细胞代谢网络与基因表达调控课件.ppt
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- 关 键 词:
- 细胞 代谢 网络 基因 表达 调控 课件
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1、16.1 16.1 代谢途径的相互联系代谢途径的相互联系16.2 16.2 代谢调节代谢调节16.3 16.3 细胞信号转导细胞信号转导16.4 16.4 基因表达调控基因表达调控16.1 代谢途径的相互联系16.1.1 16.1.1 代谢网络代谢网络(一)代谢途径交叉形成网络(一)代谢途径交叉形成网络 通过共同中间代谢物使各物质的代谢途径联系起来,形通过共同中间代谢物使各物质的代谢途径联系起来,形成经济有效、运转良好的代谢网络。成经济有效、运转良好的代谢网络。三个最关键的中间代谢物:三个最关键的中间代谢物:6磷酸葡萄糖、丙酮酸、磷酸葡萄糖、丙酮酸、乙酰乙酰CoA(二)分解代谢和合成代谢的单向
2、性(二)分解代谢和合成代谢的单向性(三)(三)ATP是通用的能量载体是通用的能量载体(四)(四)NADPH以还原力形式携带能量以还原力形式携带能量糖、脂类、蛋白质、核酸代谢之间的联系16.1.2 代谢途径间的相互关系(一一)糖代谢与脂类代谢的相互关系糖代谢与脂类代谢的相互关系(二二)糖代谢与蛋白质代谢的相互关系糖代谢与蛋白质代谢的相互关系(三三)脂类代谢与蛋白质代谢的相互关系脂类代谢与蛋白质代谢的相互关系(四四)核酸与糖类、脂类、蛋白质代谢的相互关系核酸与糖类、脂类、蛋白质代谢的相互关系 脂肪脂肪甘油甘油磷酸二羟丙酮磷酸二羟丙酮糖代谢糖代谢脂肪酸脂肪酸乙酰乙酰CoA琥珀酸琥珀酸糖糖(植物植物)
3、乙醛酸循环乙醛酸循环-氧化氧化糖异生糖异生TCA糖糖乙酰乙酰CoA,NADPH脂肪酸脂肪酸磷酸二羟丙酮磷酸二羟丙酮-磷酸甘油磷酸甘油脂肪脂肪有有氧氧化氧氧化酵解酵解从头合成从头合成糖代谢与脂类代谢的相互联系延胡索酸延胡索酸琥珀酸琥珀酸苹果酸苹果酸草酰乙酸草酰乙酸3-磷酸甘油磷酸甘油三羧酸三羧酸循环循环乙醛酸乙醛酸循环循环甘油甘油乙酰乙酰 CoA三酰三酰甘油甘油脂肪酸脂肪酸 氧氧化化 糖原(或淀粉)糖原(或淀粉)1,6-二磷酸果糖二磷酸果糖磷酸二羟丙酮磷酸二羟丙酮磷酸烯醇丙酮酸磷酸烯醇丙酮酸丙酮酸丙酮酸合合成成植物或植物或微生物微生物脂肪代谢和糖代谢的关系糖代谢与蛋白质代谢的相互联系 糖代谢为蛋
4、白质的合成提供碳源和能源:如糖分糖代谢为蛋白质的合成提供碳源和能源:如糖分解过程中可产生丙酮酸,丙酮酸经解过程中可产生丙酮酸,丙酮酸经TCATCA循环产生循环产生酮戊二酸和草酰乙酸,它们均可经加氨基或氨基移换酮戊二酸和草酰乙酸,它们均可经加氨基或氨基移换作用形成相应的氨基酸。另外,糖分解过程中产生的作用形成相应的氨基酸。另外,糖分解过程中产生的能量可供氨基酸和蛋白质的合成之用。能量可供氨基酸和蛋白质的合成之用。蛋白质分解产生的氨基酸,在体内可以转变为糖。蛋白质分解产生的氨基酸,在体内可以转变为糖。如:多数氨基酸在脱氨后转变为丙酮酸,经糖原异生如:多数氨基酸在脱氨后转变为丙酮酸,经糖原异生作用可
5、生成糖,这类氨基酸称为生糖氨基酸。作用可生成糖,这类氨基酸称为生糖氨基酸。糖代谢与蛋白质代谢联系图示糖糖-酮酸酮酸 氨基酸氨基酸 蛋白质蛋白质 NH3蛋白质蛋白质 氨基酸氨基酸 -酮酸酮酸 糖糖 (生糖氨基酸(生糖氨基酸)脂类代谢与蛋白质代谢的相互联系脂肪脂肪甘油甘油磷酸二羟丙酮磷酸二羟丙酮脂肪酸脂肪酸乙酰乙酰CoA氨基酸碳架氨基酸碳架氨基酸氨基酸蛋白质蛋白质蛋白质蛋白质氨基酸氨基酸酮酸或乙酰酮酸或乙酰CoA脂肪酸脂肪酸脂肪脂肪(生酮氨基酸)(生酮氨基酸)氨基酸氨基酸核酸与糖、脂类、蛋白质代谢的联系 核苷酸的一些衍生物具重要生理功能(如核苷酸的一些衍生物具重要生理功能(如CoACoA、NAD+
