1新药研究概论(ppt)课件.ppt
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1、新药研究概论新药研究概论 引言引言 Introduction 先导化合物的产生先导化合物的产生 Lead discovery 先导化合物的优化先导化合物的优化 Lead optimization Introduction 新药研发新药研发 R&D of New Drugs 新药新药 新药研发过程新药研发过程 新药研发涉及学科新药研发涉及学科 新药研发特点新药研发特点 药物分子设计药物分子设计 Molecular Drug Design 概念及内容概念及内容 先导化合物先导化合物 Lead CompoundNew Drugs 新药系指我国未生产过的药品。按新药系指我国未生产过的药品。按审批管理的
2、要求,新药分为中药、审批管理的要求,新药分为中药、化学药品和生物药品(新药审批办化学药品和生物药品(新药审批办法)法) 新化学实体新化学实体 NCE new chemical entities 首次成为药品的新化学结构首次成为药品的新化学结构新药研发过程新药研发过程1、制定研究计划,设计实验方案并实、制定研究计划,设计实验方案并实施之,获得施之,获得 潜在潜在NCE2、临床前研究,获得、临床前研究,获得 IND(investigational new drug) 西药临床前西药临床前22项(新药证书,项(新药证书,25项)项) 中药临床前中药临床前19项(新药证书,项(新药证书,22项)项)新
3、药研发过程新药研发过程3、临床试验(或临床验证),获得、临床试验(或临床验证),获得 NDA(new drug approval) Phase I: 2030例健康受试者例健康受试者 Phase II: 不少于不少于100例典型患者例典型患者 Phase III: 不少于不少于300例患者例患者4、上市后研究,临床药理、上市后研究,临床药理一类试生产期,一类试生产期,Phase IV: 2000例例 新药研发是一项系统工程,涉新药研发是一项系统工程,涉及多个学科及多个学科 分子生物学分子生物学 分子药理学分子药理学 生物信息学生物信息学 药物化学药物化学 计算机科学计算机科学 药物分析化学药物
4、分析化学 药理学药理学 毒理学毒理学 药剂学药剂学 制药工艺学制药工艺学新药研发特点新药研发特点 投资高投资高 周期长周期长 风险高风险高 利润高利润高 竞争激烈竞争激烈 Introduction 新药研发新药研发 R&D of New Drugs 新药新药 新药研发过程新药研发过程 新药研发涉及学科新药研发涉及学科 新药研发特点新药研发特点 药物分子设计药物分子设计 Molecular Drug Design 概念及内容概念及内容 先导化合物先导化合物 Lead Compound药物作用的三个重要相药物作用的三个重要相给药剂量给药剂量剂型崩解药物溶出剂型崩解药物溶出可被吸收的药物可被吸收的药
5、物药物利用度药物利用度吸收、分布、代谢、排泄吸收、分布、代谢、排泄可产生作用的药物可产生作用的药物生物利用度生物利用度药物与靶点相互作用药物与靶点相互作用效应效应药剂相药剂相药代动力相药代动力相药效相药效相Molecular drug design 药物的基本属性(药物的基本属性(安全性、有效性、安全性、有效性、稳定性、可控性稳定性、可控性),在一定意义上,),在一定意义上,由药物的化学结构所决定由药物的化学结构所决定 药物分子设计是实现新药创制的主药物分子设计是实现新药创制的主要途径和手段要途径和手段 通过科学的构思和理论的规划,构建通过科学的构思和理论的规划,构建具有预期药理活性的新化学实
