RNA生物合成课件.ppt
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- RNA 生物 合成 课件
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1、RNARNA生物合成生物合成 转录【目的与要求】【目的与要求】1、掌握转录的概念与特点2、掌握并能叙述原核生物与真核生物中RNA聚合酶的组成及功能3、掌握RNA转录过程4、掌握mRNA,tRNA与rRNA转录后加工过程DNADNA复制与转录的比较复制与转录的比较 复复 制制 转转 录录相相同同点点模模 板板 两股链均复制两股链均复制 模板链转录模板链转录合成方式合成方式 半保留复制半保留复制 不对称转录不对称转录原原 料料 dNTP NTPdNTP NTP聚合酶聚合酶 DNADNA聚合酶聚合酶 RNARNA聚合酶聚合酶碱基配对碱基配对 A-TA-T,G-C A-G-C A-U U,T-T-A
2、A,G-CG-C产产 物物 半保留的双链半保留的双链DNA DNA 单链单链RNARNA不不同同点点以以DNADNA为模板为模板遵循遵循碱基配对碱基配对原则原则都需都需依赖依赖DNADNA的聚合酶的聚合酶聚合过程都是生成聚合过程都是生成磷酸二酯键磷酸二酯键新链合成方向为新链合成方向为5353概 述 一、RNA的生理功能 DNA将携带的遗传信息转到RNA分子中,RNA分子以其信息指导蛋白质的合成 二、二、RNARNA合成概况合成概况 在生物界,RNA合成有两种方式:一是DNA指导的RNA合成,此为生物体内的主要合成方式。另一种是RNA指导的RNA合成,此种方式常见于病毒。转录产生的初级转录本是R
3、NA前体(RNA precursor),需经加工过程(processing)方具有生物学活性第二节第二节 转录转录一、转录一、转录: :由DNA指导的RNA合成,DNA以碱基互补原则,决定合成RNA的全部碱基成分及排列顺序,将DNA模板上的遗传信息传递到RNA分子的过程 1 1、反应体系:、反应体系:DNA模板,NTP,酶,Mg2+,Mn2+ ,合成方向53。连接方式- 3 , 5磷酸二酯键 2 2、特点:、特点:不对称转录-DNA片段转录时,双链DNA中只有一条链作为转录的模板,这种转录方式称作不对称转录不对称转录 模板链及反意义链:模板链及反意义链:指导RNA合成的DNA链为模板链,又称反
4、意义链 编码链及有意义链:编码链及有意义链:不作为转录的另一条DNA链为编码链,又称有意义链 由于基因分布于不同的DNA单链中,即某条DNA单链对某个基因是模板链,而对另一个基因则是编码链 55G C A G G C A G T T A C A A C A T T G G T T C C3333c g t c a t g t a c a gc g t c a t g t a c a g55DNADNA55G C A G G C A G U U A C A A C A U U G G U U C C33mRNAmRNAN N Ala Val His Val Ala Val His Val C C
5、多肽链多肽链转录转录翻译翻译编码链编码链模板链模板链不对称转录不对称转录: :模板链并非永远在同一单链上模板链并非永远在同一单链上3553注意:RNA的合成方向都是5 33 3、原料:、原料:四种磷酸核苷NTP,DNA中的T在RNA合成中变为U 4 4、合成过程、合成过程: : 连续,方向:方向:535 5、合成部位:、合成部位:细胞核内二、原核二、原核RNARNA聚合酶聚合酶 组成:组成:RNA聚合酶由5个亚基构成,2为全酶(分子量为480kD ), 2为核心酶 作用:作用:识别DNA分子中转录的起始部位。 促进与模板链结合,并使DNA双链打开17bp。 催化NTP的聚合,完成一条RNA链的
6、聚合反应。识别转录终止信号,停止聚合反应,参与转录水平的调控 核心酶:能与DNA链结合并启动转录,但没有特异性,转录出来的可能不是一个完整的基因序列决定基因转录的特异性亚基 分子量 每分子酶中所含数目 功能 36512 2 150618 1 与转录全过程有关 155613 1 结合DNA模板 70263 1 辨认起始位点原核原核RNARNA聚合酶各个亚基的作用聚合酶各个亚基的作用特特 点点1. 聚合速率慢,30-85NTP/秒2.缺乏外切酶活性,无校对功能,错误率10-63.不同的因子识别不同的启动子 4.可被药物抑制(利福平) 人的RNA聚合酶对利福平不敏感。利用此特点可研制杀菌药物 三、真
