C11核酸代谢与蛋白质生物合成课件.ppt
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- C11 核酸 代谢 蛋白质 生物 合成 课件
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1、第十一章第十一章 核酸代谢与蛋白质生物合成核酸代谢与蛋白质生物合成核酸:遗传物质核酸:遗传物质蛋白质:生命活动执行者蛋白质:生命活动执行者核酸核酸磷酸磷酸核苷酸核苷酸核苷核苷磷酸磷酸- -戊糖戊糖碱基碱基水水解解核酸酶核酸酶核苷酸酶核苷酸酶核苷磷酸化酶核苷磷酸化酶何处去?何处去?进入磷酸戊糖途径进入磷酸戊糖途径或或重新合成核酸重新合成核酸分解分解合成合成第一节:核酸的消化与吸收第一节:核酸的消化与吸收 核酸合成的原料核酸合成的原料 细胞内能量的利用形式:如细胞内能量的利用形式:如ATP 生理调节介质:生理调节介质:cAMP、cGMP 辅酶的构成成分:辅酶的构成成分:FAD、NAD+、NADP
2、活化中间代谢物:活化中间代谢物:UDPG、SAM 酶的变构调节剂:酶的变构调节剂:ATP、ADP、AMP等等一、嘌呤核苷酸的分解代谢一、嘌呤核苷酸的分解代谢核苷酸核苷酸核苷核苷1-磷酸核糖磷酸核糖碱基碱基核苷酸酶核苷酸酶核苷磷酸核苷磷酸化酶化酶补救合成补救合成 或或进一步分解进一步分解第二节第二节 核酸的分解代谢核酸的分解代谢NNNNNH2核糖核糖NNNNOH脱氨基酶脱氨基酶OHHOHNHHHA-腺嘌呤腺嘌呤腺苷腺苷次黄苷次黄苷核苷磷酸化酶核苷磷酸化酶PiH核糖核糖-1-磷酸磷酸NNNNOHH次黄嘌呤次黄嘌呤H黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶H2OO2NNNNOHHOHH2O2黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶
3、H2OO2H2O2NNNNOHOHOH尿酸尿酸AMP次黄嘌呤次黄嘌呤GMP鸟嘌呤鸟嘌呤黄嘌呤黄嘌呤黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶尿酸尿酸高嘌呤饮食高嘌呤饮食体内核酸大量分解体内核酸大量分解肾疾病肾疾病嘌呤核苷酸代谢酶缺陷嘌呤核苷酸代谢酶缺陷血中尿酸血中尿酸含量升高含量升高痛风痛风尿酸盐晶体沉积尿酸盐晶体沉积血血尿酸尿酸0.48mmol/LNNNNOHNNNNOH痛风的治疗痛风的治疗次黄嘌呤次黄嘌呤别嘌呤醇别嘌呤醇别嘌呤醇别嘌呤醇抑制黄嘌呤氧化酶,从而抑制尿酸抑制黄嘌呤氧化酶,从而抑制尿酸的生成的生成与与PRPP反应生成别嘌呤核苷酸,反应生成别嘌呤核苷酸,减少嘌呤核苷酸的生成减
4、少嘌呤核苷酸的生成嘧啶碱嘧啶碱1-磷酸核糖磷酸核糖嘧啶核苷酸嘧啶核苷酸核苷核苷 核苷酸酶核苷酸酶PPi核苷磷酸化酶核苷磷酸化酶胞嘧啶胞嘧啶NH3尿嘧啶尿嘧啶二氢尿嘧啶二氢尿嘧啶 H2OCO2 + NH3-丙氨酸丙氨酸胸腺嘧啶胸腺嘧啶-脲基异丁酸脲基异丁酸-氨基异丁酸氨基异丁酸H2O丙二酸单酰丙二酸单酰CoA乙酰乙酰CoATAC肝肝尿素尿素甲基丙二酸单酰甲基丙二酸单酰CoA琥珀酰琥珀酰CoATAC糖异生糖异生第三节第三节 核酸的合成代谢核酸的合成代谢(de novo synthsis)(1)原料:天冬氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、)原料:天冬氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、 一碳单位、一碳单位、CO2NNNN
