十三RNA生物合成(精品PPT)课件.ppt
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1、第十四章第十四章 RNARNA的生物合成的生物合成转录转录第一节第一节 概述概述第二节第二节 DNADNA指导下指导下RNARNA的合成的合成第三节第三节 原核生物原核生物RNARNA转录后的加工转录后的加工第三节第三节 真核生物真核生物RNARNA的转录过程的转录过程第四节第四节 催化活性催化活性RNARNA核酶及其功能核酶及其功能第一节第一节 概述概述1、概念概念及及DNA的模板链和编码链的模板链和编码链5、转录的特点转录的特点2、RNARNA聚合酶及催化特点聚合酶及催化特点3、DNADNA模板上的启动子模板上的启动子4 4、终止子和终止因子终止子和终止因子转录的概念和转录的概念和DNA的
2、模板链和编码链的模板链和编码链转录:是在转录:是在DNADNA指导下的指导下的RNARNA聚合酶的催化下,按聚合酶的催化下,按照碱基配对的原则,以四种核苷酸为原料合成一条照碱基配对的原则,以四种核苷酸为原料合成一条与模板与模板DNADNA互补的互补的RNARNA的过程。的过程。 RNARNA的转录从的转录从DNADNA模板的特定位点开始,模板的特定位点开始,该部位该部位称为转录起始位点(称为转录起始位点(start pointstart point),而终止于模),而终止于模板上的特殊顺序,称之为终止子(板上的特殊顺序,称之为终止子(terminatorterminator)或)或终止位点(终
3、止位点(termination sitetermination site)。)。启动子启动子: 能够被能够被RNA聚合酶识别并与之结合,从而调聚合酶识别并与之结合,从而调控基因的转录与否及转录强度的一段大小为控基因的转录与否及转录强度的一段大小为20200bp的的DNA序列,称之为启动子(序列,称之为启动子(promoter)。)。 转录单位转录单位:DNADNA中指导转录一条中指导转录一条RNARNA链的全部序列。从链的全部序列。从启动子到终止子之间的全部启动子到终止子之间的全部DNADNA序列称为转录单位。序列称为转录单位。53转录单位转录单位下游下游上游上游启动子启动子终止子终止子结构基
4、因结构基因 基因的本义是指负责编码一条多肽链的基因的本义是指负责编码一条多肽链的DNA片片段。后来发现,有的基因只转录成段。后来发现,有的基因只转录成RNA(如(如tRNA或或rRNA)而不编码多肽链,所以,基因的确切定)而不编码多肽链,所以,基因的确切定义应是:被转录成义应是:被转录成RNA的的DNA片段。将负责编码蛋片段。将负责编码蛋白质多肽链的白质多肽链的DNA片段称为结构基因(片段称为结构基因(structural gene)。)。 一个转录单位可以是单个基因一个转录单位可以是单个基因单顺反子单顺反子(monocistron),也可以是多个基因),也可以是多个基因多顺反多顺反子(子(p
5、olycistron)。)。53肽1肽2肽3肽4原核细胞原核细胞mRNAAUGAC GC UGGUGC AGUAA53帽子尾巴一条肽真核细胞真核细胞mRNA真核细胞mRNA的编码序列只指导一条肽链的合成,称为单顺反子mRNA。原核细胞mRNA的编码序列可指导几条肽链的合成,称为多顺反子mRNA。209页页(启动子)启动子)210页页(终止子(终止子 )结构基因结构基因模板链模板链:DNA:DNA链中被转录的一条链称模板链或负(链中被转录的一条链称模板链或负(- -)链;非编码链。链;非编码链。编码链编码链: :与模板链互补的与模板链互补的DNADNA链称为非模板链或正链称为非模板链或正(+ +
6、)链。他与从基因上转录的)链。他与从基因上转录的RNARNA在碱基序列上在碱基序列上是一致的,只是是一致的,只是DNADNA中用中用T T代替了代替了U U,故又称编码链。,故又称编码链。533355DNARNA转录方向转录方向模板链模板链编码链编码链 为了叙述的方便,习惯上以编码链为准,将转录为了叙述的方便,习惯上以编码链为准,将转录起始位点的起始位点的5-端称为上游(端称为上游(upstream),),3-端称端称为下游(为下游(downstream)。将转录起始位点标记为)。将转录起始位点标记为+1,那么,上游以负数表示,如,那么,上游以负数表示,如-10、-35等,下游等,下游则以正数
