遗传代谢性疾病的基因诊断ppt课件.ppt
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- 遗传 代谢 性疾病 基因 诊断 ppt 课件
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1、第十九章第十九章 遗传代谢性疾病遗传代谢性疾病 的基因诊断的基因诊断 退出退出 卫生部卫生部“十一五十一五” 规划教材规划教材 全国高等医药教材建设研究会规划教材全国高等医药教材建设研究会规划教材1 主要内容主要内容 前言前言 一、基因诊断技术一、基因诊断技术 二、遗传代谢性疾病的基因诊断二、遗传代谢性疾病的基因诊断 2l细胞、组织、器官和机体的生存与功能维持都必须细胞、组织、器官和机体的生存与功能维持都必须依赖不断进行的物质代谢过程。依赖不断进行的物质代谢过程。l物质代谢包括合成代谢及分解代谢两个过程。物质代谢包括合成代谢及分解代谢两个过程。l代谢性疾病是物质代谢过程的紊乱,多为酶或蛋白代谢
2、性疾病是物质代谢过程的紊乱,多为酶或蛋白异常所致。异常所致。l根据代谢性疾病的病因,可将其分为原发性和继发根据代谢性疾病的病因,可将其分为原发性和继发性。性。 前前 言言 返回章返回章 3一、代谢性疾病的分类一、代谢性疾病的分类 原发性代谢性疾病:原发性代谢性疾病: 又叫先天性代谢性疾病。是指当编码物质代谢所又叫先天性代谢性疾病。是指当编码物质代谢所需酶或蛋白的基因发生突变、不能合成或合成了无活需酶或蛋白的基因发生突变、不能合成或合成了无活性的产物时,就会导致有关代谢途径不能正常运转,性的产物时,就会导致有关代谢途径不能正常运转,造成具有不同临床表型的各种代谢缺陷病。造成具有不同临床表型的各种
3、代谢缺陷病。继发性代谢性疾病:继发性代谢性疾病: 继发性代谢性疾病是由其它原发性疾病导致的代继发性代谢性疾病是由其它原发性疾病导致的代谢性疾病,如糖尿病导致的继发性高脂血症。谢性疾病,如糖尿病导致的继发性高脂血症。 返回节返回节 4二、代谢性疾病的诊断手段二、代谢性疾病的诊断手段 l过去:过去:主要依靠与物质代谢相关的各种酶的主要依靠与物质代谢相关的各种酶的生物化学方面的诊断生物化学方面的诊断l现在:现在:生化诊断生化诊断+ +基因诊断基因诊断 返回节返回节 5 基因诊断就是利用现代基因诊断就是利用现代分子生物学和分子遗传学的分子生物学和分子遗传学的技术方法技术方法, ,直接检测基因结直接检测
4、基因结构及其表达水平是否正常构及其表达水平是否正常, ,从而对疾病作出诊断的方法。从而对疾病作出诊断的方法。 返回节返回节 6l针对性强针对性强l特异性高特异性高l灵敏度高灵敏度高l适用性强适用性强l诊断范围广诊断范围广 返回节返回节 7 第一节第一节 基因诊断技术基因诊断技术 返回章返回章 8一、一、DNADNA测序技术测序技术 所有生物基因组序列的数所有生物基因组序列的数 据均来自据均来自 DNA DNA 测序测序 特点特点: :l 稳定简便稳定简便l 自动化程度高自动化程度高l 数据准确可靠数据准确可靠l 公认为国际金标准公认为国际金标准 返回节返回节 9原理原理: :l测序基础是以测序
5、基础是以ddNTPddNTP为为测序反应的链终止剂测序反应的链终止剂l掺入到延伸链中的掺入到延伸链中的ddNTPddNTP可阻止后续可阻止后续ddNTPddNTP或或dNTPdNTP的掺入的掺入 返回节返回节 10 返回节返回节 11示例:示例:BigDyeBigDye Terminators Terminatorsl循环测序反应扩增到未端为循环测序反应扩增到未端为BigDye TerminatorsBigDye Terminators的的一系列的核苷酸链。一系列的核苷酸链。l循环测序反应产物经沉淀、洗涤和纯化,从而去除多循环测序反应产物经沉淀、洗涤和纯化,从而去除多余的未反应的余的未反应的B