6、NAD+,NADP+NADP+,cAMPcAMP,cGMPcGMP)。)。核酸是细胞内重要的遗传物质,控制着蛋白质的合核酸是细胞内重要的遗传物质,控制着蛋白质的合成,影响细胞的成分和代谢类型成,影响细胞的成分和代谢类型 核酸生物合成需要糖和蛋白质的代谢中间产物参加,核酸生物合成需要糖和蛋白质的代谢中间产物参加,而且需要酶和多种蛋白质因子。而且需要酶和多种蛋白质因子。各类物质代谢都离不开具备高能磷酸键的各种核苷酸各类物质代谢都离不开具备高能磷酸键的各种核苷酸,如,如ATPATP是能量的是能量的“通货通货”,此外,此外UTPUTP参与多糖的合成,参与多糖的合成,CTPCTP参与磷脂合成,参与磷脂合
7、成,GTPGTP参与蛋白质合成与糖异生作用。参与蛋白质合成与糖异生作用。(胞液)(胞液)(线粒体)(线粒体)(PEP)丙氨酸丙氨酸天冬氨酸天冬氨酸谷氨酸谷氨酸(转氨基作用)(转氨基作用)糖的分解代谢与糖异生的关系16.2 代谢调节代谢调节 生命是靠代谢的正常运转维持的。生命有限的空间内同生命是靠代谢的正常运转维持的。生命有限的空间内同时有那麽多复杂的代谢途径在运转,必须有灵巧而严密的调时有那麽多复杂的代谢途径在运转,必须有灵巧而严密的调节机制,才能使代谢适应外界环境的变化与生物自身生长发节机制,才能使代谢适应外界环境的变化与生物自身生长发育的需要。调节失灵便会导致代谢障碍,出现病态甚至危及育的
8、需要。调节失灵便会导致代谢障碍,出现病态甚至危及生命。在漫长的生物进化历程中,机体的结构、代谢和生理生命。在漫长的生物进化历程中,机体的结构、代谢和生理功能越来越复杂,代谢调节机制也随之更为复杂。功能越来越复杂,代谢调节机制也随之更为复杂。细胞水平调节 酶水平调节 激素水平调节 神经水平调节多细胞整体水平调节多细胞整体水平调节16.2.1 代谢调节的四级水平 代谢途径的区域化:代谢途径的有关酶类,常常组成酶系,分布于细胞的某一区域或亚细胞结构中,使不同代谢途径在不同细胞内进行 区域化的意义:区域化的存在显著影响真核细胞的代谢情况,有利于代谢的调节。例如:脂肪酸的分解与合成16.1.2 细胞结构
9、对代谢途径的分隔控制调节线粒体线粒体:丙酮酸氧化丙酮酸氧化;三羧三羧酸循环酸循环;-氧化氧化;呼吸链电呼吸链电子传递子传递;氧化磷酸化氧化磷酸化细胞质细胞质:酵解酵解;磷磷戊糖途径戊糖途径;糖原糖原合成合成;脂肪酸合脂肪酸合成成;细胞核细胞核:核酸合成核酸合成内质网内质网:蛋白质合成蛋白质合成;磷脂合成磷脂合成细胞结构对代谢途径的分隔控制调节细胞结构对代谢途径的分隔控制调节代谢途径的区域化代谢途径的区域化酶或酶系酶或酶系所在区域所在区域酶或酶系酶或酶系所在区域所在区域糖酵解酶系糖酵解酶系TCA酶系酶系磷酸戊糖途径酶系磷酸戊糖途径酶系脂肪酸脂肪酸氧化酶系氧化酶系脂肪酸合成酶系脂肪酸合成酶系尿素合
10、成酶系尿素合成酶系胞浆胞浆线粒体线粒体胞浆胞浆线粒体线粒体胞浆胞浆线粒体和胞浆线粒体和胞浆蛋白质合成酶系蛋白质合成酶系DNA聚合酶聚合酶RNA聚合酶聚合酶水解酶类水解酶类粗面内质网粗面内质网细胞核细胞核细胞核细胞核溶酶体溶酶体真核细胞内某些酶的区域化分布最基本的最基本的代谢调节代谢调节酶活性调节酶活性调节酶含量调节酶含量调节变构效应(别构)变构效应(别构)共价修饰共价修饰基因表达调控基因表达调控酶的激活与抑制酶的激活与抑制酶的诱导与阻遏酶的诱导与阻遏一、酶活性调节通过改变酶的构象或结构来调节酶的活性,是一种精细的调节。包括抑制作用和激活作用。调节机制:酶原激活;别构效应;共价修饰;聚合和解聚等
11、。一)酶活性的前馈和反馈调节前馈前馈(feedforwardfeedforward):底物对代谢过程的调节作用。底物对代谢过程的调节作用。反馈反馈(feedbackfeedback):代谢产物对代谢过程的调节作用。代谢产物对代谢过程的调节作用。调节机理调节机理:通过酶的通过酶的变构效应变构效应来实现。这种调节可能是来实现。这种调节可能是正调控正调控,也可能是,也可能是负调控负调控。S0SnS2S1E0E1En-1或或+或或+反馈反馈前馈前馈6-6-磷酸葡萄糖对糖原合成的磷酸葡萄糖对糖原合成的前馈激活前馈激活作用作用GUDPG6-P-G+1-P-G糖原糖原糖原糖原 合成酶合成酶ATP ADP U