7、表示,如则以正数表示,如+50、+100等。等。 RNA RNA聚合酶(聚合酶(RNApolymeraseRNApolymerase)是在)是在19601960年分别年分别由由L.HurwitzL.Hurwitz和和S.weissS.weiss发现。发现。(1 1)全酶全酶 由多亚基组成由多亚基组成,2 2称为全酶。称为全酶。 识别转录起始点并参与解链。识别转录起始点并参与解链。(2 2)2 2 称为称为核心酶核心酶,负责,负责RNARNA链链的的延长。延长。 因子因子功能功能 识别并结合启动子。识别并结合启动子。 RNARNA聚合酶聚合酶1.1.概念概念大肠杆菌RNA聚合酶的结构示意图 核心
8、酶核心酶( (2 2 ) )起始因子起始因子 和模板和模板DNADNA结合结合与底物结合与底物结合酶的连接、装配酶的连接、装配全酶全酶( ( ) )(1 1)模板:)模板:DNADNA(2 2)活化的底物有四种三磷酸核苷酸)活化的底物有四种三磷酸核苷酸ATPATP、 GTPGTP、UTPUTP、CTPCTP(3 3)二价的金属离子,主要是)二价的金属离子,主要是MgMg+2+2、MnMn+2 +2 RNARNA聚合酶合成的方向聚合酶合成的方向5353,即,即RNARNA聚合酶聚合酶沿模板链沿模板链 3535方向移动。合成一条与被转录方向移动。合成一条与被转录的的DNADNA互补和反平行的互补和
9、反平行的RNARNA链。链。2. RNA2. RNA聚合酶的催化特点聚合酶的催化特点 RNARNA聚合酶与聚合酶与DNADNA聚合酶不同,它不要求引物,也聚合酶不同,它不要求引物,也没有核酸外切酶的活性,缺乏校对功能,故没有核酸外切酶的活性,缺乏校对功能,故RNARNA合成合成错误率约为错误率约为10105 5,远低于,远低于DNADNA聚合酶的精确性(聚合酶的精确性(10109 9- -10101010)。所以可以产生非遗传上的错误。)。所以可以产生非遗传上的错误。 RNA聚合酶催化的反应聚合酶催化的反应ACGACGUU模板模板DNA5 3 5 3 新合成新合成RNA1.1.概念概念能够被能
10、够被RNA聚合酶识别并聚合酶识别并与之结合,从而调控基因与之结合,从而调控基因的转录与否及转录强度的的转录与否及转录强度的一段大小为一段大小为20200bp的的DNA序列,称之为启动子序列,称之为启动子(promoter)。)。 DNADNA模板上的启动子模板上的启动子目前已知的全部原核生物基因及绝大部分目前已知的全部原核生物基因及绝大部分真核生物基因的启动子位于转录起始位点的真核生物基因的启动子位于转录起始位点的上游序列中,只有真核生物上游序列中,只有真核生物RNA聚合酶聚合酶III的的启动子位于转录起始位点的下游序列中。启动子位于转录起始位点的下游序列中。 原核生物不同基因的启动子虽然在结
11、构上存原核生物不同基因的启动子虽然在结构上存在一定的差异,但具有明显的共同特征:在一定的差异,但具有明显的共同特征:在基因的在基因的55端,直接与端,直接与RNARNA聚合酶结合,控制转聚合酶结合,控制转录的起始和方向;录的起始和方向;都含有都含有RNARNA聚合酶的识别位点、结合位点和起始聚合酶的识别位点、结合位点和起始位点;位点;都含有保守序列,而且这些序列的位置是固定的,都含有保守序列,而且这些序列的位置是固定的,如如-35-35序列,序列,-10-10序列等。序列等。2.2.启动子特点启动子特点 对于大多数启动子来说,在上游对于大多数启动子来说,在上游-35bp-35bp附近存在附近存
12、在一段共有序列(一段共有序列(consensus sequenceconsensus sequence):):TTGACATTGACA,RNARNA聚合酶的聚合酶的亚基识别该序列并使核心酶与启动子亚基识别该序列并使核心酶与启动子结合,故又称结合,故又称-35-35序列序列,为,为RNARNA聚合酶的识别位点聚合酶的识别位点; -10-10序列序列又叫又叫PribnowPribnow盒(盒(PribnowPribnow box box),其共),其共有序列为有序列为TATAATTATAAT,是,是RNARNA聚合酶与之牢固结合并将聚合酶与之牢固结合并将DNADNA双链打开的部位,即双链打开的部位
13、,即结合位点结合位点,形成所谓的开放,形成所谓的开放性启动子复合物。性启动子复合物。大肠杆菌启动子共有序列的功能大肠杆菌启动子共有序列的功能 AGTCTTGACA AAT TTAAAT AACTGT AAT Pribnow框框-10-35识别区识别区16-19bp5-9bp起点-10-10区区:双螺旋打开形成开放启动复合物的区域。:双螺旋打开形成开放启动复合物的区域。-35-35区区:启动子不仅控制着转录起始的序列,并决:启动子不仅控制着转录起始的序列,并决定着某一基因的表达强度(定着某一基因的表达强度(-35-35区),启动子分为区),启动子分为强启动子和弱启动子。强启动子和弱启动子。DNA
