组织学与胚胎学课件.ppt
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- 组织学 胚胎学 课件
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1、生物化学与分子生物学教研室 第第1 14 4章章 DNADNA的生物合成(复制)的生物合成(复制)DNA Biosynthesis ( Replication )生物化学与分子生物学教研室 复制复制(replication)(replication) 是以是以DNA为模板的为模板的DNA合成,合成,是基因组的复制过程。在这个过程中,亲代是基因组的复制过程。在这个过程中,亲代DNA作为作为合成模板,按照碱基配对原则合成子代分子,其化学合成模板,按照碱基配对原则合成子代分子,其化学本质是酶促脱氧核苷酸聚合反应。本质是酶促脱氧核苷酸聚合反应。 复制复制亲代亲代DNA子代子代DNA生物化学与分子生物学
2、教研室 n本章主要内容:本章主要内容:DNADNA复制的基本规律复制的基本规律DNA复制的酶学和拓扑学变化复制的酶学和拓扑学变化原核生物原核生物DNADNA复制的过程复制的过程真核生物真核生物DNADNA生物合成过程生物合成过程逆转录和其他复制方式逆转录和其他复制方式 生物化学与分子生物学教研室 DNADNA复制的基本特征复制的基本特征Basic Rules of DNA Replication第第 一一 节节生物化学与分子生物学教研室 复制的方式复制的方式半保留复制半保留复制 (semi- conservative replication) 双向复制双向复制 (bidirectional r
3、eplication) 半不连续复制半不连续复制 (semi-discontinuous replication) 一、复制的基本规律:一、复制的基本规律: 生物化学与分子生物学教研室 DNADNA生物合成时,母链生物合成时,母链DNADNA解开为两股单链,解开为两股单链,各自作为模板各自作为模板(template)(template)按碱基配对规律,合成按碱基配对规律,合成与模板互补的子链。子代细胞的与模板互补的子链。子代细胞的DNADNA,一股单链,一股单链从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全从新从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全从新合成。两个子细胞的合成。两个子细胞的DNADNA都
4、和亲代都和亲代DNADNA碱基序列一碱基序列一致。这种复制方式称为致。这种复制方式称为半保留复制半保留复制。(一)半保留复制(一)半保留复制概念概念: :生物化学与分子生物学教研室 AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC母链母链DNADNACCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTG复制过程中形成复制过程中形成的复制叉的复制叉AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+子代子代DNADNA生物化学与分子生物学教研室 按半保留复制方式,子代按半保留复
5、制方式,子代DNADNA与亲代与亲代DNADNA的的碱基序列一致碱基序列一致,即子代保留了亲代,即子代保留了亲代的全部遗传信息,体现了遗传的的全部遗传信息,体现了遗传的保守性保守性。半保留复制的意义半保留复制的意义: :遗传的保守性,是物种稳定性的分子遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,但基础,但不是绝对的不是绝对的。生物化学与分子生物学教研室 原核生物复制时,原核生物复制时,DNADNA从从起始点起始点向两个方向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉复制叉(replication fork)(replication fork),称为称为双向复制双向复制。
6、复制中的复制叉的形成复制中的复制叉的形成(二) DNA复制从起始点向两个方向延伸复制从起始点向两个方向延伸复制叉复制叉生物化学与分子生物学教研室 A. 环状双链环状双链DNA及复制起始点及复制起始点B. 复制中的两个复制叉复制中的两个复制叉C. 复制接近终止点复制接近终止点(termination, ter)oriterA B C生物化学与分子生物学教研室 真核生物每个染色体有多个起始点,是多真核生物每个染色体有多个起始点,是多复制子的复制。习惯上把两个相邻起始点复制子的复制。习惯上把两个相邻起始点之间的距离定为一个之间的距离定为一个复制子复制子(replicon) 。复。复制子是独立完成复制
7、的功能单位。制子是独立完成复制的功能单位。 53oriorioriori53生物化学与分子生物学教研室 553353oriorioriori53复制子复制子5533解链方向解链方向ori生物化学与分子生物学教研室 (三) DNA一股子链复制的方向与解链方一股子链复制的方向与解链方向相反导致半不连续复制向相反导致半不连续复制3 5 3 3 5 3 5 3 5 解链方向解链方向领头链领头链(leading strand)后随链后随链(lagging strand)生物化学与分子生物学教研室 领头链领头链(leading strand) :顺着解链方向生成的子顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的
