DNA的生物合成1课件.ppt
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- DNA 生物 合成 课件
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1、第三章第三章DNADNA的生物合成的生物合成Biosynthesis of DNABiosynthesis of DNA(Replication of DNA)(Replication of DNA)第一节第一节 DNADNA复制的一般特征复制的一般特征 一、一、DNADNA的生物学功能的生物学功能 1 1、储存遗传信息、储存遗传信息 2 2、复制遗传信息、复制遗传信息 3 3、表达遗传信息、表达遗传信息 4 4、遗传变异、遗传变异Watson(Nature) :Watson(Nature) :我们假设的特异的(碱基)配对方式提示了遗传物我们假设的特异的(碱基)配对方式提示了遗传物质可能的复制
2、机制:每一条链均可作为合成一条新链的模板,就使质可能的复制机制:每一条链均可作为合成一条新链的模板,就使子代双螺旋与母本完全一致子代双螺旋与母本完全一致。他们在另一篇论文中:由此产生了在他们在另一篇论文中:由此产生了在当时难于解决的解开双链结构的困难。当时难于解决的解开双链结构的困难。许多科学家难于接受许多科学家难于接受WatsonWatson提出的机制。提出的机制。二、二、 DNADNA复制方式复制方式 全保留全保留半保留半保留分散式分散式DNA如何进行复制?如何进行复制?可能的三种方式可能的三种方式N15N14N15N15N15N14N14N14N14一一条条带带一条带一条带两条带两条带两
3、条带两条带重带重带中带中带中带中带 和轻带和轻带轻带轻带 和中带和中带轻带轻带一条带一条带根据实验结果:第一代的根据实验结果:第一代的DNADNA仅有一条带否定了仅有一条带否定了全保留复制的可能,第二代出现两条带,一条完全保留复制的可能,第二代出现两条带,一条完全轻带一条中带否定了分散式复制的可能,证明全轻带一条中带否定了分散式复制的可能,证明DNADNA只能是半保留方式进行复制只能是半保留方式进行复制 1 1 、 DNA DNA的半保留复制的半保留复制 SemiconservativeSemiconservative Replication Replication DNA DNA双链解开,以
4、单链做模板,碱基互双链解开,以单链做模板,碱基互补原则,各自合成一条链。在新合成的补原则,各自合成一条链。在新合成的DNADNA双链分子中,双链分子中,一条是原来的老链,一一条是原来的老链,一条是新链条是新链。如果是半保留复制,必须解决解开双螺旋的问题。如果是半保留复制,必须解决解开双螺旋的问题。250Mb的的1 1号染色体,需要旋转号染色体,需要旋转250250万次。万次。 DNADNA拓扑异构酶解决了拓扑异构酶解决了 解开解开DNADNA双螺旋的问题双螺旋的问题DNADNA复制速率复制速率 大肠杆菌完成复制需大肠杆菌完成复制需4040分钟。分钟。 大肠杆菌基因组有大肠杆菌基因组有40040
5、0万万bpbp,复制速率:,复制速率:1700 bp1700 bp/ /秒。秒。 真核生物复制速率:真核生物复制速率:60 bp60 bp/ /秒。但完成整秒。但完成整个基因组复制所需的时间比大肠杆菌短。个基因组复制所需的时间比大肠杆菌短。 原因是大肠杆菌基因组仅有一个复制起原因是大肠杆菌基因组仅有一个复制起始位点,而真核基因组有多个起始位点。始位点,而真核基因组有多个起始位点。2 DNA复制的半不连续性复制的半不连续性复制时复制时DNA链延伸可能有三种方式:链延伸可能有三种方式:12 3 日本科学家冈崎用实验证明复制过程中产生日本科学家冈崎用实验证明复制过程中产生1001000bp的短片段,
6、然后又消失的短片段,然后又消失没有从没有从3 5 延长延长DNA链链的聚合酶的聚合酶2 DNA2 DNA复制的半不连续性复制的半不连续性 一条链连续合成一条链连续合成,称主导链称主导链,Leading Leading Strand Strand 另一条链分段合成另一条链分段合成,称,称随从链随从链(随后链)(随后链)Lagging Strand Lagging Strand 。 原因:原因:DNADNA双螺旋分子两条链方向相反,双螺旋分子两条链方向相反,新链合成的方向只能新链合成的方向只能5 53 3一个方向合成。一个方向合成。3 DNA复制的双向性复制的双向性 在两个方向同时进行,形成两个复
