临床诊断的转化医学研究课件.pptx
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- 临床 诊断 转化 医学 研究 课件
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1、2016.06.172016.06.17夏宁邵夏宁邵厦门大学,公共卫生学院国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心分子疫苗学和分子诊断学国家重点实验室临床诊断的转化医学研究临床诊断的转化医学研究 转化医学转化医学 为什么我们需要转化医学?为什么我们需要转化医学?转化医学的定义转化医学的定义 转化医学的作用转化医学的作用 转化医学的内容转化医学的内容 临床诊断中临床诊断中的转化医学的转化医学 新生物标志物与新方法学的转化新生物标志物与新方法学的转化流程流程 新生物标志物的研发及转化过程新生物标志物的研发及转化过程 转化医学实施案例转化医学实施案例 临床需求促进新标志物的发现与推广临床需求促进新标
2、志物的发现与推广 技术发展推动新标志物在临床上的广泛应用技术发展推动新标志物在临床上的广泛应用 基础研究的新发现促进了已有标志物的新应用基础研究的新发现促进了已有标志物的新应用1992Science首次提出“Bench to Bedside”19941994出现“translation research”的概念1996Lancet首次应用“Translational medicine”这一名词2003NIH路线图计划:转化医学是连转化医学是连接基础学科与临床学科的桥梁接基础学科与临床学科的桥梁 为什么我们需要转化医学?临床需求:涉及预防与诊疗等多个方面 日益增长基础研究:大量资金投入 大量人员
3、投入缺乏沟通,各行其道 为什么我们需要转化医学?基础研究对健康提升的改进?1972199719721997肿瘤研究领域肿瘤研究领域20002000亿美元亿美元156156万篇论文万篇论文1975-2006年美国85岁以下癌症患者死亡率并未明显下降CA cancer 2010 statistics 为什么我们需要转化医学?认为有临床价值的研究成果应用情况?19791983在CNS等著名期刊中有101101篇文章篇文章明确声称具有广阔临床应用前景1999仅5 5项项获准应用于临床2003仅1 1项项显示了重要价值THE AMERICAN JOURNAL OF MEDICINE,2003 为什么我们
4、需要转化医学?基础研究与成果的实际应用处于平衡状态;基础研究获得的成果进行了充分的应用转化。成果应用基础研究生物标志物方法学治疗手段通过新的生物标志物、新的检测方法学或新的治疗手段的研发,以此满足临床上对疾病防治的需求。预防诊断治疗 为什么我们需要转化医学?因此,作为连接基础研究与实际应用因此,作为连接基础研究与实际应用的主要桥梁,转化医学必须得到重视的主要桥梁,转化医学必须得到重视与发展。与发展。转化医学的定义 转化医学,是指医学领域基础研究和临床应用相互指导、相互转化的一门新兴科学研究;是“Bench to Bedside”的一个连续、双向、开放的研究过程。BenchBedside 转化医
5、学的作用使用基础研究获得的成果满足临床需求,解答临床疑问;通过临床需求的反馈,指导基础研究的发展方向。临床需求基础科研应用研究 转化医学的作用一门新兴的交叉学科一座连接基础研究与临床诊疗的桥梁功能何在功能何在将基础研究取得的成果应用于临床疾病的预防、诊断与治疗中根据临床的需求及反馈,推动和促进基础研究是什么是什么 转化医学的内容转化医学的内容基础科学研究明确机制、靶点以及主要作用分子前期临床动物研究T0向人体转化诊断、治疗及预防的新方法概念验证一期临床T1向患者转化在控制的研究中获得正面的效果二期临床三期临床T2向实际应用转化在正确的时间为适当的患者提供正确的治疗四期临床临床结果研究T3向群体
6、健康转化真正做到惠及社会人群结果研究T4将基础研究应用到临床前期循证基础上的临床推广NIH Roadmap,2003 转化医学的内容转化医学的内容动物生物标志物人类生物标志物疾病/靶标整合的技术和信息技术平台生物化学免疫学影像学各种组学董尔丹,科学通报,2013 转化转化医学在临床上的应用医学在临床上的应用预防诊断治疗新表位疫苗研发新生物标志物诊断试剂、方法学药物靶点新药物转化医学转化医学为什么我们需要转化医学?为什么我们需要转化医学?转化医学的转化医学的定义定义转化医学转化医学的的作用作用转化医学的内容转化医学的内容临床诊断中临床诊断中的转化医学的转化医学新生物标志物与新方法学的转化新生物标