8、,这股链称为领头链。链,复制是连续进行的,这股链称为领头链。后随链后随链(lagging strand) :另一股链因为复制的方另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称为后随链。,这股不连续复制的链称为后随链。冈崎片段冈崎片段(okazaki fragment) :复制中复制中后随链后随链上上的不连续片段的不连续片段。半不连续复制:半不连续复制:领头链连续复制而随从链不连续领头链连续复制而随从链不连续复制。复制。生物化学与分子生物学教研室 DNADNA复制的酶学和拓扑学变化复制的酶学和拓扑学变化第第 二二 节
9、节The Enzymology and Topology of DNA Replication生物化学与分子生物学教研室 n参与参与DNADNA复制的物质复制的物质: : 底物底物(substrate):dATP, dGTP, dCTP, dTTP; 模板模板(template):解开成单链的解开成单链的DNA母链;母链; 引物引物(primer):提供提供3 -OH末端使末端使dNTP可以依次可以依次聚合;聚合; 聚合酶聚合酶(polymerase):(polymerase): 依赖依赖DNADNA的的DNADNA聚合酶,简聚合酶,简写为写为 DNA-polDNA-pol; 其他的其他的酶酶
10、和蛋白质因子。和蛋白质因子。生物化学与分子生物学教研室 核苷酸和核苷酸之间生成磷酸二酯键核苷酸和核苷酸之间生成磷酸二酯键(dNMP)n + dNTP (dNMP)n+1 + PPi生物化学与分子生物学教研室 n聚合反应的特点:DNA 新链生成需新链生成需引物引物和和模板模板; 新链的延长只可沿新链的延长只可沿5 3 方向进行。方向进行。生物化学与分子生物学教研室 一、DNA聚合酶催化核苷酸之间聚合全称:全称:依赖依赖DNA的的DNA聚合酶聚合酶 (DNA-dependent DNA polymerase)简称:简称:DNA-pol活性:活性:1) 51) 53 3 的聚合活性的聚合活性2) 2
11、) 核酸外切酶活性核酸外切酶活性生物化学与分子生物学教研室 5 C G C T T C A G G A T A 3 | | | | | | | | | | |3 T C G A A G T C C T A G C G A C 5 3 5 外切酶活性外切酶活性: 5 3 外切酶活性外切酶活性:?能切除突变的能切除突变的DNADNA片段。片段。能辨认错配的碱基对,并将其水解。能辨认错配的碱基对,并将其水解。n核酸外切酶活性核酸外切酶活性: : 生物化学与分子生物学教研室 DNA-pol DNA-pol DNA-pol (一)原核生物的(一)原核生物的DNADNA聚合酶分为三型聚合酶分为三型生物化学
12、与分子生物学教研室 催化催化DNA聚合聚合参与参与DNA损损伤的应急状态伤的应急状态修复修复修复合成、修复合成、切除引物、切除引物、填补空隙填补空隙功能功能20?400分子数分子数/ /细胞细胞10?1亚基数亚基数+5 5 外切酶活性外切酶活性+ 5 5 外切酶活性外切酶活性+5 5 聚合酶活性聚合酶活性pol IIIpol IIpol I原核生物中的原核生物中的DNA聚合酶聚合酶生物化学与分子生物学教研室 n功能:功能:1. DNA-pol (109kD)对复制中的错误进行校读,对复制和修复对复制中的错误进行校读,对复制和修复中出现的空隙进行填补。中出现的空隙进行填补。生物化学与分子生物学教
13、研室 323个氨基酸个氨基酸小片段小片段5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性大片段大片段/Klenow 片段片段 604个氨基酸个氨基酸DNA聚合酶活性聚合酶活性 5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性N 端端C 端端木瓜蛋白酶木瓜蛋白酶DNA-pol Klenow片段是实验室合成片段是实验室合成DNA,进行,进行分子生物学研究中常用的工具酶。分子生物学研究中常用的工具酶。 生物化学与分子生物学教研室 2. DNA-pol (120kD) DNA-pol II基因发生突变,细菌依然能存活。基因发生突变,细菌依然能存活。 DNA-pol 对模板的特异性不高,即使在已发生对模板的特异性不高,即使在已发生损伤
14、的损伤的DNA模板上,它也能催化核苷酸聚合。因模板上,它也能催化核苷酸聚合。因此认为,它参与此认为,它参与DNA损伤的应急状态修复。损伤的应急状态修复。生物化学与分子生物学教研室 n功能:功能:3.DNA-pol (250kD)是原核生物复制延长中真正起催化作用的酶。是原核生物复制延长中真正起催化作用的酶。目录目录个核心酶个核心酶1个个 -复合物(复合物( 、 、 、 、 、 6种亚基)种亚基)1对对 -亚基(可滑动的亚基(可滑动的DNA夹子)夹子)DNA聚合酶聚合酶全酶结构全酶结构全酶结构包括:全酶结构包括:生物化学与分子生物学教研室 (二)常见的真核细胞(二)常见的真核细胞DNADNA聚合