7、制叉在两个方向同时进行,形成两个复制叉 Replication Fork .复制子复制子 RepliconReplicon RepliconReplicon 基因组中能独立进行复制的结构单基因组中能独立进行复制的结构单位称复制子位称复制子, , 或者说单个复制起始点控制的或者说单个复制起始点控制的DNADNA。 复制的起始位点复制的起始位点 控制并起始复制的特定位点。控制并起始复制的特定位点。 终止位点终止位点 终止复制的位点终止复制的位点 复制子包含起始位点和终止位点,从起始位点复制子包含起始位点和终止位点,从起始位点至终止位点的全部至终止位点的全部DNADNA。第二节第二节 DNA DNA
8、 复制的基本过程复制的基本过程 一一 复制的起始复制的起始 (一) 起始部位起始部位的序列特征的序列特征 复制在特定部位起始。复制在特定部位起始。 原核生物仅有一个起始部位。原核生物仅有一个起始部位。 真核生物有多个起始部位。真核生物有多个起始部位。 1 1、 M M1313噬菌体的起始部位顺序特征噬菌体的起始部位顺序特征 59bp 59bp的发夹结构。的发夹结构。 2 2、大肠杆菌的起始部位顺序特征、大肠杆菌的起始部位顺序特征 2 2个区个区域:起始蛋白识别区:域:起始蛋白识别区:4 4个个9bp9bp重复顺序重复顺序和邻近的和邻近的ATAT富含区富含区3 3个个13bp13bp重复顺序重复
9、顺序。 大肠杆菌基因组复制起始部位大肠杆菌基因组复制起始部位3 3、酵母、酵母起始部位顺序特征起始部位顺序特征酵母酵母4 4、 SV40SV40起始部位的顺序特征起始部位的顺序特征5211 5220 5230 5240 1 10 20 30CACTACTTCT GGAATAGCTCAGAGGCCGAGGCGGCCTCGGCC TCTGCATAAAT AAAAAAATTAGTGATGAAGACCTTATCGAGTCTCCG GCTCCG CCGGAGCCGGAGACGTATTTA T TTTTT TAAT 反转重复序列反转重复序列 大大T抗原结合部位抗原结合部位 II A/T 富含区富含区 图图
10、3-7 SV40 复制起始部位结构复制起始部位结构5 5、起始部位的顺序特征、起始部位的顺序特征(高等真核生物)(高等真核生物) 多个复制起始点,有人发现任何大于多个复制起始点,有人发现任何大于15kb15kb的的DNADNA就能自主复制就能自主复制。 起始不是随机的,但未发现起始位点的特征序起始不是随机的,但未发现起始位点的特征序列。列。(二)(二) 起始需要多种蛋白因子参与起始需要多种蛋白因子参与 1 噬菌体噬菌体( X174X174) priApriA 识别起始位点,识别起始位点,ATPATP酶活性酶活性 priB priB 起始引发起始引发 priC priC 起始引发起始引发 Dna
11、T DnaT 起始引发起始引发 DnaB DnaB 起始引发起始引发 DnaC DnaC 起始引发起始引发, ,与与DnaBDnaB一起作用一起作用 DnaG DnaG RNA RNA引物合成引物合成 2 2 大肠杆菌大肠杆菌 DnaADnaA 结合于结合于oriCoriC区区,有,有ATPATP酶活性,使酶活性,使ATAT富含富含 区区解链,促进解链,促进DnaBDnaB结合形成起始复合物结合形成起始复合物。 DnaBDnaB DNA DNA螺旋酶,有解旋和解链作用。螺旋酶,有解旋和解链作用。 DnaCDnaC 运输运输DnaBDnaB,形成起始复合物,形成起始复合物。 DnaGDnaG D
12、NA DNA复制引发酶,合成引物。复制引发酶,合成引物。 HuHu 促进复制复合物的形成促进复制复合物的形成。 回旋酶回旋酶 松弛正超螺旋,促进单链松弛正超螺旋,促进单链DNADNA产生。产生。 单链结合蛋白单链结合蛋白 促进促进DNADNA解链,稳定单链解链,稳定单链DNADNA。3 3、真核细胞(真核细胞(SV40) 真核细胞(真核细胞(SV40)的)的DNA复制至少需要复制至少需要6个蛋白因子参与。个蛋白因子参与。 T抗原抗原:N端为端为DNA结合区,识别起始位点,结合区,识别起始位点, C端具有螺旋端具有螺旋 酶活性,在酶活性,在RFA的协助下解开双链。的协助下解开双链。 RFA:人单