7、志物与新方法学的转化流程流程新生物标志物的研发及转化过程新生物标志物的研发及转化过程转化医学实施案例转化医学实施案例 临床需求促进新标志物的发现与推广临床需求促进新标志物的发现与推广 技术发展推动新标志物在临床上的广泛应用技术发展推动新标志物在临床上的广泛应用 基础研究的新发现促进了已有标志物的新应用基础研究的新发现促进了已有标志物的新应用 新生物标志物与新方法学的转化流程新生物标志物与新方法学的转化流程Stage 1判断新标志物在对象与非对象之间是否存在差异判断新方法学相比原有方法学是否存在提升概念验证Stage 2通过病例对照和前瞻性研究得到大量证据。方法学评价获得数据。功效测试说明成本效
8、益策略Stage 3评估新指标改进鉴别目标人群和非目标人群的能力评估新方法学在临床实际应用的工作性能。校正干扰因素以准确评估价值Stage 4社会推广改善现有的防控与诊疗体系 新生物标志新生物标志物研发及转化过程物研发及转化过程 生物标志物的发现 分析验证 临床应用 临床验证 生物标志物的发现生物标志物的发现 通过基础研究发现潜在的生物标志物;通过应用研究完成对生物标志物应用、标本种类、检测方法、目标人群等参数的验证;在应用研究的指导下,确定临床实验计划 分析验证分析验证分析验证分析验证分析前验证患者因素 病理生理状态 饮食情况样本因素 样本类型 采集技术 保存时间与条件 样本呈递 样本体积检
9、测自身技术参数 灵敏度 特异性 重复性 精确度CAP与CNAS的实验室认证体系室内质控与室间质评 临床验证临床验证目的:目标人群非目标人群区分目标人群与非目标人群的能力内容:生物标志物有效性的验证生物标志物“Harm to Benefit Ratio”临床应用临床应用大量的高水平实验数据区分目标人群与非目标人群显著提升现有诊疗水平提升患者预后指导病患管理临床运用 药物性致聋简介药物性致聋简介2005年春晚舞蹈千手观音氨基糖甙类抗生素“一针致聋”基础研究发现相关基因靶点基础研究发现相关基因靶点1993年,Prezant等发表文章,发现人线粒体RNA点突变与药物性致聋相关;这是世界范围第一篇揭示药
10、物性致聋相关基因的文献;该位点为m.1555AG。将研究成果向患者转化将研究成果向患者转化2004年始,中国301医院聋病分子诊断中心与清华大学程京院士团队合作,开始开展涵盖18省的聋病基因筛查;药物性致聋基因位点m.1555AG亦在筛查盘中;结果显示,其平均人群携带率约为017%,且地区差异显著。中华耳科学杂志,戴朴等,2006 临床转化中发现问题,回归基础研究寻找答案临床转化中发现问题,回归基础研究寻找答案有用药史无用药史A1555G突变聋人用药史情况A1555G 阳性A1555G 阴性药物致聋患者A1555G突变情况携带A1555G突变的患者,约90%有氨基糖甙类用药史。有氨基糖甙类用药
11、史的患者,仅6070%携带A1555G突变。从基础研究中获得相关信息从基础研究中获得相关信息2005年,NAR上首报一个在中国人群中特殊存在的,与药物致聋相关的独特位点,并阐述了其致病机制;经过门诊患者及各地聋校学生标本验证,该突变位点在中国人群携带率约为03%。从基础研究中获得相关信息从基础研究中获得相关信息A1555GC1494TRare经过分析,C1494T与A1555G两个突变位点占中国人群药物致聋突变的九成以上;其余的罕见突变则约占10%左右;因此,只需检测C1494T及A1555G即可筛查出大部分药物致聋性基因携带者。进一步的将研究成果向诊断转化进一步的将研究成果向诊断转化1993
12、至今221篇相关文献240个相关位点具备中国特色的耳聋基因筛查盘4家公司/机构6个检测试剂盒通过CFDA认证 转化成果对人群健康产生巨大效益转化成果对人群健康产生巨大效益药物性致聋占聋病总数百分比2011年始,以北京为代表,全国各地陆续开展新生儿耳聋基因筛查;据估计,该检测每年可减少聋儿3.5万名,按照每名聋儿一生耗费社会卫生资源约70万计算,每年可为国家节省245亿卫生资源。唐氏综合征简介唐氏综合征简介发病率约为1/600-800心智年龄发育迟缓生长发育障碍多发畸形 唐氏综合征的危害唐氏综合征的危害患者总体人群:60万以上唐氏患儿出生率:2.32.5万年,平均20分钟一个造成的家庭经济负担:
13、25万元例医疗和社会救助经费:根据2003年资料测算,社会每年需支付约100亿元两大特点:发病率高不可治愈准确的产前诊断是目前唯一的预防手段!唐氏综合征的传统诊断方法唐氏综合征的传统诊断方法1933Penrose等最先报道了孕妇年龄与唐氏综合征发生的关系,指出孕妇的妊娠年龄越大,其胎儿罹患DS的概率越高。19331959DS患者的第三条21号染色体被确认,从而揭示了DS发生的机制,为以后产前诊断的研究奠定了基础 唐氏综合征的传统诊断方法唐氏综合征的传统诊断方法193319591966首次从羊水中分离胎儿细胞,培养及核型分析获得成功 唐氏综合征的传统诊断方法唐氏综合征的传统诊断方法1933195
14、919661968第一例DS儿产前诊断获得成功 唐氏综合征的传统诊断方法唐氏综合征的传统诊断方法19331959196619681972Brock等报道了羊水中AFP的增高与胎儿患有先天性神经管缺陷及无脑儿和脊柱裂有关。唐氏综合征的传统诊断方法唐氏综合征的传统诊断方法193319591966196819721987Bogart发现母血清中的hCG的变化与DS的发生有关 唐氏综合征的传统诊断方法唐氏综合征的传统诊断方法1933195919661968197219871988Wald等首次提出AFP、hCG、uE3三联的筛查有助于阳性病例诊断 唐氏综合征的传统诊断方法唐氏综合征的传统诊断方法193
15、31959196619681972198719881991研究显示血清妊娠相关蛋白A(PAPP-A)的低水平可以作为DS15周之前的筛查指标 唐氏综合征的传统诊断方法唐氏综合征的传统诊断方法193319591966196819721987198819931991在世界各地广泛临床验证的基础上,美国遗传协会正式向全美医生推荐使用AFP、hCG作为唐氏综合征的产前筛查指标。唐氏综合征的传统诊断方法唐氏综合征的传统诊断方法 产前筛查(唐筛)母血清学筛查超声颈部透明带(NT)筛查风险评估5%假阳性率40%漏诊产前诊断 羊水穿刺绒毛取样脐静脉穿刺产前诊断(行业金标准)0.53%流产风险 唐氏综合征的传统
16、诊断方法唐氏综合征的传统诊断方法产前筛查产前诊断准确性差方便安全准确性高风险较大新型产筛技术 唐氏综合征的传统诊断方法唐氏综合征的传统诊断方法 新型产筛的问世新型产筛的问世1997年,香港中文大学卢煜明教授发现孕妇外周胎儿游离DNA存在;2008年,首次利用高通量测序技术在实验室中首次实现唐氏综合征检测。新型产筛的问世新型产筛的问世 是一项基于高通量测序和生物信息分析技术的新型唐氏综合征产前筛技术;仅需10ml 孕妇静脉外周血;即可准确地判断胎儿是否患有21-三体综合征(唐氏综合征)、18-三体综合征(爱德华氏综合征)、13-三体综合征(帕陶氏综合症);准确率 99.9%以上;临床应用情况临床
17、应用情况2012年11月20日,美国妇产科学会(ACOG)与美国母胎医学会(SMFM)共同发表委员指导意见,若有以下适应症,可推荐使用无创产前胎儿DNA检测作为非整倍体高危人群的筛查:母亲年龄超过35岁 超声结果显示非整倍体高危 生育过三体患儿 早孕期、中孕期或三联筛查、四联筛查呈现非整倍体阳性结果 临床应用情况临床应用情况 加拿大妇产科医师协会,2013年2月针对母亲血浆中游离DNA进行无创产前检测21,18和13三体发表专家共识与指导意见,建议NIPT检测应当适用于胎儿21、18、13-三体高风险人群,该技术针对唐氏综合征的检出率接近100%,假阳性率低于1%。临床应用情况临床应用情况20
18、13年4月,国际产前诊断协会(ISPD)针对胎儿非整倍体产前筛查发表指导意见,列举了数个无创产前临床实验的检测结果。准确率假阳性21三体18三体13三体99.598.484.60.20.20.7 临床应用情况临床应用情况2014年2月27日,新英格兰医学杂志刊发表了DNA测序技术与常规产前染色体非整倍体疾病筛查技术的比较;结果证实,无创产前检测技术不仅对于高危孕妇可精确检测,且对一般孕妇检测的假阳性率显著低于常规产前检测技术,而阳性预测值测显著地高于常规技术。HBcAg aa1149形成的类病毒颗粒在标记后-标记HRP或Biotin等信号分子不能很好地维持其颗粒构象,因此不适合作为双抗原夹心法
19、标记抗原使用;而aa1-183难以表达纯化。J Virol.2003 Dec;77(24):12950-60 乙型肝炎病毒重组核心抗原HBcAg案例三:案例三:基础研究的新发现促进了已有标志物的新应用基础研究的新发现促进了已有标志物的新应用 乙肝治疗应答标志物的发现与应用乙肝治疗应答标志物的发现与应用高度均一的重组HBcAg全长颗粒的获得cAg-HRP高度稳定的重组核心抗原,标记后仍然维持良好的颗粒抗原性,是实现双抗原夹心法检测HBcAb的关键基础。cAg 1mg/ml CpCCpDClin.Vaccine Immunol.Mar.2010,p.464-469基于C183重组颗粒抗原构建双抗原