6、体的分具有预期药理活性的新化学实体的分子操作。子操作。Molecular drug design 创制新药的四要素创制新药的四要素 生物靶标的选择生物靶标的选择 检测模型的确定检测模型的确定 先导化合物的发现先导化合物的发现 先导化合物的优化先导化合物的优化Molecular drug design 药物分子设计由多学科相互穿插,药物分子设计由多学科相互穿插,交替进行交替进行药物设计学药物设计学分子生物学分子生物学结构生物学结构生物学基因组基因组生物信息学生物信息学数学数学统计学统计学药物化学药物化学有机药物化学有机药物化学计算机科学计算机科学计算化学计算化学分子药理学分子药理学一般药理学一般
7、药理学 Introduction 新药研发新药研发 R&D of New Drugs 新药新药 新药研发过程新药研发过程 新药研发涉及学科新药研发涉及学科 新药研发特点新药研发特点 药物分子设计药物分子设计 Molecular Drug Design 概念及内容概念及内容 先导化合物先导化合物 Lead Compound先导化合物先导化合物 Lead compound 简称先导物(简称先导物(Lead),是指新发现),是指新发现的对某种靶标和模型呈现明确药理的对某种靶标和模型呈现明确药理活性的化合物。活性的化合物。 应与应与 hit 相区别相区别药物分子设计的策略基础药物分子设计的策略基础 分
8、子的多样性、互补性和相似性构成了分子的多样性、互补性和相似性构成了设计方法的策略基础设计方法的策略基础 分子的分子的多样性(多样性(diversity)是先导物发现的是先导物发现的物质基础物质基础 分子的分子的互补性(互补性(complementarity)是分子识是分子识别和受体别和受体-配体结合的基础和推动力配体结合的基础和推动力 分子的分子的相似性(相似性(similarity)在不同的层次上在不同的层次上有不同的含义有不同的含义Lead discovery分子的多样性分子的多样性天然生物活性物质天然生物活性物质组合化学组合化学组合生物合成和组合生物催化组合生物合成和组合生物催化基于临床
9、副作用观察产生先导物基于临床副作用观察产生先导物虚拟筛选虚拟筛选分子的互补性分子的互补性基于生物大分子结构和作用机理的药物基于生物大分子结构和作用机理的药物分子设计分子设计反义寡核苷酸反义寡核苷酸Lead discovery and optimization 分子的相似性分子的相似性基于内源性配体分子的药物设计基于内源性配体分子的药物设计过渡态类似物过渡态类似物肽模拟物肽模拟物生物电子等排置换生物电子等排置换类似物变换类似物变换药物合成的中间体药物合成的中间体基于代谢转化基于代谢转化天然生物活性物质作为先导物天然生物活性物质作为先导物 天然生物活性物质来源广泛天然生物活性物质来源广泛 植物植物
10、 动物动物 微生物微生物 海洋生物海洋生物 矿物矿物天然生物活性物质作为先导物天然生物活性物质作为先导物 天然生物活性物质的特点天然生物活性物质的特点 新颖的结构类型(分子多样性)新颖的结构类型(分子多样性) 独特的药理活性独特的药理活性 资源有限及地域性差异资源有限及地域性差异 有效成分含量很低有效成分含量很低 大多数结构复杂,作用强度不同大多数结构复杂,作用强度不同天然生物活性物质作为先导物天然生物活性物质作为先导物 抗生素类抗生素类天然抗生素天然抗生素微生物培养液微生物培养液半合成抗生素半合成抗生素天然生物活性物质作为先导物天然生物活性物质作为先导物 动物毒素动物毒素 蛇毒蛇毒Bunga
11、rotoxin,N2受体拮抗剂受体拮抗剂肌松肌松药药 蛇毒蛇毒Batroxobin,溶血栓酶,溶血栓酶抗栓药抗栓药 鱼毒鱼毒Tetrodotoxin,钠通道阻断剂,钠通道阻断剂心血心血管药物管药物 蜂毒蜂毒Apamin,钙通道阻断剂和钾通道开,钙通道阻断剂和钾通道开放剂放剂心血管药物心血管药物组合化学组合化学Combinatorial chemistry 同时制备含众多分子的化合物库同时制备含众多分子的化合物库 以代数级数增加构建块的数目,库容以代数级数增加构建块的数目,库容量则以几何级数增加量则以几何级数增加 与高通量筛选(与高通量筛选(high-throughput screening,
