基于生物电子等排原理的药物设计课件.ppt
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1、第七章 基于生物电子等排原理的药物设计n电子等排体(isosterism)又称同电异素体。n狭义的电子等排体概念是指原子数及电子总数相同,而且电子排列状态也相同的不同分子或原子团。n广义的电子等排体概念是指具有相同数目价电子的不同分子或原子团,不论原子及电子总数是否相同。例如,-F、SH, -OH、-NH2、-CH3为一系列的电子等排体,-O-、-CH2-、-NH-是另一个系列;-N=、-CH=为一个系列;Ne、HF、H2O与NH3又成一系列。n更为广义的电子等排体概念是由内外层电子数来决定,如-CH=CH-与-NH-, -S-, -CH2-, -O-为电子等排体,因而“苯”与“噻唑”也为电子
2、等排体。同样-O-与-NH-为电子等排体,因而“呋喃”与“吡咯”也是电子等排体;CH3-与Br-为电子等排体,因而“甲苯”和“溴苯”也是电子等排体等等。 n由于电子等排体具有相近的物理化学性质,因而,在设计新药时可在具有生物活性的分子中,以一个电子等排体取代另一个,常导致具有与母体化合物类似的生物活性或有与母体化合物起拮抗的作用。利用这一规律设计新药的道理,称为药物化学中的生物电子等排原理(bioisosterism principles)。 第一节第一节 生物电子等排体的发展演化过程生物电子等排体的发展演化过程 一、生物电子等排体的提出与发展一、生物电子等排体的提出与发展n生物电子等排体(b
3、ioisosterism)是由化学电子等排体衍化而来的。化学电子等排体概念是由Langmuir于1919年首先提出的。n原子、官能团和分子由于类似的电子结构,其物理化学性质也相似。这些类似性往往发生在元素周期表中同族原子中,即外层电子相同或近似、其大小和质量相差不大的那些原子。而横排相近的那些原子则很少有相同趋向。 n Langmuir概念的关键是最外层电子的数目和排列必须相同。表6-1是有关N2和CO2物理比较,以及由Langmuir例举的某些数据,证明N2和CO2也有类似的关系。 表6-1 性 质 N2 CO2黏度(20)14810-614810-6液态密度(+10)0.8560.858液
4、态折射指数(16)1.1931.190液态介电常数(0)1.5891.582醇中溶解度(15)3.2503.1301925年,Grimm建立了一套氢化物取代规则。 表6-2 Crimm氢化物取代规则 表6-3 Crimm氢化物取代规则(续)SiPSClArSiHPHSHHClSiH2PH2SH2SiH3PH3SiH4CNOFNeCHNHOHFHCH2NH2OH2CH3NH3CH4nErlenmeyer等扩展了电子等排体概念,同时也加进了一些条件。n他认为,外周电子层结构必须在形状、大小、极化度方面要近似,并且化合物应是同晶形的或可共晶的,一对电子等排体分子应适合于同一晶格。虽然遇到过一些这种化
5、合物,但要求条件太苛刻。n表6-4例举了一些能够成对形成混合晶体的化合物。表6-4 二者能形成混合共晶体的某些化合物C6H5-N=N-C6H5C6H5-O-CH2-C6H5C6H5-CH=CH-C6H5C6H5-NH-CH2-C6H5CH3-C6H4-C6H4-CH3Cl-C6H4-C6H4-ClC6H5-O-CH2-C6H5C6H5-NH-NH-C6H5C6H5-CH2-CH2C6H5C6H5-CH2-CH2C6H5n后来Hinsberg首先提出了电子等排体-CH=CH-被-S-取代,并开始注意到各种芳杂环的相互交换,如噻吩、苯、吡啶、吡咯和呋喃作为电子等排基团的相互取代。n以上的研究与生物