7、核三、真核RNARNA聚合酶聚合酶 真核较原核的酶复杂,已清楚的有RNA Pol,及Mt四型 组成和功能组成和功能:均由多亚基构成,聚合酶主要负责mRNA的合成; Pol主要负责rRNA的合成; Pol主要负责tRNA和5srRNA的合成 三种RNA聚合酶对转录抑制剂鹅膏覃碱的敏感性反应不同种类种类 对鹅膏覃对鹅膏覃碱的反应碱的反应 耐受耐受极敏感极敏感中度敏感中度敏感 四、启动子与终止子四、启动子与终止子(一)启动子 1 1、原核启动子:、原核启动子:约55bp,分为起始点(start site)、结合部位、识别部位 起始点:起始点:转录起始部位以+1表示,转录的第1个核苷酸常为嘌呤-G,A
8、 结合部位:结合部位:约6bp组成,是高度保守区,共有序列为5-TATAAT-3,位于起始点上游-10。因Tm低,DNA易解开双链,为RNA聚合酶提供场所 识别部位:识别部位:约6bp组成,在-35处,为高度保守区,序列5-TTGACA-3, s因子识别此部位* * -35 -35和和-10-10都是大致位点都是大致位点 启动子:启动子:RNARNA聚合酶结合聚合酶结合DNADNA的部位,包括的部位,包括一些转录调控组件一些转录调控组件TTGACA盒子TATA盒子启动子区结构基因-10bp+1转录初级转录物RNA-35bp2 2、真核启动子结构、真核启动子结构 -25处含AT富集区, 共有序列
9、TATAA (TATA box) -70处含共有序列CAAT ,还含许多其它box ,例如:GC-box,E-box等含增强子(enhancer)和静息子(silencer) RNA pol和 RNA pol与聚合酶所识别的启动子差异较大(二)终止信号(二)终止信号 特点:终止部位含GC富集区与AT富集区,它们分别形成发卡结构和连续的U区,以终止转录 蛋白因子辅助识别终止信号,参与终止五、转录过程-转录起始转录起始1.RNA1.RNA聚合酶与启动子的结合聚合酶与启动子的结合(亚基辨认亚基辨认-35-35区)区)2.2.DNADNA双链的打开双链的打开RNA pol RNA pol (全酶移向(
10、全酶移向-10-10区区)3. 3. RNARNA链上链上合成第一个磷合成第一个磷酸二酯键酸二酯键5-ppp5-pppG Gp pN N-OH-3-OH-3亚基脱落亚基脱落转录过程 ( (二)延长二)延长 转录泡:是由转录泡:是由DNADNA双链双链,RNA,RNA聚合酶与新聚合酶与新合成的转录本合成的转录本RNARNA局部形成的结构局部形成的结构, ,它贯穿它贯穿于延长过程的始终于延长过程的始终 过程:在起始阶段形成第一个磷酸二过程:在起始阶段形成第一个磷酸二酯键后,酯键后,RNARNA聚合酶核心酶沿模板向下游移聚合酶核心酶沿模板向下游移动,核苷酸之间以动,核苷酸之间以3,53,5磷酸二酯键
11、相连,磷酸二酯键相连,合成方向合成方向5353,合成的,合成的RNARNA自自33末端逐步末端逐步延长。合成出的延长。合成出的RNARNA与与DNADNA形成杂交分子形成杂交分子, ,约约12bp12bp,因结合不紧很易脱离,因结合不紧很易脱离 RNA pol转录复合物:转录复合物:酶酶-DNA-RNA-DNA-RNA:转录空泡转录空泡RNA(三)终止(三)终止 合成移到终止信号时合成移到终止信号时, ,酶不滑动酶不滑动, ,聚合停聚合停止止, ,转录完成转录完成 特点:特点:因子参与的终止:因子参与的终止:r r因子与因子与RNARNA产物中富含产物中富含C C的部位结合的部位结合, ,并诱
12、使并诱使RNARNA聚合酶聚合酶构象改变停止滑动构象改变停止滑动; ; 因子的解螺旋酶活性因子的解螺旋酶活性, ,利于利于RNARNA产物的释放产物的释放(一)原核生物的转录终止(一)原核生物的转录终止1. 1. 依赖依赖因子因子的转录终止的转录终止2. 2. 不依赖不依赖因子因子的转录终止的转录终止因子因子1. 1. 识别结合识别结合富含富含C C的的RNARNA链链功能功能2. ATPase2. ATPase活性活性3. 3. 解螺旋酶活性解螺旋酶活性RNA RNA 聚合酶聚合酶因子附在因子附在RNARNA链上链上因子因子RNA RNA 链形成一个发夹结构,转链形成一个发夹结构,转录停止,
13、录停止,因子利用因子利用ATPATP能滑行能滑行因子发挥解螺旋酶活性,解开发夹和因子发挥解螺旋酶活性,解开发夹和RNA-DNARNA-DNA依赖依赖RhoRho因子的转录终止因子的转录终止TOHAAAUUUOHUUUOH不依赖不依赖因子因子的转录终止的转录终止四四 真核生物转录特点真核生物转录特点 启动子复杂,某些基因不含TATA box,由起动序列参与基本转录的开始 顺式作用元件顺式作用元件:真核生物中转录起始中起转录真核生物中转录起始中起转录调控作用的调控作用的DNADNA序列序列 -35-35区区 5 -TATA (TATA5 -TATA (TATA盒盒) ) -70 -70-110-1
