生基因沉默(gene silence)的现象。因此,又称为knockdown。1995年,康乃尔大学的Su Guo用反义RNA技术抑制par-1基因时,意外发现正义RNA(sense RNA)也能
2、抑制C.elegans par-1基因表达。1998年,Andrew Fire和Craig Mello揭示正义RNA抑制基因表达是由于混有双链RNA。RNAi现象普遍存在动植物体内。发现植物中的21-25nt的RNA分子诱导PTGS(post-transciption gene silence,转录后基因沉默)。2001年,Emily等在果蝇中确定了降解dsRNA的关键酶,并命名为Dicer,此酶属于RNaseIII家族,在进化上保守。SiRNA的类型 寡核苷酸SiRNA:人工合成、体外转录o 特点:易于设计、合成昂贵、瞬时表达 吗啡啉核苷SiRNA:人工合成RNA类似物。o 特点:结合力强,
3、不易降解,效率高 载体表达型SiRNA(细菌质粒、病毒载体):基于表达载体在细胞内表达。o 特点:稳定表达、可大量扩增,转染效率低,操作繁杂RNAiRNAi的机制的机制 细胞自然存在二种干扰RNAo siRNA(短干扰RNA):19-25nt,由长dsRNA裂解而成的小片段,诱导mRNA降解。o microRNA(miRNA):22nt,呈短发夹结构(short hairpin RNA,shRNA),由miRNA前体酶解而成,抑制mRNA翻译。线虫晚期线虫晚期miRNA的的形成形成早期胚早期胚胎发育胎发育过程中过程中miRNAmiRNA参参与细胞与细胞分化分化病毒或病毒或基因重基因重组组siR
4、NAsiRNA的形成的形成及作用及作用 RNAiRNAi 的基本过程:的基本过程:siRNAsiRNA形成:形成:dsRNA被Dicer酶剪切成siRNA,消耗能量;RISCRISC(RNA-induced silencing complexRNA-induced silencing complex)形)形成:成:与RNAi辅助蛋白argonaute家族分子、RNA依赖性聚合酶结合形成RISC,消耗ATP能量;RISC RISC 活化:活化:siRNA解螺旋成单链,无活性的复合体转变成活性形式;阻止翻译或诱导阻止翻译或诱导mRNAmRNA降解:降解:在siRNA引导下,RISC识别并切割互补的
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