6、活性分子无直接关系,然而却为向生物科学的渗透奠定了基础。nFriedman于1951年恰当地引用了生物电子等排体的术语,从此该术语的含意就逐渐扩展开了。n近代生物电子等排体的概念认为:生物电子等排体不仅应具有相同总数外层电子,还应在分子大小、形状(键角、杂化度)、构象、电子分布(极化度、诱导效应、共轭效应、电荷、偶极等)、脂水分布系数、pKa、化学反应性(代谢相似性)和氢键形成能力等方面存在相似性。n这些参数不全部要求相似,仅在某些重要参数上求其相近,并与生物活性存在相关性。n如具有相近脂水分配系数的生物电子等排体,称等疏水性等排体;n具有相近电性效应参数的,称等电性等排体;n具有相近立体效应
7、参数的,称等立体性等排体。以上多种性质相似者可称作等电性、等疏水性、等立体性生物电子等排体。 表6-5 某些官能团的等电性、等疏水性与等立体性官能团mEsF0.340.140.78Cl0.370.710.27Br0.390.860.08I0.351.12-0.16CF30.430.88-0.16SCF30.491.44COMe0.31-0.55CHO0.36-0.65COOMe0.32-0.01CH=CHNO20.320.11n由表6-5可知,所列10种官能团的m相近,具有等电性,为等电性电子等排体。表中Cl、Br及CF3的值相近,为等疏水性电子等排体,-COMe与-CHO也属此类。就Es而论
8、,I与CF3为等立体性电子等排体。n任意两种上述相近性质的官能团可为兼有这些性质的电子等排体。如I与CF3即具有等电性又具有等立体性,可称为等电性-等立体性电子等排体。就Br与CF3而论,其m、有相近性,可称为等电性-等疏水性电子等排体。n在药物设计中,可根据、m、Es三方面的不同要求选择有关的取代基。如等电性为主导影响,则可选等电性生物电子等排体。如需三方面兼顾,则应选三方面均近似的取代基。n例如,羧苄西林的侧链羧基改变为巯基或酰胺基,其电性效应参数m分别为: 0.37、0.25及0.28,其立体参数MR分别为6.93、9.22及9.81,有相似性,存在等电性及等立体性;但脂水分布系数值相差
9、较大,分别为-0.32、0.39及-1.49,不存在等疏水性。因此,在羧基被疏水基酰胺基置换后,仍存在相应的抑菌效力,但由于疏水性的不同,在作用强度上有所差异。CHCONHCOOHNOSCOOHCH3CH3n羟基的、Es、m值分别为-0.67、0.69和0.12;巯基则分别为0.39、0.17和0.25,三者均不相近,此二种电子等排体如在芳环上相互置换,往往生成对抗物。n如机体正常代谢物质次黄嘌呤(6-羟基嘌呤)中的羟基改换为巯基,则成为抗代谢物,有抗白血病疗效。NNNHNSHNNNHNOHn磺胺类药物的对位氨基换为羟基,其生物活性相差极大。n氨基的为-1.23,m为-0.16,Es为0.63
10、。羟基的相应值分别为-0.67,0.12及0.69,n二者的m及值相差较大,而无等电性及等疏水性,因为电性效应与疏水性对活性影响较大,因此严重影响其生物活性。SO2NHRNH2n构象与生物活性之间也存在重要相关性,具有相近构象的电子等排体或基本结构称作等构象性电子等排异构体。n等构象性可用单晶X-射线衍射数据来表达。-内酰胺类抗菌活性结构中,环上羧基应在假横键位置,而非活性构象中羧基则在假竖键位置。按此构效关系,-内酰胺环酰胺键上的氧原子与羧基碳原子或磺酸基上硫原子的距离介于3.03.9时,具有抗菌活性,如在4.1以上,则不具抗菌活性。NSORCONHCOOH二、生物电子等排体的分类二、生物电
