DNA生物合成过程课件.ppt
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- DNA 生物 合成 过程 课件
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1、 第三篇第三篇基因信息的传递基因信息的传递授课教师授课教师 蔡文秀蔡文秀* * DNADNA通过基因表达,决定了蛋白质的结构通过基因表达,决定了蛋白质的结构、功能、功能 * * DNADNA通过复制,将基因信息代代相传通过复制,将基因信息代代相传 * * RNARNA参与参与DNADNA遗传信息的表达遗传信息的表达 * * RNARNA也可作为某些病毒遗传信息的载体也可作为某些病毒遗传信息的载体本本 篇篇 主主 要要 内内 容容1、复制(、复制(replicationreplication) 2、基因表达、基因表达转录(转录(transcriptiontranscription) 翻译(翻译(
2、translationtranslation)3、基因表达调控、基因表达调控4、基因工程(基因工程(genetic engineering )genetic engineering )(gene expression)gene expression)(control of gene expression)control of gene expression) 第十章第十章 DNA的生物合成的生物合成 复制复制 (replication)(replication) 由亲代由亲代DNADNA合成两个相同的子代合成两个相同的子代 DNADNA的过程。的过程。 复制复制亲代亲代DNA子代子代DNA本章
3、主要内容:本章主要内容:1 1、复制的基本规律、复制的基本规律2 2、复制的酶学和拓扑学变化、复制的酶学和拓扑学变化3 3、DNADNA生物合成过程生物合成过程4 4、逆转录和其他复制方式、逆转录和其他复制方式5 5、DNADNA损伤与修复损伤与修复第一节第一节 复制的基本规律复制的基本规律一、半保留复制一、半保留复制 (semi-conservative replication)二、双向复制二、双向复制 (bidirectional replication)三、半不连续复制三、半不连续复制 (semi-discontinuous replication)四、复制的高保真性四、复制的高保真性
4、(high fidelity)子链继承母链遗传信息的几种可能方式子链继承母链遗传信息的几种可能方式 全保留式全保留式 半保留式半保留式 混合式混合式 一、半保留复制一、半保留复制(一)半保留复制的定义(一)半保留复制的定义复制时,母链的双链复制时,母链的双链DNA解开成两股单链,各解开成两股单链,各自作为模板指导子代合成新的互补链。子代细自作为模板指导子代合成新的互补链。子代细胞的胞的DNA双链,其中一股单链从亲代完整地接双链,其中一股单链从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全重新合成。由于碱受过来,另一股单链则完全重新合成。由于碱基互补,两个子细胞的基互补,两个子细胞的DNA双链,都和亲代母
5、双链,都和亲代母链链DNA碱基序列一致。这种复制方式称为碱基序列一致。这种复制方式称为半保半保留复制(留复制(semi-conservative replication)。AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+母链母链DNA 复制过程中形成复制过程中形成的复制叉的复制叉子代子代DNA (二)半保留复制的实验依据(二)半保留复制的实验依据(三)半保留复制的意义(三
6、)半保留复制的意义 1、使亲代、使亲代DNA所含的信息以极高的准确度传所含的信息以极高的准确度传递给子代递给子代DNA分子。分子。 2、DNA通过复制和基因表达这两种主要功能,通过复制和基因表达这两种主要功能,决定了生物的特性和类型并体现了遗传过程的决定了生物的特性和类型并体现了遗传过程的相对保守性相对保守性。遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,但遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,但不是绝对的。不是绝对的。二、双向复制二、双向复制(一)双向复制的定义(一)双向复制的定义复制时,复制时,DNA从从起始点(起始点(origin)向两个向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复方向解链,形成两个