15、酶有五种聚合酶有五种起始引起始引发,引发,引物酶活物酶活性性+-高高高高高高?中中12.514.04.016.5分子量分子量(kD)DNA-pol填补引物填补引物空隙,切空隙,切除修复,除修复,重组重组线粒体线粒体DNADNA复复制制5 5 3 3 聚合酶活性聚合酶活性16.5参与损参与损伤与修伤与修复复生物学功能生物学功能3 3 5 5 外切酶活性外切酶活性延长子链延长子链的主要酶,的主要酶,解螺旋酶解螺旋酶活性活性+25.5生物化学与分子生物学教研室 二、二、DNADNA聚合酶的碱基选择和校对功能聚合酶的碱基选择和校对功能实现复制的保真性实现复制的保真性 复制按照碱基配对规律进行,是遗传信
16、息能复制按照碱基配对规律进行,是遗传信息能准确传代的基本原理。准确传代的基本原理。 此外还需酶学的机制来保证复制的保真性。此外还需酶学的机制来保证复制的保真性。生物化学与分子生物学教研室 遵守严格的碱基配对规律;遵守严格的碱基配对规律;聚合酶在复制延长时对碱基的选择功能;聚合酶在复制延长时对碱基的选择功能;复制出错时复制出错时DNA-polDNA-pol的及时校读功能。的及时校读功能。nDNADNA复制的保真性至少要依赖三种机制:复制的保真性至少要依赖三种机制:生物化学与分子生物学教研室 (一)复制的保真性依赖正确的碱基选择(一)复制的保真性依赖正确的碱基选择 DNADNA聚合酶靠其大分子结构
17、协调非共价(氢键)聚合酶靠其大分子结构协调非共价(氢键)与共价(磷酸二酯键)键的有序形成。与共价(磷酸二酯键)键的有序形成。 嘌呤的化学结构能形成顺式和反式构型,与相应嘌呤的化学结构能形成顺式和反式构型,与相应的嘧啶形成氢键配对,嘌呤应处于反式构型。的嘧啶形成氢键配对,嘌呤应处于反式构型。 生物化学与分子生物学教研室 (二)核酸外切酶活性在复制中辨认切除错配(二)核酸外切酶活性在复制中辨认切除错配碱基并加以校正碱基并加以校正核酸外切酶核酸外切酶(exonuclease)(exonuclease)是指能从核酸链是指能从核酸链的末端把核苷酸依次水解出来的酶,外切酶的末端把核苷酸依次水解出来的酶,外
18、切酶是有方向性的。是有方向性的。 生物化学与分子生物学教研室 A A:DNA-polDNA-pol的外切酶活性切除错配碱基;并用其聚合活的外切酶活性切除错配碱基;并用其聚合活性掺入正确配对的底物。性掺入正确配对的底物。B B:碱基配对正确,:碱基配对正确, DNA-polDNA-pol不表现活性。不表现活性。DNA pol 的校读功能的校读功能生物化学与分子生物学教研室 三、复制中的解链伴有三、复制中的解链伴有DNADNA分子拓分子拓扑学变化扑学变化DNADNA分子的碱基埋在双螺旋内部,只有把分子的碱基埋在双螺旋内部,只有把DNADNA解成单链,它才能起模板作用。解成单链,它才能起模板作用。生
19、物化学与分子生物学教研室 (一)解螺旋酶(一)解螺旋酶(helicasehelicase)Dna BDna C解链方向解链方向生物化学与分子生物学教研室 DNA聚合酶不能从头合成聚合酶不能从头合成DNA链,只能延链,只能延长已有的长已有的DNA或或RNA引物链。引物链。引物酶引物酶在复制起始时催化在复制起始时催化RNA引物引物合成,合成,提供提供3 -OH末端,使末端,使DNA-pol能够催化能够催化dNTP聚合。聚合。(二)引物酶(二)引物酶(PrimasePrimase)生物化学与分子生物学教研室 53 5RNA引引物物55RNA引引物物3 引物酶属引物酶属DNA指导的指导的RNA聚合酶聚
20、合酶,但不同于催,但不同于催化转录过程的化转录过程的RNA聚合酶。在聚合酶。在E.coli,引物酶是,引物酶是dnaG基因的产物基因的产物DnaG。生物化学与分子生物学教研室 (三)(三) 单链单链DNADNA结合蛋白(结合蛋白(SSBSSB) 在复制中维持模板处于单链状态并保护单链在复制中维持模板处于单链状态并保护单链的完整。的完整。生物化学与分子生物学教研室 108局部解链后局部解链后(四)(四)DNADNA拓扑异构酶拓扑异构酶复制过程正超螺旋的形成:复制过程正超螺旋的形成:改变改变DNA超螺旋状态、理顺超螺旋状态、理顺DNA链链生物化学与分子生物学教研室 解链过程中正超螺旋的形成解链过程
21、中正超螺旋的形成生物化学与分子生物学教研室 既能水解既能水解 、又能连接磷酸二酯键。、又能连接磷酸二酯键。 拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶n拓扑异构酶分类:拓扑异构酶分类:n拓扑异构酶作用特点:拓扑异构酶作用特点:生物化学与分子生物学教研室 拓扑异拓扑异构酶构酶切断切断DNADNA双链中双链中一股一股链,使链,使DNADNA解解链旋转不致打结;适当时候封闭链旋转不致打结;适当时候封闭切口,切口,DNADNA变为松弛状态变为松弛状态。反应反应不需不需ATPATP。拓扑异拓扑异构酶构酶切断切断DNADNA分子分子两股两股链,断端通过链,断端通过切口旋转使超螺旋松弛。切口旋转使超螺旋松弛。
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