6、igDye TerminatorsBigDye Terminators。l电泳与结果分析。电泳与结果分析。 返回节返回节 12 返回节返回节 13原理原理: : 引物与模板引物与模板DNADNA退火后,在退火后,在DNADNA聚合酶、聚合酶、ATPATP硫硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶等酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶等4 4种酶种酶的协同作用下,将每一个的协同作用下,将每一个dNTPdNTP的聚合与一次荧光信的聚合与一次荧光信号的释放偶联起来,通过检测荧光的释放和强度,号的释放偶联起来,通过检测荧光的释放和强度,以荧光信号的形式实时记录模板以荧光信号的形式实时记录模板DNADNA
7、的核苷酸序列。的核苷酸序列。 返回节返回节 14 返回节返回节 ABDNA PolymeraseACCTTGAATTCGTCCTAGGAGGATCTTdNTPApyrase(d)NMPPPiATPATP-sulphurylaseLuciferaseLightCTGCTTAAA G T C A G T C A G T C A G T C15基本流程:基本流程:第第1 1步步一个特异性的测序引物和单链一个特异性的测序引物和单链DNADNA模板结合,然后加入酶模板结合,然后加入酶混合物混合物( (包括包括DNA PolymeraseDNA Polymerase、ATP SulfurylaseATP
8、Sulfurylase、LuciferaseLuciferase和三磷酸腺苷双磷酸酶和三磷酸腺苷双磷酸酶Apyrase)Apyrase)和底物混合和底物混合物物( (包括腺苷酰硫酸包括腺苷酰硫酸APSAPS和和Luciferin)Luciferin)。 返回节返回节 16基本流程:基本流程:第第2 2步步向反应体系中加入向反应体系中加入1 1种种dNTPdNTP,如果它刚好能和,如果它刚好能和DNADNA模板的模板的下一个碱基配对,则会在下一个碱基配对,则会在DNA DNA 聚合酶的作用下,添加到聚合酶的作用下,添加到测序引物的测序引物的33末端,同时释放出一个分子的焦磷酸末端,同时释放出一个
9、分子的焦磷酸(PPi)(PPi)。 返回节返回节 (DNA)n+dNTP(DNA)n+1+PPi聚合酶聚合酶17基本流程:基本流程:第第3 3步步在在ATPATP硫酸化酶的作用下,生成的硫酸化酶的作用下,生成的PPiPPi可以和可以和APSAPS结合形成结合形成ATPATP;在荧光素酶的催化下,生成的;在荧光素酶的催化下,生成的ATPATP又可以和荧光素又可以和荧光素结合形成氧化荧光素,同时产生可见光。通过结合形成氧化荧光素,同时产生可见光。通过CCDCCD光学系光学系统即可获得一个特异的检测峰,峰值高低则和相匹配的统即可获得一个特异的检测峰,峰值高低则和相匹配的碱基数成正比。碱基数成正比。
10、返回节返回节 18基本流程:基本流程:第第4 4步步反应体系中剩余的反应体系中剩余的dNTPdNTP和残留的少量和残留的少量ATPATP在在ApyraseApyrase的作的作用下发生降解。用下发生降解。 返回节返回节 dNTPdNDP+dNMP+PiATPADP+AMP+PiATPATP双磷酸酶双磷酸酶ATPATP双磷酸酶双磷酸酶19基本流程:基本流程:第第5 5步步加入另一种加入另一种dNTPdNTP,使,使 第第2 24 4步反应重复进步反应重复进 行,根据获得的峰值行,根据获得的峰值 图即可读取准确的图即可读取准确的DNADNA 序列信息序列信息 返回节返回节 DNA序列GGCC-TA
11、AGGGCCCTT核苷酸递增20 返回节返回节 焦磷酸盐测序法步骤焦磷酸盐测序法步骤21二、聚合酶链反应技术二、聚合酶链反应技术 PCRPCR是体外酶促合成特异是体外酶促合成特异DNADNA片段的方法。片段的方法。l四种主要成分:四种主要成分: DNADNA模板、引物、模板、引物、DNA DNA 聚合酶和聚合酶和dNTPdNTP。l三个反复步骤:三个反复步骤: 高温变性、低温退火和高温变性、低温退火和适温延伸。适温延伸。 返回节返回节 22三、毛细管电泳技术三、毛细管电泳技术 l毛细管电泳统指以高压电场为驱动力,毛细管电泳统指以高压电场为驱动力,以毛细管为分离通道,依据试样中各组以毛细管为分离