12、HTS)技术结合,可极大)技术结合,可极大地加快先导物发现和优化的速度地加快先导物发现和优化的速度组合合成组合合成Combinatorial synthesis 平行合成和混分合成平行合成和混分合成 固相合成和液相合成固相合成和液相合成 小分子组合合成小分子组合合成 计算机辅助设计及虚拟库合成计算机辅助设计及虚拟库合成 八学期选修课八学期选修课“组合化学与新药研组合化学与新药研究究”组合生物合成组合生物合成Combinatorial biosynthesis 基本原理基本原理基因变异(混合、匹配、交换、突变等)基因变异(混合、匹配、交换、突变等)基因克隆基因克隆多种变异的酶系多种变异的酶系多种
13、非天然的天然物质多种非天然的天然物质组合生物催化组合生物催化Combinatorial biocatalysis 基本原理基本原理变异酶系或微生物酶系变异酶系或微生物酶系催化小分子化合物转化催化小分子化合物转化多种人工的天然化合物多种人工的天然化合物筛选发现先导物筛选发现先导物 随机与非随机筛选随机与非随机筛选 Random/nonrandom screening 高通量筛选高通量筛选 High-throughput screening (HTS) 虚拟筛选虚拟筛选 Virtual screeningVirtual screening 用计算机筛选的方法称为虚拟筛选,或用计算机筛选的方法称为虚
14、拟筛选,或称称in silico筛选筛选 ,成为,成为in silico-in vitro-in vivo模式模式 。 用一系列用一系列“基于知识的滤片基于知识的滤片”对虚拟库对虚拟库“筛选筛选”,以,以“浓缩浓缩”出能够满足预定出能够满足预定标准的化合物。标准的化合物。 这些滤片包括类药性这些滤片包括类药性( (drug like) ),药代,药代动力学性质,毒性,知识产权问题以及动力学性质,毒性,知识产权问题以及与受体的互补性或与配体的相似性等,与受体的互补性或与配体的相似性等,是通过数据库搜寻和计算化学实现的。是通过数据库搜寻和计算化学实现的。 Virtual screening虚虚拟拟
15、库库专专利利指指导导设设计计库库类类药药原原则则药药代代性性质质潜潜在在毒毒性性受受体体结结构构类药性类药性 Lipinski归纳的归纳的“类药类药5 5规则规则”( (Rule of Five) ),概括了类药的最低标准,即分子,概括了类药的最低标准,即分子量在量在500500以下;氢键的给体不超过以下;氢键的给体不超过5 5个;个;氢键的接受体不超过氢键的接受体不超过1010个;计算的分配个;计算的分配系数系数( (正辛醇正辛醇- -水系统水系统)clogP)clogP值不超过值不超过5 5。上述原则只限于化合物经被动扩散机理上述原则只限于化合物经被动扩散机理的吸收。的吸收。 化合物的柔性
16、不宜过强。否则会存在许化合物的柔性不宜过强。否则会存在许多种构象多种构象 化合物不得含有重金属和反应活性基团。化合物不得含有重金属和反应活性基团。 药代动力学性质药代动力学性质 临床试验被终止淘汰的候选药物临床试验被终止淘汰的候选药物40%40%是由于是由于药代动力学不合理造成的药代动力学不合理造成的 决定药物能够穿越细胞膜并在胞浆中转运的决定药物能够穿越细胞膜并在胞浆中转运的性质是分子的化学结构,表现在分子量,离性质是分子的化学结构,表现在分子量,离解常数,亲脂性,极性表面积,以及形成氢解常数,亲脂性,极性表面积,以及形成氢键的数目等键的数目等 药物的代谢转化主要在肝脏中发生。将细胞药物的代
17、谢转化主要在肝脏中发生。将细胞色素色素P450 2D6P450 2D6和和3A43A4催化中心的三维结构作催化中心的三维结构作为药效团,可用于预测未知化合物的代谢命为药效团,可用于预测未知化合物的代谢命运。通过分析化合物的三维结构与半衰期的运。通过分析化合物的三维结构与半衰期的相关性,可以来预测未知物的代谢模式相关性,可以来预测未知物的代谢模式 毒性的预测毒性的预测 基于已有化合物的毒性和结构特征,经基于已有化合物的毒性和结构特征,经线性判别分析和多重回归分析得到的模线性判别分析和多重回归分析得到的模型,可用来预测未知物的毒性。型,可用来预测未知物的毒性。 基于知识的专家系统基于知识的专家系统