7、延伸方向相反的复制叉,称为制叉,称为双向复制双向复制(bidirectional replication) 。复制中的放射自显影图象复制中的放射自显影图象(三)真核生物的双向复制(三)真核生物的双向复制真核生物每个染色体有多个起始点,是多真核生物每个染色体有多个起始点,是多复制子的复制。复制子的复制。习惯上把两个相邻起始点之间的距离定为习惯上把两个相邻起始点之间的距离定为一个一个复制子复制子(replicon) 。复制子是独立完。复制子是独立完成复制的功能单位。成复制的功能单位。 三、复制的半不连续性三、复制的半不连续性DNA双螺旋的两条链是反平行的,而双螺旋的两条链是反平行的,而DNA合成的
8、合成的方向只能是方向只能是53 。在在DNA复制时,复制时,1条链的合成方向和复制叉的前条链的合成方向和复制叉的前进方向相同,可以连续复制,叫作进方向相同,可以连续复制,叫作前导链前导链(leading strand);而另一条链的合成方向和复);而另一条链的合成方向和复制叉的前进方向正好相反,不能连续复制,只能制叉的前进方向正好相反,不能连续复制,只能分成几个片段(分成几个片段(冈崎片段)冈崎片段)合成,称之为合成,称之为滞后链滞后链(lagging strand)。)。领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的的半不连续复制半不连续复制。3 5
9、3 5 解链方向解链方向3 5 3 3 5 领头链领头链(leading strand)随从链随从链(lagging strand)半不连续复制半不连续复制四、复制的高保真性四、复制的高保真性DNA复制的精确度极高,误差率很低,以保证复制的精确度极高,误差率很低,以保证物种在维持遗传保守性的同时,还要通过变异不物种在维持遗传保守性的同时,还要通过变异不断进化。断进化。DNA复制的高度忠实性至少要依赖三种机制:复制的高度忠实性至少要依赖三种机制:1、遵守严格的碱基配对规律;、遵守严格的碱基配对规律;2、DNA聚合酶在复制延长中对碱基的选择功能;聚合酶在复制延长中对碱基的选择功能;3、复制出错时,
10、、复制出错时,DNA聚合酶的即时校读功能。聚合酶的即时校读功能。 复制的保真性和碱基选择复制的保真性和碱基选择 DNA聚合酶靠其大分子结构协调非共价(氢键)聚合酶靠其大分子结构协调非共价(氢键)与共价(磷酸二酯键)键的有序形成。与共价(磷酸二酯键)键的有序形成。 嘌呤的化学结构能形成顺式和反式构型,与相嘌呤的化学结构能形成顺式和反式构型,与相应的嘧啶形成氢键配对,嘌呤应处于应的嘧啶形成氢键配对,嘌呤应处于反式构型反式构型。 DNA聚合酶的即时校读功能聚合酶的即时校读功能第二节第二节 DNA复制的酶学复制的酶学一、复制的化学反应一、复制的化学反应(一)复制的反应体系(一)复制的反应体系1底物:四
11、种底物:四种 dNTP:dATP 、dTTP、 dGTP、 dCTP2聚合酶:依赖聚合酶:依赖DNA的的DNA聚合酶,聚合酶,DNA- pol;3模板:指解开成单链的模板:指解开成单链的DNA母链;母链;4引物:提供引物:提供3OH末端,使末端,使dNP可以依可以依 次聚合;次聚合;5其他酶和蛋白质因子。其他酶和蛋白质因子。(二)复制的化学反应(二)复制的化学反应在聚合酶的作用下,一个核苷酸在聚合酶的作用下,一个核苷酸 5 5-P和相和相邻的核苷酸上核糖的邻的核苷酸上核糖的3 -OH生成磷酸二酯生成磷酸二酯键而逐一聚合的形成多核苷酸链。键而逐一聚合的形成多核苷酸链。(dNMP)ndNTP(dN
12、MP)n+l ppiDNA链生成过程,链生成过程,DNA 新链生成需新链生成需引物引物和和模板模板; 只能从只能从5-端向端向3-端延长。端延长。复制的化学反应复制的化学反应 (dNMP)n + dNTP (dNMP)n+1 + PPi 二、参与复制的主要酶类二、参与复制的主要酶类(一)(一)DNA聚合酶聚合酶(二)解链解旋酶(二)解链解旋酶(三)引物酶(三)引物酶(四)(四)DNA连接酶连接酶(一)(一)DNA聚合酶聚合酶全称:依赖全称:依赖DNA的的DNA聚合酶(聚合酶(DDDP)缩写:缩写:DNApol活性:活性: 1. 53 的聚合活性的聚合活性 2. 核酸外切酶核酸外切酶活性活性5