13、链结合蛋白人单链结合蛋白 拓补异构酶拓补异构酶I或或II:解开超螺旋。:解开超螺旋。 复制因子复制因子C(replication facter C, RFC):形成起始复合物。):形成起始复合物。 DNA聚合酶聚合酶-引物酶复合物引物酶复合物:合成引物,起始:合成引物,起始DNADNA合成。合成。4、真核细胞(真核细胞(Yeast) (1) ORC( Origin Recognition Complex) 6 6个亚基组成个亚基组成 在真核生物中相当保守在真核生物中相当保守 特异识别特异识别ARS ARS (Autonomously replicating sequenceAutonomous
14、ly replicating sequence) ORC1pORC1p,ORC2pORC2p,ORC4p ORC4p 与与A A 元件结合,元件结合, ORC5pORC5p与与B B元件结合元件结合 结合过程需要结合过程需要ATPATP (2) Cdc6/Cdc18 (3 3)微染色体支持蛋白()微染色体支持蛋白(Minichromosome Minichromosome maintenance proteinsmaintenance proteins,MCMpMCMp) (4) Cdc45 (三)(三) 复制的起始引发(复制的起始引发(PrimingPriming)SSB的作用的作用无无SS
15、B结合非特异引发结合非特异引发有有SSB结合特异引发结合特异引发1、M13噬菌体噬菌体 pppGGGCGAAAAACCGUCUAUCAGGGCGAUGG单链结合蛋白单链结合蛋白SSB与与M13噬菌体单链噬菌体单链DNA结结 合,在发夹结构前合,在发夹结构前6 bp处,处,RNA聚合酶合成聚合酶合成 2030个碱基的个碱基的RNA. 破坏发夹结构;破坏发夹结构;SSB结合;结合;DNA聚合酶聚合酶III在在3OH延长延长DNA链。链。 DNA聚合酶聚合酶I水解水解RNA,并,并补补平缺口,连接酶连接平缺口,连接酶连接。SSB与与DNA结合结合priA,priB,priC识别起始点识别起始点在在D
16、naT帮助下帮助下DnaB,DnaC复合物结复合物结合形成前引发体合形成前引发体引发体引发体引发体可沿着引发体可沿着DNA链移动,在链移动,在合适的位点起始合适的位点起始引物引物RNA的合成的合成引发体的装配只能在起始点,引发体的装配只能在起始点,引物合成可在多处。引物合成可在多处。引发体移动的方向与引发体移动的方向与DNA链延链延长的方向相反。长的方向相反。类似冈崎片段的合成类似冈崎片段的合成2、 X174DNA 复制叉前进方向复制叉前进方向 3ATCGGAATCGGAACCTGCGTTAAGCAAAC-53ATCGGAATCGGAACCTGCGTTAAGCAAAC-5 链延长方向链延长方向
17、 TTCGTTTG-3TTCGTTTG-3 GACGCAA GACGCAA TAGCCTTG TAGCCTTG 5 TAGCCT 55 TAGCCT 5 3 3 3、大肠杆菌大肠杆菌DnaA与起始位点与起始位点OriC结合形成起始复合物结合形成起始复合物DnaA与与A-T富含区作用,解富含区作用,解 链,形成开放复合物链,形成开放复合物SSB与单链与单链DNA结合结合DnaA指导指导DnaB-DnaC复合物结合到解链复合物结合到解链 区,形成前引发复区,形成前引发复合物合物。DnaB 引导引导DnaG引物合成酶的结合形成引发复合物,合成引物合成酶的结合形成引发复合物,合成RNA引引物物Hu因子
18、促进引发过程因子促进引发过程4 SV404 SV40T抗原识别起始点和解链抗原识别起始点和解链RFA结合到单链结合到单链DNA拓扑异构酶参与下形成前引发体拓扑异构酶参与下形成前引发体DNApol -引物酶结合形成引发体引物酶结合形成引发体首先,在复制起始位点形成前复制复合物首先,在复制起始位点形成前复制复合物(pre-replicative complex,Pre-RC) 。) 。其次,其次,Pre-RC 被激活,从而启动被激活,从而启动DNA 的复制,并的复制,并防止一个细胞周期中复制的再次发生。防止一个细胞周期中复制的再次发生。最后,最后,Pre-RC 的激活主要依赖于两种促的激活主要依赖
19、于两种促 S 期激酶期激酶(S phase promoting kinases)ORC:Origin Recognition Complex5、真核生物复制的起始、真核生物复制的起始二二 DNA DNA链的延长链的延长 (一)一) 原核生物原核生物DNADNA链的延伸链的延伸 延伸延伸反应:反应: 在在RNARNA引物的引物的OHOH端由端由DNADNA聚合酶聚合酶IIIIII,按碱基互补,按碱基互补规则延伸规则延伸。 主导链的延长主导链的延长: 3 35 5方向这条链做模板链的方向这条链做模板链的新链合成可以随着复制叉向前移动,连续合成新链合成可以随着复制叉向前移动,连续合成(5 5 3 3