11、子等排体的分类n近代,Burger等人按照其发展衍化过程,将生物电子等排体分成了如下两种类型:n(一)经典的生物电子等排体,包括:n1、一价原子和基团n2、二价原子和基团n3、三价原子和基团n4、四取代的原子n5、环系等价体n(二)非经典的生物电子等排体,包括:n1、可交换的基团n2、环与非环结构n经典的一价电子等排体主要包括卤素和-XHn基团,X为C、N、O和S。n二价电子等排体原子和基团包括R-O-R、R-NH-R、R-CH2-R和R-Si-R,n三价电子等排体原子仅限于C和N,三价基团的形式为R-N=R和R-CH=R,n四价电子等排体原子仅有三个元素构成,=C=、=N+=和=P+=,这三
12、个基团的形式并不代表三维特征,多数情况下接近一个四面体。n与环内电子等排体有关的基团是-CH=CH-、-S-、-O-、-HN-和-CH2-的相互交换。 n非经典的生物电子等排体,即前述的近代生物电子等排体概念,它不是刻板地迎合经典生物电子等排体的立体和电性规则。如下列出了一些化学结构存在生物电子等排现象,可相互更换的生物电子等排体n羰基 n羧基:-COOH, -SO2NHR, -SO3H, -PO(OH)NH2, -PO(OH)OEt,-CONHCNC OCCNCNSOSO2SO2NOC NOHCCNCONOHOHOONNNNn羟基:-OH, -NHCOR, -NHSO2R, -CH2OH,
13、-NHCONH2, -NHCN, -CH(CN)2n邻苯二酚:n卤素:-F, -Cl, -Br, -I, -CH3, -CN, -N(CN)2, -C(CN)3n硫醚: HOHOHNNXNOHOOOHX=OX=NRNSOCCNNCn硫脲: n甲亚胺:-N= n吡啶: n空间近似基:-(CH2)3- CNHNCNNH2CNHSNH2CNHCHNO2NH2CCNNNNO2RNR2第二节第二节 经典的生物电子等排体在新药设计中的应用经典的生物电子等排体在新药设计中的应用 一、一价原子或基团的取代一、一价原子或基团的取代n例例1:儿茶酚胺类药物的酚羟基被其烷基磺酰胺电子等排体取代的某些化合物有激动剂活
14、性,而另一些则为拮抗剂 n烷基磺酰胺基和酚羟基被认为都类似地与受体部位相匹配,因此,二者都能在肾上腺能受体引起反应 CHOHCH2NHCH3OHXCHOHCH2NHCH3NHXCH3SO2受体受体苯肾上腺素苯肾上腺素的烷基磺酰胺化合物n例例2:口服降血糖药丁磺酰脲(carbutamide)的-NH2被其生物电子等排体-CH3或Cl取代,分别得到甲磺丁脲(tolbutamide)和氯磺丙脲(chlorpropamide),具有更长的生物半衰期并降低了毒性。 H2NSO2NHCONHC4H9CH3SO2NHCONHC4H9ClSO2NHCONHC4H9丁磺酰脲甲磺丁脲氯磺丁脲n例例3:叶酸的-OH
15、被其电子等排体-NH2取代,生成其代谢拮抗剂氨基喋呤(aminopterin),同样次黄嘌呤和鸟嘌呤的6-OH被-SH取代,得到抗代谢类抗癌药6-巯基嘌呤(6-mercaptopurine)和6-巯基鸟嘌呤(6-thioguamine),n这些含硫的结构,-N=C(SH)-和-NH-C=S作为氧的电子等排体在类似的生物相中发挥作用。 NNNNH2NCH2NHCONHCHCH2CJ2COOHCOOHNNNHNSHNNNHNSHH2N6-巯基嘌呤6-巯基鸟嘌呤氨基蝶呤n例例4:巴比妥(barbital)和硫巴比妥(thiopental)为另一例子,后者由于脂溶性大,迅速透过血脑屏障沉积于脂质中,产
16、生迅速短暂的作用,适于静脉诱导麻醉。CC2H5C2H5COCONHNHCOCC2H5C2H5COCONHNHCS巴比妥硫巴比妥 二、二价原子或基团的交换二、二价原子或基团的交换 1、酯和酰胺的交换、酯和酰胺的交换n生物电子等排体取代最常见于二价原子和基团之间发生,此处的立体相似性是借助于键角的相似性,如表所示。n相连结的基团也以类似的方式在空间分布,这在酯和酰胺的电子等排关系中得以证实。n在酯类化合物中,C-O-C键的旋转受到共轭和脂烃的限制,在优势上,顺式构型(Z)较反式(E)有利(如下式)。对酰胺的研究也证明了类似的平面结构,其优势构型(Za)同于顺式的酯。 基团OSNHCH2键角(o)1