13、A G C T T C A G G A T A 3 | | | | | | | | | | |3 T C G A A G T C C T A G C G A C 5 3 5 外切酶活性外切酶活性 5 3 外切酶活性外切酶活性?能切除能切除RNA引物和突变的引物和突变的 DNA片段。片段。能辨认错配的碱基对,并将其水解。能辨认错配的碱基对,并将其水解。 核酸外切酶活性核酸外切酶活性 1原核生物的原核生物的DNA聚合酶聚合酶DNA-pol IDNA-pol IIDNA-pol (1)DNA聚合酶聚合酶:结构特点结构特点单一多肽链,从单一多肽链,从N端到端到C端有端有3个酶促活个酶促活性结构域依次排
14、列:性结构域依次排列:53外切酶、外切酶、35外切酶和外切酶和DNA聚合酶。聚合酶。DNA Pol I在蛋白酶的作用下,可分为大、在蛋白酶的作用下,可分为大、小两个片段。小片段具有小两个片段。小片段具有53外切外切酶活性。大片段(又称为酶活性。大片段(又称为Klenow片段)片段)具有聚合酶活性及具有聚合酶活性及35 外切酶活性,外切酶活性,它对核酸技术十分有用。它对核酸技术十分有用。DNA-pol(109kD)323个氨基酸个氨基酸小片段小片段5 核酸外切核酸外切酶活性酶活性大片段大片段/Klenow 片段片段 604个氨基酸个氨基酸DNA聚合酶活性聚合酶活性 5 核酸外切酶活性核酸外切酶活
15、性N 端端C 端端木瓜蛋白酶木瓜蛋白酶DNA-pol Klenow片段是实验室合成片段是实验室合成DNA,进行,进行分子生物学研究中常用的工具酶。分子生物学研究中常用的工具酶。 DNA-pol I在活细胞内的功能在活细胞内的功能1)53聚合酶的活性:对复制和修复聚合酶的活性:对复制和修复中出现的空隙进行填补。中出现的空隙进行填补。2)35外切酶活性:对复制中错误进外切酶活性:对复制中错误进行即时校读,保证复制的准确性。行即时校读,保证复制的准确性。3)53外切酶活性:可去除外切酶活性:可去除RNA引物引物和突变碱基。和突变碱基。(2)DNA-pol II 53聚合酶活性聚合酶活性35外切酶活性
16、外切酶活性无无53外切酶活性外切酶活性它只是在无它只是在无pol I及及pol 的情况下才起作的情况下才起作用,其真正的功能也未完全清楚,可能用,其真正的功能也未完全清楚,可能在在损伤修复中有特殊作用。损伤修复中有特殊作用。(3)DNA pol-结构特点结构特点由由1010种亚基(种亚基( )组成不)组成不对称异源二聚体。对称异源二聚体。核心酶(核心酶() 亚基:亚基:53 聚合酶活性聚合酶活性 亚基:亚基:3 5外切酶活性和碱基选择功能,外切酶活性和碱基选择功能, 是是复制保真性所必需复制保真性所必需 亚基亚基:可能起组装作用可能起组装作用亚基:夹稳模板链并使酶沿模板链滑动亚基:夹稳模板链并
17、使酶沿模板链滑动复合物:促进全酶组装至模板及增强核心复合物:促进全酶组装至模板及增强核心 酶活性酶活性DNA-pol (250kD) DNA-pol 在活细胞内的功能在活细胞内的功能53聚合酶的活性:聚合酶的活性:是在复制延长中真正催化新链核苷酸聚是在复制延长中真正催化新链核苷酸聚合的酶。合的酶。35外切酶活性:外切酶活性:对复制中错误进行即对复制中错误进行即时校读,保证复制的准确性。时校读,保证复制的准确性。催化催化DNA聚合聚合参与参与DNA损损伤的应急状伤的应急状态修复态修复修复合成、修复合成、切除引物、切除引物、填补空隙填补空隙功能功能2040400分子数分子数/细胞细胞1011亚基数
18、亚基数+5 外切酶活性外切酶活性+ 5 外切酶活性外切酶活性+5 聚合酶活性聚合酶活性pol IIIpol IIpol IE. Coli中的中的DNA聚合酶聚合酶2真核生物的真核生物的DNA聚合酶聚合酶DNApol ,。DNApo1:延长领头链和随从链;:延长领头链和随从链;DNApoI:合成:合成RNA引物;引物;DNApol:校读、修复和填补缺口。:校读、修复和填补缺口。DNApol:在没有其他:在没有其他DNApol时时 发挥催化功能。发挥催化功能。DNApo1:催化线粒体:催化线粒体DNA的合成。的合成。真核生物的真核生物的DNA聚合酶聚合酶真核生物的真核生物的DNA聚合酶聚合酶填填补
19、补引引物物空空隙隙,切切除除修修复复,重重组组延延长长子子链链的的主主要要酶酶,解解螺螺旋旋酶酶活活性性线线粒粒体体DNA复复制制低低保保真真度度的的复复制制起起始始引引发发,引引物物酶酶活活性性功功能能+-3 5 核核酸酸外外切切酶酶活活性性高高高高高高?中中5 3 聚聚合合活活性性25.512.514.04.016.5分分子子量量(kD)DNA-pol填填补补引引物物空空隙隙,切切除除修修复复,重重组组延延长长子子链链的的主主要要酶酶,解解螺螺旋旋酶酶活活性性线线粒粒体体DNA复复制制低低保保真真度度的的复复制制起起始始引引发发,引引物物酶酶活活性性功功能能+-3 5 核核酸酸外外切切酶酶