20、)。 随从链的延长随从链的延长 5 5 3 3 方向这条链做模板链的新链合成则不能方向这条链做模板链的新链合成则不能随着复制叉向前移动随着复制叉向前移动进行连续合成,只能分段进行连续合成,只能分段合成一小段,这一小段新合成的合成一小段,这一小段新合成的DNADNA链称冈奇链称冈奇片段。每一段新合成的一小段中有片段。每一段新合成的一小段中有RNARNA,由,由RNARNA酶水解,酶水解,DNADNA聚合酶聚合酶I I补平,最后由连接补平,最后由连接酶连接。酶连接。DNADNA链延长的要点链延长的要点 1) DNA1) DNA聚合酶不能从头合成新链,只能在聚合酶不能从头合成新链,只能在3-OH3-
21、OH羟基端延长。复制起始时的羟基端延长。复制起始时的3-OH3-OH羟基端是羟基端是RNARNA。 2) 2) 按照碱基互补原则合成新链按照碱基互补原则合成新链。 3) 3) 两条链同时复制,新链的延伸方向是两条链同时复制,新链的延伸方向是5 53 3,一条链连续合成,称主导链,另一条链不连续一条链连续合成,称主导链,另一条链不连续合成,称随从链(后随链)。合成,称随从链(后随链)。 4) 复制以双向进行,复制正在进行的部位称复制以双向进行,复制正在进行的部位称复制叉(复制叉(ReplicationReplication fork fork), , 复制叉从起始点沿复制叉从起始点沿着着DNAD
22、NA移动。复制能够发生的移动。复制能够发生的DNADNA单位称复制子单位称复制子(RepliconReplicon).(二)(二)SV40SV40的的DNADNA延伸延伸 1、前导链的延伸前导链的延伸 PolPol 合成一段新链合成一段新链 在在RFCRFC和和PCNAPCNA协助下,协助下, PolPol Pol Pol 转转换换 由由PolPol 完成全部前导链的合成完成全部前导链的合成 2 2、后随联的延伸、后随联的延伸三三 复制的终止复制的终止 对于线性对于线性DNADNA复制例如复制例如 噬菌体等比较简噬菌体等比较简单,复制到单,复制到分子末端终止。分子末端终止。 对于环状的大肠杆菌
23、对于环状的大肠杆菌DNADNA复制和真核生物复制和真核生物的的DNADNA复制就比较复杂。复制就比较复杂。复制叉到达终止区,完成复制前,复制暂停。两个子代复制叉到达终止区,完成复制前,复制暂停。两个子代DNADNA缠绕在一起,缠绕在一起,需要分开。需要分开。 在大肠杆菌:在大肠杆菌: 有复制起始点,也有复制终止点。有复制起始点,也有复制终止点。终止子(终止子(Terminator))含)含22bpTus: Terminus utilization substance复制叉到达终止区,完成复制前,复制叉到达终止区,完成复制前,复制暂停。两个子代复制暂停。两个子代DNA缠绕在缠绕在一起,需要分开。
24、一起,需要分开。第三节第三节 参与参与DNADNA复制的酶类复制的酶类 参与参与DNADNA复制的酶或蛋白因子主要有以下几种:复制的酶或蛋白因子主要有以下几种: 1 DNA1 DNA聚合酶聚合酶 催化催化DNADNA的合成。的合成。 2 2 引物酶引物酶 起始起始DNADNA的合成的合成 3 3 连接酶连接酶 连接岗奇片段连接岗奇片段 4 DNA4 DNA解链,解旋酶解链,解旋酶 5 DNA5 DNA结合蛋白。结合蛋白。一一 DNADNA聚合酶聚合酶(Polymerase)(Polymerase) (一)(一) 作用机制作用机制 以以DNADNA做模板,碱基互补配对,催化做模板,碱基互补配对,
25、催化4 4种种dNTPdNTP 之间形成磷酸二酯键,从而延长之间形成磷酸二酯键,从而延长DNADNA链。链。 在模板链上进行在模板链上进行 不能从头合成,在引物的不能从头合成,在引物的3OH3OH端上延长端上延长 新链延长方向为新链延长方向为5 53 3延长延长 (二)二) 原核生物原核生物DNADNA聚合酶聚合酶 有有3 3种:种:DNADNA聚合酶聚合酶 I I,II II,IIIIII。 多功能酶:合成多功能酶:合成DNADNA的活性的活性 聚合酶作用聚合酶作用, , 延长延长DNADNA链。链。 水解水解DNADNA的活性的活性 外切核酸酶活性。切除不配外切核酸酶活性。切除不配对碱基,
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