DNA的生物合成9课件.ppt
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- DNA 生物 合成 课件
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1、目录目录第第10章章DNA的生物合成的生物合成(常考点:(常考点:DNA生物合成的大致过程及生物合成的大致过程及各过程所用的酶;各过程所用的酶;DNA损伤及修复;逆损伤及修复;逆 转录和逆转录酶)转录和逆转录酶)目录目录复制复制(replication) 是指遗传物质的传代,是指遗传物质的传代,以母链以母链DNA为模板合成子链为模板合成子链DNA的过程。的过程。复制复制亲代亲代DNA子代子代DNA目录目录n本章主要内容:本章主要内容: 复制的基本规律复制的基本规律 DNA复制的酶学和拓扑学变化复制的酶学和拓扑学变化 复制的过程复制的过程 逆转录和其他复制方式逆转录和其他复制方式 DNA损伤(突
2、变)与修复损伤(突变)与修复复制的基本规律复制的基本规律(掌握内容较少)(掌握内容较少)第第 一一 节节目录目录本本节节主主要要内内容:容:目录目录复制的方式复制的方式 半保留复制半保留复制(semi-conservative replication)双向复制双向复制(bidirectional replication)半不连续复制半不连续复制(semi-discontinuous replication) n复制的基本规律复制的基本规律 目录目录一、半保留复制是一、半保留复制是DNA复制的基本特征复制的基本特征(掌握)(掌握) DNA生物合成时,母链生物合成时,母链DNA解开为两解开为两股单
3、链,各自作为模板股单链,各自作为模板(template)按碱基配按碱基配对规律,合成与模板互补的子链。子代细对规律,合成与模板互补的子链。子代细胞的胞的DNA,一股单链从亲代完整地接受过,一股单链从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全从新合成。两个子来,另一股单链则完全从新合成。两个子细胞的细胞的DNA都和亲代都和亲代DNA碱基序列一致。碱基序列一致。这种复制方式称为这种复制方式称为半保留复制半保留复制。n半保留复制半保留复制的概念的概念: :AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTG
4、AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+母链母链DNA复制过程中形成复制过程中形成的复制叉的复制叉子代子代DNAn密度梯度实验密度梯度实验: : 实验结果支持实验结果支持半保留复制半保留复制的设想。的设想。含重氮含重氮-DNA的细菌的细菌培养于普培养于普通培养液通培养液 第一代第一代继续培养于继续培养于普通培养液普通培养液 第二代第二代梯度离心结果梯度离心结果目录目录体现了遗传的体现了遗传的保守性保守性。n半保留复制的意义半保留复制的意义: :遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,遗传的保守性,是物种稳定性的分子
5、基础,但但不是绝对的不是绝对的。目录目录 原核生物复制时,原核生物复制时,DNA从从起始点起始点(origin)向两向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,称为叉,称为双向复制双向复制。 二、二、DNA复制从起始点向两个方向复制从起始点向两个方向延伸形成双向复制(了解)延伸形成双向复制(了解)A. 环状双链环状双链DNA及复制起始点及复制起始点B. 复制中的两个复制叉复制中的两个复制叉C. 复制接近终止点复制接近终止点(termination, ter)oriterA B C目录目录 真核生物每个染色体有真核生物每个染色体有多个起始点,是多复制子的复
6、多个起始点,是多复制子的复制制。从一个。从一个DNA复制起始点起始的复制起始点起始的DNA复制起始区复制起始区域称为域称为复制子复制子 。复制子是独立完成复制的功能单位。复制子是独立完成复制的功能单位(原核一个起始点原核一个起始点)。)。 53oriorioriori5353oriorioriori535533553复制复制3目录目录三、三、DNA一股子链复制的方向与解链一股子链复制的方向与解链方向相反导致半不连续复制(熟悉)方向相反导致半不连续复制(熟悉)3 5 3 5 解链方向解链方向3 5 3 3 5 领头链领头链(leading strand)随从链随从链(lagging strand