20、夹心法Anti-HBc检测试剂间接法间接法夹心法夹心法竞争法竞争法l灵敏度较低l重现性不佳l不适合定量检测l灵敏度提高l重现性提高l可用于定量检测l灵敏度/特异性更佳l特异性更高l适合定量检测1、雅培Axysm2、罗氏Elecsys1、雅培Architect 双抗原夹心法Anti-HBc定性检测试剂与Abbott I2000的符合率Clin Vac Immno,Mar.2010,p.464469 夹心法夹心法Anti-HBcAnti-HBc试剂在试剂在不同人群中与不同人群中与Abbott Abbott i2000 i2000 的符合率在的符合率在96.4100%96.4100%。两者不符合的标
21、本经单两者不符合的标本经单抗中和实验结合临床背抗中和实验结合临床背景确认,证实夹心法景确认,证实夹心法Anti-HBcAnti-HBc具有更强的灵具有更强的灵敏度敏度/特异性。特异性。WT sHBcAbAxSYM CoreArchitect anti-HBc1.0 IU/mL20/20 20/2020/200.5 IU/mL20/2020/2020/200.25 IU/mL20/2020/200/200.125 IU/mL20/20 9/200/200.0625 IU/mL14/200/200/200 IU/mL0/200/200/20Anti-HBc定量的WHO国际标准品双抗原夹心法实现An
22、ti-HBc定量检测(溯源至WHO标准品)-2.0-1.5-1.0-0.5-1.0-0.50.00.5Log10 Con.Log10 OD 20个独立测试:高值 cv5%,中值cv10%,临界低值cv0.991234512345Log10 IU/mL(2nd test)Log10 IU/mL(1st test)100份临床标本两次独立定量 一致性R2 0.99,平均定量偏差为9.310%(以log10计为1.21.5%)Y=0.989XR20.99-1.00.01.02.03.04.05.06.0p0.001p0.001p0.001p=0.20p=0.22Numbers:53556108209
23、148133HBsAg:negativenegativepositivepositivepositivepositiveHBeAg:negativenegativepositivepositivenegativenegativeViral load:negativevery lowvery highhighlowhighALT:normalnormalnormalelevatednormalelevatedAnti-HBc level log10(IU/mL)PBI OBI IT IC LR ENH0.00.10.20.30.40.50.60.70.80.91.00.00.10.20.30.4
24、0.50.60.70.80.91.0AUROC=0.991(0.986-0.995)p0.0001Sensitivity:95.8%Specificity:98.0%optimal cutoff:89 IU/mLb1-SpecificitySensitivity0.00.10.20.30.40.50.60.70.80.91.00.00.10.20.30.40.50.60.70.80.91.0AUROC=0.723(0.651-0.795)p0.0001Sensitivity:60.7%Specificity:75.3%optimal cutoff:6.6 IU/mLc1-Specificity
25、SensitivityaClin Microbiol Infect.2015 Feb;21(2):197-203.探索不同HBV感染阶段标本中的qAnti-HBc水平Anti-HBcAnti-HBc定量水平反映肝脏炎症状态,可能是机体对乙肝定量水平反映肝脏炎症状态,可能是机体对乙肝病毒的免疫反应的一个指标。病毒的免疫反应的一个指标。1014202840R=0.277p0.001ALT(U/L)0.01.02.03.04.05.03.03.54.04.55.05.56.06.5R=-0.268p0.001Anti-HBc log10(IU/mL)HBsAg log10(IU/mL)R=0.342
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