5、CCCCC134256789COCO2 2(2)过程:两个阶段)过程:两个阶段 第一阶段:次黄嘌呤核苷酸第一阶段:次黄嘌呤核苷酸(IMP)的合成的合成 第二阶段:腺嘌呤核苷酸第二阶段:腺嘌呤核苷酸(AMP)与鸟嘌呤与鸟嘌呤 核苷酸核苷酸(GMP)的生成的生成R-5-PPRPPPRPP合成酶合成酶PRA酰胺转移酶酰胺转移酶GARFGARFGAMAIRCAIRSAICARAICARFAICARIMPGlnGlyGlnH2OCO2AspH2OATPATPATPATPNHNNNOR5PfumarateCHO-FH4CHO-FH4IMP腺苷酸代琥珀酸腺苷酸代琥珀酸黄嘌呤核苷酸黄嘌呤核苷酸(XMP)Asp
6、NADH+H+NAD+AMPGTPGMPGlnATP延胡索酸延胡索酸NNNNNH2NNNNONH2NNNNOAMPADPATP激酶激酶激酶激酶ATPADPATPADPGMPGDPGTP激酶激酶激酶激酶ATPADPATPADP(3)部位:以肝脏为主,其次是小肠粘膜及胸)部位:以肝脏为主,其次是小肠粘膜及胸腺。并不是所有细胞都具有从头合成嘌呤核苷腺。并不是所有细胞都具有从头合成嘌呤核苷酸的能力。酸的能力。(4)特点:在磷酸核糖分子上逐步合成,而)特点:在磷酸核糖分子上逐步合成,而不是首先单独合成嘌呤碱再与磷酸核糖结合。不是首先单独合成嘌呤碱再与磷酸核糖结合。 (salvage pathway)v概
7、念:细胞利用现成的嘌呤碱基或嘌呤概念:细胞利用现成的嘌呤碱基或嘌呤核苷重新合成嘌呤核苷酸的过程,称为补核苷重新合成嘌呤核苷酸的过程,称为补救合成途径。救合成途径。腺嘌呤腺嘌呤 PRPPAMP PPiAPRT次黄嘌呤次黄嘌呤 PRPPIMP PPiHGPRT鸟嘌呤鸟嘌呤 PRPPGMP PPiHGPRT腺嘌呤核苷腺嘌呤核苷AMP腺苷激酶腺苷激酶ATPADPv反应:反应:v生理意义:生理意义:(1)节省能量与氨基酸消耗)节省能量与氨基酸消耗(2)某些器官如脑、骨髓等,缺乏从头)某些器官如脑、骨髓等,缺乏从头合成嘌呤核苷酸的酶体系,只能进行合成嘌呤核苷酸的酶体系,只能进行补救合成补救合成v在二磷酸核
8、苷(在二磷酸核苷(NDP)的水平上直接还原)的水平上直接还原v由核糖核苷酸还原酶催化由核糖核苷酸还原酶催化v脱氧嘧啶核苷酸(脱氧嘧啶核苷酸(dUDP、dCDP)也是在也是在二磷酸核苷的水平生成(二磷酸核苷的水平生成(dTMP除外)除外)碱基碱基OOHOHCH2OPOOOPOOHOOOHHCH2OPOOOPOOHO碱基碱基NADPH+H+NADP+ +H2O核糖核苷酸还原酶核糖核苷酸还原酶NDPdNDP核糖核苷酸还原酶核糖核苷酸还原酶硫氧化还原硫氧化还原蛋白蛋白-(SH) 2硫氧化硫氧化 还原蛋白还原蛋白SS(还原型还原型)(氧化型氧化型)NADPH+H+NADP+硫氧化硫氧化 还原蛋白还原酶还
9、原蛋白还原酶(FAD)l从头合成途径从头合成途径l补救合成途径补救合成途径一、嘧啶核苷酸的合成代谢一、嘧啶核苷酸的合成代谢主要是肝细胞胞液主要是肝细胞胞液嘧啶核苷酸的从头合成是指利用磷酸核嘧啶核苷酸的从头合成是指利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及二氧化碳等简单物糖、氨基酸、一碳单位及二氧化碳等简单物质为原料,经过一系列酶促反应,合成嘧啶质为原料,经过一系列酶促反应,合成嘧啶核苷酸的途径。核苷酸的途径。 定义定义合成部位合成部位嘧啶合成的元素来源嘧啶合成的元素来源氨基甲氨基甲酰磷酸酰磷酸天冬氨酸天冬氨酸合成过程合成过程1. 尿嘧啶核苷酸的合成尿嘧啶核苷酸的合成谷氨酰胺谷氨酰胺 + + HCO3-氨