7、)目录目录 顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,这股链称为这股链称为领头链领头链(leading strand) 。 另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的能顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称为链称为随从链随从链(lagging strand) 。复制中的不连。复制中的不连续片段称为续片段称为岡崎片段岡崎片段(okazaki fragment)。 领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的半不连续性。制的半不连续性。
8、 目录目录DNA复制的酶学和拓扑学变化复制的酶学和拓扑学变化第第 二二 节节(掌握内容较多)(掌握内容较多)目录目录本本节节主主要要内内容:容:目录目录n参与参与DNA复制的物质(了解)复制的物质(了解): 底物底物(substrate): dATP, dGTP, dCTP, dTTP; 聚合酶聚合酶(polymerase): 依赖依赖DNA的的DNA聚合酶,聚合酶,简写为简写为 DNA-pol; 模板模板(template): 解开成单链的解开成单链的DNA母链;母链; 引物引物(primer): 提供提供3 -OH末端使末端使dNTP可以依次可以依次聚合;聚合; 其他的酶和蛋白质因子。其他
9、的酶和蛋白质因子。目录目录一、一、核苷酸和核苷酸之间生成磷酸二酯键是核苷酸和核苷酸之间生成磷酸二酯键是复制的基复制的基本化学反应(了解)本化学反应(了解)(dNMP)n + dNTP (dNMP)n+1 + PPi目录目录n聚合反应的特点(了解)聚合反应的特点(了解): : DNA 新链生成需新链生成需引物引物和和模板模板; 新链的延长只可沿新链的延长只可沿5 3 方向进行。方向进行。目录目录二、二、DNA聚合酶聚合酶催化核苷酸之间聚合催化核苷酸之间聚合(掌握)(掌握) 全称:全称:依赖依赖DNA的的DNA聚合酶聚合酶 (DNA-dependent DNA polymerase,DDDP) 简
10、称简称: DNA聚合酶聚合酶 (DNA-pol) 活性:活性:1. 53 的聚合活性的聚合活性2. 核酸外切酶活性核酸外切酶活性5 A G C T T C A G G A T A 3 | | | | | | | | | | |3 T C G A A G T C C T A G C G A C 5 3 5 外切酶活性外切酶活性: 5 3 外切酶活性外切酶活性:?能切除突变的能切除突变的 DNA片段。片段。能辨认错配的碱基对,并将其水解。能辨认错配的碱基对,并将其水解。n核酸外切酶活性核酸外切酶活性: : 目录目录(一)原核生物的(一)原核生物的DNA聚合酶聚合酶分为三型分为三型(掌握)掌握) D
11、NA-pol DNA-pol DNA-pol 目录目录(一)(一)原核生物的原核生物的DNA聚合酶聚合酶(掌握酶活性及功能)(掌握酶活性及功能)可能可能不可能不可能可能可能基因突变后的致死性基因突变后的致死性无无无无有有5 3 核酸外切酶活性核酸外切酶活性20?400分子数分子数/细胞细胞多亚基不对称多亚基不对称二聚体二聚体?单肽链单肽链组成组成250120109分子量分子量(kD)DNA-pol IIIDNA-pol IIDNA-pol I可能可能不可能不可能可能可能基因突变后的致死性基因突变后的致死性无无无无有有5 3 核酸外切酶活性核酸外切酶活性20?400分子数分子数/细胞细胞多亚基不
12、对称多亚基不对称二聚体二聚体?单肽链单肽链组成组成250120109分子量分子量(kD)DNA-pol IIIDNA-pol IIDNA-pol I可能可能不可能不可能可能可能基因突变后的致死性基因突变后的致死性无无无无有有5 3 核酸外切酶活性核酸外切酶活性20?400分子数分子数/细胞细胞多亚基不对称多亚基不对称二聚体二聚体?单肽链单肽链组成组成250120109分子量分子量(kD)DNA-pol IIIDNA-pol IIDNA-pol I可能可能不可能不可能可能可能基因突变后的致死性基因突变后的致死性无无无无有有5 3 核酸外切酶活性核酸外切酶活性20?400分子数分子数/细胞细胞多亚
13、基不对称多亚基不对称二聚体二聚体?单肽链单肽链组成组成250120109分子量分子量(kD)DNA-pol IIIDNA-pol IIDNA-pol I校读,切除校读,切除引物引物, 填补填补空隙空隙应急修复应急修复子链延长子链延长可可能能不不可可能能可可能能基基因因突突变变后后的的致致死死性性无无无无有有5 3 核核酸酸外外切切酶酶活活性性20?400分分子子数数/细细胞胞多多亚亚基基不不对对称称二二聚聚体体?单单肽肽链链组组成成250120109分分子子量量(kD)DNA-pol IIIDNA-pol IIDNA-pol I可可能能不不可可能能可可能能基基因因突突变变后后的的致致死死性性无