14、DNA聚合酶和启动子亲和力聚合酶和启动子亲和力高,转录效率高,具有强启动子的基因被频繁转高,转录效率高,具有强启动子的基因被频繁转录,而弱启动子的基因很少转录。录,而弱启动子的基因很少转录。1. 1. 依赖于依赖于因子的终止子因子的终止子2. 2. 不依赖于不依赖于因子的终止子因子的终止子E.coliE.coli 的转录终止有两种机制:的转录终止有两种机制:1.1.概念概念终终 止止 子和终止因子子和终止因子提供转录停止信号的提供转录停止信号的DNADNA序列称为终止子。序列称为终止子。协助协助RNARNA聚合酶识别终止信号的辅助因子聚合酶识别终止信号的辅助因子(蛋白质)则称为终止因子(蛋白质
15、)则称为终止因子 (termination (termination factor)factor)。不依赖于不依赖于因子的终止子的回文结构因子的终止子的回文结构A. 不依赖于不依赖于Rho( )的)的终止子终止子富含富含G-C系列系列U合成的合成的RNA尾部的序列特征:尾部的序列特征: 二重对称的序列形成发卡结二重对称的序列形成发卡结构;在发卡结构的茎基部富含构;在发卡结构的茎基部富含G-C对;发卡结构可减缓或暂对;发卡结构可减缓或暂停合成;停合成;尾部有约尾部有约6个连续的(模板个连续的(模板链上是一串链上是一串A)U;当;当RNA转转录物生产后,发卡结构立即形录物生产后,发卡结构立即形成,
16、迫使聚合酶停止作用。成,迫使聚合酶停止作用。 1. 以以DNA为模板酶促合成为模板酶促合成RNA; RNA聚合酶必须以双链聚合酶必须以双链DNA中的一条中的一条链(或单链链(或单链DNA)为模板,按照)为模板,按照A与与U、G与与C配对的原则,将配对的原则,将4种核糖核苷酸(种核糖核苷酸(NTP)以以3,5-磷酸二酯键的方式聚合起来。磷酸二酯键的方式聚合起来。转录的特点转录的特点2. DNA双链中只有一条链被转录成双链中只有一条链被转录成RNA;不对称转录不对称转录 :以:以DNA一股链为模板转录一股链为模板转录RNA的方式。的方式。在在DNA链上编码链和模板链是相对的,在同一链上编码链和模板
17、链是相对的,在同一DNA分子上的某些部分基因以这条链作模板,而在另一区分子上的某些部分基因以这条链作模板,而在另一区域别的基因中则以该域别的基因中则以该DNA分子另一条链为模板分子另一条链为模板 不对称性转录。不对称性转录。3. 转录的方向为转录的方向为 53。 第二节第二节 DNA指导下指导下RNA的合成的合成 模板的识别模板的识别转录起始转录起始转录延伸转录延伸转录终止转录终止 在在亚基的帮助下,亚基的帮助下,RNARNA聚合酶识别并结合聚合酶识别并结合到启动子上,到启动子上,RNARNA聚合酶以全酶的形式辨认聚合酶以全酶的形式辨认DNADNA启启动子。动子。 注意注意: :核心酶不能识别
18、启动子。核心酶不能识别启动子。 亚基的主要作用亚基的主要作用: :促进促进RNARNA聚合酶识别启动聚合酶识别启动子顺序子顺序, , 还参与促使还参与促使DNADNA双螺旋打开并以其中的双螺旋打开并以其中的一条链作为模板进行转录。一条链作为模板进行转录。模板的识别模板的识别 亚基识别亚基识别-35-35序列并与核心酶一起结合在启序列并与核心酶一起结合在启动子上。动子上。RNARNA聚合酶与聚合酶与-10-10序列牢固结合并将序列牢固结合并将DNADNA双链打开,形成开放性启动子复合物,双链打开,形成开放性启动子复合物,RNARNA的转的转录开始。录开始。 当形成新当形成新RNARNA的第一个磷
19、酸二酯键后,的第一个磷酸二酯键后,亚基亚基即由全酶中解离出来即由全酶中解离出来,由核心酶继续进行转录。,由核心酶继续进行转录。 转录的起始转录的起始全酶的作用:选择起始部位并启动转录全酶的作用:选择起始部位并启动转录核心酶的作用:核心酶的作用:延长延长RNARNA链链 绝大多数新合成的绝大多数新合成的RNARNA链的链的5-5-末端是末端是pppApppA或或pppGpppG,说明转录的起始核苷酸是三磷,说明转录的起始核苷酸是三磷酸腺苷或三磷酸鸟苷。酸腺苷或三磷酸鸟苷。1. 1. 当第一个磷酸二酯键生成后,释出当第一个磷酸二酯键生成后,释出亚基。亚基。2. 2. 核心酶即沿核心酶即沿DNADN
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