18、( (knowledge-based system) )的软件如的软件如DEREKDEREK,可批处理化合,可批处理化合物的致癌性、致畸性、致突变性、刺激物的致癌性、致畸性、致突变性、刺激性、皮肤敏感性、急性毒性和神经毒等。性、皮肤敏感性、急性毒性和神经毒等。另一个基于知识的专家系统是另一个基于知识的专家系统是HazardExpertHazardExpert程序,通过输入化合物名程序,通过输入化合物名称、给药途径、剂量和用药时程,程序称、给药途径、剂量和用药时程,程序可给出结果。可给出结果。基于结构的设计基于结构的设计 在受体结构信息已知的情况下,可在受体结构信息已知的情况下,可根据结合部位的
19、三维结构信息,用根据结合部位的三维结构信息,用分子对接方法,对互补性好、评分分子对接方法,对互补性好、评分高的化合物,可预计有较强的亲和高的化合物,可预计有较强的亲和力。若不知受体的三维结构,可根力。若不知受体的三维结构,可根据药效团特征筛选虚拟库,并以不据药效团特征筛选虚拟库,并以不同程度的限制条件,同程度的限制条件,“滤除滤除”与药与药效团无相似性的分子。效团无相似性的分子。 知识产权的预测知识产权的预测 化合物具备自主的知识产权和专利化合物具备自主的知识产权和专利保护的前景,是开发决策的重要指保护的前景,是开发决策的重要指标,筛选虚拟库和组合库时要剔除标,筛选虚拟库和组合库时要剔除已被其
20、它专利覆盖或有可能侵权的已被其它专利覆盖或有可能侵权的化合物。所以,完备的化合物检索化合物。所以,完备的化合物检索查新系统可确保化合物结构的新颖查新系统可确保化合物结构的新颖性。性。 Lead discovery分子的多样性分子的多样性天然生物活性物质天然生物活性物质组合化学组合化学组合生物合成和组合生物催化组合生物合成和组合生物催化基于临床副作用观察产生先导物基于临床副作用观察产生先导物虚拟筛选虚拟筛选分子的互补性分子的互补性基于生物大分子结构和作用机理的药物基于生物大分子结构和作用机理的药物分子设计分子设计反义寡核苷酸反义寡核苷酸基于生物大分子结构基于生物大分子结构和作用机理设计先导物和作
21、用机理设计先导物 合理药物设计合理药物设计 Rational drug design合理药物设计即以药物作用靶点的三维合理药物设计即以药物作用靶点的三维结构和生物化学作用机制为基础进行药结构和生物化学作用机制为基础进行药物设计的方法物设计的方法 Structure-based drug design Mechanism-based drug designStructure-based drug design 了解生物大分子(受体)的三维结构,了解生物大分子(受体)的三维结构,特别是与配体分子形成的复合物的三维特别是与配体分子形成的复合物的三维结构,是前提结构,是前提 大分子与小分子的结合模式是
22、基础大分子与小分子的结合模式是基础 多种方法并用多种方法并用数据库搜寻数据库搜寻分子碎片连接分子碎片连接从头构建从头构建从酶作用发现先导物从酶作用发现先导物ACE抑制剂抑制剂 ACE的功能的功能 将将Angiotensin I 从羧基端水解掉二肽,从羧基端水解掉二肽,活化成活化成Angiotensin II 将将Bradykinin 从羧基端水解掉二肽失从羧基端水解掉二肽失活活 天然天然ACE底物及一些肽类天然底物及一些肽类天然 ACE抑制剂抑制剂 每克分子每克分子ACE含有一克原子含有一克原子Zn+ACEACE抑制剂抑制剂ACEACE的功能的功能羧肽酶羧肽酶A A的作用模式的作用模式肽类抑制
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