14、无无无有有5 3 核核酸酸外外切切酶酶活活性性20?400分分子子数数/细细胞胞多多亚亚基基不不对对称称二二聚聚体体?单单肽肽链链组组成成250120109分分子子量量(kD)DNA-pol IIIDNA-pol IIDNA-pol I目录目录 DNA-pol (了解)(了解)目录目录323个氨基酸个氨基酸小片段小片段5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性大片段大片段/Klenow 片段片段 604个氨基酸个氨基酸DNA聚合酶活性聚合酶活性 5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性N 端端C 端端木瓜蛋白酶木瓜蛋白酶DNA-pol Klenow片段是实验室合成片段是实验室合成DNA,进行,进行分子生物学研究
15、中常用的工具酶。分子生物学研究中常用的工具酶。 目录目录 DNA-pol (了解)(了解) DNA-pol II基因发生突变,细菌依然能存活。基因发生突变,细菌依然能存活。 DNA-pol 对模板的特异性不高,即使在已发生损伤的对模板的特异性不高,即使在已发生损伤的DNA模板上,它也能催化核苷酸聚合。因此认为,它参模板上,它也能催化核苷酸聚合。因此认为,它参与与DNA损伤的应急状态修复(损伤的应急状态修复(SOS修复)。修复)。目录目录 DNA-pol (熟悉熟悉)目录目录(二)常见的真核细胞(二)常见的真核细胞DNA聚合酶有五种(了解)聚合酶有五种(了解)DNA-pol 起始引发,有引物酶活
16、性。起始引发,有引物酶活性。延长子链的主要酶,有解螺旋酶活性。延长子链的主要酶,有解螺旋酶活性。参与低保真度的复制参与低保真度的复制 。在复制过程中起校读、修复和填补缺在复制过程中起校读、修复和填补缺口的作用。口的作用。在线粒体在线粒体DNA复制中起催化作用。复制中起催化作用。DNA-pol DNA-pol DNA-pol DNA-pol 目录目录真核生物的真核生物的DNA聚合酶聚合酶填填补补引引物物空空隙隙,切切除除修修复复,重重组组延延长长子子链链的的主主要要酶酶,解解螺螺旋旋酶酶活活性性线线粒粒体体DNA复复制制低低保保真真度度的的复复制制起起始始引引发发,引引物物酶酶活活性性功功能能+
17、-3 5 核核酸酸外外切切酶酶活活性性高高高高高高?中中5 3 聚聚合合活活性性25.512.514.04.016.5分分子子量量(kD)DNA-pol填填补补引引物物空空隙隙,切切除除修修复复,重重组组延延长长子子链链的的主主要要酶酶,解解螺螺旋旋酶酶活活性性线线粒粒体体DNA复复制制低低保保真真度度的的复复制制起起始始引引发发,引引物物酶酶活活性性功功能能+-3 5 核核酸酸外外切切酶酶活活性性高高高高高高?中中5 3 聚聚合合活活性性25.512.514.04.016.5分分子子量量(kD)DNA-pol目录目录三、三、核酸外切酶的校读活性和碱基选择功能是核酸外切酶的校读活性和碱基选择功
18、能是复制保真性的酶学依据复制保真性的酶学依据(掌握)(掌握)目录目录遵守严格的碱基配对规律;遵守严格的碱基配对规律;聚合酶在复制延长时对碱基的选择功能;聚合酶在复制延长时对碱基的选择功能;复制出错时复制出错时DNA-pol的及时校读功能。的及时校读功能。nDNA复制的保真性至少要依赖三种机制复制的保真性至少要依赖三种机制(掌握)(掌握):目录目录四、复制中的分子解链伴有四、复制中的分子解链伴有DNA 分子拓扑学变化分子拓扑学变化(掌握)(掌握)DNA分子的碱基埋在双螺旋内部,只有把分子的碱基埋在双螺旋内部,只有把DNA解成单链,它才能起模板作用。解成单链,它才能起模板作用。目录目录(一)多种酶
19、参与(一)多种酶参与DNA解链和稳定单链状态解链和稳定单链状态(掌握)(掌握)理顺理顺DNA链链拓扑异构酶拓扑异构酶 (gyrA, B)稳定已解开的单链稳定已解开的单链单链单链DNA结合蛋白结合蛋白SSB催化催化RNA引物生成引物生成引物酶引物酶DnaG (dnaG)运送和协同运送和协同DnaBDnaC (dnaC)解开解开DNA双链双链解螺旋酶解螺旋酶DnaB (dnaB)辨认起始点辨认起始点DnaA (dnaA)蛋白质(基因)蛋白质(基因)通用名通用名功能功能原核生物复制起始的相关蛋白质原核生物复制起始的相关蛋白质目录目录E. Coli 基因图基因图目录目录解螺旋酶解螺旋酶(helicas
20、e)利用利用ATP供能,作用于供能,作用于氢键,使氢键,使DNA双链解开成为两条单链。双链解开成为两条单链。引物酶引物酶(primase) 复制起始时催化生成复制起始时催化生成RNA引物的酶。引物的酶。单链单链DNA结合蛋白结合蛋白(single stranded DNA binding protein, SSB) 在复制中维持模板处于单链状在复制中维持模板处于单链状态并保护单链的完整态并保护单链的完整。 目录目录108局部解链后局部解链后(二)(二)DNA拓扑异构酶改变拓扑异构酶改变DNA超螺旋状态、超螺旋状态、理顺理顺DNA链链(掌握)(掌握)n复制过程正超螺旋的形成:复制过程正超螺旋的形
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