10、基甲酰磷氨基甲酰磷酸合成酶酸合成酶II2ATP2ADP+Pi谷氨酸谷氨酸 + + 氨基甲酰磷酸氨基甲酰磷酸CPS-ICPS-II肝细胞线粒体中肝细胞线粒体中氨氨N-乙酰谷氨酸乙酰谷氨酸胞液(所有细胞)胞液(所有细胞)谷氨酰胺谷氨酰胺无无分布分布氮源氮源变构激活剂变构激活剂功能功能尿素合成尿素合成嘧啶嘧啶 合成合成CPS-ICPS-II肝细胞线粒体中肝细胞线粒体中氨氨N-乙酰谷氨酸乙酰谷氨酸胞液(所有细胞)胞液(所有细胞)谷氨酰胺谷氨酰胺无无分布分布氮源氮源变构激活剂变构激活剂功能功能尿素合成尿素合成嘧啶嘧啶 合成合成氨基甲酰磷酸合成酶氨基甲酰磷酸合成酶 I、II 的区别的区别2. 胞嘧啶核苷酸
11、的合成胞嘧啶核苷酸的合成ATPADP尿苷酸激酶尿苷酸激酶UDP二磷酸核苷激酶二磷酸核苷激酶ATPADPUTPCTP合成酶合成酶谷氨酰胺谷氨酰胺ATP谷氨酸谷氨酸ADP+Pi3. dTMP或或TMP的生成的生成TMP合酶合酶N5, N10-甲烯甲烯FH4FH2FH2还原酶还原酶FH4NADP+NADPH+H+dUMP脱氧胸苷一磷酸脱氧胸苷一磷酸dTMPUDP脱氧核苷酸还原酶脱氧核苷酸还原酶dUDPCTPCDPdCDPdCMP嘧啶嘧啶 + + PRPP磷酸嘧啶核苷磷酸嘧啶核苷 + + PPi嘧啶磷酸核糖转移酶嘧啶磷酸核糖转移酶尿嘧啶核苷尿嘧啶核苷 + + ATP尿苷激酶尿苷激酶UMP +ADP胸腺
12、嘧啶核苷胸腺嘧啶核苷 + + ATP胸苷激酶胸苷激酶TMP +ADPDNA的生物合成的生物合成( (复制复制) )DNA Biosynthesis,Replication 第第 三节三节复制复制( (replication)是指遗传物质的传代,以母链是指遗传物质的传代,以母链DNA为模板为模板合成子链合成子链DNA的过程。的过程。复制复制亲代亲代DNA子代子代DNAl 复制的方式复制的方式半保留复制半保留复制(semi-conservative replication)l 复制的高保真性复制的高保真性(high fidelity) l 双向复制双向复制(bidirectional replic
13、ation)l 半不连续复制半不连续复制(semi-discontinuous replication) 一、半保留复制一、半保留复制 DNA生物合成时,母链生物合成时,母链DNA解开为两解开为两股单链,各自作为模板股单链,各自作为模板(template)按碱基配对按碱基配对规律,合成与模板互补的子链。子代细胞的规律,合成与模板互补的子链。子代细胞的DNA,一股单链从亲代完整地接受过来,另,一股单链从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全从新合成。两个子细胞的一股单链则完全从新合成。两个子细胞的DNA都和亲代都和亲代DNA碱基序列一致。这种复制碱基序列一致。这种复制方式称为方式称为半保留复制半保
14、留复制。半保留复制的概念半保留复制的概念AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+母链母链DNA 复制过程中形成复制过程中形成的复制叉的复制叉子代子代DNA 目目 录录按半保留复制方式,子代按半保留复制方式,子代DNA与亲代与亲代DNA A的的碱基序列一致碱基序列一致,即子代保留了亲代的全部遗,即子代保留了亲代的全部遗传信息,体现了遗传的传信息,体现了遗传的保守性保
15、守性。半保留复制的意义半保留复制的意义遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,但但不是绝对的不是绝对的。原核生物复制时,原核生物复制时,DNA从从起始点起始点(origin)向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,称为复制叉,称为双向复制双向复制。 二、双向复制二、双向复制复制中的放射自显影图象复制中的放射自显影图象A. 环状双链环状双链DNA及复制起始点及复制起始点B. 复制中的两个复制叉复制中的两个复制叉C. 复制接近终止点复制接近终止点(termination, ter)oriterA B C真核生物每个染色