12、通道,依据试样中各组分间淌度和分配行为上的差异来实现分分间淌度和分配行为上的差异来实现分离的一类分离技术。离的一类分离技术。l基本原理是根据在电场作用下离子迁移基本原理是根据在电场作用下离子迁移的速度不同而对组分进行分离和分析。的速度不同而对组分进行分离和分析。 返回节返回节 23 返回节返回节 变性高效液相色谱变性高效液相色谱(DHPLC)是一种新的是一种新的高通量筛选高通量筛选DNA序列变异的技术,其原序列变异的技术,其原理是利用离子对反向高效液相色谱原理理是利用离子对反向高效液相色谱原理,通过一个通过一个DNA分离柱,进行核苷酸片段分离柱,进行核苷酸片段的分离和分析。的分离和分析。24四
13、、基因芯片技术四、基因芯片技术 基因芯片技术基因芯片技术就是指将大量特定的靶基因片段就是指将大量特定的靶基因片段或寡核苷酸片段作为探针有序和高密度地排列或寡核苷酸片段作为探针有序和高密度地排列固定于玻璃和硅等固相载体上,然后检测与待固定于玻璃和硅等固相载体上,然后检测与待测的不同荧光标记样品基因按碱基配对的原理测的不同荧光标记样品基因按碱基配对的原理进行杂交,通过激光共聚焦系统检测探针分子进行杂交,通过激光共聚焦系统检测探针分子的杂交信号强度,经计算机分析处理数据资料,的杂交信号强度,经计算机分析处理数据资料,获取不同样品分子的数量和大量生物信息,从获取不同样品分子的数量和大量生物信息,从而可
14、对基因序列及功能进行大规模和高通量的而可对基因序列及功能进行大规模和高通量的研究。研究。 返回节返回节 25 第二节第二节 遗传代谢性疾病的基因诊断遗传代谢性疾病的基因诊断 遗传代谢性疾病是指由于基因突变导致酶的质和量的遗传代谢性疾病是指由于基因突变导致酶的质和量的改变,从而所催化的酶促反应发生变化而引起的一系列疾改变,从而所催化的酶促反应发生变化而引起的一系列疾 病。病。 返回章返回章 26l代谢途径的某些终末产物缺乏代谢途径的某些终末产物缺乏l受累代谢途径中间和或旁路代谢产物大量蓄积受累代谢途径中间和或旁路代谢产物大量蓄积l由于代谢连径受阻而导致对肝、脑、肌肉等蛆织由于代谢连径受阻而导致对
15、肝、脑、肌肉等蛆织能量供应不足能量供应不足一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略 返回节返回节 27l父母双方或者某一方携带着致病基因。父母双方或者某一方携带着致病基因。l多在新生儿期、幼儿或儿童期发病,有些虽然在成多在新生儿期、幼儿或儿童期发病,有些虽然在成人期发病,但在儿童期已有潜在病变。人期发病,但在儿童期已有潜在病变。l临床表现无特异性,多为胃肠道、呼吸系统、神经临床表现无特异性,多为胃肠道、呼吸系统、神经系统症状、代谢性酸中毒。系统症状、代谢性酸中毒。l家族史中往往有同样病情的先证者存在,而且往往家族史中往往有同样病情的先证者存在,而且往往因为饮食和应激
16、等因素而发病。因为饮食和应激等因素而发病。 返回节返回节 28l检测已知的能产生某种特定功能蛋白的基因检测已知的能产生某种特定功能蛋白的基因l检测与某种遗传标志连锁的致病基因检测与某种遗传标志连锁的致病基因l检测表型克隆基因检测表型克隆基因 返回节返回节 29二、苯丙酮酸尿症二、苯丙酮酸尿症(PKU) (PKU) l氨基酸代谢障碍氨基酸代谢障碍l属常染色体隐性遗传属常染色体隐性遗传l我国发病率约为我国发病率约为1/16,5001/16,500 返回节返回节 30l是由于人类肝细胞内苯丙氨酸羟化酶是由于人类肝细胞内苯丙氨酸羟化酶(PAH)(PAH)缺乏或缺乏或活性降低所致。活性降低所致。l上述酶