20、活活性性高高高高高高?中中5 3 聚聚合合活活性性25.512.514.04.016.5分分子子量量(kD)DNA-pol(二)与复制起始及解链解旋相关的酶类(二)与复制起始及解链解旋相关的酶类在复制起始时需要多种酶和蛋白因子,在复制起始时需要多种酶和蛋白因子,共同起解开、理顺共同起解开、理顺DNA链,维持链,维持DNA在在一段时间内处于单链状态的作用。一段时间内处于单链状态的作用。理顺理顺DNA链链拓扑异构酶拓扑异构酶 (gyrA, B)稳定已解开的单链稳定已解开的单链单链单链DNA结合蛋白结合蛋白SSB催化催化RNA引物生成引物生成引物酶引物酶DnaG (dnaG)运送和协同运送和协同Dn
21、aBDnaC (dnaC)解开解开DNA双链双链解螺旋酶解螺旋酶DnaB (dnaB)辨认起始点辨认起始点DnaA (dnaA)蛋白质(基因)蛋白质(基因)通用名通用名功能功能原核生物复制起始的相关蛋白质原核生物复制起始的相关蛋白质E. Coli 基因图基因图1. 与复制起始及解链相关的酶类及蛋白与复制起始及解链相关的酶类及蛋白(1) DnaA蛋白蛋白(2) DnaB蛋白(解螺旋酶)蛋白(解螺旋酶)(3) DnaC蛋白蛋白(1)DnaA蛋白蛋白DnaA蛋白是由相同亚基组成的四聚体。蛋白是由相同亚基组成的四聚体。复制起始时,复制起始时, DnaA蛋白辨认并结合蛋白辨认并结合E.coli上上复制起
22、始点复制起始点oriC,1020个DnaA蛋白相互靠近形成蛋白相互靠近形成DNA蛋白质复合体结蛋白质复合体结构,促使构,促使oriC局部解链。局部解链。复制起始点(复制起始点(E E.coli-oriC.coli-oriC) GATTNTTTATTT GATCTNTTNTATT GATCCTTATTAG 1 13 17 29 32 44 1 13 17 29 32 44 TGTGGATTA-TTATTACACA-TTTGGATAA-TTATCCACA58 66 166 174 201 209 237 24558 66 166 174 201 209 237 245串联重复序列串联重复序列反向重
23、复序列反向重复序列5 3 5 3 识别区识别区AT富含区富含区(2 2)DnaB蛋白蛋白解螺旋酶解螺旋酶、复制蛋白复制蛋白rep ,利用利用ATPATP供能,供能,作用于氢键,使作用于氢键,使DNADNA双链解开成为两条双链解开成为两条单链。单链。Dna BDna C解链方向解链方向(3) DnaC蛋白蛋白Dna C蛋白的作用是将具有解链酶活性的蛋白的作用是将具有解链酶活性的Dna B蛋白运送到复制模板,并协同蛋白运送到复制模板,并协同Dna B 蛋白的作用。蛋白的作用。DnaB、DnaCDnaG(引物酶)(引物酶) DnaA蛋白复合物蛋白复合物 解链过程中,解链过程中,DNADNA分子会过度
24、拧紧、打结、分子会过度拧紧、打结、缠绕、连环等现象。缠绕、连环等现象。2DNA拓扑异构酶拓扑异构酶(DNA topoisomerase)DNADNA拓扑异构酶,改变拓扑异构酶,改变DNADNA分子构象,分子构象,理顺理顺DNADNA链,使复制能顺利进行。链,使复制能顺利进行。分类:拓扑酶分类:拓扑酶和拓扑酶和拓扑酶作用特点:对作用特点:对DNA分子的作用是既能水分子的作用是既能水解,又能连接磷酸二酯键。解,又能连接磷酸二酯键。DNA分子一边解链,一边复制,拓扑酶分子一边解链,一边复制,拓扑酶是在复制全过程中都是有作用的。是在复制全过程中都是有作用的。拓扑异拓扑异构酶构酶切断切断DNA双链中双链
25、中一股一股链,使链,使DNA解链旋转不致打结;适当时候封解链旋转不致打结;适当时候封闭切口,闭切口,DNA变为松弛状态变为松弛状态。反应反应不需不需ATP。拓扑异拓扑异构酶构酶切断切断DNA分子分子两股两股链,断端通过链,断端通过切口旋转使超螺旋松弛。切口旋转使超螺旋松弛。利用利用ATP供能,连接断端,供能,连接断端, DNA分子进入负超螺旋状态。分子进入负超螺旋状态。作用机制作用机制 目目 录录3单链单链DNA结合蛋白结合蛋白单链单链DNA结合蛋白(结合蛋白(single stranded DNA binding protein,SSB) 的作用是在复制中维的作用是在复制中维持模板处于单链状
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