16、体有多个起始点,是多真核生物每个染色体有多个起始点,是多复制子的复制。复制子的复制。习惯上把两个相邻起始点之间的距离定为习惯上把两个相邻起始点之间的距离定为一个一个复制子复制子(replicon) 。复制子是独立完成复。复制子是独立完成复制的功能单位。制的功能单位。 53oriorioriori535533553复制子复制子3三、复制的半不连续性三、复制的半不连续性3 5 3 5 解链方向解链方向3 5 3 3 5 领头链领头链(leading strand)随从链随从链(lagging strand)顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,这股链称
17、为这股链称为领头链。领头链。另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称为为随从链随从链。复制中的不连续片段称为。复制中的不连续片段称为岡崎片段岡崎片段(okazaki fragment)。 领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的的半不连续性。半不连续性。 参与参与DNA复制的物质复制的物质 底物底物(substrate): dATP, dGTP, dCTP, dTTP聚合酶聚合酶(polymerase): 依赖依赖DNA的
18、的DNA聚合酶,简写聚合酶,简写 为为 DNA-pol模板模板(template) : 解开成单链的解开成单链的DNA母链母链引物引物(primer): 提供提供3 -OH末端使末端使dNTP可以依次聚合可以依次聚合 其他的酶和蛋白质因子其他的酶和蛋白质因子一、复制的化学反应一、复制的化学反应 (dNMP)n + dNTP (dNMP)n+1 + PPi 目目 录录聚合反应的特点聚合反应的特点DNA 新链生成需新链生成需引物引物和和模板模板; 新链的延长只可沿新链的延长只可沿5 3 方向进行方向进行 。一、一、DNA聚合酶聚合酶全称:全称:依赖依赖DNA的的DNA聚合酶聚合酶 (DNA-dep
19、endent DNA polymerase)简称:简称:DNA-pol活性:活性:催化磷酸二酯键形成催化磷酸二酯键形成5 A G C T T C A G G A T A 3 | | | | | | | | | | |3 T C G A A G T C C T A G C G A C 5 3 5 外切酶活性外切酶活性 5 3 外切酶活性外切酶活性?能切除突变的能切除突变的 DNA片段。片段。能辨认错配的碱基对,并将其水解。能辨认错配的碱基对,并将其水解。 核酸外切酶活性核酸外切酶活性 目目 录录(一)原核生物的(一)原核生物的DNA聚合酶聚合酶DNA-pol DNA-pol DNA-pol (一
20、)原核生物的(一)原核生物的DNA聚合酶聚合酶DNA-pol :与修复有关:与修复有关DNA-pol DNA-pol :复制主要酶:复制主要酶(二)真核生物的(二)真核生物的DNADNA聚合酶聚合酶DNA-pol 起始引发,有引物酶活性。起始引发,有引物酶活性。延长子链的主要酶,有解螺旋酶活性。延长子链的主要酶,有解螺旋酶活性。参与低保真度的复制参与低保真度的复制 。在复制过程中起校读、修复和填补缺在复制过程中起校读、修复和填补缺口的作用。口的作用。在在线粒体线粒体DNA复制中起催化作用。复制中起催化作用。DNA-pol DNA-pol DNA-pol DNA-pol 二、复制中的分子解链及二