14、10区区 CAATCAAT盒盒 GCGC盒盒(真核(真核TATATATA序列的位置不像原核序列的位置不像原核-35-35和和-10-10那样典型,那样典型,某些真核生物基因也可以没有某些真核生物基因也可以没有TATATATA序列)序列)转录因子转录因子与反式作用因子反式作用因子 转录因子转录因子与反式作用因子反式作用因子: 调节基因表达的蛋白为转录因子;它们与特异的顺式作用元件相互作用,并激活另一基因的转录TATATF II D TF II ATF II BRNA-pol II/TF II F TF II EPIC12345TATADNARNApolA DBEF转录起始复合物转录起始复合物结合
15、顺序结合顺序真核转录的真核转录的转录终止序列,在转录终止序列,在33端之后有共同序列端之后有共同序列AATAAAAATAAA及多个及多个GTGT序列,序列,mRNAmRNA在转录终止序列处被切断在转录终止序列处被切断AATAAAAATAAAGTGTGTGGTGTGTG-AAUAAAAAUAAAGUGUGUGGUGUGUGAAUAAAAAUAAAGUGUGUGGUGUGUG酶切酶切加尾信号加尾信号GC丰富序列AATAAAAATAAAGTGTGTGGTGTGTG- AAUAAAAAUAAAGUGUGUGGUGUGUG酶切酶切( (继续转录,继续转录,但但55端没端没有有“帽子帽子”,产物被降解)产
16、物被降解)加尾加尾转录后的加工转录后的加工原核原核RNARNA不需加工,边转录边翻译不需加工,边转录边翻译真核真核RNARNA需要需要加工加工rRNArRNAtRNAtRNAmRNAmRNA55加加帽帽33加加尾尾 剪接剪接在转录过在转录过程中程中转录后进行转录后进行第三节第三节 真核生物转录后的加工真核生物转录后的加工 意义:意义:转录生成的前体RNA,无生物学活性,需加工变为成熟、有活性的RNA 加工种类:加工种类:剪切与剪接、末端添加核苷酸、修饰、RNA编辑 一、一、mRNAmRNA前体的加工前体的加工 (一)生成特点: 原核原核 :mRNA是多顺反子(polycistronic),每分
17、子RNA中含几种蛋白质信息,RNA寿命短,转录没完时翻译即开始 例:乳糖操纵子,含Z,Y,A三个基因,分别编码半乳糖苷酶、透过酶及乙酰基转移酶 真核:真核:单顺反子,一个mRNA仅编码一种蛋白质 外显子: 在真核生物基因中编码蛋白质的序列 内含子:非编码蛋白的序列,因其插于外显子之间又称插入序列,居间序列 hnRNA: 为mRNA的前体,转录物中外显子与内含子间隔排列,需经剪接加工后生成mRNA (二)(二) mRNA前体加工过程前体加工过程 真核:真核: 5末端帽子 部位:核内 3端多聚A尾 部位:核内,胞质有酶也可进行 剪接作用 部位:胞核 甲基化(甲基化发生在剪接之前,在非编码区分子中含
18、1-2个m6A ) RNA编辑(某些mRNA的核苷酸序列,在生成转录产物后还需插入、删除或取代一些核苷酸残基,方能生成具有正确翻译功能的模板,遗传信息在mRNA水平上的改变过程,称为RNA编辑) 原核:原核:多顺反子mRNA在RNase作用下转变为单独的顺反子5加帽pi5pppG磷酸酶ppi5pGpppG5GpppG甲基化酶CH3mGpppGOHOH帽1帽0帽2NNNNOH2NCH3+OHHCH2HOP OPO P OPPPN1N2N3OOHOOHOOHOCH3OCH32OH79H甲基鸟苷5,5-三磷酸33加尾加尾AAUAAAAAAAAAAAA.加尾加尾AATAAAGTGTGTG-AAUAAA
19、GUGUGUGAAUAAAGUGUGUG酶切酶切转录的终止转录的终止加尾信号加尾信号GC丰富序列polyApolyA尾(约尾(约2020200200个个A A)A AA AA AA AA AA A断裂基因:断裂基因:真核生物的基因由若干个编真核生物的基因由若干个编码区和非编码区互相隔开但又连续镶嵌而成码区和非编码区互相隔开但又连续镶嵌而成外显子(外显子(exon): exon): 基因中出现在基因中出现在mRNAmRNA的序列的序列内含子(内含子(intronintron):): 基因中不出现于基因中不出现于mRNAmRNA而被剪接掉的序列而被剪接掉的序列核内不均一核内不均一RNA RNA (
20、hnRNAhnRNA):真核生物中编码蛋白):真核生物中编码蛋白质基因的初级转录本,包括质基因的初级转录本,包括55帽子、帽子、3poly(A)3poly(A)尾、外显子、内含子,经剪接加工成为尾、外显子、内含子,经剪接加工成为mRNAmRNA剪接 剪接剪接: :在细胞核内在细胞核内, hnRNA, hnRNA剪切掉内含子剪切掉内含子, ,将多个外将多个外显子连接为成熟显子连接为成熟mRNAmRNA的过程为剪接的过程为剪接 例例: :同一转录本同一转录本, , 在不同的组织在不同的组织, , 因剪接差异因剪接差异产生各自不同的产生各自不同的mRNAmRNA 剪接的本质:磷酸酯键的转移剪接的本质
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