17、08311221113111.53COCOCCOCOCCOCOCCOCNHCOCNHCCZEZ2、-O-、-S-、-NH-和和-CH2-的相互交换的相互交换n例例1:H1受体拮抗剂类抗组胺药,二苯烃胺(diphenhydramine)最初用-NH-代替了醚-O-后,用非经典的方法作了广泛的修饰。随后的结构修饰是加一个苯环到亚胺基氮上,导致了强效抗组胺药安体根和新安体根(antergan;neo-antergan)的发现。 CHOCH2CH2NMe2CHNHCH2CH2NMe2NC6H5CH2CH2CHN(CH3)2C6H5NN CH2CH2N(CH3)2CH2CH3O苯海拉明苯阿拉明安体根新安
18、体根n例例2:丁咪胺(burimamide)侧链-CH2-被-S-取代生成了甲咪硫胺(metiamide),使更有利于对改善H2抗组胺活性所要求的电子和构象的效应。硫胺部分进一步应用电子等排体修饰,由甲咪硫胺-NHC(S)NH-到胍-NHC(NH)NH-,导致了西咪替丁(cimetidine)的合成。NNHCH2CH2CH2CH2NHCNHCH3SNNHCH2SCH2CH2NHCNHCH3CH3SNNHCH2SCH2CH2NHCNHCH3CH3NCN丁咪胺甲咪硫胺西咪替丁n例例3:吩噻嗪类抗精神失常药氯丙嗪(chlorpromazine)杂环中的-S-和-N-被其电子等排体-CH2CH2-和=
19、C=取代,导致了抗抑郁药丙咪嗪(imipramine)和阿咪替林(amitriptyline)的发现和发展。7-员环进一步修饰,-CH2-被电子等排体-O-取代,产生了精神病治疗药物多塞平(doxepin)。NSCH2CH2CH2N(CH3)2ClNCH2CH2CH2N(CH3)2CCHCH2CH2N(CH3)2氯丙嗪丙咪嗪阿米替林多塞平CCHCH2CH2N(CH3)2On3、芳杂环中、芳杂环中-CH=CH-被其电子等排体被其电子等排体-S-或或-O-取取代在新药设计中十分常见,且成功率极高。代在新药设计中十分常见,且成功率极高。n例例:磺胺吡啶(sulfapyridine)中的杂环以这种方式
20、取代生成了疗效更高的磺胺噻唑(sulfathiazole )、磺胺异恶唑(sulphafurazole)和磺胺甲基噻唑(sulphamethizole)等。H2NSO2NHN磺胺吡啶SO2NHH2NNSSO2NHH2HONH3CCH3SO2NHH2NNSCH3磺胺噻唑磺胺异恶唑磺胺甲基噻唑 三、三价原子或基团的交换三、三价原子或基团的交换n1、芳环中的、芳环中的-CH=被被-N=取代是经典的电子等排体理论取代是经典的电子等排体理论最成功的应用之一最成功的应用之一n例例1:强效抗组胺药新安替根就是由安替根中的苯环被吡啶环代替衍化而来的。吡啶环的缺电子使氮的电子对能够与水分子形成氢键,该亲水性的增
21、加使生物活性显著提高。NC6H5CH2CH2CHN(CH3)2C6H5NN CH2CH2N(CH3)2CH2CH3O安体根新安体根n新安体根中的吡啶氨基-N=被电子等排体-CH=取代,生成了氯苯那敏(扑尔敏),作用强,持续时间短,相对消除了抗组胺药的催眠副作用。吡啶和对氯苯基取代基对-CH=的电性效应,使有利于与生物受体相互作用的药物分子中正电中心的形成。NN CH2CH2N(CH3)2CH2CH3O氯苯那敏新安体根NNCln2、苯环苯环被被吡啶吡啶环取代也有效地改善了三环类环取代也有效地改善了三环类抗组胺药和安定镇静药的活性抗组胺药和安定镇静药的活性n例如:1-氮杂异丙嗪(isothiope
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