12、TP UDPG 举例举例反馈抑制(反馈抑制(feedback inhibition):也称负反馈,这是):也称负反馈,这是生物体普遍存在的一种调节机制,反馈抑制是指反应终生物体普遍存在的一种调节机制,反馈抑制是指反应终产物对自身合成途径中的酶活力起抑制作用,大多是对产物对自身合成途径中的酶活力起抑制作用,大多是对第一个酶的活力起抑制作用。第一个酶的活力起抑制作用。反馈抑制在代谢中很多,特别是在氨基酸和核苷反馈抑制在代谢中很多,特别是在氨基酸和核苷酸的生物合成中,这类例子更多。酸的生物合成中,这类例子更多。反硝化作用反硝化作用氧化亚氮氧化亚氮氨甲酰磷酸氨甲酰磷酸分支酸分支酸脱氧庚酮糖酸脱氧庚酮糖
13、酸-7-磷酸磷酸天冬氨酸天冬氨酸天冬氨酰磷酸天冬氨酰磷酸赤藓糖赤藓糖-4-磷酸磷酸脱氢奎尼酸脱氢奎尼酸莽草酸莽草酸谷氨酸谷氨酸磷酸烯醇式丙酮酸磷酸烯醇式丙酮酸 预苯酸预苯酸TryPheTrpIleTrpHisCTPAMPGlnLysMetThr酮丁酸酮丁酸GlyAla谷氨酰胺合酶谷氨酰胺合酶天冬氨酰半醛天冬氨酰半醛高丝氨酸高丝氨酸氨基苯甲酸氨基苯甲酸氨基酸合成的反馈调控 共价修饰(covalent modification):亦称化学修饰,就是酶蛋白 在另一种酶的催化下,在其分子上以共价结合的方式接上或脱去某种特殊的化学基团,从而引起酶活力改变的过程。自从1955年Krebs和Sutherla
14、nd等有关糖原磷酸化酶的研究以来,到目前已经知道的有100多种酶在它被翻译后进行共价修饰。目前已知有6种类型共价修饰酶:磷酸化/脱磷酸化 腺苷酰化/脱腺苷酰化 乙酰化/脱乙酰化 尿苷酰化/脱尿苷酰化 甲基化/脱甲基化 S-S/SH相互转变 意义:代谢作用中关键酶的共价修饰是级联放大的最终阶段(特别是激素调节)。二)共价修饰 激酶激酶ATPADP磷酸化酶磷酸化酶 b(无活性)(无活性)磷酸化酶磷酸化酶a P(有活性)(有活性)磷酸酯酶磷酸酯酶-OHH2OP例:糖原磷酸化酶的共价修饰例:糖原磷酸化酶的共价修饰糖原磷酸化酶磷酸化/脱磷酸化共价修饰表示通式磷酸化酶的共价修饰调节糖原合成酶和糖原磷酸化酶
15、修饰的区别糖原合成酶和糖原磷酸化酶修饰的区别 糖原的分解和合成都是根据肌体的需要由一系列的调控机制进行调控,其糖原的分解和合成都是根据肌体的需要由一系列的调控机制进行调控,其限速酶分别为糖原限速酶分别为糖原磷酸化酶磷酸化酶和和糖原合成酶糖原合成酶。它们的活性是受磷酸化或去磷酸化。它们的活性是受磷酸化或去磷酸化的共价修饰的调节及变构效应的调节。二种酶磷酸化及去磷酸化的方式相似,的共价修饰的调节及变构效应的调节。二种酶磷酸化及去磷酸化的方式相似,但其效果相反。但其效果相反。糖原合成酶糖原合成酶 a (有活性有活性)糖原磷酸化酶糖原磷酸化酶 b (无活性无活性)OHOHATPADPH2OPi糖原合成
16、酶糖原合成酶 b (无活性无活性)糖原磷酸化酶糖原磷酸化酶 a (有活性有活性)PP共价修饰与级联放大细胞能量状态指标细胞能量状态指标能荷能荷=ATP+0.5ADPATP+ADP+AMPATPATP ADPATP系统质量作用比系统质量作用比=正常状态,该比值很高。机体的调节也非常灵敏和正常状态,该比值很高。机体的调节也非常灵敏和精确,因此该比值波动很小。精确,因此该比值波动很小。正常情况下,大约为正常情况下,大约为0.90.9,变动范围,变动范围0.850.850.950.95二、酶量的调节 组成酶 诱导酶 酶量的调节通过调节酶合成和降解速度来实酶量的调节通过调节酶合成和降解速度来实现。酶的合
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