17、的缺乏或活性降低直接导致体内来源于食物上述酶的缺乏或活性降低直接导致体内来源于食物的苯丙氨酸不能正常转化为酪氨酸,从而使苯丙氨的苯丙氨酸不能正常转化为酪氨酸,从而使苯丙氨酸在体内异常蓄积,并打破大脑氨基酸的平衡而导酸在体内异常蓄积,并打破大脑氨基酸的平衡而导致致PKUPKU。 返回节返回节 31l神经系统症状:神经系统症状: 以智力发育落后为主的障碍。以智力发育落后为主的障碍。l外貌:外貌: 患儿在出生数月后因黑色素合成不足,毛发、皮肤患儿在出生数月后因黑色素合成不足,毛发、皮肤和虹膜色泽变浅。和虹膜色泽变浅。l其他:其他: 呕吐和皮肤湿疹常见;尿和汗液有鼠尿臭味。呕吐和皮肤湿疹常见;尿和汗液
18、有鼠尿臭味。 返回节返回节 32lPAH PAH 基因定位于基因定位于1212号染色体的长臂上,即号染色体的长臂上,即12q24.112q24.1,包括包括1313个外显子和个外显子和1212个内含子,编码个内含子,编码451451个氨基酸个氨基酸的酶单体。的酶单体。lPAH PAH 基因除了缺失突变外,大多是点突变。基因除了缺失突变外,大多是点突变。l由于由于PKU PKU 是第一个可以用饮食控制治疗的遗传病,是第一个可以用饮食控制治疗的遗传病, 因此,对因此,对PKU PKU 产前诊断的研究是非常有意义的。产前诊断的研究是非常有意义的。 返回节返回节 3334三、三、同型胱氨酸尿症同型胱氨
19、酸尿症(HCU) (HCU) l是蛋氨酸先天代谢障碍所致的氨基酸代谢缺是蛋氨酸先天代谢障碍所致的氨基酸代谢缺陷性疾病。陷性疾病。l常染色体隐性遗传病。常染色体隐性遗传病。l基本病因是胱硫醚合成酶基本病因是胱硫醚合成酶(CBS)(CBS)缺乏或活性降缺乏或活性降低导致尿中的同型胱氨酸和蛋氨酸增高。低导致尿中的同型胱氨酸和蛋氨酸增高。 返回节返回节 35l胱硫醚合成酶缺乏型胱硫醚合成酶缺乏型( (简称简称“合成酶型合成酶型”) ),是由,是由同型胱氨酸变为胱硫醚的代谢途径发生阻滞同型胱氨酸变为胱硫醚的代谢途径发生阻滞, ,本本型最为多见。型最为多见。l甲基四氨叶酸甲基四氨叶酸- -同型半胱氨酸甲基
20、转移酶缺乏型同型半胱氨酸甲基转移酶缺乏型( (简称简称“甲基转移酶型甲基转移酶型”) ),是同型半胱氨酸变为,是同型半胱氨酸变为蛋氨酸的代谢途径发生紊乱。蛋氨酸的代谢途径发生紊乱。l5,10-N-5,10-N-甲烯四氢叶酸还原酶缺乏型甲烯四氢叶酸还原酶缺乏型( (简称简称“还原还原酶型酶型”) )。 返回节返回节 36l典型的症状见于胱硫醚合成酶缺乏型的病例典型的症状见于胱硫醚合成酶缺乏型的病例, ,患患儿初生时正常,儿初生时正常,5 59 9个月间起病个月间起病, ,主要症状是骨主要症状是骨骼异常、晶体脱位、血栓形成、智力发育落后、骼异常、晶体脱位、血栓形成、智力发育落后、惊厥等。惊厥等。l
21、“甲基转移酶缺乏型甲基转移酶缺乏型”症状较轻,可有骨骼畸形,症状较轻,可有骨骼畸形,体格和智力发育迟缓。体格和智力发育迟缓。l“还原酶缺乏型还原酶缺乏型”以神经系统状为主,如惊厥、以神经系统状为主,如惊厥、智力低下、精神分裂症状、肌病等。智力低下、精神分裂症状、肌病等。 返回节返回节 37l目前的基因诊断主要集中于分析胱硫醚合成酶的目前的基因诊断主要集中于分析胱硫醚合成酶的基因型。基因型。l可通过绒毛膜绒毛取样可通过绒毛膜绒毛取样(CVS)(CVS)和羊水诊断来对已和羊水诊断来对已有有HCUHCU患儿的家庭中的其他成员进行产前诊断。患儿的家庭中的其他成员进行产前诊断。 返回节返回节 38 返回
22、节返回节 39四、四、酪氨酸血症酪氨酸血症 l芳香族氨基酸代谢缺陷病芳香族氨基酸代谢缺陷病l常染色体隐性遗传常染色体隐性遗传l发病率约为发病率约为1/10,0001/10,000l特征是血液中的酪氨酸水平增高特征是血液中的酪氨酸水平增高 返回节返回节 40l酪氨酸在其分解代谢途径中需要一系列酪氨酸在其分解代谢途径中需要一系列酶的参与,当这些酶缺乏时会导致酪氨酶的参与,当这些酶缺乏时会导致酪氨酸在组织和器官的堆积,从而使血液的酸在组织和器官的堆积,从而使血液的酷氨酸水平增高,并最终导致一系列的酷氨酸水平增高,并最终导致一系列的临床症状。临床症状。 返回节返回节 41分型分型l酪氨酸血症酪氨酸血症
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