21、、复制中的分子解链及DNA 分子分子拓扑学变化拓扑学变化 DNA分子的碱基埋在双螺旋内部,只有把分子的碱基埋在双螺旋内部,只有把DNA解成单链,它才能起模板作用。解成单链,它才能起模板作用。(一)解螺旋酶、引物酶和单链(一)解螺旋酶、引物酶和单链DNA结合蛋白结合蛋白理顺理顺DNA链链拓扑异构酶拓扑异构酶 (gyrA, B)稳定已解开的单链稳定已解开的单链单链单链DNA结合蛋白结合蛋白SSB催化催化RNA引物生成引物生成引物酶引物酶DnaG (dnaG)运送和协同运送和协同DnaBDnaC (dnaC)解开解开DNA双链双链解螺旋酶解螺旋酶DnaB (dnaB)辨认起始点辨认起始点DnaA (
22、dnaA)蛋白质(基因)蛋白质(基因)通用名通用名功能功能原核生物复制起始的相关蛋白质原核生物复制起始的相关蛋白质 解螺旋酶解螺旋酶(helicase)利用利用ATP供能,作用于氢键,使供能,作用于氢键,使DNA双链双链解开成为两条单链解开成为两条单链 引物酶引物酶(primase)复制起始时催化生成复制起始时催化生成RNA引物的酶引物的酶 单链单链DNA结合蛋白结合蛋白(single stranded DNA binding protein, SSB)在复制中维持模板处于单链状态并保护单在复制中维持模板处于单链状态并保护单链的完整链的完整 1010 8 8 局部解链后局部解链后(二)(二)D
23、NA拓扑异构酶拓扑异构酶(DNA topoisomerase) 解链过程中正超螺旋的形成解链过程中正超螺旋的形成目目 录录拓扑异构酶作用特点拓扑异构酶作用特点既能水解既能水解 、又能连接磷酸二酯键、又能连接磷酸二酯键 拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶分分 类类拓扑异拓扑异构酶构酶切断切断DNA双链中双链中一股一股链,使链,使DNA解链旋转不致打结;适当时候封解链旋转不致打结;适当时候封闭切口,闭切口,DNA变为松弛状态变为松弛状态。反应反应不需不需ATP。拓扑异拓扑异构酶构酶切断切断DNA分子分子两股两股链,断端通过链,断端通过切口旋转使超螺旋松弛。切口旋转使超螺旋松弛。利用利用ATP
24、供能,连接断端,供能,连接断端, DNA分子进入负超螺旋状态。分子进入负超螺旋状态。作用机制作用机制 三、三、DNA连接酶连接酶连接连接DNA链链3 -OH末端和相邻末端和相邻DNA链链5 -P末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相邻的邻的DNA链连接成一条完整的链。链连接成一条完整的链。 DNA连接酶连接酶(DNA ligase)作用方式作用方式POO-O-OHO5POO-O-O335DNA连接酶连接酶ATPADP5353目目 录录DNA连接酶在复制中起最后接合缺口的连接酶在复制中起最后接合缺口的作用。作用。在在DNA修复、重组及剪接中也起缝合缺修复
25、、重组及剪接中也起缝合缺口作用。口作用。也是基因工程的重要工具酶之一。也是基因工程的重要工具酶之一。功能功能DNA生物合成过程生物合成过程The Process of DNA Replication(一)复制的起始(一)复制的起始需要解决两个问题:需要解决两个问题:1. DNA解开成单链,提供模板。解开成单链,提供模板。2. 合成引物,提供合成引物,提供3 -OH末端。末端。一、原核生物的一、原核生物的DNA生物合成生物合成 Dna A Dna B、 Dna CDNA拓扑异构酶拓扑异构酶引物引物酶酶SSB3 5 3 5 含有解螺旋酶、含有解螺旋酶、DnaC蛋白、引物酶和蛋白、引物酶和DNA复制
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